Cyanobium sp. NIES-981: CBM981_1050
Help
Entry
CBM981_1050 CDS
T04888
Symbol
mexF
Name
(GenBank) Multidrug efflux RND transporter MexF
Organism
cyi
Cyanobium sp. NIES-981
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SBO42761
UniProt:
A0A182AP76
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(939883..943038)
Genome browser
AA seq
1051 aa
AA seq
DB search
MKSISDPFLRRPVLTLVISLLVLLAGLVSLPGLQIENLPAIAPGRVTVSASYPGASPEVV
EQGVTTLLEKQLNGLERLDQVRSTSSAGSSSITLSFEGGDPEINQINAQNEAAVVNPRLP
PQVARFGVRVRRSSDDLLMVLSFSADRGRYDDTFLSGWVEQVVVDRLQRVSGVGEARLFG
GSPLAFRLWLDPARLNQLGLTITDVRDALEEQNVLAALGQAGDAPAPEDQMLTLPLRMEG
RLRSVQEFERLVVAPTPEGGVTLLRDVGRVTLGSENYDAIATNLQGRATVAMGIFQRDGS
NALEVSRGISTALEEISESLPPGVEFQVIIDEAETVRQNIDRTVASLRDAVLLVFLALLL
GLGNSRLAFISALVVPVALVGALTVLRLTDSSINTLTLFGMVLATGLVVDDAIVVSEDIG
RRIEQGHPPLLAAREAMAELGGAVVATSLVLIAVFLPVLTLGGSTGRLYAPIGLTIGATI
VFSTFNALTFTPVAASRLLRADGRGEPAWLRRWIDPPRRALESLEGPYDRWLTRALGWRR
RIVALLLVGLLLTAAAYQQRPKAFIPQEDGSQLRGVVVLPDGMALARTQAVMERVRQVIA
RDPLVVTGNFYAGRSFGDSAPNKGIFFLRLKPVEERPGSDQTPAALASRLNRQLAASIDD
AQVVVIEAPTVRGFGSEGGIEFDLLDTSGGRLSLREFEQAAQAFIEAAEATGAFERVNTR
FVADAPLVRLEPDRLRLASLGVDLEDVVEVLGASFGSDYVNDSFEGDRVRRVIVQLEGSE
RRNVQDVLSLQVRGRDDVLIPLAQVVRVVEGTGPTVINHTRLVRSIGIRAQPRNGVSTGQ
AMARLQEVRQQLGSSATDLEWAGLAREEARAGGASEQVFLLAVLVMLLVLAGLYENFIDP
MIILVTVPLGLLGGIAGLAIRDLPLDVYGRMGLLVLVSLAAKNGILIVEFANQRLAAGMP
LEQAIHGAAVARLRPILLTAISSLAGFLPLLFASGAGAASRTSIGTVVFAGLLVATVLSL
FVVPVIYRIVKGWELRRRPPQASPDSGSEAF
NT seq
3156 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaaatcgatctcggatccctttctgcgccggccggtgctcacgctggtgatcagcctg
ctggtgctgctggccggattggtgagcctgcctggcctgcagatcgagaacctgcccgcc
atcgcccccggccgggtcacggtgagcgccagctatccgggggccagcccggaggtggtg
gagcagggggtcaccaccctgctggaaaagcagctcaacggcctcgagcgcctcgatcag
gtgcgctccaccagttcagccggcagcagcagcatcaccctcagcttcgagggcggcgat
ccggagatcaaccagatcaacgcccagaacgaggcggcggtggtgaacccgcgcctgccg
ccccaggtggcccgcttcggggtgcgggtgcgccgcagttccgacgacctgctgatggtg
ctcagcttcagcgccgatcggggccgctacgacgacaccttcctgagcggctgggtggag
caggtggtggtcgaccgtctgcagcgggtgtcgggggtgggggaggcgcgcctgttcggc
ggcagccccctggccttccggctctggctcgatccggcccggctcaaccagctggggctc
accatcaccgacgtgcgggacgcccttgaggagcagaacgtgctggcggccctgggccag
gccggtgacgcccctgcccccgaagatcagatgctcaccctgcccctgcgcatggagggg
cgcctgcgcagcgtgcaggagttcgagcggctggtggtggcgcccacgccggagggcggg
gtgaccctgctgcgcgatgtgggccgggtgaccctcggcagcgagaactacgacgccatc
