Rippkaea orientalis PCC 8801: PCC8801_2674
Help
Entry
PCC8801_2674 CDS
T00806
Name
(GenBank) protein of unknown function DUF490
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
cyp
Rippkaea orientalis PCC 8801
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cyp00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cyp02000
]
PCC8801_2674
Transporters [BR:
cyp02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PCC8801_2674
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACK66675
UniProt:
B7K519
LinkDB
All DBs
Position
2756375..2762302
Genome browser
AA seq
1975 aa
AA seq
DB search
MSQSPTPQPSPSTFVGRLLRRLTHPATIAIGVGSVTVVLIGYTGLRLFLKEYLPPWLETQ
VSYIINRPIKIGELQDFSLTGLSLGSTSIPVTPDNPNQITISKINVKFNPLAVVFRRTLP
ITISPQKVDVDVFQNAQGQLLTIDVEESKLPVKLDLTFKVEKADINVFPYQKKQPLEVQF
KGEARYLEEDVAKWQYDLNLALLNSQVKLQGETICSTTESNIKLNVEKLDFSSLTSFIID
FPLRLNSGNVQANLNIQSPSLKEFQGTQAQGNVNLSNLQGQVKPLTKPFEVLSNISFKNN
KVLVKNARLTIGQITAKLGGEYDWNTGSNLVVNLEGLTGKNLRQVLPPSFPLQVEGELDA
NFKLTGQLNKPLLKGKINNKKAVTVLKTKFDQVAVNFQTNFNDFLLQNVSIKPQVGGEIR
AQGTLKPNLLISLTNSQKIDWKKIPFQLIFKTELPTQKLIADYYKLPDLVSLNSLTSQGR
ITGTLANPNGLIQWQTSGDLTTANTRVINEGTLVVQNKNILVKNTELVTNEGKISFNGSG
SWLTKRWQGYLSSQGLSLNPFTSLICQSKQLVCPENVKLNTANIRLGGDLNKPGTTGLNL
VANLGLTINQGTLVINSQLQQDNLTTSITGFKVPIAAKFMNIAVPITLKQSRINLGGKLS
QIWQNSTVNLDAIQANSNLELGIAESTLTVAGRLQKGFLQGDANITPLSLNQFLPQVPIP
VQLAKSKIEVSGDVKSLLPLGQPPNFNTLKIKGNSQFAIANGTLTAISQLNQGKIDLNAT
ATPIILSNLLPQISPPIALKQTNVNLTGNLSDLISFNFKKFQGNAQVRLGIANGEINTST
QLINQQWNSQIIANNLDATTVNNPLLKLENLDRINAKINLAGRLNNLLSSESLLAIQAKL
ISVQMGQQILTANGNILVTNLWKKPDIKQVSLNLNTQANLATLPLTQLVAKLPIKRQLLP
NVIELAGRGNFQGNLVGKNLLTSPLSPGNLQLNGTLKLANFGINNVLFDPLLRGTVKIAT
GGQLSVNLTGQEDIITAVFNPCKQANCLLPYIPQSFKITQSYNNSTPIIVQGNRENNILV
TQVQNFPLELLTIAPVSNYGFYDYLGGKVNINAQIDTLSLTNSGTLTILNPELGKIVGNR
FDAAWVYKHGKITLENTSLKLGETRYEVVGGLNLKSGEIQGKLNVDRGYIQDILTALNIS
DLDSLWRTLRLKKPPLGDTKGLQTESVGNRNAPLSEQVNQLWNNDQKIQAIATKRQAGDI
PRQLNIRGQFAAEIGLSGTLEKPEMSLNFQGNQWQWTPQRSGPAIINPLGFVIEGAQVIP
IEKLAIEGSLKEGIIQFNPSLKLGSSLTQGNLSLIYQNNQFYIKDSSFSFENLSLDTVRS
LIVVPGDINGNLNLQGTLKGLLTEPKIEGEFQFSDGSIYARLIQDTFKGNFIYENAQVKV
QINEPTYLQVSANLPFPIQPDINDKFQINTQIETEAFSLLETLTKQQLIWSGGEGSLDIN
LSGRILINDTIKISLDQTTKAILDFNNTLFQTDLFTEPLNLNGQISLQNGRLQTAQLTGT
IGERTIRTIGVLPLFPDASANIETAVPFTIALTQDQVNSEGLYQGLADGRIIITGSLINP
TIGGEVRLTQGKIVIPDVRELQKQPSPVFNQWIGNLRPLEGVLLPPTFNNLRILIDQVAV
EQTKISPRFNLNLSGDLSLNGQLNSFSLPGVLALKPSGSVKVNEGKIDIPLTSVFLSRQY
DNTITFLPEQGLLNPSIDLTLKLYILSVSLQTIRDNEIPDDLIQTGRSKSIEVNLGIQGQ
ASELLPNLGSRFQQICQLRTEDYPPVPQSPAIPTNKLQQLAECIQINNLGANSIADLIRS
PIVSFSSNPRLSNSELFTLFSQQLPNLLGNSQVGNSTQLVNARSPQIALVLLPFLQDWIF
ELNENINQKGSEPGMVNFRVFPSLETIYQLEGDALIRFSYDYSFNEAIIRYENKF
NT seq
5928 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtcagtcgccaacacctcaaccttctccgtctaccttcgttggtcgtctcttgaga
agactgacgcaccccgctacgattgctataggggtaggttctgttacggtcgttttgatt
ggctatacaggtttacgtctgtttcttaaggaatatcttcccccttggttagagacacaa
gttagttacattattaatcgtcccatcaaaataggggaattacaagacttttctctgacg
