Rippkaea orientalis PCC 8802: Cyan8802_4502
Help
Entry
Cyan8802_4502 CDS
T00968
Name
(GenBank) protein of unknown function DUF490
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
cyh
Rippkaea orientalis PCC 8802
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cyh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cyh02000
]
Cyan8802_4502
Transporters [BR:
cyh02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Cyan8802_4502
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACV03284
LinkDB
All DBs
Position
complement(4656765..4662710)
Genome browser
AA seq
1981 aa
AA seq
DB search
MTNITPNPPPEPSESNHLLTRLTNFIKKPSTLIVGGMLLTVGVTTYAGLNYFVHQKLSPL
LSRELSKLLQREVKIGEVESFYFNQVRLGFSTIPATKTDTDYLEIKAIAIGFNPFPILIG
KPLAVNITLNHPTFYIEQDQKGEWLQLPTIKEEGELNLPIGIKTKVRLDNTNIQFRPHGL
KKSLNLDLEGEAGYVYQSNDNQWINYDVAANIFQSNINIKGETHLKSWKTQADLTVNQLD
LPQLVSFVPNLPLTLKSGQVNGNFNLLFNALDNLEENQSLGQVNISSIEADIKPLQVPLK
ANLNLEFEGKNILFKNTEISLGKLVTEITGSINWQKGYNLNFNINPISLSNLVKIIPSKL
PLSLQGELAGKIKLNGELTNPILTGSINNTKSLLIDQIAIKNLKANFTANLDQVQLQQLQ
ILPTAGGRMTAKGKLETGILKSIQKQEAINWQKMPLLFGFEAQLPTQKLLTPYLQTSQKF
SLGNITAKGSLSRTLGNPLGKIEWQTANLIRVSGEQISGQGNLLLSGTNILLKDTVLRST
GGNITVNGLGNFKANQWQTNLTANSFVLNPLLTVACSFISCSDKILSQAIALNKANLNLS
GKLNSFEPRTFNGKGNFLINLDGGVVAINSNLSQGNLNATASLSEINLDPFLTTVTVPIK
LAQTNVNFSGSIEEIFRDSTFNINSLSANGNLQLVVAGSPINSNFNLGNGIVGLETQISQ
LALNQVIPNLPIESRLISSNFTLTGNLNSLIKSLGKSPDFTSFQANGTARLAVNNGQVNV
TGRLNNGQISAMVNLGELSLDKMIPELPIAAQLIGGKINLSSPLTPLLSTTPNLDNLNAT
INLQLATAQGRINSNTQLHGNQWNTNITGSNLNSALILSQIAPQLSSLEISDLNSKINLS
GSLKGIFQGQTTIPIQVNTIAFQTNGQMLKGQGSILLSNLLTNPDITKIDLSVNASSNFE
QLPLIQLMSLIPLDKKLLPEELSLKGKGQFTGQFIAKNLLTSPNIPGNIQLLGNLKLTNF
AINNRIFEPSLSGKLNVIPGKTIALNLKGKQDTILAKLTACNQNNCPIPYLPVSFELRQT
FGEQIPIIATGKLQNNRLITQIQAFPLDLFNITPGQQYGILGVINGSLDTQIEIDPFTLQ
GWGKITIQQPRLGFIKAEKFTAEVSYNNNIAALSNARLILGQSNYNLNGSINLKSGALQG
NLNIEQGYIEDLLTALRISNVERFLHLIQLQPIDYATSEKIGIQSAGNANRTIAEQVNLL
AIIDQKIRQLANEREAGSIPTELDLRGRFNTNISLTGTLFNPTINVAFSGKKWEWHPQKA
FPDIVEPLGLVIRDQKFIPINQVQLQANLSNGVIAIETAKIQIKETLLSLDGKFSLEQIA
ANWNIQRLSLDTTRNFVPIPVDISGDINLAGKLEGTLFNPQIKGQFSLVDASFQGRFLNQ
IIAGQFNYQDQQLKLLTTDPSFVYSAISVPFPIYPDNNTFDIDIRLDNNALQLIGILTQE
QIVLSGGEGEIIAKATGRIDLNQGLRLYDLNAQGNVNLNQIILRSPTLPEPLTITGQIII
DDQTIQVPQLQGTFAKSTLAMTGILPLFESNSQIETPLTVAIQQGKIDLQGLYNGQIEGN
IIVTGNAIKPIVGGQIILANGEVFIPQTPDTNQAEPIAAFNQWSKIRRQAIQSEKSLAFI
PELQDFRVSLQGLSIESLPIYQFQFGGDLLINGHLNNFATLQPEGSIIINRGLINFLETR
FFMERRHLNQVVFQPEQGLLNPELDMQLRTIVSEVPNTTKQLRTGETSEIPDDSLNKVQR
IDINLALKGSLNQLIPNLNQDQTEVCQIRNPLQPIRTETTFSEAELEQLETCLTLLANQR
QGTPDEQLLSNPVISLTSNPPRSQGEIVRLLGEQLFVLADALQGQNTEQLIQFGIVQLAL
PMVFQTIIYDIETAVSDTIGSTDFRVVPFLETIYEVENKGFVRLSYDYGFNEFRVRYEKR
F
NT seq
5946 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactaatataacacctaatcccccaccagaaccgtctgaatctaaccatttattgact
cgattgactaattttatcaagaaaccttctacgcttattgtagggggaatgttgttaaca
gtgggagtgacaacctatgcaggacttaattattttgtgcatcaaaagttatctcctctt
ctttcaagggaattaagtaaacttttacaaagggaagttaaaattggagaagttgaaagt
