Cyanobacterium sp. IPPAS B-1200: A5482_003835
Help
Entry
A5482_003835 CDS
T10868
Name
(GenBank) CBS domain-containing protein
Organism
cyr Cyanobacterium sp. IPPAS B-1200
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CBS
HATPase_c
GAF
Response_reg
PAS_9
HisKA
PAS_4
PAS
GAF_3
PAS_8
PDE8A_N
GAF_2
HATPase_c_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XPM69521
LinkDB
All DBs
Position
complement(842068..846135)
Genome browser
AA seq
1355 aa
AA seq
DB search
MSTDKSPQLMKHKVLSNNYVTVKLDASLLDVVEQLSQVKPDNLKEDTTSKYARGNRHFSC
ALVVNNERLVGLITERDIVKLSAQNSSLENMVAAQIMTRDVITFEEEKIGSVLELVDILK
THKIRHLPLVDKQSRVVGIVTPETIRATLQPLDLLKHRHVEEVMRRNIIYAFPWQKLTDL
VQLMANNSISCVVVVEEGENNQVKPCGIITEKDIVRYQALRLNMEELEAQQVMTKPLKVI
NGNSSLWDAHKLMEKKGFRRLVVVDNEGYLQGIITQSSVLEGIDPRELQDVITVLEKQVE
LLENKNTELLKQVVRQQQESLKEAEKREKLLLDISLRIRSSLDLKEILQRAVDEVRNLLS
VERVVILRVSENWENPFLIESIIDSKYSLKGRIIRDACFEELWLNSKNVFPTVAIEDIYD
SDLTECHVDLLASFGIRGNLVIGLEVNQCLWGLLIAHSCEDIRLWKSEEIEFLDKLAIQL
SIGIQQASLLNQVKQNSVELEKKVAMRTLELTNLNQEYHEELIKSNEIQMELEKTKSTLA
GILNVAQDGIISINHEQKIIMFNQGASQIFGYTLEEVLGKPLDILLPDRFVASHRHHVEN
FDGAGQVNSCCRMSGDNDDKDFVMGKRKGGEEFPLEASISRLVTQEDTISTVILRDVTQK
RALEAERRKLAHYLEVSLNEIYVFRADTFLFEYVNQGALNNIGYSLEELQGMTPIDVKPE
YTKDSFLEVVNPLLTGEQNIVVFKTIHRRQDGSLYPVEVHLQLVDEGNDRVFVAIISDIT
ERERAEKQLKDELDKSLLLGNITDKIRRTLNPDDIFATAAQEIGMAFEVNRCLIHDCLFQ
PFFSMPLRAEYSAGDYPSIMSFPVPIQGNVHLNKILYQEGAIASSNVYQDDSFQPIIGYC
RSILLKSILTIGTFYQGKINGVIILHHCDSFHEWTAEELDLIESVAAQLGIAIAQSNLLK
QEKRRLNQLAFKNHELSQARKEADSANRAKSEFLAMMSHEIRTPMNGVIGMTNLLADTPL
NPQQEDFIKTIRHSGESLLIIINDILDFSKIESGKLELENEPFNLLESVNSIIDLMKFQA
HAKNIKLIYKKEPLKSEYFRGDVTRLRQILLNLISNAIKFTKQGTVTINITSHTVNETKC
ILKFTIKDTGIGIPKNRQNKLFKPFSQVDNSISRHYGGTGLGLVISKRLAEMMDGEMWFE
SQENVGSTFFFTVVLPMSSNPKDVINNNLDNQGLNQSKKYKILLAEDNKVNQKVAMLSLK
KIGYQCDMVANGLEVIEAIKKVNYDIIFMDIQMPEMNGLEATRWIRENNTHQPHIIAMTA
NAMEGDKNICLQAGMNDYLTKPLHLDELKEVLNKF
NT seq
4068 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtccacggataaaagtcctcaactcatgaagcacaaagtcttaagtaacaactatgta
acggtaaaactagatgccagtttattagatgttgttgaacaactaagtcaagtaaaacca
gataatttaaaggaagatactacttctaaatatgcccgtggaaataggcattttagttgt
gctttagttgtcaataatgagcgtttagtaggattaattacagagagagatattgttaaa
ctttcggctcaaaattcttccctagaaaatatggtggctgcacaaataatgacgagggat
gtaattacttttgaggaggaaaaaattggcagtgttttagagttagtagatattttaaaa
actcataaaattagacatttacctttagtagataaacaatcaagggtagtgggtattgtc
accccagaaaccattagggcaactttacaaccccttgatcttttgaagcatcgtcatgta
gaagaagtaatgaggcgtaatatcatttatgcttttccatggcaaaaattgacggattta
gtacagttaatggcaaataattccattagttgcgtggtggtagttgaggaaggagaaaat
aatcaggttaaaccctgtgggattattacagaaaaagacattgttaggtatcaagccctt
cgtttgaatatggaggagttggaggcgcagcaggttatgacaaaacctctgaaggtgatt
aatggaaattcttctctttgggatgcccataagttgatggaaaaaaaaggttttcgccgt
ttagtagtggtggataatgagggttatcttcaagggattatcactcagagtagtgtatta
gaaggaattgatcctcgtgaattacaagatgttataactgtattagagaaacaagttgaa
ttattagaaaataagaatactgagttattaaaacaggttgttagacaacaacaggaaagt
ttgaaagaagcggagaaaagagagaagttattactagatatatcgttgcgaattcgctca
tctttggatttgaaggaaattttacaaagggcggtggatgaggtaagaaatttattgtcg
gtggaaagggtagttattctcagggtatctgaaaattgggaaaatccttttttgattgag
