Cycloclasticus sp. P1: Q91_2021
Help
Entry
Q91_2021 CDS
T02265
Name
(GenBank) Outer membrane adhesin like proteiin
Organism
cyq
Cycloclasticus sp. P1
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
HemolysinCabind
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFT68054
LinkDB
All DBs
Position
complement(2111280..2116217)
Genome browser
AA seq
1645 aa
AA seq
DB search
MTGNVAGTTDEGGADNKNFSLTVDPTEDIDFNLDALNIDTVETDSTVAVDLAGTVSISDA
DGSEQFTSVEYTFNGLPAGTTAFGGVLVGNVLTVTLTAGELPASYGLTLPTDYSTTGVAG
STTNNGADITFDVAVSTNEGSDSESGTITVGVEGDINVEVATIAAQDETDAVVTFTLSDK
LTVEETDADTSEQVTSVTATLSGVPEGSVMTGWTEVGVDSGHYTWTGTSTAGVPDVGIAA
DWSGTVTGNVAGTTDEGGADNKNFSLTVDSTEDIDFNLDALNIDTVETDSTVAVDLAGTV
SISDADGSEQFTSVEYTFNGLPAGTTAFGGVLVGNVLTVTLTAGELPASYGLTLPTDYST
TGVAGSTTNNGADITFDVAVTTNEGSDSESGTITVGVEGDINVEVATIAAQDETDAVVTF
TLSDKLTVEETDADTSEQVTSVTVTLSGVPEGSVMTGWTEVGVDSGHYTWTGTSTAGVPD
VGIAADWSGTVTGNVAGTTDEGGADNKNFSLTVDPTEDIDFNLDALNIDTVETDSTVAVD
LAGTVSISDADGSEQFTSVEYTFNGLPAGTTAFGGVLVGNVLTVTLTAGELPASYGLTLP
TDYSTTGVAGSTTNNGADITFDVAVTTNEGSDSESGTITVGVEGDINVEVATIAAQDETD
AVVTFTLSDKLTVEETDADTSEQVTSVTVTLSGVPEGSVMTGWTEVGVDSGHYTWTGTST
AGVPDVGIAADWSGTVTGNVAGTTDEGGADNKNFSLTVDPTEDIDFNLDALNIDTVETDS
TVAVDLAGTVSISDADGSEQFTSVEYTFNGLPAGTTAFGGVLVGNVLTVTLTAGELPASY
GLTLPTDYSTTGVAGSTTNNGADITFDVAVSTNEGSDSESGTITVGVEGDINVEVATIAA
QDETDAVVTFTLSDKLTVEETDADTSEQVTSVTVTLSGVPEGSVMTGWANDGGGDYSWTG
TSTAGVPDVGIAADWSGTVTGNVAGETDEGGADNKNFSLVVDSTPDTPVNDVITVEEESI
PSINGNDENDGLSYTINGTFSDNADWGADGFGGIVSVNGVIPSSNVITVSDPQWTLTVNA
TTGDYTFTLLSNISSTPFGDNLEGTDNLPTFNVIGQDGNGSQIGFGLEVGVVDDIPAYLN
PTTSHLKDAATSPDVVQLLNFAVGADGVEKVVFDTSMEGTAAIDSLGNELTFNGTGEALF
VHFSDDNTQLQFVTKNTDGSLNTANVKFFIELSADGQTYSVHSEGVIINGTAVTATNLSS
VGGGNVELKAISNIDGTSEDVVMTTEAGETVNTNANSIGIGTQNAVTVGEAIRFDFTNGE
VTGNGGNAFYQYGGSHNLTNAFTQQVYRTTACTSSANITISAILADADEVFYGDTTGETF
VDITSVKVYSGTLADVQAGTATDETSNVTITLNADGSASIAGLQEKWIYQIETTDEFSAV
TVGVDVGNIKLGVFSYGIGSDGLPIELDYDVIGTDTDGDSVTGSLGVNLYPDGATIEGGD
TGDILNGTNSDDYIIGRDGDDDLFGLDGDDLLIGGFGDDELTGGSGEDSFLFSMAANSGD
DIIKDFEVNTDKLNFIDVLDVDNSGDFNLADAISNVSDSGVGGDISVSLTNGGSVTLEGI
GTGAINDITSLQAYLGATNITVDES
NT seq
4938 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgacgggtaatgtagcgggcacgaccgatgaaggcggcgctgataataaaaactttagc
ttaaccgttgatccaactgaagacatcgactttaaccttgatgcacttaatatcgacacc
gttgaaacggacagcaccgtagctgttgatttagcgggcaccgtgagcatcagcgatgcg
gatggttcagaacagttcaccagtgttgagtatacctttaatggcttgccagctggcaca
acagcctttggtggtgtcttggtgggcaacgtcttaacagtgaccttaacggcaggagaa
