Cyanobacterium sp. DS4: Dongsha4_05585
Help
Entry
Dongsha4_05585 CDS
T11028
Name
(GenBank) ABC transporter substrate-binding protein
KO
K02035
peptide/nickel transport system substrate-binding protein
Organism
cyd Cyanobacterium sp. DS4
Pathway
cyd02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cyd00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
Dongsha4_05585
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cyd02000
]
Dongsha4_05585
Transporters [BR:
cyd02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Peptide and nickel transporters
Peptides/nickel transporter
Dongsha4_05585
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SBP_bac_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WVL01660
LinkDB
All DBs
Position
1321536..1323314
Genome browser
AA seq
592 aa
AA seq
DB search
MKTLKFIRPIFCEKITKLLTISLLFISLNLSISSCNVINKTDNSSRIIQSVLSDPKTFNV
ALSQESPNIFGLTYEGLVRENPLTGEIEPALAKNWTISDDKLTIIFTLKEDLKWSDGQPL
TVDDVVFSYNQIYLNEEIPTNVRDSLRIGQSRAFPTVEKLNESQVKFTIPEPFAPFLDST
GLAILPKHILEEKVNTKGSDGKPLFLSFWGVDTPPENLVVNGAYKLKNYVTSQRIIFTKN
PFYWEKDIMGNQLPYIEEVVWEIVESTDTSLLQFRSGSLDSVGITPEYFSLLKKEEKRGN
FTIFNGGPAYGTTFMAFNLNQGSRDGKPLVTPYKSRWFNNVNFRRAIAHGINRERMINNI
YRGLGEPQNSPISVQSPFYDQTIKGYDYDPELAKQILLEEGFKYREDGKLLDSENNEVRF
TLLTNAGNKIRESLGSQIKQDLSQIGITVDFTPIAFNVLVDKLSNSLDWEAHIIGFTGGN
EPNGGANLWFPDGNLHLFNQKPQPGRQPIEGRVIADWEAKIGQLYIDGARELDFEKRKEI
YDQTQQLASEYLPLIYLVNPYSLSAVRNRIEGVEYSALGGAFWNIQKLTIRD
NT seq
1779 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaccttaaaatttatacgtcctatattttgcgaaaaaataactaaattattaact
atatctctattatttataagtttaaatttatcaatatctagttgtaacgttatcaataaa
acagataattcctcacgaattatacaatcagttttaagtgatccaaaaacctttaatgta
gcactttctcaagagtcacctaatatttttggtttaacctatgaggggttagtaagagag
aatcctttgacgggcgaaattgaaccagcattggctaaaaattggactatttctgatgat
aaattaacgattatttttactttaaaagaagatttaaaatggtctgacggacaaccatta
acagtggatgatgttgtctttagttataatcaaatttaccttaatgaagagatacctaca
aatgttagggatagtttacgcattggtcaaagtcgagcttttcctacggtagaaaaatta
aatgaatctcaagttaaattcacaattcctgaaccattcgctccatttttggatagcaca
ggattagcaattttacctaaacatattttggaagaaaaagttaatactaaaggcagtgat
ggaaagccacttttcttatctttttggggtgtggatactccccctgaaaatttagtggtt
aatggtgcttataaattaaaaaactatgtaacttctcaacgaattattttcacaaaaaat
cctttctattgggaaaaagatattatgggtaatcagctaccttatatagaagaagttgta
tgggaaattgttgaatcaacagacacttctttattacaatttcgttcgggtagtttagat
tctgttggcattacacctgagtatttttcccttttaaagaaagaagaaaagagaggaaat
tttactatttttaatggtggtcctgcctatggtacaacttttatggcattcaatcttaat
cagggttcaagagatggtaagcctttagtaactccttataaatcaagatggtttaataat
gtcaattttcggagagcgatcgcacatggtataaatagagagagaatgatcaataatatt
tatcggggtttaggagagcctcaaaactcccccatttcggtgcagtcacctttttatgat
caaaccattaaaggatatgattatgacccagaattagccaagcaaatacttttagaagaa
ggttttaaatatagagaagatggcaaacttttagactcagaaaataatgaagttagattt
actcttttaaccaatgcggggaataaaattagagagtctttaggttcacaaataaagcaa
gatttaagccaaattggtattactgtggactttaccccgatcgcatttaatgttttagta
gataaattaagtaattctttagattgggaagcccatattattggttttactggcggtaat
gagcctaatggtggtgctaatttatggtttccagatggaaatttacatctttttaatcaa
aaacctcaacccggaagacaacccattgaaggtagagttatcgctgattgggaagccaaa
attggacaattatatatagacggagcaagggaattagactttgaaaaaagaaaagaaatt
tatgatcaaactcaacaattagcctctgaatatttacccttaatttatttagtgaatccc
tactctttatctgctgtcagaaatcgcattgaaggagttgaatattctgccctaggtggt
gctttttggaacatacaaaaattaactattagggattaa
DBGET
integrated database retrieval system
