Cyanobacterium sp. IPPAS B-1200: A5482_006340
Help
Entry
A5482_006340 CDS
T10868
Name
(GenBank) type I polyketide synthase
Organism
cyr Cyanobacterium sp. IPPAS B-1200
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
AMP-binding
KR
Acyl_transf_1
Ketoacyl-synt_C
Sulfotransfer_3
PP-binding
Abhydrolase_1
CurL-like_PKS_C
Hydrolase_4
KAsynt_C_assoc
DUF7080
adh_short
Beta-ketacyl_N
Abhydrolase_6
RhiE-like_linker
AMP-dom_DIP2-like
Sulfotransfer_1
adh_short_C2
Mug62
Thiolase_N
GDP_Man_Dehyd
LIDHydrolase
Epimerase
Polysacc_synt_2
Abhydrolase_8
AMP-binding_C_2
Peptidase_S9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XPM69987
LinkDB
All DBs
Position
complement(1354146..1362629)
Genome browser
AA seq
2827 aa
AA seq
DB search
MGYVRYSSFVSLLQERAVLHPNQVIFTFLGDGENESDYLTYHQLDQQARAIAHKLQSRKA
KGERALLLYQPGLEFVTAFLGCLYAGVIATPAYPPRANRSYTRLSAIIKDAGALFALTTQ
ALKEKIEQKLTKNDDITCITTDDIPLSVAQDWQPHPIKPEETAFLQYTSGSTGTPKGVIV
SHGNLVHNSQLIKDYFHNDEHCVGSFWLPPYHDMGLIGGILQPIYSRFHSIMLPPVTFLQ
RPIRWLRAISKYKVTTAGGPNFAYEMCVNSVTPQQKKDLDLSHWKLAFSGAEPVRAETIT
KFSQYFADCGFKKESFYPCYGMAETTLIVSGANPDESPTVKNISATKLQENQIVFNPEDE
GDIQKVVSSGTISPQLEVNIVNPDTLVQCPDNNVGEIWVKGESVTQGYWLKEELTEKTFN
GTTKNGKKKGFLRTGDLGFLSDGELFVTGRLKDLIIIRGRNHYPQDIEESVGNIHEAINS
ESGAAFAIEKDNDEQLIVVFELKRTFLQKVRQSNSLKQEIFDAIRKVVAENHELQAHSIV
LIRTGSIPKTSSGKIARYASRKEFLEGNLPIVAQWDLHSITSLESNNIKTINRLKSNSLF
DNKNINKKTLKIRQWLVNNVANRLQVNPNSIDIEQPFINYGLDSVQAVQLTADLEDYLGC
KLSPTLAYDYPNIRSLSFYLSELKNDSILGLEVEEKNEQKVEQIAIVAMACRFPGADSPK
QYWQLLSNNQNSISKTYLRPNIDSFGGYIKDYDQFDPQFFGISTREAINIDPQQRILLEV
TYEALENAHLTTEKLSGSATGVFMGISSQDYAHLQMKHGWDVNVYSGTGNSSAIASNRIS
YNFNLTGPSLSVDTACSSSLVAVHLAVNSLKNGECDCAIVGGVNLILAPELTETFQKAGM
MAEDGKCKTFSEDADGYGRGEGCGVVILKPLTKALADGDNVLAVIHGSAINQDGRSNGLT
APSGKAQQRVIQSAWKNASITPDKINYIEAHGTGTPLGDPIEVNSLAGLLPLVDEQQTVN
SSSVMDDNEEKTSFDSVVNSKEEKTSPQSVANGKGKESSVTVDDSSAQKIKEEREKDYPI
CWLGSAKTNIGHLEAAAGIAGLIKTVLMLNHEEIPSIVNFKELNPYINLEKSRLQIATKS
VEWKKSNQPRFAGVSSFGFGGTNAHVIVGDMIDSPVTIEEKEVKTEKVKRPYHLLTLSAT
TEKALQELVNRYEGYLGKTQEDDISHICYSTNQGRSHFNHRLAISAKDKTELTEKLSSVT
IFPENQINNNQIAFLFTGQGSQYHNMGKELYQTAPLFKDTIDYCSEILSQYLEKPLTEII
FNPEEKETLNQTIYTQPAIFVMEYALAQLWLSWGVKPSIMMGHSVGEYVAATLAGVFSLE
DALKLVAHRGKLMQQLPLDGGMVCLFTNLDTAKKLITKTELPLDIAAINGNSNIVISGKK
EDLQQLQTTAKASKVKCRPLKVSHGFHSRLMQPILADFEKIAQEITYNSPQGEIVSNLTG
KTIGEEIASPDYWVKHIINPVNFAQSVEYLQQQNYQIFLEIGSKPTLLGMARMIVENKTN
PDDCLWLPSLRKGESDWQNLLSSLGILYQQGLKIDWHGFHQDYPYLERVSLPNYPWQNQR
YWHGDSLSNTVDDSQQWLYEVVWEKDSSIHIENEEDSFRINLPSSYLIFVDEKKLGEKWA