gccaccaacctgcagggcagggccaccgtggccatgggcatcttccagcgggacggcagc
aatgccctggaggtgagccgcggcatcagcacagccctcgaggagatcagcgaaagcctg
ccgccgggggtggagttccaggtgatcatcgacgaggccgagacagtgcggcagaacatc
gaccgcaccgtggccagcctgcgggatgcggtgctgctggtgttcctcgccctgctgctg
ggcctgggcaacagccgccttgccttcatctccgccctggtggtgccggtggcgctggtg
ggggcgctcacggtgctgcggctcaccgacagctcgatcaacaccctcaccctgttcggc
atggtgctggccaccggtctggtggtggatgacgccatcgtggtgagcgaggacatcggc
cgccgcatcgagcagggccaccctcccctgctggcggcccgggaggccatggccgagctg
gggggggcggtggtggccacctccctggtgctgatcgccgtgttcctgccggtgctcacc
ctgggcggcagcaccggacggctctatgccccgatcggcctcaccatcggcgccacgatc
gtgttctccaccttcaacgccctcaccttcacgccggtggcggccagccgcctgctccgg
gccgatggccgcggcgagccggcctggctgcgccgctggatcgatcccccccggcgggcc
ctcgagtccctggagggcccctacgaccgctggctcacccgggcgctgggctggcggcgc
cgcatcgtggccctgctgctggtggggctgctgctcaccgcggcggcctaccagcagcgg
cccaaggccttcatcccccaggaggacggcagccagctgcgcggcgtggtggtgctgccc
gacggcatggccctggcgcgcacccaggcggtgatggagcgggtgcggcaggtgatcgcc
cgggaccccctggtggtgacgggcaacttctacgccggccgctccttcggcgacagcgct
ccgaacaagggcatcttcttcctgcgcctcaagcccgtggaggagaggccgggcagcgat
cagacccccgccgccctggccagccggctgaaccgccagctggccgccagcatcgatgac
gcccaggtggtggtgatcgaggcccccacggtgcgcggtttcggcagcgaggggggcatc
gagttcgacctgctcgacaccagcggcggccggctcagcctccgcgagttcgagcaggcc
gcccaggccttcatcgaggcggccgaggccaccggtgccttcgagcgggtgaacacccgc
ttcgtggcggatgcgccgctggtgcggctggagcccgaccgcctcaggctggcctccctc
ggggtggatctcgaggacgtggtggaggtgctgggcgccagcttcggcagcgactacgtg
aacgacagcttcgagggcgaccgggtgcggcgggtgatcgtgcagctcgagggttccgag
cgccgcaacgtgcaggatgtgctctcgctgcaggtgcgggggcgggacgacgtcctcatc
cccctggcccaggtggtgcgggtggtggagggcacgggccccacggtgatcaaccacacc
cgcctggtgcgctcgatcggcatccgggcccagccgcggaacggggtcagcaccggtcag
gccatggcccggctgcaggaggtgcgccagcagctgggcagctccgccaccgacctggag
tgggcgggactggcccgggaggaggcccgcgccggcggggccagcgagcaggtgttcctg
ctggcggtgctggtgatgctgctcgtgctggcgggcctctacgagaacttcatcgacccg
atgatcatcctggtcacggtgcccctgggcctgctcggcggcatcgccgggctggcgatc
cgcgatctgcccctggatgtgtacggccggatggggctgctggtgctggtgagcctggcg
gccaagaacggcatcctgatcgtggagttcgccaaccagcgcctggcggccgggatgccg
ctggagcaggccatccacggcgccgccgtggcccgtctgcgccccatcctgctcacggcc
atctcctcgctggccggcttcctgcccctgctgttcgcctcgggcgccggggcggccagc
cgcaccagcatcggcacggtggtgttcgccgggctgctggtggccacggtgctgagcctg
ttcgtggtgcccgtgatctacaggatcgtcaagggttgggagttgcgccgccgtccccct
caggcatccccggacagcggctccgaagccttctag
DBGET
integrated database retrieval system
