Rippkaea orientalis PCC 8801: PCC8801_4560
Help
Entry
PCC8801_4560 CDS
T00806
Name
(GenBank) YD repeat protein
Organism
cyp
Rippkaea orientalis PCC 8801
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
DUF6531
RHS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACK68468
UniProt:
B7K6P6
LinkDB
All DBs
Position
pP880103:5342..9799
Genome browser
AA seq
1485 aa
AA seq
DB search
MTTTLEVLDFNDVDAPIINFPRLANNTITSPIEIIGTVTDYDEDNHDTLQYYTLEVAKLG
TDDFQEVFKGTKSVNNGVLGIFDPSLLENDAYTLRLKAVDRGGNLVFEERTINVEGDLKL
GNFQLSFTDLSIPVAGIPISITRTYDTLTAQERDDFGYGWRLEFRDTNLRTSLGKDDYYE
TFDIIGQGFKEGDKVYLTLPGGKREAFTFKPELDRLGAFLQGAAAGLGLGEDPGLYHPKF
VSESDSNNVLTVKDVLIIRTANGDFAGLAGNLYNPVDPYFGGQYTLTTGEGIVYEIEAET
GDLLTVTDTNNNRLTFSENGIKSETGVEVKFNRDAKGRITSIVDPMGNVIKYDYDGHGDL
IKVIDREENETKFDYSEERKHYLERIIDPLNREAVRTEYDETGRLKKVIDVNGEAVELVY
DVDNSTQTTKGEEGYTTTYTYDEKGNKLTETDALGNTTYYTYGKLNRLLSETDAKGNTTT
YDYGVRTGNLLSTKDALGNITKFSYDSRGNLVSLTDAANNITKFEYDLQGNVTKIIDANG
HETHYTYDSNGNQLTESKTVTTAQGLVTVLTQNTYDKQGNLLSVTDAENNPTYYEYNELN
QQTAVTDTLLRKTEYRYDNKGQLVETIYPDSTPNNNADNPRTITVYDRGSRQKATIDQAG
RVTYYNYDQLGRLIETIYPDEVDTLSQFVSFLDSSKTVTTIDWTEVIYPDSNPSYLSDNP
RTQTEYYQDGQVKANINERGYRTEYIYDANDQLIEIIYPELEYNPGINFTTTSTYDVVGR
KIAETDGLGRTTNYVYDELGRLTKTLFADGTFTTSTYDKLGRRITTTDQEGKVTNYEYDS
LGRLTDVVQYLNQNSLNPTEIRTEYGYDELGRLIWVEDANDHKTNYEYDKLGRRTDIELP
LGQRSTTSYDEVGNIETVTDFNEKIITYFYDEQNRLIKKLFADNSSVDYTYTLTGLRETI
TDSRGTTTYTYDERDRLIAQTDPTGVYLNSGNTLEYSYDLTGNRTSVTTPSGTVYYTFDE
WNRLKTVTDADNHQTIYVYDGVSNLIETTFSNGVIETRDYDDLNRLIKLENKLGNQVISG
YEYTLDKVGNRLKVKEADGRIVEYEYDDLYRLIEEKITDSLDTVNDGRVISYTYDAVGNR
LTKVDSVEGTTTYDYNANDWLLTETEENGDVKEYEYDETTFYQVDGLGSTRILTNEKGEL
INTYDYDAFGNLIESTGDIENNYLFAGEQFDENLGEYYLRQRYYNQEVGRFTRRDTYEGS
LNNPVSLHKYLYANANPVIYIDPTGLYTLTEFSAGQAIADALAISLGISGFISNSYNPER
LGGFGENEKPSTVLDRLLIWRNTWAPESIGGFGENLQPTFPNHTGHSNRDINDLIRYIFA
ISDPFELSNDIAYGHAWNAARNLEWAKLGINSQQQLADLIYDIVIFYEQKKVDGDKIIYL
GSDGTIVIDNPRDPDGGTAFNPNIQQGNSQASQIYFDEQPGRVVD
NT seq
4458 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaccacaacccttgaggttttagattttaatgatgtggatgcccctattattaacttc
cctagattagcgaataatacgattacttcccccattgaaattattggcacggtgactgat
tatgatgaggataatcatgatacgttacagtattatactttggaagtagctaagttagga
accgatgattttcaagaggtctttaaaggaacgaagtcagttaataatggggtcttagga
atttttgacccgtcgttattagaaaatgatgcttatactttacgattaaaagcggttgat
agaggaggtaatcttgtttttgaagaaagaacgattaacgttgaaggagacttaaaatta
ggcaacttccaattatcgtttacggatttatcgattccggtggccgggattcctattagt
attaccagaacctatgatacgttaacggcacaagaaagggatgattttgggtatggatgg
cgattagaatttagggatactaatttaagaaccagtttaggaaaagatgactattatgag
acgtttgatattattggtcaagggtttaaagaaggggataaagtctatcttaccttacca
ggagggaaacgagaagcctttacgtttaagcctgaattagatagattaggggcattttta
cagggggctgctgcggggttaggactaggagaagacccggggttatatcatcctaaattt
gtttctgagtccgattctaataatgtgttaaccgtcaaagatgtgttaattattcggact
gctaatggagattttgcggggttagccgggaatttatataatccagttgacccttatttt
gggggacaatatacgttaacgacaggggagggtattgtttatgaaattgaggcagaaacg
ggagatttattaacggtaacggatacgaataataatcgattaaccttctctgagaatggc
attaaaagtgagacaggagtcgaagttaaatttaatcgagatgctaagggaagaattacc
tcaattgttgacccaatggggaatgtaattaagtatgactatgatggtcatggggattta
attaaggttattgatagggaagagaatgaaacgaagtttgattatagtgaggaaaggaag
cattatttagagagaattattgacccgttaaatcgggaagcggtgaggactgaatatgat
gaaactggacggttaaagaaggtaattgatgttaatggagaagcggttgaattagtttat
