Cyanobacterium sp. DS4: Dongsha4_17510
Help
Entry
Dongsha4_17510 CDS
T11028
Name
(GenBank) phospholipase D-like domain-containing protein
Organism
cyd Cyanobacterium sp. DS4
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Helicase_C
SNF2-rel_dom
PLDc_2
ResIII
RE_NgoFVII
DEAD
PP_kinase_C
Cas3-like_C_2
DUF7540
NotI
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WVL00420
LinkDB
All DBs
Position
complement(4016184..4019126)
Genome browser
AA seq
980 aa
AA seq
DB search
MKQPNLLTSGIRDNHNRGSVADFLRSNLYSGSLLSIVSAYFTIYAFEKLEQELSEIKELN
FLFGEPTFIKSVNDTAQLQSFKIEDDQIKLETKLQQNSIAKRCEQWIKEKVNIRSIIQSN
LLHGKLYHIINGNKESAILGSSNFTVKGLGLAENNSNIELNLVVDSDRDRQDLKFWFDEV
WNNPELVKDVKQEVINYLQQLYQDNPPSFIYYKTLYHLFFRDLLNQEKGDRLLQQQHLLD
TKIWSMLFDFQKDGVKGVINKILTYNGCILADSVGLGKTFEALAVIKYFELLNYRILVLC
PKKLRENWTIYQAQNNSELNILLEDRFNYTVLSHTDLSRDNGKVGDIDLATINWGNYDLI
VIDESHNFRNNTKGKKDEDGNIIKKSRYERLLDDVIKSGIKSKVLLLSATPVNNNLKDLK
NQLDLISEGKESAFSETLGISNIKQVLTNAQTKFKQWATKDNRSNNELLESLSSAFFTLL
DGLTIARSRKHIEQYYPEVVDNLGGFPERLKPLSVFYRIDLDDNFLDYEDIYNEISKYKL
SLFTPSSYVLEDYKSLYEGKVIQRNFTQENREYYLIGMMRVNFLKRLESSIYSFKLTLER
TIAKIEELIKIIKEFKQYKQDIIYTQDEEIRNIINDDDEFADAFQVGQKINYHLVHLDIE
KWLNELIKDKKQLNKLYLQAQAIDNNRDAKLAELKELIKEKVNNPTINKLGKPNRKIIVF
TAFADTATYLYDSLKTWAKNELNINLALVTGSNKNKTTLGETKFEHILTNFAPYAKKRDK
IPSLPQHEEIDLLIATDCISEGQNLQDCDYLINYDIHWNPVRIIQRFGRIDRIGSPNSAV
QLVNFWITQDFDQYINLRDRVESRMALMDLTATGEDNLLDEELIKKDLNYRDNQLLRLQE
EVLDLEDFNDSISLNEFSLEDFRTDLLNYIQENRKALEEAPLGLYAVVPPLPEHSVIKPG
VIFCLQQKGDTKDNQEVNPL
NT seq
2943 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagcaacctaacttattaacatcaggaataagggataaccataataggggttcagta
gctgattttctccgcagtaacctttactctggctctctactgtcgattgtctctgcttac
tttactatctatgcctttgagaagttagaacaggaattatcagagattaaggagttgaat
tttctctttggcgaacccacctttataaagtctgttaatgatactgctcaattacagtcc
tttaaaatagaagatgaccagataaaattagagactaaattacagcagaatagtattgct
aaacgctgtgaacaatggataaaagaaaaggttaatattcgttctattatacagtctaat
ttactgcacggtaaactctaccatatcattaatggtaataaagaatcagctattttaggt
agttctaatttcactgttaagggattaggattagcagaaaataatagtaatatagaatta
aatttagtagttgatagtgatagagatagacaagatttaaagttctggtttgatgaggtt
tggaataacccagagttagtaaaagatgttaaacaagaggttattaattatctccaacaa
ttatatcaggataatccccctagtttcatttattataaaactttatatcatcttttcttc
agagatttattaaaccaagaaaagggtgatcgactattacaacaacagcatttattggat
actaaaatatggtcaatgttgtttgatttccagaaagatggggtaaaaggagtaatcaat
aaaatattgacctataacggttgtatccttgctgatagtgtaggtttagggaagacgttt
gaggcattagcagttataaaatactttgagttattaaattatagaatactggtattatgt
cctaagaaattaagagaaaactggacaatttatcaggcacaaaataatagtgaacttaat
atattattagaagatagatttaattatacggtgctttctcatactgatttaagtagagat
aatggtaaagtaggggatattgatttagctactattaattggggtaattatgatttaatt
gtaatagatgaatcccataactttaggaataatactaagggaaaaaaagatgaagacggc
aacatcataaagaaaagtagatatgaaagactgttagatgatgtcataaaatcagggata
aaaagcaaagttttattattatctgctactcctgtcaataataacctcaaagacttaaag
aaccaattagacttaatctctgaaggtaaagaatcagcttttagtgagacattagggatt
agtaacattaaacaggtattaaccaatgcccaaactaagtttaaacagtgggcaacaaaa
gataatcgtagcaataatgaattactagagagtcttagttctgctttctttactctttta
gatggtttaactattgcccgttcccgtaaacatatagaacagtattaccccgaagtagtg
gataatttaggtggttttcctgagagattaaaaccattatcagtattttatcgcattgac
ttagatgataatttccttgactatgaagatatatataacgaaatctctaagtataaatta
tctttgtttaccccttctagttatgttttagaagattataaatcattgtatgaaggtaag
gttattcaacgtaattttacccaagaaaatagggaatattatctaatcggaatgatgagg
gtaaatttccttaaaagattagagagttctatttattcttttaaattaaccttagagaga
actatagctaaaattgaggaattaataaaaataattaaggaatttaagcagtataaacaa
gatataatttacactcaagatgaagaaataaggaatattattaatgatgatgatgagttt
gctgatgcctttcaggtcggtcaaaagattaattatcatttagttcaccttgatattgag
aaatggttaaatgaattaataaaggataaaaagcaactaaataaattatatttacaagct
caggcaatagataataatagggatgctaaactagcagaattaaaggagttaattaaagaa
aaagtaaataatcctaccattaataaattaggtaaacctaaccgtaaaataatagtattt
actgcttttgctgataccgcaacttatctctatgactcccttaaaacatgggctaaaaat
gaattaaatattaatcttgctcttgttactggtagcaataagaataagactactctagga
gaaactaaatttgagcatatcctgactaattttgccccttatgctaagaaacgggataaa
ataccatctttaccccaacatgaagaaatagacttattaatcgccactgactgcatctct
gaaggtcaaaacctccaagactgcgattatttaattaactatgatatacactggaatcct
gtaagaattatacagagatttggaaggattgacaggattggtagtcctaacagtgcagta
cagttagttaatttctggattacccaagactttgaccagtacattaatttgagggatagg
gtcgagtcaaggatggcattaatggatttgacggcaacaggggaggataatcttttagat
gaagaattgattaagaaagacttaaattatagggataatcaattactacggttacaagaa
gaagtgttagaccttgaggatttcaatgattccatctccctcaatgagtttagtttagaa
gattttagaacagatttactaaactatattcaagaaaataggaaggcattagaagaagct
cctctcggactttatgctgttgtgccaccattacccgaacattctgttattaaacccggg
gtaatcttctgtcttcagcagaaaggggatacgaaggataatcaagaagttaatccttta
taa
DBGET
integrated database retrieval system