EELTSQGSRVYLVYQGESYRQEEDTYYINPQEKKDYQLLLDSLGGKVEKIIYGWAINQDD
DLENINQLTANNYLDCLPVIYLIQNLVNSKHQVKIWLISQNSQFITHQEKINPYGGSIWG
LGKVIALEHSEYWGGMIDIDNSKLALPLLGYLVNHKPEETMTAIRDNAVFYCRLQNKNLD
TPKEAKKVSVKSSGSYLITGGLGALGLETANYLISQGAKNLILVSRSQPSSLASQKISQW
QEEGINVVIKQGDVTQKESLTKIIDDIDKSFPPLKGIIHTAGVLDDGILATLSPEKLTKV
MEAKVVGVNNLHLLTLDNSLDFFILYSSVASMLGSMGQGNYAMANSYLDTFASYRQSLGL
TCLSINWGAFSVGMAKATQEGLKAVGIETISPDKGISMVGDLMNYPNSGVGVIKFNWDTV
ARKFPQLSQSPYLQNIISSSDGEENKQDDTQTQLFNQLLKADDSGRISLLIDYLISAIAL
ILHIDKEKITPEDSLIDLGMDSLMVMEAINHLKTDLQLMLYPREIYERPQISTLAQYLAQ
EFATSHDSNSSKITSPSQKGMIVSPSPEEEEEKPTFNPTNHQPIAFILSSPRSGSTLLRV
MLAGHPALVSPPELHLLPFATMEERQRELESSHLGEGLIRTVMDLKQISAEESEALINQW
VEENLTIAQVYEILQSFGKNRLLIDKSPTYASSKKTLYNAENIFSQAKYIHLVRHPYSVI
ESFARMRMDKLLDIKEANPYEIGENIWYQSNQNVINFSKQIDSNKILTIYYENLVTSPQQ
EMEKISNFLGIEFNKSLLNPYEGERMTAGLYKQSMSVGDPNFNSRKKIDPNLANHWKKVQ
LPILLNPITRQLSETFNYELPHELNTVETKEKYLDIRGLNICVSTWGDENNPPLFIVHGI
LDQGFAWEKVAQNLVQKGYYVIAPDMRGHGKSDHNSLGCAYNLLDFVADLDCLIDELNNG
QTITLVGHSFGSMITGIYAGMRPDKVEKLYLIEPILPVKNKDDKDIENISSQLNNLLNVS
PLPVFETVEIVAQRLQKTAPRIEDGFALKLAKRMTKPVEGGVTFTYSPLLATRIGVGFNS
IPRNQYLKLLSGIQAPITLVYGDNSSFNRPQDLEAQKTAMANAQIFTMVGGHNLHLENPL
SLADVII
NT seq
8484 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggatacgttagatactctagtttcgtcagtcttcttcaagagcgtgcagtcttgcac
ccaaatcaagttatcttcaccttcttaggggatggtgagaacgagtctgattatctaact
tatcatcaattggatcaacaagcaagggcgatcgcccataaactccaaagcagaaaagca
aaaggagaaagagcattattactatatcaaccggggctagaattcgtcaccgccttcctc
ggttgtctctatgcaggagtcatcgccacccccgcctatcctccccgtgccaatcgttcc
tatacccgcttatcagctatcatcaaagatgctggagcattatttgccctgacaactcaa
gcactcaaagagaaaattgagcaaaaattaaccaaaaacgatgatataacctgtattacc
accgatgacatccccctaagtgtagcccaagactggcaaccacaccccatcaaaccagaa
gaaactgcttttttgcaatataccagcggctctacaggcacacccaagggagttatagta
agtcatggtaacttggtccacaattcccagctaatcaaagattattttcataacgacgaa
cattgtgtaggctcattttggcttcccccttaccacgatatgggcttaattggaggtatt
ttacaaccaatttactctcgttttcactctatcatgttacctcccgttaccttcctacag
cgccccattcgctggttacgggctattagtaagtataaagtaaccaccgcaggaggccca
aattttgcctatgagatgtgtgtcaactccgttacaccacagcaaaaaaaggatttagac
ttaagccattggaaactggcgtttagtggtgctgagcctgtgagggcagaaactattacc
aaatttagccaatatttcgccgattgtggctttaaaaaagaaagtttctacccctgctat
ggtatggcagaaacaaccctcattgtgtcgggggcaaatcccgatgagtctcccactgtt
aaaaatatctctgccactaaactacaagaaaatcaaattgtttttaatcctgaagatgaa
ggcgatatacaaaaagttgtcagcagtggcaccatatctccccaattagaggtaaatatt
gtcaatcctgataccctcgtacaatgccctgataataacgtaggggaaatatgggtaaaa
ggggaaagtgtaactcaaggttattggttgaaagaagaattaaccgaaaaaacctttaat
