Rippkaea orientalis PCC 8802: Cyan8802_3373
Help
Entry
Cyan8802_3373 CDS
T00968
Name
(GenBank) MscS Mechanosensitive ion channel
KO
K22044
moderate conductance mechanosensitive channel
Organism
cyh
Rippkaea orientalis PCC 8802
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cyh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cyh02000
]
Cyan8802_3373
Transporters [BR:
cyh02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Cyan8802_3373
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MS_channel_2nd
MS_channel_3rd
MS_channel_1st
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACV02202
LinkDB
All DBs
Position
3439295..3440881
Genome browser
AA seq
528 aa
AA seq
DB search
MIKKLLKLLVIALISCLIVLPLNAQILVLPELNNTNTWLPTNNNSAEVSACIRLDGLCLF
EVSATASDIAERVQQIEQRLHRISNLYFYQQDATLTIEKRTVNNLPNIHVKVNDLEIRLL
TITSLDIKNQGVDLETKAQEIIEQVQEGLERGRKERELVSLVQKGLIAFIIFGLLLILNF
LVLRLIKRLNTYRDRVAELRINQPISTELTRRQQWNIREVQYRLLQLLEVGLWLGATLVI
VGLFPYTRIAQIWLITLLRIPARITIVGLGTYLLIRLSYALIAKLSTLLFSQDVLDFEFN
QRLQLRLRTISLVSRSIITIIWVMVGIIVALSVIGVNIAPLLAGVGILGVAVSLASQNLI
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LSSNWSRADLSIPVAYESDIDEVLTLVHQVAEEMTKDKIWQENILETPEILGVDNFSERG
LIIRVWIKTKPLKQWDISREFRRRLKIAFDRQGLPLSLPQQKLWLTNI
NT seq
1587 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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caaaaactttggttaacgaatatatag
DBGET
integrated database retrieval system
