Cyanobacterium sp. DS4: Dongsha4_14355
Help
Entry
Dongsha4_14355 CDS
T11028
Name
(GenBank) DNA polymerase III
Organism
cyd Cyanobacterium sp. DS4
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNase_T
AAA_16
nSTAND1
AAA_22
NACHT
ResIII
TniB
nSTAND3
AAA_5
DUF6876
Viral_helicase1
Rrn6_HB
DNA_pol_A_exo1
DUF7310
Sugarporin_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WVK99837
LinkDB
All DBs
Position
complement(3346714..3349125)
Genome browser
AA seq
803 aa
AA seq
DB search
MNFIVIDTEGSDTLREIAIINQDGKLIYEAFVRTRGSTTKRLNHKPLTEIVRDLQNILPN
QNIICHNAQHDRTILHKSFRRCRQQLPQVQFICTLELAQEKHPNLDSYQLGNLSRRFFLQ
VDNLYFRKVQAHRARYDAQFTLQLYLYLTSHSRIEDKPAMTVEKIVTTPSVKNPFSSSRV
DDPYQNHLDFEHIYKSQFYHLTSLVEEIRQDRENKQSRGALILGEAGSGKTHLIMRLAKA
TLKTNRLLYVRQPNNPNSVMHHIYSRILESFAQKVDIEGSQRTQLDLLLAHVFVNILKTI
QQEYQSQKLGQIIKLLQNDSLSLYERLGGENTQRNRDNWKYIETKITQWWENNYSASGYA
PNILQGIIKYCSYKDLKIKDKVRRWLTGNELDSQICEEIGLNNWQEDNLSREDFALEGIR
LFGQLSTLDEPLIIVFDQLEYLIHKLDILTSFGNALREIITHVPNSLIVVNLFPDRWQSF
QGYFDNSTIDRLSTNQLILQTPSSDELRKMLGMKCERVGTTLEELFQPEDLQIILRQSSI
RKVINKASDYYHYRILSIPLPPPPKKISVEERLDKLENALQQLETLVKEIEGKIGPTPPP
KPPIITSNDPILKYLEENERLIADKYHNPNIITDDDEYGKLVTIMEAFKSYDSSINIDHL
PLGKKVIPENLLITRNKLKLAVGFLNIGGSAFTSRIKNFNQLVISNRNIKFYLLRDKKEG
YITGKVGLEEIDKLNYTENGSFLIINKEARVIFELIYKMIVAINQNDLEVSMTDAIKVVL
NKYGNYWLIREIFPTNDIMITSK
NT seq
2412 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattttattgttatcgacaccgaaggaagtgacaccctcagagaaatagccattatc
aaccaagacggaaaattaatttacgaagcctttgtcagaacaagaggcagtacaacaaaa
agactgaatcacaaacccctaacagaaatagtcagagacttacaaaatattctacctaac
caaaacattatctgtcataatgcacaacacgatcgcacgattcttcataagagtttccgc
cgatgccgacaacaattaccccaagtacaatttatctgcacccttgaattagcacaagaa
aaacaccccaacctcgacagttatcaactcggtaacctaagccgtagattcttcctacaa
gtggataatctttattttagaaaagttcaagcccatcgagctcgttatgatgcacaattt
accttacaattatatttatacttaacttctcactcccgaatagaagataaaccagcgatg
acagtagaaaaaattgtgacaacaccctctgttaaaaatccctttagtagcagtcgtgtg
gatgatccttaccaaaatcatttagactttgagcatatatacaaaagccaattttatcat
ctaacatccctagtggaagaaatcagacaagatagggaaaacaaacaaagtcgaggtgcg
ttaatactgggggaagcaggaagcggaaaaactcacctgataatgcggttagccaaagcc
accttaaaaaccaatcgcctcttatatgtgcgtcaacctaacaatcctaactccgtgatg
catcatatctattcaagaatactagaaagttttgctcaaaaagttgacatcgaaggcagt
caacgcacccaattagacttacttttagcccatgtttttgtcaatattttaaaaacaatt
cagcaggaatatcaaagccaaaaattaggacaaatcattaaacttttacaaaatgatagt
ctaagtttatatgaacgtttaggaggagaaaatactcaaagaaatagggataattggaaa
tatatagaaactaaaattactcaatggtgggaaaataattattccgctagtggttacgcc
cctaatattcttcaaggtatcattaaatattgtagctataaagatctgaaaatcaaagat
aaagttagaagatggttaacaggcaacgaattagacagtcaaatttgtgaagaaataggc
ttaaataattggcaagaagataatctcagcagagaagattttgccttagaaggaatccgt
ttatttgggcaattatcgactttagatgaaccattaattattgtctttgaccaactggaa
tatctaattcataaactcgatattcttaccagttttggcaatgctttaagggaaattata
acccatgttcctaactctttaattgtagttaatctttttccagatcgttggcaaagtttt
caaggatattttgacaattctaccattgacagattatccactaatcaactaattttacaa
actccctctagtgatgaattaagaaaaatgttagggatgaaatgcgaaagagttggcaca
actttagaggagttatttcaacccgaagatttacaaataattttgagacaatcttccatt
agaaaagtaattaataaagcctcagactactatcattatcgaattttaagcataccttta
cccccccctcctaagaagatttctgtagaagaaagattagataaattagaaaatgcttta
cagcaattagaaacattagtaaaagaaattgaggggaaaataggaccaacacccccacca
aaaccaccaataattacttcaaatgatcctattttaaaatacttagaagaaaatgaacgt
ttaattgctgataaatatcacaaccctaacattattaccgatgatgatgagtatggaaaa
ttagtaacaattatggaggcatttaaaagctatgattcaagtattaatatagatcattta
cctttaggaaaaaaggtaattccagaaaatttactaataacgagaaataagctaaaatta
gcagtaggttttttaaatataggtggttcagcttttacatccagaattaaaaattttaac
caattggttatatctaaccgtaatattaaattttatttattaagggataaaaaagagggt
tacattacaggaaaagtaggattagaagaaattgataagttaaattatactgaaaatggc
tcatttttaataataaataaagaagcaagagttatctttgaattaatttataaaatgata
gtcgcaattaatcaaaatgatttagaagttagtatgactgatgctattaaagtggtttta
aataagtatggaaattactggttaatcagggaaattttccccacaaatgatataatgata
actagcaagtag
DBGET
integrated database retrieval system