ggcactactaaaaacggaaaaaaaaagggttttctacgcactggggatttaggttttctc
agcgatggagagttatttgttacgggaagattaaaggatttaattattattaggggtaga
aatcattacccccaagatatagaagaaagtgtaggtaatattcatgaggctattaactcg
gaaagtggtgctgcttttgccattgagaaggataatgatgagcaattgatagtagttttt
gaacttaaaagaacttttttacaaaaggtaagacagagtaatagtttaaagcaagaaata
tttgatgccattcgtaaagttgtggctgaaaatcacgaattacaagctcattctatagtt
ttaattcgcactggtagtattcctaaaacctctagtggtaagattgctcgttatgcctct
cggaaagaatttttagagggaaatttacctatagtcgcccagtgggatttacactctatt
acatctttagaaagtaataatataaaaactataaatagattaaaaagcaatagtcttttt
gataataaaaatattaataaaaaaactttaaagatacgacaatggttagtaaataacgtt
gctaatcgcttacaagtaaatcctaattccatcgatatagaacaaccttttatcaattat
ggactagattccgtccaagctgtgcaactcaccgccgatcttgaagattatttgggttgt
aaattgtctcccactttggcttatgattatccaaatataagaagtttatctttttatttg
tctgaattaaaaaatgatagtattttaggcttagaagttgaagaaaaaaacgagcaaaaa
gtagaacaaattgctattgttgccatggcttgtcgttttcctggggcggatagccctaag
cagtattggcaattgttatccaataatcagaatagcatcagtaaaacttatctgcgcccg
aacatcgatagttttgggggttatataaaagattatgaccaatttgacccacagtttttt
ggaatttccacccgtgaggcgataaatattgacccacaacaacgtattttattagaagta
acctatgaagcgctggaaaatgcccatttgacaacagagaaattgtcgggtagtgccacg
ggagtttttatgggtattagtagccaagattatgcccatttgcagatgaaacatggttgg
gatgttaatgtttattctggcacaggaaattctagtgcgatcgcctctaaccgtatatcc
tataattttaatttaactggcccttccttgagtgtggataccgcttgttcatcttctttg
gttgcggtacacttagccgtaaatagcctcaaaaatggtgagtgtgactgtgccattgta
gggggagtaaatttaattcttgcccctgaattgacagaaactttccaaaaagcagggatg
atggcagaggatggcaagtgtaaaactttctctgaagatgccgacggttatgggcgcggg
gaaggttgcggggtagttatcctcaaacctttaactaaagccttagctgatggtgacaat
gttttggcggtaattcatggtagcgccattaatcaggatgggcgtagtaatggcttaaca
gcgccttcaggtaaagcgcaacagagggtaattcaatcggcgtggaaaaatgcgtctatt
actcctgataaaattaattatatcgaagctcatggaactggtacacctctaggagatcct
atcgaggttaattctttggctggtttattacctttggtggatgagcaacagactgttaat
tcttcttctgttatggatgacaatgaggaaaagacttcctttgatagtgtagttaatagc
aaagaggaaaagacttcccctcagagtgtagctaatggaaaaggaaaagagtcttctgtt
actgtcgatgattcctctgcacagaagataaaagaagaaagagaaaaagactaccctatt
tgttggttaggtagtgcgaaaacaaacatcgggcatttagaagctgccgcaggtattgcg
gggttaataaaaactgtgttgatgttaaaccatgaagagataccctccatcgttaacttt
aaagaattaaatccctatatcaatttagaaaaaagtcgcttacaaattgccaccaaatca
gtggagtggaaaaaatcgaatcaacctcgttttgctggggtaagttcctttggttttgga
ggaacaaatgcccatgttatagtgggagatatgattgattctcctgtaactatagaagaa
aaagaagttaagacagaaaaagtcaaacgcccctatcatcttttaacccttagtgcgaca
acagaaaaagcccttcaagagttagttaatcgttatgaaggttatctaggcaaaacacag