ttaccggcttcatacggcttaaccctaccaacagactactcaacgacaggcgttgctggc
agcacaacgaataatggagcagacattacgttcgatgtagcggtctccacaaacgaaggc
agcgacagtgaaagtggcacgattaccgtaggcgttgaaggcgacatcaatgttgaagta
gcaacgattgccgcacaagatgaaaccgacgccgttgtgaccttcaccttaagtgacaag
ctaacggttgaagagaccgatgcggatacctctgagcaagtgacctcagtcaccgccacc
ctatcaggtgttccagaaggctcagtgatgacgggttggactgaagtaggtgttgatagt
ggtcattacacctggacaggaacaagcacagctggcgtaccggatgttggtattgccgca
gactggtcaggcacagtgacgggtaatgtagcgggcacgaccgatgaaggcggcgctgat
aataaaaactttagcttaaccgttgattcaactgaagacatcgactttaaccttgatgca
cttaatatcgacaccgttgaaacggacagcaccgtagctgttgatttagcgggcaccgtg
agcatcagcgatgcggatggttcagaacagttcaccagtgttgagtatacctttaatggc
ttgccagctggcacaacagcctttggtggtgtcttggtgggcaacgtcttaacagtgacc
ttaacggcaggagaattaccggcttcatacggcttaaccctaccaacagactactcaacg
acaggcgttgctggcagcacaacgaataatggagcagacattacgttcgatgtggcggtc
accacaaacgaaggcagcgacagtgaaagtggcacgattaccgtaggcgttgaaggcgac
atcaatgttgaagtagcaacgattgctgcacaagatgaaaccgacgccgttgtgaccttc
accttaagtgacaagctaacggttgaagagaccgatgcggatacctctgagcaagtgacc
tcagtcaccgtcaccctatcaggtgttccagaaggctcagtgatgacgggttggactgaa
gtaggtgttgatagtggtcattacacctggacaggaacaagcacagctggcgtaccggat
gttggtattgccgcagactggtcaggcacagtgacgggtaatgtagcgggcacgaccgat
gaaggcggcgctgataataaaaactttagcttaaccgttgatccaactgaagacatcgac
tttaaccttgatgcacttaatatcgacaccgttgaaacggacagcaccgtagctgttgat
ttagcgggcaccgtgagcatcagcgatgcggatggttcagaacagttcaccagtgttgag
tatacctttaatggcttgccagctggcacaacagcctttggtggtgtcttggtgggcaac
gtcttaacagtgaccttaacggcaggagaattaccggcttcatacggcttaaccctacca
acagactactcaacgacaggcgttgctggcagcacaacgaataatggagcagacattacg
ttcgatgtggcggtcaccacaaacgaaggcagcgacagtgaaagtggcacgattaccgta
ggcgttgaaggcgacatcaatgttgaagtagcaacgattgctgcacaagatgaaaccgac
gccgttgtgaccttcaccttaagtgacaagctaacggttgaagagaccgatgcggatacc
tctgagcaagtgacctcagtcaccgtcaccctatcaggtgttccagaaggctcagtgatg
acgggttggactgaagtaggtgttgatagtggtcattacacctggacaggaacaagcaca
gctggcgtaccggatgttggtattgccgcagactggtcaggcacagtgacgggtaatgta
gcgggcacgaccgatgaaggcggcgctgataataaaaactttagcttaaccgttgatcca
actgaagacatcgactttaaccttgatgcacttaatatcgacaccgttgaaacggacagc
accgtagctgttgatttagcgggcaccgtgagcatcagcgatgcggatggttcagaacag
ttcaccagtgttgagtatacctttaatggcttgccagctggcacaacagcctttggtggt
gtcttggtgggcaacgtcttaacagtgaccttaacggcaggagaattaccggcttcatac
ggcttaaccctaccaacagactactcaacgacaggcgttgctggcagcacaacgaataat
ggagcagacattacgttcgatgtagcggtctccacaaacgaaggcagcgacagtgaaagt