tcgattattgattcaaaatattctttgaagggaagaataattcgtgatgcttgttttgag
gagttgtggttaaattccaaaaatgtttttcctacggttgccattgaggatatttatgac
agtgatttaactgaatgtcatgtggatttgttggcgagttttggtattcggggtaatttg
gtaattggtttggaggtaaaccaatgtttgtgggggttgttgattgcccatagttgtgag
gatattcgcctttggaagtcagaggaaattgagtttttagataagttagcgattcagttg
tctattggcattcaacaggcaagtttgttaaatcaggtgaaacaaaatagtgtggaattg
gaaaaaaaggtggctatgcgtactttggagttaacgaatcttaatcaagagtaccatgaa
gagttgattaaatctaatgagatacaaatggagttggaaaaaacgaagtcaactttggcg
ggtattttgaatgttgcccaagatggcattatctctattaatcatgagcaaaaaattatt
atgtttaatcaaggggcaagtcagatttttggttatactcttgaggaggttttgggtaag
cctttagatattttattgcctgataggtttgtggcttctcatcgtcaccatgtggaaaat
tttgatggggcagggcaagtaaattcttgttgtcgtatgagtggtgataatgatgataag
gattttgtcatgggcaagagaaaagggggtgaggagtttcctttggaggcttctatttct
cgtttggttactcaggaggatactatttctacggttatcttacgggatgtaactcaaaag
agggctttggaggcggaaagaaggaagttagcccattatttggaggtgagtttgaatgaa
atttatgtttttcgtgcggatacttttttgtttgagtatgtgaatcagggggctttaaat
aatattggttatagtttagaggagttacaaggtatgactccgatagatgttaagcctgaa
tatactaaggatagttttttggaagtggttaatcctttgttgacgggtgagcaaaatatt
gtggtgtttaagacgattcatcgtcgtcaagatggtagtttgtatcctgtagaggtacat
ttacagttagtggatgagggtaatgatagggtatttgtggcgattatttcggatattacg
gaaagggaaagggctgaaaaacaattgaaggatgagttggataagagtttgttgttgggc
aatattacggataagattaggcgcactcttaatcctgatgatatttttgcgacggcagcg
caggagattggtatggcttttgaggtgaatcgttgtttgattcatgattgtttgtttcag
cctttcttttctatgcctttacgggcggaatattctgcgggggattatccttctatcatg
tcttttcctgtgccaattcaagggaatgtccatcttaataaaattttataccaagaaggg
gcgatcgcctctagtaatgtttatcaggatgattcttttcaaccgataatcggttattgt
cgcagtattcttctcaagtcaattttaactattggtactttttatcagggcaaaattaat
ggggtaatcatccttcatcactgtgattctttccatgaatggacggctgaagagcttgat
ttgattgaatccgtggcggcacagttaggaattgcgatcgcacaatctaaccttttaaaa
caagagaaaagacgactaaatcaactagcatttaaaaatcatgagttgtcacaggcaaga
aaagaagcagattcggctaaccgtgccaaaagtgaatttttagccatgatgagtcacgaa
attcgcactcccatgaatggagtaattggcatgacaaatttgttggctgatactccctta
aatcctcaacaagaagactttattaaaactattcgtcatagcggagaaagtttattaatt
atcatcaatgatattttagatttttccaaaatagagtcaggtaaattagagttagaaaat
gagccatttaatctactagaatcagttaacagcatcatcgatttaatgaaatttcaagcc
catgctaaaaatataaaattaatatataaaaaagaacctttaaaaagcgaatattttaga
ggagacgttactagacttcgacaaattctattaaatttaattagcaatgccattaaattt
accaaacaaggtactgtaacaattaacattaccagtcacacagttaatgaaacaaaatgt
attctcaaatttaccataaaagatacaggtattggtattcctaaaaatagacaaaataaa
ttatttaaacccttttctcaggtagataattccattagtcgccattatggtggtacaggg
ctaggattagttatcagtaaaagactagcagaaatgatggacggggaaatgtggtttgaa
agtcaagaaaatgtcggctcaacttttttctttaccgttgttttaccgatgtctagtaac
ccaaaagatgttataaataacaacttagataaccaaggtttaaatcaatcaaaaaaatac
aaaattttgttggctgaagataataaagttaatcaaaaagtcgccatgttgagcttaaaa
aaaataggctatcaatgtgatatggttgctaatggtttagaggtaattgaagcaattaaa
aaagtaaattatgatattatctttatggatatacaaatgccagaaatgaatggtttagag
gcaactcgttggattagggaaaataacacccatcagccccatattatcgccatgacagct
aatgccatggaaggggataaaaatatttgtcttcaagcaggaatgaatgattatcttact
aagcctcttcatttagatgaattgaaagaagtattaaataagttttga
DBGET
integrated database retrieval system