ttttattttaatcaagttcgtctaggtttttcgactattccagcaactaaaaccgataca
gattatctggaaattaaagcgatcgctattggttttaatccctttcctattttgattggc
aaacctttggctgtcaatattactcttaatcatcctactttttatattgaacaagatcag
aaaggagaatggttacaattaccaacaataaaagaagaaggagagttaaatcttcctatt
ggtattaagactaaagttcgtttggataatacaaatattcaatttcgtccccatggattg
aaaaagtctttaaatctcgacttagaaggggaagcaggttatgtttatcaatccaatgac
aatcaatggattaattatgatgttgctgctaatatttttcaaagtaatattaatataaaa
ggagaaactcatcttaaaagttggaaaactcaagcggatttaacggttaatcaattagat
ctccctcagttagtttcttttgttcctaatttgcctctaacccttaaaagtggtcaagtc
aacggtaattttaatctgttgttcaatgctttagataacctagaagaaaaccaaagttta
ggacaagttaatatttctagcattgaagcggatattaaaccacttcaagttccccttaag
gctaatttaaacttagaatttgaaggtaaaaatattttatttaaaaatactgaaattagt
ttaggaaaattagttactgaaattacagggtcaattaattggcaaaaaggatataatctt
aattttaatattaatcccatttctttaagcaatttagttaagattattccgagtaaatta
ccccttagtttgcaaggtgaactagctggaaaaatcaagttaaatggagaattaactaat
cctattttaacgggttcaattaataatactaaatcgctattgattgatcaaattgctatt
aaaaatctcaaagctaattttactgctaatttagatcaagtccaacttcaacaactgcaa
attcttccaactgcggggggaagaatgactgctaaaggaaaactagaaacaggtattctt
aaatcgattcaaaaacaagaagctattaattggcaaaaaatgcccttactgtttgggttt
gaggcacaattacccactcaaaaacttttaactccctatcttcaaacttcccaaaaattt
agcttagggaatatcacagcaaaaggttcacttagcagaacattaggcaatccattaggt
aaaatagaatggcaaactgctaacttaattagggtatcaggagaacaaatttcaggacaa
ggaaatcttctgttatcgggaactaatattttacttaaagatacagttctgcgttctaca
ggaggaaatattacagttaatggattagggaattttaaagctaatcaatggcaaactaat
ttaaccgctaattcttttgttcttaatccgttgttaacagtagcttgttcatttattagt
tgttctgataaaattttaagtcaagcgatcgcgcttaataaagctaacttgaatttgtcg
ggtaaattaaattcttttgaacccagaacgtttaacgggaaaggcaattttctgattaat
cttgatggaggtgttgttgcaattaatagtaatctttctcaaggtaatctaaatgctact
gcttctctttcagaaattaatcttgatcctttccttactactgtaacggttcccattaaa
ttagcacaaacaaacgttaatttttcgggttctatagaagaaatttttagagattcaacc
tttaatattaattctcttagtgccaatggtaatttacagctagtcgtcgcaggaagtcct
atcaatagtaactttaatttaggcaatggaatcgtaggattagaaacacaaattagtcaa
cttgcacttaatcaagttattccgaatttaccgattgagtcgcgtttaattagtagtaat
tttactttaacaggaaatcttaattctttaattaagtctttgggtaaatcacctgatttt
actagctttcaagcgaatggtactgcaagattagccgtcaataatggacaagttaatgtt
actggaagactcaacaatggacaaattagtgccatggttaatttaggagaattatctctt
gataaaatgattcctgaattgcccatcgcagcgcaattaataggaggtaaaattaattta
tcgagtcccctgacccctttactttctacgactcctaatttagataatctcaacgctact
attaatttacaactggcaacagcccaaggtagaatcaatagcaatacacaattacatggc
aatcaatggaatacgaatattactggatccaacctcaattctgctctcattttaagtcaa
attgcgccacaattgtcatcactagaaatttccgacttaaattctaaaattaatctttca
ggtagtctcaagggcatttttcaaggacagacaactattccgattcaagttaatacaatt
gcctttcaaaccaatgggcaaatgttaaagggacaaggtagtattttattatctaatctt
ctgacaaaccctgatattaccaagatagatttatccgttaatgctagttctaactttgag
caattacccttaatccaattaatgtctcttattcccttagataaaaaattactccccgaa
gaacttagtttaaaaggaaagggacaatttaccggacagttcattgctaaaaacttgtta
acttctcctaatattccaggcaatatacaattattaggcaacttaaaattaactaatttt
gcgattaataatcgcatttttgaaccaagcttaagcggaaaactcaacgtaataccagga