ggcacgattaccgtaggcgttgaaggcgacatcaatgttgaagtagcaacgattgccgca
caagatgaaaccgacgccgttgtgaccttcaccttaagtgacaagctaacggttgaagag
accgacgcggatacctctgagcaagtgacctcagtcaccgtcactctatcaggtgttcca
gaaggctcagtgatgacgggttgggctaacgatggtggtggtgattatagctggacagga
acaagcacagctggcgtaccggatgttggtattgccgcagactggtcaggcacagtgacg
ggtaatgtagcaggcgagaccgatgaaggcggcgctgataataaaaactttagcttggta
gttgatagtactcctgatactccagttaatgacgttatcaccgttgaagaagaatcaatt
ccatctatcaatgggaatgatgagaatgatgggttgagttacacaatcaatggtaccttc
tctgataatgctgattggggggctgatggttttggtggtatcgtgagtgttaatggtgtc
attccaagcagtaatgttattactgttagtgatccacagtggacgttgacagtgaatgct
acgacgggtgactacacatttaccttactgagcaatattagctcaacaccttttggggat
aatttagaaggaacagataatctacctacatttaatgtgattggccaagatggtaatgga
agccaaatcggctttggtttagaggttggtgttgtcgatgatattcctgcctaccttaac
ccaacaacatctcaccttaaagatgctgcgacgtctcctgatgtcgttcagcttcttaac
tttgctgtaggtgctgatggtgttgagaaggtcgtatttgatacgagcatggagggaact
gcggctatagactcacttggaaacgagctgacttttaacggtacaggtgaagcgttgttt
gttcacttttctgatgacaatacccagcttcaatttgtaactaaaaatactgatggttcg
ttgaatacagcgaacgtgaagttttttattgagcttagcgcagacggacaaacttatagt
gtgcactcagagggtgtcattattaatggtacagcagttacagccacaaacttgtcgagt
gttggtggtggtaatgttgagttaaaagcaatctctaatattgatggtacttcagaagat
gtggtgatgacgactgaagcgggcgaaacagttaataccaacgcaaactcaattggtata
gggacgcagaatgcggttactgttggcgaggcgattcgttttgattttaccaatggtgaa
gtaaccggtaatgggggtaatgcattttatcaatacggtggttcacacaacctaacaaat
gcctttactcaacaggtctatagaacaacggcttgtacatcgtctgcaaacattactatt
tcagcgatactggcagatgctgatgaggtgttttatggtgatacgacaggtgagacgttt
gttgatattacgagtgtcaaagtctattcaggaacgcttgctgatgttcaagcagggact
gcgactgatgaaactagcaatgtgactatcacattaaacgcggatggttctgcaagtatt
gctggtttgcaagaaaaatggatttaccaaattgagaccactgatgagtttagtgctgtg
actgttggagtcgatgttggaaatatcaaactgggtgtatttagttacggtataggaagt
gatgggctaccaatagagctggattacgatgttatcggtacagatactgacggtgacagc
gtgaccggttcactgggtgtaaacctttatccagatggcgctacgattgaaggtggcgat
acgggtgatattctaaatggtacgaatagtgatgattacatcattgggcgtgatggtgat
gatgacttatttggtcttgatggtgatgacttgttgattggcggttttggtgatgacgag
ctgacaggtggttcaggtgaagattcattcttgttcagtatggcagctaattcgggtgat
gacattatcaaagacttcgaagtaaatacggataagttaaactttatcgacgtgttggat
gtagacaattcaggtgatttcaatttagctgatgctattagtaatgttagtgatagcggt
gttggtggagatatctctgttagtctaactaatggtggaagtgtcactcttgaagggatt
ggtacaggggcaataaatgatattacatctttacaagcctatcttggcgctacaaatatt
acagtagacgaaagttag
DBGET
integrated database retrieval system
