Gloeothece citriformis: PCC7424_2994
Help
Entry
PCC7424_2994 CDS
T00808
Name
(GenBank) protein of unknown function DUF490
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
cyc
Gloeothece citriformis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cyc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cyc02000
]
PCC7424_2994
Transporters [BR:
cyc02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PCC7424_2994
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
HTH_34
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACK71396
UniProt:
B7KA40
LinkDB
All DBs
Position
complement(3339763..3345204)
Genome browser
AA seq
1813 aa
AA seq
DB search
MFGVRKKPITKDDSSFLNHSHSNLILKPKSPFFFKFKLGRRFWLGLGTVSFLSISGGLVY
GWFLIDRHLAPILEQELTNFLNRPVKIGSVEGISLTGVRFGKSEILPTSDDPAKIALEQV
DVTFNPIKLLTHSQLALDVKAIRPDIYVQQGVNGAWLITPFDGVKSTGNEKVTIELETLR
FIDADVIVIARSATNQLQSPVNLFFPVANLDFSDQGRIIDFEGEGKLAKGGQVKLSGVGK
TNTQEINLSVVGEQIKATDVKDLLPLPFNLNEGEIGANLTVKLRPKQSPSIAGIATLNNV
TAQIPQLPQSFTQSKGILRFNQTRVNLEGVTTQFGQLAGVANGKIDLAGGYDLQAKTEPF
LVQNALKTLNIPAPTVPITAQLQSDIKVRGSLAKPQVSLTVNSTQAAKIDHIDFKSLKAN
LQVTDSQISISQFQALPTIGGELTVQGKINPQTSTVVLDVQASHLPSQDIAQLYKTPIPS
SVGKVSGELNISGNFSQANSWKGRGAVNFAFGQGTINLTDVEYLGGNWQGQLQATDVEVT
SLGVNIPKNIPHGRVNADLNVSGNQNSFTPDTILVKGVANLGIAEGKITANNLHLAQGKW
KTDLQVQGVQVNPFVPNLPEQFDGRLGGNFSINGDLNSTLADIQGTGKANLTLGSGTIQA
TDLHLDRGNWKGNLQTNNLQIARFMPDVPTPLQGKLKGAVTLSGNLNSSLEQIEGQGQVS
LISKSGTITAKNIQLKQGQFTTLLTPEQVKLASFSPQLKGHLGGKLNISGDLNNLNPETI
KAQGTLNFSQGLALINHPLTTTINWSGNRLDILEATANNFKAKGFVAVDLSNQDIQQFEL
NVNAQNLNLKSLAQSLPVNQINYEGSLDFTGKIAGKPEKTAMSGELALENFNVANLAFEP
VLKGSINLDPNSGVKLQLAGNRDKIHLNLDQNYQPLAFALNLDQIAVEGTYQNQHLLTTA
NNIPLEFLTELAKSTDVPIPKTLLSKPIEGQLSGNFALNIKDQNFSGENLVITDWRWGHI
RGDRFSGNISLKEGNVSLSDGELQQKNSLYRINGTVTQSSAGPQLHTEVAVTGGEIQDIL
ETLQIFELSDLKRGLTPPNYAKAKDLWTAEELENPPADSSLYSVGLSKAPLAQQLEYFAK
LAENLQKTEQQQQNASSFPELSELKGKFDGKIVLDASMKAGIEAKFDVKGQDWQWGSYKV
QHLQAKGDFREGLLKLEPVSLQLDESLVAFAGEIGQQTQTGKLQLQNIPLDLVQKFVPLP
PDVEVEGDLNGEIVLDGKRDNPEIRGEMAIAKASLNQIPIQATEGEFTYHNSRFNFSAGS
IVTNQTAPVKIEGSFPYQLPFAKVAPTSDDLNLNIRVQNDGLALLDVLTQGQVSWKGGKG
EVNVDIAGKFDQQKARPTQLKAEGIAQVENATLSTQILPDVPLTGVEGKILFNFDQIQVE
HLKGNFSGGKITVAGTLPLLFPIPMKDPLTIEGNDLALNLKGLYQGKVNGTIQVGGSVLT
PQLGGEIKLDNGQIFLNESIAQTETNATPKQGLASLTGFKDLNLNLGDNVWISLPPVMHI
LATGNLNINGSLDKPLPEGEIKLETGQVNLFSAQFGLVGGEVNTAKFTPNRGLDPYLDVQ
MTAVVSETTRNPVRINPLSSEVRDNSIFPSDSLQTVHINAKVDGFASQLTQSLEVTSLPP
RSEGEIIALLGGNFINPVVETDPRLGLANLAGSAVFGTIQGPISKVLGLSDFRVYPTQLI
NEKERISDYQIGIAAEASVDLRDNLSLSIQKIVNTDRPPHFGLRYRINNNTVIRGTSNFS
DDNRGMVEYQRRF
NT seq
5442 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttcggtgtcaggaaaaagcctataacaaaagatgattcatcttttttaaatcattct
cactccaatctcattttaaagccaaaatctccctttttctttaagtttaagctaggcaga
