Cyanobacterium sp. IPPAS B-1200: A5482_008185
Help
Entry
A5482_008185 CDS
T10868
Name
(GenBank) ATP-binding cassette domain-containing protein
KO
K21397
ABC transport system ATP-binding/permease protein
Organism
cyr Cyanobacterium sp. IPPAS B-1200
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cyr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cyr02000
]
A5482_008185
Transporters [BR:
cyr02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
Other subfamilies
Other ABC transporters
A5482_008185
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
FHA
ABC2_membrane
Yop-YscD_cpl
ABC2_membrane_3
AAA_21
SMC_N
AAA_22
RsgA_GTPase
AAA_29
Zeta_toxin
AAA_16
MMR_HSR1
AAA_14
DUF3339
AAA_33
Septin
ATP-synt_ab
nSTAND1
AAA_28
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XPM67653
LinkDB
All DBs
Position
complement(1783507..1785966)
Genome browser
AA seq
819 aa
AA seq
DB search
MSESFSPNTVLDRNLNPYITLNNQGITLSAMELSAPEHRLGRDPAMVDLVVPNEWNIVSR
CQGTFIREDDNGYRLLDGSRQKRSSNGLFINNRLIPPEGHVLHNGDRIQIGQNPRDWVII
EYHSSMVHSGFSPPKTQSVSLVEKPIILGRDENADLPLNAPTVSRKHAVISKNSQGQYVL
TDYSANGVFVNEHKVNGSCILDHDSLINIGPYRLVLQGHRLVVADQGDNIRLDAFNLIRV
VKDETRKDRTIINDISLPIEPGQFVALVGGSGAGKSTLMRTLLGIEPTTNGAVYINGEDL
RQNFNIYRNQIGYVPQQDIIHKDLTVVEALEYAAKLRLPPDINVREIVSKTLTQIELVDY
KNILVKNLSGGQLKRVSIGVELLADPKLFFLDEPTSGLDPGLDKKMMELLRKLADEGRTI
ILVTHATTNINMCDRLVFLGRGGHLCYYGEPKSAMEFFNISSGNFADIYIDLESIDAVIN
KAQEFKKSSHYQENVSNHLSLKNTDSSSSQNTGHGFTSASVGNNKSVSSSTPEKAKPSLI
KQTITLTQRYAKIIFRDKINLSISLLTAPIGISLISFAIQIEPLVLGAEDNPKLASTALS
VLFVFTCANIWVGLSGSLQEIVKEADIYFRERLVNLDIFAYLFSKLSVLKLVTFLQSLLI
VITVLLRFESPSSELIYWSIGVFITSFLTIFASINFALMVSATVKNITQANSLLPLLLIP
QIIFSGVLFTMEDAGKYLSWLTISRWSVGAYGTLVDVNSMIPEPIILPDGSAIAQGIPES
LVYESTWDNLATNWLVLIVHTIVYFTITFILQKRKDIYN
NT seq
2460 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgagtcttttagccctaataccgttcttgaccgtaatcttaacccttatattact
ctaaataatcagggaattaccctgtctgccatggaattgtctgcccctgaacatcgtttg
ggtcgtgatcctgctatggttgatttggtagtacctaatgagtggaatattgtcagccgt
tgtcagggtacttttatccgtgaggatgataatggttatcgtctattggatggtagtcgg
caaaagcgtagctctaatgggctttttattaataatagactaattcccccagagggtcat
gtattacataatggcgatcgcatccaaatcggtcaaaatccccgagactgggtcatcata
gagtatcattcctccatggtgcatagtggttttagcccccccaaaacccaatccgtatcc
ctagtagaaaaaccgattatccttggtagggatgaaaatgctgaccttcccttaaatgcc
cctacggtatctcgtaaacacgctgttatcagcaaaaatagtcaagggcagtatgtttta
acggactatagcgctaatggggtgtttgtaaatgaacataaagttaatggttcttgtatt
ctagatcatgattccttaattaatattggtccttatcgtttggtattacaaggacatcga
ttagttgttgccgatcaaggagataatattcgtttagatgcttttaatttaatacgagta
gttaaagatgaaacgagaaaagatcgcactattattaatgatatatctttacccattgaa
ccaggtcaatttgtcgctttggtggggggaagtggtgcgggaaaatctactttgatgcgt
actcttttaggtattgaacccacaacaaatggggctgtatatattaatggggaagactta
cggcaaaattttaatatctatcgtaatcaaattggttatgttccgcaacaggatattatt
cacaaggatttaacagtggtagaagccctcgaatatgcggcaaaattacgtttaccccct
gatattaatgttcgggaaatagttagtaaaactttgactcaaatagagttagttgattat
aaaaatattttagttaaaaatcttagtggcggtcagttaaaaagggttagtattggggta
gaattattagcagatcctaaattatttttccttgatgaaccaacttcagggcttgatcca
ggattggataaaaaaatgatggagttgttgcgcaagttagccgatgaagggcgcaccatt
atccttgtcacccatgctactacgaatataaatatgtgcgatcgcctcgtatttttgggc
agaggggggcatctctgttattatggcgaacctaaatccgccatggaattttttaatatt
tctagtggtaattttgctgatatttatattgatttagaaagcattgatgcggtaattaat
aaagcccaagaatttaaaaaatcatcccattatcaagagaatgttagcaatcatttatct
ctaaaaaatacagactcttcttcttctcaaaatactggtcatggctttaccagtgcatct
gttggtaataataaatctgtttcttcatctactcccgaaaaagcaaaaccatctttaata
aaacagacaattacccttactcaaagatatgccaaaattatttttagggataaaattaac
ctttcaatttctcttttaactgcccccatcggtattagtttaattagttttgctattcaa
atagaacctttggtattaggtgcagaagataatcctaaactagcatctacggccctcagt
gtcttatttgtgtttacctgtgctaatatttgggtgggtttatcaggttcccttcaagag
atagtaaaagaggctgatatttatttccgagaaaggttagtaaatctcgatatttttgct
tatttattttctaagctatcagtattaaaattagttacttttttacaaagtttgttaatt
gttataactgttttattacgctttgaaagtcctagttctgagttaatttattggtcaatc
ggagtatttattaccagttttttaactatttttgctagtataaattttgccttaatggta
tctgctactgtaaaaaatatcacccaagctaacagtttattacccttattattaatccct
caaattatcttctctggggtgttatttaccatggaggatgcagggaaatatctgtcttgg
ttaactattagtcgttggtctgtgggtgcttatggtacattggtggatgttaatagtatg
atacctgagcctattatattaccggatggcagtgcgatcgcccagggcattccagaatcg
ttagtttatgagtccacttgggataatttagccactaattggctagtgttaattgtccac
actattgtttattttacgattacttttattttgcaaaaaaggaaggatatatataattga
DBGET
integrated database retrieval system