gggttatctttgggttcaacgtctattccggttactcctgataatcctaatcaaataaca
attagtaaaatcaacgttaagtttaatcccctcgctgttgtttttaggcgcactttaccg
attacgatttcccctcaaaaagtcgatgttgatgtctttcaaaatgcccaaggacagtta
ttgacaatagatgtagaagaaagcaaacttccggttaagttagatttgacttttaaggtt
gaaaaggctgatattaatgtctttccctatcaaaaaaaacaaccccttgaggttcaattt
aagggagaagcaaggtatcttgaggaagatgtagcaaaatggcaatatgatctgaatttg
gctttactcaatagtcaagttaagttgcaaggagaaaccatttgtagtaccactgaaagt
aacataaaattaaacgttgaaaagttagattttagttctttaacctcttttattattgat
tttcctcttcggttaaattcaggcaatgttcaagctaatctcaatattcagtccccttcc
cttaaagagtttcagggaacgcaagcacaaggaaatgttaatttaagtaatcttcaaggt
caagttaagccattgactaaaccttttgaagttttaagcaatatttcgtttaaaaacaac
aaggttttagtgaaaaatgctcgattaactattggtcaaattaccgctaaattaggggga
gaatacgattggaatacggggagtaatttggttgttaatcttgaggggttaacggggaag
aatttacgtcaagttttacccccttcttttcctcttcaggttgaaggagaattagacgct
aattttaagctaacaggacagctaaataagcctttattaaaagggaaaataaacaataaa
aaagccgttacggttttgaagacaaaatttgatcaagttgcggttaattttcaaaccaat
tttaatgattttttattgcaaaatgtatctattaagccccaagtagggggtgaaattaga
gcacaaggaacccttaaaccgaatcttcttatatccttgactaattctcaaaagatagac
tggaaaaaaataccttttcaattaatttttaagacagaattaccaactcaaaaattgatt
gcagattattataaacttcctgatttagttagcttaaatagtctaacaagtcaaggaaga
attacaggaactttagctaatcccaatggcttaattcaatggcaaacatcgggagatctc
acaacggctaatactagggtaataaacgaaggcactcttgtagttcaaaataaaaatatt
ctggttaagaatacagaattggttactaatgaagggaaaataagctttaatgggagtggt
agttggttaacaaaaagatggcaaggatatttaagttctcagggattatctttaaatcct
tttacttcacttatttgtcaaagcaaacaattagtctgtcctgagaatgttaagttaaat
actgctaatattagacttggtggagatttgaataaacccggaacaacaggactgaattta
gtagcaaatttaggacttacaatcaatcaaggaaccttagttattaatagtcagttacaa
caagataatctaactacatcaataacaggattcaaagtgcctatagcagcaaaatttatg
aatattgctgttcctattacgttaaaacaatctcgaattaatttaggaggaaagttaagt
caaatttggcaaaactcaaccgttaatttagacgctattcaagcgaatagtaacctcgaa
ttaggaattgccgaaagtaccctaactgtagcaggaaggttacaaaagggtttcttacaa
ggagacgcaaatataactcctttatccctgaatcaattcttgcctcaagtacccataccc
gttcaattagctaagagtaaaattgaggtttcaggagatgttaaatcattactgccttta
ggacaacctcctaactttaataccttaaaaataaagggtaatagtcaatttgcgatcgcc
aatggaaccctaacagcaattagtcagttaaaccaaggtaaaatcgaccttaatgctaca
gcaacccctattatattatccaatcttttaccccaaatttcaccccccattgctttaaaa
caaactaacgttaatttaacgggtaatttatcggatttaatttcatttaatttcaagaaa
tttcaaggaaatgctcaagttagattaggaattgctaacggagaaatcaatacatcaacc
caactgattaatcaacaatggaatagccaaattattgctaataatctagatgctacaact
gtcaataaccctctactaaaattagaaaatttagaccgaattaacgctaaaattaatcta
gcaggaagactcaataatctcttatcatctgaatctttacttgctattcaagctaagcta
atctctgtacagatgggacaacaaatcctcactgctaacggaaatatattagtaactaat
ttatggaaaaaacctgatattaaacaggttagtttaaatcttaacactcaagccaattta
gccaccttacccttgacccaacttgtggctaaacttcccattaaacgacaactcctccct
aacgttattgaactagcaggaagaggaaactttcaaggaaatttagtcggaaaaaatctg
ttaacctctcccctatctccaggcaatttacaactaaatggaactctcaaattagctaac
tttgggattaataatgttctctttgatcctcttttaaggggaactgtaaaaatagcaaca
ggagggcaattatctgttaatttaacaggacaagaagatattataacggctgtttttaat
