Cyanobacterium sp. IPPAS B-1200: A5482_005635
Help
Entry
A5482_005635 CDS
T10868
Name
(GenBank) tetratricopeptide repeat protein
Organism
cyr Cyanobacterium sp. IPPAS B-1200
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_1
TPR_2
TPR_11
TPR_8
TPR_17
Pkinase
TPR_16
TPR_12
TPR_14
TPR_9
TPR_6
PK_Tyr_Ser-Thr
TPR_19
TPR_7
TPR_10
TPR_CcmH_CycH
SHNi-TPR
NatA_aux_su
ANAPC3
APH
BTAD
ARM_TT21_N
RPN7
FAT
SusD-like_3
DUF357
bCoV_NS8
YrbL-PhoP_reg
DZR
Whirly
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XPM69858
LinkDB
All DBs
Position
1209992..1212106
Genome browser
AA seq
704 aa
AA seq
DB search
MSKCFNPDCLTENYPKDDTCKNCGSKLLLKNRYRAVRIIGEGGFGRTFYGIDDQKTAGSR
CIIKQFLPQAQGTSNKKKAKTLFAQEARQLEKLGTHPQIPKFFDYFTQDGRQYLLQEFVD
GDNLAQELALEGVFDEGKIRDLLLNLLPVLKFVHENKVIHRDIKPENIIRRRSDNQLFLV
DFGASKVVQNVDLAITSTVIGSAQYSAPEQTFGKTNYYSDLYSLGVTCLHLMTGVEPFDL
FDTREGEWIWRDYLLNNPIQNDLARVLNKLVEGASNKRYQWVDEVLDALKQKEAETLISL
EAKSSANLYFERGNHYLELQDYKNALDCFENVIRIDPNYGFAYQRRDFTSMQLAKISRKN
NLSLRVQKMLQLSPLVVSGAIAFYAFLPTSGGVVDYINPMEAESVEVPSSNSSVGLEPSR
YYELGNRAYDEQRYNVAIIHYNSALRGDPNFVDAYNNRGISHHALGEYQEAIADYERIME
LDPSYMRAYYNRGNAYKSLGEDQKAIANYLQAIELDPTYTNAHYNLGNIYREIGEAQKAI
AQYDKVIEIDPNYKNAYYNRGIANYSLENHEQAIKDNTETLRIDNTDTNALINRGNSHFA
LANYPQAMADYNRAIELKPDYQIAYYNRGNVYRVLENYDLAIQDYQKSIELNPNHLDSYN
NMALSYEKMGNIDRAIEEYQKAIAINPNYQLAIDNLNRLQNNNP
NT seq
2115 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaagtgctttaatcctgactgcctaacggaaaattatcctaaggatgatacttgt
aaaaattgcggatctaaattattacttaaaaatcgttatcgtgccgtcagaattattggg
gaagggggatttggtcgaaccttttatggtattgatgaccagaaaacagcgggatctagg
tgtataattaagcagtttttgccccaagcccaaggcacgagtaataagaaaaaggcaaag
actctttttgcccaagaagcaaggcaattagaaaaattaggcactcatccacagataccg
aagttttttgattactttacccaagatggtcgtcaatatctattacaagagtttgttgat
ggagataatctagctcaggagttggctttggagggggtttttgatgagggaaaaatccga
gatttattacttaatcttttacctgtattaaagtttgtccatgaaaataaagttattcac
cgagatataaaaccagaaaatattatccgtcgtcgcagtgataatcagttatttttggtg
gattttggagcgtcaaaggtggtgcaaaatgttgatttggcgataacaagtacggtaatt
ggttctgctcaatattcggcaccagaacaaaccttcggtaagacaaattactatagtgat
ttgtacagtttgggggtgacttgtcttcatttgatgactggggttgaaccttttgatttg
tttgatacgagggaaggggagtggatatggcgagattatttacttaataaccccattcaa
aatgatttggcgagggtgttgaataagttggtagaaggagctagtaataaacgttatcaa
tgggtggatgaggtattggatgctttgaaacaaaaagaggctgaaacgttaatttctctg
gaggctaaatcatcggctaatttatattttgaacggggtaatcattatttggagttgcag
gattataaaaatgcgctagattgttttgagaatgtgatacgcattgatcctaactatggt
tttgcttatcaaagaagggattttacttcgatgcagttggctaaaataagtcgtaaaaat
aatttatctttgagggtacaaaaaatgttgcagttatctcctttggtggtttctggggcg
atcgccttttatgcttttttaccaacttctgggggggtggttgattatatcaatcccatg
gaagctgagtcggtggaagttccttcctctaattcctcggtaggtttagaaccttcacga
tattatgagttgggcaatagagcttatgatgagcaacgttacaatgtggctattattcat
tataattcggctcttcgaggagatcccaattttgtggatgcttataataaccgtggtatt
tcccatcatgccttgggagaatatcaagaggcgatcgccgattatgaacgtattatggaa
ttagatcctagttacatgagggcttactacaatcgtggtaatgcttataaatccctagga
gaagatcaaaaagcgatcgccaactatcttcaagccatagagttagatcccacctatacc
aatgcccattacaatttaggcaatatttaccgagagataggagaagcacaaaaggcgatc
gcccaatacgataaagtcattgaaattgatcctaactacaaaaatgcttactacaatcga
ggtattgctaactatagcttagagaatcatgaacaagccataaaagataataccgaaact
ttacgcattgataacaccgataccaacgctctgattaatagaggaaattcccacttcgcc
ctcgccaattatccccaagctatggcagactacaacagagccatagaattaaaaccagat
tatcaaattgcctactataaccgaggtaacgtttatcgagttttagaaaattatgattta
gctatccaagactatcaaaaatctatcgaattaaatcctaatcatctcgactcctataat
aatatggctttgtcctacgaaaaaatgggtaatattgatagagcaatagaagagtatcaa
aaagcgatcgccattaaccccaactatcaactagccatagacaatctcaaccgcttacaa
aacaacaacccttaa
DBGET
integrated database retrieval system
