Gloeothece verrucosa: Cyan7822_6073
Help
Entry
Cyan7822_6073 CDS
T01310
Name
(GenBank) TRAG family protein
Organism
cyj
Gloeothece verrucosa
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TrwB_AAD_bind
T4SS-DNA_transf
TraG-D_C
AAA_14
AAA_16
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADN17915
UniProt:
E0ULT5
LinkDB
All DBs
Position
Cy782201:746189..748066
Genome browser
AA seq
625 aa
AA seq
DB search
MSSQVESVPHNPSIVSIDFGRLLGKYATPEGALMLGLLVVSLLLTKLGGSSAKLTSGRFC
GRKELCRATATALKQIEEKKCQPVTLWAGTPKYWLGGKLKGLSAFIQTLLGSSPTVWFPH
AERGILVIGAPGSGKTASVIDRAIESAMRQGHSILVYDKKGDQVRLHAALATRYGYSVEV
FAPGYSYSGVINPLDFVTGPEDTTMAGEIGKIFTSSSRTGESKGNEFFETAGEMLARGLV
QLAKASNYRDLAQVYAFIQLPNFVERIYHSIYRPDKHPLKMNPWIAPSFSQLMSSKDAEK
TVAGIKATAEMVYSAFIQRDLLRAFIGKSTIPIKLKEKQILFFQLDDERRTVLAPLIAAA
LHLCIVSNLSQKRTNPFCYFLDEFPSIGRLPRTVNYVNEYRSNGGVPVLGIQSLEQLYDT
YGERQGKAIASALSTHVLFYPGDYNTAEQYSKRYGETEVVIRSRSTGNSYGGSQTSRSTN
WSEQIHKKPLLSPDEILRFPQGECVITSPAYGSGKEALFPYKLKIPIEQREFKRASESEA
LWDSVIRPQLEQRAFNWAKLQELDEENLHLEITKRIEEAFRMLPMPGELADGVVDKNNSD
YKEQMKKIVAQTLKKLPIDLSRLAA
NT seq
1878 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgagttctcaggttgagtccgttcctcataatccctcgattgtttccattgatttcggg
cgtttattgggcaaatatgcaacgccagaaggagcattaatgctcggtttactggtggta
tcgttattgttgaccaaattaggcggctcttcggctaaactgacatcaggacgcttttgt
ggacgaaaagaactctgtcgtgctacggcaactgccctcaaacaaatagaggaaaaaaag
tgtcaacccgtgacattatgggcgggaacaccaaaatattggttagggggtaaattaaaa
ggattgagtgccttcatccaaaccctgttaggttcatcgcctacggtatggtttcctcac
gctgaacggggaattttagtgattggtgcgccgggttcgggaaaaaccgcttccgtgatt
gaccgggcgattgaatcggcgatgcgccaggggcatagtatcctagtctatgataaaaag
ggagatcaggtgcggcttcatgcggctttagccacccgttatggttatagtgtagaagtt
ttcgcgcctgggtacagttacagtggagttattaatcccctggattttgtcacaggaccc
gaagacacgacgatggccggggaaatcggcaaaatttttaccagtagtagccgcactggc
gagagcaaaggcaatgaattttttgaaactgccggggaaatgttggcacgagggttagtg
caattggccaaggcgagtaactaccgtgatttagctcaagtttatgcttttattcagttg
ccgaattttgtggaacgcatctatcattccatttaccgccccgataaacatcctttaaaa
atgaatccttggattgctccctcgttttctcagttgatgagttccaaagatgcagagaaa
acggtcgcgggaatcaaggccaccgcagagatggtttatagtgcctttattcaacgtgat
ttactacgggcgtttatcggtaagagtacgattcctattaagcttaaagaaaagcaaatt
ctcttctttcagttggatgatgaacgtcgcacggttttagcaccgttaatcgccgcagca
ctccatttatgtattgtttctaatctctcgcaaaaacgcactaatcctttttgttatttc
cttgatgagtttccttctatcggtcggttgccacgcaccgttaactatgtcaatgagtac
cgttctaatggcggtgtacccgtcctcggtattcaatctctagagcaactttacgatact
tatggtgagcggcaaggaaaagcgattgcttctgccctttctactcatgttttattttat
ccaggggattacaacacggctgaacaatattcgaaacggtatggagaaaccgaggtggtt
atccgttctcgcagtaccggcaattcttatggcggttctcaaacgagtcgttctactaat
tggagtgaacagattcataaaaaaccgttactctcaccggatgaaattttaaggtttccc
caaggcgaatgtgtaattacttctccggcttacgggtcgggtaaagaagcactttttccc
tataagttaaaaattccgattgaacagcgtgagtttaagcgagcgagtgagtctgaggcg
ttatgggatagcgtgattcgaccccaattagagcaaagggcttttaattgggctaaatta
caagaattggatgaagagaatttgcatcttgaaattaccaaacgaattgaggaagcgttc
cgtatgctgccgatgccgggtgaacttgctgatggggtggtggataagaataattcagac
tataaagagcaaatgaaaaagattgttgctcaaacgttaaaaaaacttcccattgatttg
agtcgtttggcggcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