gaagatgatattagtcatatttgttatagcacaaaccaagggcgatcgcactttaaccat
cgtctagccattagtgcaaaagacaagacagaattaacagaaaaactgtcttcagtgaca
attttcccagaaaaccagattaataataatcaaatagcctttctatttacagggcaaggc
tcacagtatcataatatgggcaaagaattatatcaaactgccccccttttcaaagacacc
attgattactgtagtgagattcttagtcaatatttagagaaacccctcaccgagataatc
tttaaccccgaggaaaaagaaacccttaaccaaaccatctatacccaacccgccatcttc
gtcatggaatatgcccttgcgcaactgtggctatcatggggagtaaaaccatctataatg
atggggcatagtgtgggcgaatacgttgccgctacccttgcaggagtttttagtttagaa
gatgccctcaaattagttgcccaccgtggtaaactcatgcaacaacttcccctcgatggg
ggcatggtgtgtctatttaccaaccttgacaccgccaaaaagttaattacgaaaacagaa
ttacccctcgacatcgccgccatcaatggtaatagtaatattgttatctcagggaaaaaa
gaagacttacaacaattacaaactaccgccaaagctagtaaagtaaaatgtcgtccatta
aaagtctcccatggtttccattcccgattgatgcaacccatcttggcagactttgaaaaa
attgcccaagaaattacctataattcaccccaaggggaaatagtctctaatctcacagga
aaaaccatcggcgaagaaattgcctccccagactactgggtaaaacacattatcaatccc
gttaactttgcccaaagtgtggagtatttacaacaacaaaactatcaaatctttttggaa
attggcagtaagccaaccctccttggtatggcaaggatgatagtagaaaacaaaactaat
cccgatgattgtctttggttgcctagtttacgcaaaggagaatccgactggcaaaattta
ctttctagtctaggtattctttaccagcaaggattaaaaattgactggcatggtttccat
caagactatccttatttagaaagggtttctttacctaactatccttggcaaaaccaaaga
tactggcatggagatagtttaagtaataccgttgatgatagtcaacagtggttatatgaa
gtggtatgggaaaaagactcttctattcatatcgagaatgaggaagactcttttcgtata
aatctccctagtagttatttaatctttgtggatgagaaaaaactaggagaaaaatgggca
gaggaattaacttcccaaggtagtcgagtttatttagtctatcaaggagaaagttatcgt
caggaagaagacacctattatattaatcctcaagagaaaaaagactaccaattattgtta
gatagtcttggtggtaaggtagaaaaaattatctatggttgggcaatcaatcaagatgat
gatttagagaatattaatcaattaactgccaataattatttagactgtttacccgttatc
tatctaattcaaaatttagttaacagtaagcatcaagtaaaaatatggttaatcagccaa
aacagtcagtttattacacaccaagaaaaaattaatccctacggtggcagtatctgggga
ttaggaaaagtcattgccctcgaacatagtgaatactgggggggtatgattgatatagat
aatagtaaacttgcccttcctcttcttggttacctcgttaaccacaagccagaagaaact
atgacagcaatcagggataatgctgttttctattgtcgtttacaaaataaaaatcttgat
acccccaaggaagcaaaaaaagttagtgtcaaatcctctggtagttatctcattacaggg
ggattaggggcattaggtttagaaactgctaattatttaattagtcagggggcaaaaaat
cttattcttgtttcccgtagtcaaccttcttccttggcttctcaaaaaattagtcaatgg
caagaggagggtattaatgtagttatcaaacaaggggatgtaactcaaaaagaatccttg
acaaaaattattgatgatattgataagtcttttcctcccctcaaagggattattcatacc
gcaggggtattggatgatggtatcttggcaactctttcccctgaaaaattgactaaggta
atggaagctaaggtggtgggagtaaataatttacatctacttaccctcgataacagcctt
gacttttttatcttgtattcttctgtggcttctatgttaggctctatgggacagggtaat
tatgccatggcgaatagttacctagatacttttgcctcctatcgacaatcccttggttta