ccctgtaaacaagccaattgtctgcttccttatattcctcaatcttttaaaattacacaa
agttataacaattctactcctattattgttcaaggaaatagagaaaacaatatcttagtt
actcaagtacaaaactttcccctagaacttttaaccattgcacctgtgagtaactacgga
ttttatgattatttaggaggaaaagtcaatattaatgcacaaattgacaccctaagctta
acaaatagtggaactctgactattttgaatccagagttaggcaaaattgtaggaaatcgt
tttgatgctgcttgggtgtataaacatggcaaaatcaccttagaaaacaccagtttaaaa
ttaggagaaactcgctatgaagtggtcggtggattaaatctaaaatcaggagaaatacaa
ggtaaattaaatgttgatcgaggttatatccaagatattctcactgctttaaatatctct
gatttagatagtttatggcgtactttacgactgaaaaaaccacctttaggggataccaaa
ggactgcaaaccgaatcagttggaaatcgtaatgcacccctttcagaacaagtcaatcaa
ttatggaacaacgatcaaaaaattcaagcaatagccactaaaagacaagcaggagatatt
cccagacagttaaatatccggggtcaatttgcagcagaaattggcttatctggaacctta
gaaaaaccagaaatgtctttaaattttcaaggtaatcaatggcaatggactccacaacgg
tctggacctgctatcattaaccccttgggatttgtcatagaaggagctcaggtaattccc
attgagaaattagcaatagaaggaagtctcaaagaagggataattcagtttaatccatct
ctaaaacttgggtcaagtttaacccaaggaaatttatctttaatctatcaaaataaccaa
ttttatatcaaagattctagttttagttttgaaaatttgtccttagataccgtccgcagc
ttaatcgtggttccgggggatattaatggcaatctgaatttacaaggaaccctcaaagga
ctgttaacagaacccaaaattgaaggagagtttcagtttagtgacggctcaatttatgcg
cgattaattcaagatacatttaaaggaaattttatctatgaaaacgctcaagtaaaagtg
caaatcaacgaacctacttatcttcaagtttcagctaatttaccttttcctattcaacct
gatattaatgataaatttcaaattaatacccaaatagaaaccgaagctttctccctacta
gaaaccttaactaaacagcaactaatctggtcgggaggagagggaagcttggatattaat
ctaagcggcagaatcttgattaatgatacaattaaaattagtttagatcaaactactaag
gcgattttagattttaataacaccctttttcaaaccgatttatttactgaaccccttaat
ctaaatggacaaatttctctccaaaatggacgactgcaaacagcacaattaaccggaaca
ataggagaaagaacgattagaacaatcggcgttttacctctatttcctgatgcttctgct
aatattgaaacagccgttcctttcaccatagccttaacccaagatcaagttaactcagaa
gggttatatcaaggccttgctgatggccgtattattattaccggatcattgattaatcca
acgattggaggagaggttagattaacgcaaggaaaaattgtcatccctgatgttagggaa
cttcaaaaacagccttctccagtgtttaatcaatggataggaaatcttagacccctagaa
ggagtactgcttcctcccacatttaataacctcagaattttgattgatcaagtggctgtt
gaacaaacaaaaattagtcctagatttaatcttaatttgagtggagatttaagcttaaat
ggtcaactaaatagcttttctttgcccggagtacttgccttaaaaccatcaggaagcgtt
aaggttaatgaaggtaaaatagatattcccctgacttccgttttcctcagtcgtcaatac
gacaacaccataacatttttacccgaacaaggattattgaatccttccattgatctaacc
ttaaaactctatattctaagcgtttctctccagactattcgggataatgaaatccctgat
gatcttatccaaactggacggtctaaatcaatagaagttaacctcggaatccaaggacaa
gccagtgaattattgcctaatttgggatctcgatttcagcaaatttgtcaattacggaca
gaagactatcctcctgtccctcaatctccggcgattcctactaataagctacaacagtta
gctgaatgtattcaaatcaataatttaggggcaaattctattgccgacttaatccgttct
cctattgtttccttctctagtaatccccgtcttagtaatagtgaattgttcacacttttt
agtcagcaactgcctaatttactaggaaattcacaagtcggaaattcaacgcaattagtc
aatgccagaagtccacaaatagccctagtattactaccatttctacaagattggattttt
gaactcaatgaaaatattaatcaaaaaggtagcgaacccggtatggttaattttcgggta
tttccctcattagaaaccatttatcagcttgaaggagatgctttaatccgcttttcctat
gactattcctttaatgaagcaattattcgctatgaaaacaaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
