Cysteiniphilum sp. QT6929: NYP54_01345
Help
Entry
NYP54_01345 CDS
T09052
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
KO
K07787
copper/silver efflux system protein
Organism
cys
Cysteiniphilum sp. QT6929
Pathway
cys02020
Two-component system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cys00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
02020 Two-component system
NYP54_01345
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cys02000
]
NYP54_01345
Transporters [BR:
cys02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
NYP54_01345
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WHN65896
LinkDB
All DBs
Position
complement(299538..302639)
Genome browser
AA seq
1033 aa
AA seq
DB search
MIKNVIYWSIKNRFLVIVATIALIVAGIYAIKTTSVDAIPDLSDVQVIVKTNYPGQAPQV
VEDQVTYPLSTAMLSVPGAQSVRGYSFFGDSYVYIIFKDGTDPYWARSRVLEILSQVSNK
LPASVKSALGPDATGVGWIYQYALVDRSHNTDISKLTSLQNWFLKYELQTVPGVSEVATV
GGMVKQYQITLNPNAIRAYNLNLNKIKQAIIEANQEVGGSVLEMAEAEYMVRTNGYLKNS
QSIKDIPVGVMQNGTAILLKDIATINIGPEMRRGVADLNGEGDSVGGIIVMRDGENALAT
IKAVKAKLQSLQKSLPLGVEVVETYDRSTLIHNAIDNLSDKLIEELIIVLLVCLVFLFHI
RSSLVVLISLPIGILCAFIIMRLQGINANIMSLGGIAIAIGAMVDAAIVMIENVHKHFEK
NVVTKDNRWQLIAKATAEVGPPIFFSLLIITLSFLPVFALQAQEGKLFSPLAYTKTYAMA
AAAGLSITLVPVLMGYLIRGKIVSEHKNPINRILMAAYKPFLNGVLKFPKTTILACLIIV
AITLYPLKHIGYEFMPDMNEGDLMYMPTLVPGVSIGKAEQVLQQTDRLIKTVPEVKTVFG
KIGRAQTATDPAPLTMIEAVIQFKPKSQWRKGMTFEKIKQELDQAVKIPGVTNAWVMPIR
TRIDMLSTGIKTPIGIKISGDNLAEIQVLGSKIEKLLNQLPNTTSVYADRSEGGRYINID
INRKKAANYGLSIAEIQSLISMAVGGMNITETVEGLERYPVNLRFPQYDRDSLEKLKALP
IVTATGAHIALSEVADIYIDKGAPMIKSENGRLTGLVLVDIKGDVGSYIHEAQALLDQKL
SLPTGYALSFSGQYEYMQRANQQLLKVVPIAVAIILLLLYLSFRRVADVLMIVLTLPLSI
VGGIWLIYLLNYNLSVAVGVGFIALAGVAVEIGVLMLVYMNQTIQSLNRETLSEDDIKRA
IIEGALLRVRPITMTVATIIIGLIPIMFATGTGSEVMQRIATPMVGGMISATILALLLLP
AVYYVYQKRRLLK
NT seq
3102 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaaaaatgtgatttattggtcaattaaaaatagatttttagtaatagtcgcaaca
attgcattaattgttgcaggcatttacgctattaaaacaacctctgttgatgcaattcca
gatctttctgatgtgcaagtcattgttaaaaccaattacccagggcaagcacctcaagtt
gttgaagaccaagtaacctacccattgtcaacggcaatgttatcagtgcctggcgcgcag
agcgtgcgtggctactcattctttggagattcatatgtctatattattttcaaagatggc
acggatccttattgggcgcgctcacgtgttttagaaattttaagtcaggtttcaaacaag
ttaccggcttctgtaaaaagtgccttggggccagatgccacaggggttggctggatttat
caatatgccttggttgatcgatcacacaatacggatatttcaaagctaaccagcttgcaa
aattggtttttaaaatacgagttacaaactgtacccggtgtctcagaggttgcaaccgtt
ggtggtatggttaaacagtatcaaattaccttaaaccctaatgccattcgcgcttataac
ttgaatttaaataaaatcaagcaagccattattgaggctaatcaggaagtaggaggttca