acatgtttgagtattaactggggtgctttttctgtgggtatggcgaaggcaacccaagag
ggtttaaaggcggtgggtattgaaactatctctcctgataagggtatctccatggtgggg
gatttgatgaattatcctaactctggggtaggggtaatcaagtttaactgggatactgtt
gcccgtaagtttcctcaactatctcaatctccttatctacaaaatataatttcttcttct
gatggggaggagaataaacaagatgatactcaaactcaattatttaaccaattactaaaa
gccgatgatagtggcagaatatccctattgatagattatctcataagtgcgatcgccctt
atccttcatatagacaaggaaaaaattacccctgaagatagtctcatagatttgggtatg
gattcattaatggtgatggaagccattaaccacttaaaaaccgacttacaattaatgtta
taccctagggaaatttatgagcgcccccagatttctaccctagcgcagtatttagcccaa
gaatttgccactagccatgatagtaatagtagtaaaatcacttctcccagccaaaaaggg
atgatagtttctccatcccccgaagaagaggaagaaaagcccacctttaatcccaccaat
caccaacctattgccttcatcttatcaagtccgcgctcaggttcaaccctcctgcgggta
atgttggctgggcatcccgccttggtttctccccccgaattgcacctattaccctttgct
accatggaggaaagacaacgggaattagaatcctctcaccttggggaagggttgattcgc
accgtcatggatttaaaacaaattagtgccgaagaaagcgaagcattaattaatcaatgg
gttgaggaaaacttaaccatcgcccaagtgtatgaaatcttgcagtctttcggcaaaaat
cgtcttttaatcgataaatcgcccacttatgcaagtagtaaaaaaactctttataatgca
gaaaatatcttttctcaagcaaaatatattcatttagttcgtcacccttattctgtcata
gaatcatttgcacggatgagaatggataaattactagatataaaagaggcaaacccttat
gaaattggggaaaatatctggtatcaaagtaatcaaaatgttattaattttagtaagcaa
atagatagtaataaaattttaaccatttattatgaaaatttagtgacgtctcctcaacaa
gagatggaaaaaataagtaattttctaggaattgagtttaataaatctctactaaatccc
tatgaaggggaaagaatgaccgcagggttatataaacaatccatgtccgtaggagatcct
aattttaatagtcgtaaaaaaatcgatccaaatttagcaaatcactggaaaaaagttcaa
ttacccatactattaaaccctatcactagacaattatctgaaacatttaactatgaatta
ccccatgaattaaacaccgtagaaaccaaagaaaaatatcttgatattagaggtttaaat
atatgtgtttctacttggggagatgaaaacaatcctcctctgtttattgtccatggaata
ttagatcaaggttttgcatgggaaaaagtagctcaaaacttagttcaaaaaggatactat
gtgattgctcctgatatgagaggacatggtaaatctgaccataacagcctagggtgtgct
tataatttacttgattttgtagcagatttagactgtttaattgatgagttaaataatggg
caaacaatcactttagttggtcattcttttggctctatgattacaggaatatatgctggt
atgcgtcctgacaaagtagaaaaattatatttgattgaacctattttacccgtgaaaaac
aaagatgataaagacatagaaaatatcagtagtcaattgaataacctactgaatgtgtct
cctctccctgtatttgagacggtggaaatagttgcccaaaggttacaaaaaactgccccc
cgcatagaggatggctttgccctcaaacttgctaaaaggatgacaaaacccgtggaaggt
ggggtgacatttacctattctcctctcttagccactaggattggggtaggttttaacagc
attccccgtaatcaatacctaaagctattatctggcattcaagcacccattactctagta
tatggtgacaatagttcttttaatcgtcctcaagatttggaggcacaaaaaacagccatg
gcaaatgctcaaatttttaccatggttggggggcataatttacacttagaaaaccctttg
agtttagcggatgttattatttag
DBGET
integrated database retrieval system