aaaactattgctttaaatctaaaaggtaaacaagatactatcctagctaaattaactgct
tgtaatcaaaacaattgtcctattccttatcttcctgtttcctttgaattacgtcaaacc
tttggagaacaaatccctattatagccacaggaaaactacaaaataatcgactaatcacc
caaatacaagcgtttcctttagacttatttaacattacaccaggtcaacagtatggtatt
ttaggggttataaatggatctctagatactcaaattgaaattgatccctttacccttcaa
ggatggggaaaaattaccatccaacaacccagattggggtttattaaagcagaaaaattt
accgcagaagttagctataacaacaatattgctgccttaagcaatgctagattaatatta
ggacaaagcaattataatctcaatggttctatcaacctaaaatctggtgcattacaaggt
aacttaaatattgaacaaggttacatcgaagatctactaactgctttaagaatatctaat
gttgaacgatttttacacttaattcaattacaaccgattgactatgctacatccgaaaaa
attgggattcaatctgccggtaatgctaatagaactatcgctgaacaagtcaatttactg
gctataattgatcaaaaaattcgtcaattagccaatgaaagagaagcaggatcaattcca
actgaactcgatctgcgaggacgttttaacacaaatatttcacttactggaacgttattt
aatcctactattaatgtagcattcagtggtaaaaagtgggaatggcatcctcaaaaagcg
tttcctgatattgttgaacccctaggtttagtcattcgagatcaaaaatttattcccatt
aaccaagttcaactacaagctaatttaagtaatggtgtgatcgctattgaaacagctaaa
atacaaattaaagaaaccttattatctctagacggaaaattctctttagaacaaattgct
gctaattggaatatccaacgattatctctagatactacccgtaactttgttccaattcct
gttgatatttctggtgatattaacttagcaggtaaactagaaggaacactgtttaatcct
caaattaaaggacaattttctctggttgatgcgtcatttcaaggacgatttttaaatcaa
attattgctggacaatttaactatcaagatcaacagcttaaactattaacaactgatccc
tcttttgtctatagtgccatcagtgttccttttccaatttaccctgataataataccttt
gatattgatataagattagataacaacgcactacaattaatcggtatattaactcaagaa
caaattgttttaagcggaggagaaggtgaaattattgccaaagcaacaggacgcattgat
ctcaatcaaggattaagattatacgacttaaatgctcaaggaaacgttaacttaaatcaa
ataatattgagaagtcccaccttacctgaacccctaacaattactggacaaattatcatt
gatgatcaaaccatacaagtcccccaacttcagggaacctttgctaaaagtaccttagca
atgaccggaattttacccttgtttgagtctaattcccagattgaaacccctttgactgtt
gctattcaacaaggaaaaattgacttacaaggattgtataatggacaaatagaaggaaac
attattgttacaggaaatgccattaaacccattgtaggaggtcaaattattttagccaat
ggggaagtttttattccacaaactcccgacactaatcaagcagaacctattgctgctttt
aatcaatggtcaaaaattcgtcgtcaggcaattcagtcagaaaaatccctagcatttatc
cctgaattgcaagattttagagtcagtttacaaggactatccatagaatctttacctatc
tatcaatttcaatttggaggagatttacttattaatggacatctcaataattttgctact
ttacaaccagaaggaagcattattattaatcgaggattaattaattttcttgaaactcgc
ttttttatggaacgtcgtcatcttaatcaagtggtttttcaacccgaacaaggattatta
aaccctgaattagatatgcaactaagaaccattgtttctgaagttcctaataccactaaa
cagttacggacaggggaaaccagcgaaattcctgatgatagtttaaataaagtccaacgg
attgatattaatttagcccttaaaggttctttaaatcaattaattcctaatcttaatcaa
gatcaaactgaagtgtgtcagattagaaatccgcttcaacccatacgaactgaaacaacc
ttttctgaagcagaattagaacaactagagacttgcttaaccctcttagcgaatcaacgt
caagggacaccagacgaacaattattgagtaatcccgttatcagtttaacaagtaatcct
ccacgaagtcagggggaaattgtgcgattattaggcgaacaactatttgttttagctgac
gcattacaaggacaaaataccgaacaattaatccaatttggaattgttcaattagcctta
ccgatggtttttcaaaccatcatttatgatatagaaacggctgttagtgataccattggt
agtactgattttcgagtcgttccgtttttagaaaccatttatgaagtagaaaataaagga
tttgttcggttatcctatgattatgggtttaatgaatttcgagtgcgttatgaaaagcga
ttttag
DBGET
integrated database retrieval system