cgcttttggctagggcttggtactgtatcttttttgagtattagtggaggattggtctac
ggttggtttttgatcgatcgacacttagccccaattcttgagcaagaattaacgaatttt
ctcaatcgtccggttaaaattggttcagttgagggaatttctttaaccggagttcgcttc
ggaaagagtgaaattttaccaacttctgatgatccggcgaaaattgctctagaacaagtc
gatgttacttttaatcctatcaaactgttgacccattctcaactggctttagatgttaaa
gccattcgtccggatatttatgtccaacaaggagttaatggggcttggttaattacccct
tttgatggggtaaaatctacagggaatgaaaaggtaacgattgaattagaaactttacgg
tttattgatgctgatgtcattgttatagcgagatcagctactaatcagttacaatcgcca
gttaatttgttttttcctgtagctaatctggatttttctgatcaagggcggattattgat
tttgaaggagaaggaaaactggcaaagggaggccaagttaaactgtctggggtagggaaa
accaatacccaagaaattaatttaagcgttgttggggaacaaattaaagcaaccgatgtt
aaagatttacttcctctgccttttaatttaaatgagggagaaattggcgcaaatttaacc
gttaaattaagacccaaacaatccccctcgatcgcaggaattgctaccttaaataatgtt
actgcccagattcctcaattgccccaatcttttactcaaagtaaaggaatcttacggttt
aatcaaactagagtgaatttagaaggggtaacaacacaatttggacaacttgccggggtg
gccaatggcaagatagacttagccggaggatatgatctacaggctaaaactgaacccttt
ttagtgcaaaatgcccttaaaaccttaaatattcctgccccgactgttcccattacagcc
caattacagagtgatattaaagtaaggggaagtttagcaaaaccgcaagtttctttaacg
gtaaatagtacccaagcggctaaaattgatcacattgattttaaatctctcaaggccaat
ttacaggtaactgattctcaaatttctatcagtcaatttcaagctttaccgacgatagga
ggagaattaaccgtccaaggcaagattaatcctcagacttcaaccgttgtccttgatgtt
caagctagtcatttaccctctcaagacatcgcccaattatataaaacccctattccctcc
tcagtaggaaaagtttcaggagaattaaatatttcaggaaatttcagtcaagctaatagt
tggaaaggaagaggggcagttaattttgcctttggacaaggaacaattaatctaactgac
gttgaatatttaggcggaaattggcaaggacaattacaagcaacagacgttgaagtgacg
agtttaggggtaaatatccctaaaaatattcctcacggtagagttaatgcagatttaaat
gtatccggaaatcaaaactcttttactcctgatactatcctagtcaaaggcgtggctaat
ctaggaattgccgagggaaaaattaccgccaataacttacacttagcccaaggaaaatgg
aaaacggatctccaggttcaaggggttcaagttaatccatttgtgcctaatcttcccgaa
caattcgacggtcgtctgggaggaaatttttcgataaacggagatttaaacagtacctta
gcggatattcaagggacaggaaaagccaatttaacccttgggagtgggacaattcaagcc
actgatttacatctcgatcggggtaactggaaagggaatttacagactaataatttacaa
atagcccgttttatgcctgatgtacccactcccttacaaggaaaattaaaaggggcggtg
acattatccggcaatctaaacagcagtttagaacagattgaaggccaaggtcaagtcagt
ttaatttccaagtcgggaacaattaccgctaaaaatattcaattaaaacaaggacaattt
acaacccttttaactccagagcaagttaaattagcctctttttcccctcaattaaaagga
catttgggggggaaattgaacattagtggagatttaaataatctaaatcccgaaacgatt
aaagcccaaggaacactcaattttagtcaaggattagctttaattaatcatcctttaacg
actacaattaactggagtggcaaccggttagacattctggaggcaactgctaataatttt
aaggctaagggatttgtagcggttgatttatctaatcaagatattcagcaatttgaatta
aatgttaatgcccaaaacttaaatttaaagagtttagcccaatctctacccgttaatcaa
attaactatgaaggtagccttgattttactggaaaaatagccggaaaaccagaaaaaacc
gccatgagtggagagttagccttagagaattttaatgtagctaatttagcctttgaaccc
gttttaaaaggatcgattaacttagatcctaacagtggggttaaacttcaattagccgga
aacagagataaaatccatctaaatctcgatcaaaattatcaacctctagcctttgccctc