gtgcttgagatggcagaagctgaatatatggttagaaccaatggctatctgaaaaattca
caatcgatcaaagatattcccgttggtgtcatgcaaaatggtacggcaatactgcttaaa
gatattgcaacgattaatattggccctgaaatgcgtcgaggtgttgctgacttaaatggg
gaaggcgatagtgttggtggtatcattgtgatgcgtgatggtgaaaatgcactggcaacc
attaaggcggttaaagctaagctacagtctttacaaaaaagcctccctcttggggttgaa
gttgttgaaacctatgatcgttcaacgcttattcataatgcgattgataatttaagtgat
aaattaatcgaagagttgatcatcgtattattggtttgcttggtatttttatttcatatt
cgctcttcactggtggtattaatcagcttgccgattggcatattatgcgcatttattatt
atgcgtcttcaagggatcaatgcaaatattatgtcgcttggagggattgccatcgctatt
ggtgcaatggtggatgctgctattgtgatgattgagaatgtacataaacactttgaaaag
aacgtagtgaccaaggataaccgctggcagttaattgccaaagccactgctgaagtcggt
ccgcctattttcttttcattattaattatcactttaagcttcttgcccgtatttgcttta
caagcacaagagggcaagcttttttcgcccttagcctatactaaaacttatgccatggca
gcggcagctggtctttcaattacactagtgccggtactgatgggctatctaattcgtggt
aagatcgtgtcagagcataaaaacccaataaaccgtatcctaatggcagcttataagcca
tttttaaatggggtgcttaagtttccaaaaacaacgatattggcgtgcttaatcattgtg
gcaataacgctttatccgttaaagcatattggttatgagtttatgcctgatatgaacgaa
ggagacttgatgtatatgccgacacttgtccctggtgtttcgattggtaaagctgagcaa
gtgttgcagcaaacagatcgtttgattaaaacagttcctgaggttaaaacggtttttggc
aagattggtcgcgcgcaaacggcaaccgatcctgcccctttaaccatgattgaagcagtg
attcagtttaagcctaagtcacaatggcgcaaaggcatgacatttgaaaagatcaaacaa
gaacttgatcaggcggttaagatcccaggtgtgactaatgcatgggtgatgccgattcgt
acacgtattgatatgttatcaacggggattaaaacaccaattggtatcaaaatctcaggt
gataatttagcagagattcaagttttaggtagcaagattgagaagctgttaaatcaattg
cctaacactacatccgtttatgctgatcgttcggaaggtggacgttatatcaatattgat
atcaatcgcaaaaaggcggcgaactatgggctttccattgctgaaattcaatcgctcatc
tcaatggcagtaggggggatgaatatcaccgaaaccgttgaagggttagagcgatatcct
gtcaatctaagatttccacaatatgatagagactctttagagaaactcaaagcattaccg
attgtgacagcaacgggtgcacatattgctttatcagaagttgctgatatttatatcgat
aaaggcgcgccgatgattaaaagtgagaacggacgtttaacaggactcgtgttggttgat
atcaaaggtgatgttggcagttatatacatgaagcacaagcgctattagatcaaaaacta
tcgttaccaactggatatgcactcagtttttcagggcaatatgaatatatgcagcgcgct
aatcaacaacttttaaaagttgttcccattgctgtggcaattattttattgttattgtat
ttaagcttccgacgagtcgctgatgtcttaatgattgtattgactttgccactatctatc
gttggtgggatttggttaatctatcttttaaattataatttgtcggtagctgtaggagtt
ggttttatcgcattagctggcgttgccgttgaaattggtgtgctgatgctggtttatatg
aatcaaacgatacaatctcttaatagagaaacattgtctgaagatgatattaaacgcgcc
attattgagggggcattactgcgcgtgcgcccaatcacaatgacggtggcgacgattatt
attggtttgattcctattatgtttgcaacaggaactggatcagaagttatgcagcgtatt
gcaacaccaatggtcggtggcatgattagtgcgaccattttagcgctattgctactgccg
gctgtgtactatgtttatcaaaaaaggcgtttgttaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