gatgttgataattcgacgcagacaactaagggggaagaaggttatacaacgacttatact
tatgatgaaaaagggaataagttaacggaaacggatgcactagggaataccacttattat
acctatggtaaattgaatcgtttattaagtgaaaccgatgctaagggaaatacaaccacc
tatgactatggagtccgtacaggtaatttattgtccacaaaagatgcactaggaaatatt
accaaattcagttatgacagtcgaggaaatctggttagtctaaccgatgcagccaacaac
attaccaaatttgaatacgatttacaaggaaacgttacgaaaattattgatgccaatgga
catgaaacccattacacttatgatagcaatggaaaccaattaactgaaagtaaaactgtt
actactgcacaaggactggtaacagttttgacgcagaatacttatgataaacaaggcaat
cttttatcggtaacagatgcagaaaataaccccacttattatgaatataatgagttaaat
caacaaacagcagtcacagatacactcttaagaaaaaccgaataccgttatgataacaaa
ggacaattagtagaaaccatttatcctgatagcactcctaataataacgctgataatccc
agaacgattacggtttatgacagaggaagtcgtcaaaaagcgaccatagaccaagcagga
agagtcacttattataattatgatcaattaggcagattaattgaaaccatttatcctgat
gaagttgatactttaagtcaatttgttagttttctcgatagtagtaagactgttactacg
attgattggacagaggtaatttatcctgatagtaatcccagttatttaagtgataatcct
cggactcagactgaatattatcaagatggacaagttaaagcgaatattaatgaaaggggt
tatagaactgagtatatttatgatgcaaatgaccaattaattgagattatttatcctgaa
ttagaatataacccaggaattaactttacgacaacttctacctatgatgtagtaggaaga
aaaattgctgaaactgatgggttaggacgaacaactaactatgtttatgatgaattagga
agactcaccaaaaccctatttgctgatggaacctttaccacttctacctatgataaatta
ggacgaagaattaccaccactgaccaagaaggaaaggtaactaattatgaatatgattca
ttaggacgcttaacagatgtggttcaatacctcaatcaaaatagtcttaatcctacagaa
attagaaccgaatatggttatgatgaactaggtcgtttaatctgggttgaagatgctaat
gaccacaaaactaactatgaatatgataaattaggtcgtcgaacggacatagaattacca
ttaggacaacgttcgacaacgagttatgatgaagtcggaaatattgagacggtaacagat
tttaatgagaagataattacctatttctatgatgaacaaaaccgtctaattaagaaactg
tttgctgataatagttccgttgattatacttatacattaacaggattacgagaaacgatt
acagatagtcgaggaactacgacttatacttatgatgaacgagatagattaattgctcaa
actgaccctactggagtgtatttaaacagtggaaatactcttgaatatagctatgattta
acaggaaatagaacctctgttactaccccatcgggaaccgtttattataccttcgatgaa
tggaatcgtttaaagacggtaacagacgcagataatcatcagaccatttatgtctatgat
ggggtcagtaatttaattgaaactactttctctaatggagttatagaaacaagagattat
gatgacttaaatcgattaatcaagttagagaataagttaggtaatcaagttatttctggt
tatgaatatacgttagataaagtgggtaatcgtcttaaagtcaaagaagcagatggaagg
attgttgagtatgagtatgatgatttgtatcggttaattgaagaaaaaattacggattca
ttggatacggttaatgatggaagagtgattagttatacctatgatgcggtggggaatcgg
ttaactaaggttgattcggttgaagggacaactacttatgattataatgctaatgattgg
ttattaactgaaactgaagagaatggagacgttaaagaatatgaatatgatgagacgact
ttttatcaagtagatgggttagggagtacgagaattttaactaatgaaaagggagaatta
attaacacttatgattatgatgcgtttggtaatttaattgaatccacaggagatattgag
aataattatttatttgcaggggaacagtttgatgagaatttaggggagtattatttaagg
caaagatattacaatcaggaagttgggaggtttacaagaagggatacttatgaggggagt
ttaaataatcctgtttctctgcataagtatctttatgctaatgctaatcctgttatttat
atagatccaacaggattatatacattaactgagtttagtgctggacaagctattgcagat
gctttagccataagtctaggaatttcaggtttcatctcaaactcttacaaccctgaacga
cttggcggttttggcgagaatgaaaaaccaagcactgtactagatagactgctaatctgg
agaaatacatgggcccctgagtctataggtggttttggggaaaatctacaacctactttt
cctaatcatacagggcattcaaatcgtgacataaatgacttaattagatatatttttgca
attagtgatcctttcgagctatctaacgacatcgcttatggtcatgcttggaatgcagct
agaaacttggaatgggcgaaattaggtataaacagtcaacaacaactagcagatcttatt
tatgacattgtaattttttatgaacaaaagaaagtagatggagataaaattatttatctt
ggtagtgacggtacaattgtcattgataatcccagagatcctgacggtggtacagctttt
aatcccaatatacagcaaggaaattcgcaagcatctcaaatttacttcgatgagcaacca
ggtcgagtagtggactaa
DBGET
integrated database retrieval system