aatttagatcaaatcgcagtagaaggaacatatcaaaaccaacatctattaacaaccgcg
aataatattcccttagaattcctaaccgaattagctaaatcaaccgatgtcccaattccc
aaaactctattatctaaaccaatagaagggcaattatccgggaactttgccttaaatatt
aaggatcagaattttagcggggaaaacctagtcattacggattggcgctggggacatatc
cgaggcgatcgctttagtggcaatattagtttaaaagagggaaatgttagtctcagtgac
ggagaattacaacagaaaaatagtttatatcggattaatggaacagttacccaatcctct
gccggaccgcaattacacacagaagttgctgtgactgggggagaaattcaagatatttta
gaaaccttacaaatttttgaattatcggatttaaaacgaggtttaacccctccgaattat
gctaaagccaaagatctttggacagcagaagaattagaaaatccgccggcagattcttcg
ttatattctgtcggtttatcgaaagcccccttagcccaacaattggagtattttgctaaa
ctggctgaaaatttacaaaaaaccgaacagcaacagcaaaacgcctcatcctttcccgaa
ttaagcgaactcaaagggaaatttgatggaaaaattgttcttgatgcttctatgaaagcg
ggaatagaggctaaatttgacgttaaaggacaagattggcaatggggaagttacaaggtt
caacacttacaagctaaaggagattttagagagggcttactcaaacttgaacccgtcagt
cttcaattagacgagagtttagtggcttttgctggagaaattgggcagcaaacccaaacc
ggcaaactacaattacaaaacattcctcttgatctggttcaaaaatttgtccccttaccc
cctgatgtggaggtggaaggagatcttaatggggagattgttctcgatgggaagcgggat
aaccccgaaatcagaggagaaatggcgatcgctaaagctagtctcaatcaaatccctatc
caagcaactgaaggagaatttacttaccataacagtcgtttcaatttctccgccggaagt
attgttacaaaccaaactgcccccgttaaaatcgaagggagttttccctatcaattaccc
tttgccaaagtagcgccaaccagcgacgatcttaacctcaatattcgggtgcaaaatgac
ggacttgccctattagatgttctgactcaaggacaagtatcttggaaaggtggaaaagga
gaagttaatgtcgatattgccggcaaatttgatcaacaaaaagcccgtcccactcaatta
aaagccgaaggaatcgcccaagttgagaatgcaactctgtccactcaaattttaccggat
gtgcctttaactggagttgaagggaaaattttatttaacttcgatcaaatccaagttgaa
catttaaaggggaattttagtgggggtaaaatcaccgttgctggaactttgcctttactg
tttcctattccgatgaaagaccctttaaccattgaaggaaatgatttagccttaaatctt
aaaggactgtatcaaggaaaagttaacggaacaattcaagtcggggggagtgttcttact
cctcaattaggaggggaaatcaagttagataatggtcaaattttcttaaatgaatcaatc
gcccagacagaaactaatgctactccaaaacaaggattagcctctctgacaggatttaaa
gatttaaaccttaatttaggggataatgtttggattagtctgcctccagtgatgcacatt
ttagcaacgggtaatctgaatattaatggaagtttagacaaacctctgccagagggagaa
attaaactcgaaaccggtcaagtgaatctattttcagcccaatttggattagtgggagga
gaagttaatacggcaaaatttacgccaaatcggggattagacccttatcttgatgtacag
atgacggcggtagtttcggagacaacccgaaatccagttcggattaatcctctttcttct
gaggttagagataatagtattttcccctcagatagcttacaaactgttcatatcaacgct
aaagttgacggttttgccagtcagttaactcaaagtttagaagtgaccagtcttcctcct
cgttccgaaggggaaattattgctttattaggaggtaattttattaatccggtggtagaa
acagatccgaggttagggttagctaatttagccggttcggcagtttttggcactattcaa
ggccccattagtaaggtattaggattaagtgattttcgagtttatccgactcaattaatt
aatgaaaaagaacggatttctgactatcaaattggaattgcggcggaggcgagtgtcgat
ctcagagacaatttatccttgtcaatccaaaaaatagtgaataccgatcgtcctcctcat
tttggcttacgttatcgaattaataacaataccgtcattagaggaacaagcaatttttca
gatgataatcggggaatggttgaatatcaaaggaggttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
