KEGG   Cysteiniphilum sp. QT6929: NYP54_03365
Entry
NYP54_03365       CDS       T09052                                 
Symbol
hrpA
Name
(GenBank) ATP-dependent RNA helicase HrpA
  KO
K03578  ATP-dependent RNA helicase HrpA [EC:5.6.2.6]
Organism
cys  Cysteiniphilum sp. QT6929
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:cys00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:cys03019]
    NYP54_03365 (hrpA)
Enzymes [BR:cys01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.6  RNA 3'-5' helicase
     NYP54_03365 (hrpA)
Messenger RNA biogenesis [BR:cys03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   Other RNA degradation factors
    Others
     NYP54_03365 (hrpA)
SSDB
Motif
Pfam: DUF3418 OB_NTP_bind Helicase_C HA2_C DEAD HA2_N AAA_22 nSTAND3 AAA_19 AAA_23 RsgA_GTPase ResIII DUF7667 NTPase_1 NACHT T2SSE ABC_tran AAA_29
Other DBs
NCBI-ProteinID: WHN66283
LinkDB
Position
complement(779075..782932)
AA seq 1285 aa
MQSTNSLIKVINNVQTKDRARLMMRFSELAKAHHTDNDKWQKLLTDADQSKEKVALRRTS
MPKINYPDLPVSQRVDEIKKAICDNQVVIIAGETGSGKSTQLPKICLDLGLGAKGLIGHT
QPRRLAARSIANRLSEETNMPLGQGIGFKIRFSDQTNDNTFIKVMTDGILLAEIQNDKYL
SQYEVIIIDEAHERSLNIDFLLGHIHQILKKRPDLKLIITSATIDQARFAEHFNAPIIEV
SGRTYPVEIRYQDPLDFEDELSQADQILRAVHSLHHEKPGDILVFLATERDIHETAEVLR
KAQLRHTEVLPLFARLSNADQDKIFNPRGVGRRIILSTNVAETSLTVPGICYVIDSGDVR
ISRYSYRTKVQHLPIEPISQASANQRAGRCGRVAEGICIRLYSEEDFLSRAAFTDPEILR
TNLASVILQMETLKLGNIEKFPFLEKPDSRMVKDGYRLLHEIGALTEHSKKHHLQITPIG
RQIAKFPLDPRLARMLVSGAKLGVLREILIIVSFLSIQDPRERPMQFQQKSDEMHKQDHH
QDSDFLGVVNLWQRFNAETKSLSHRLTREYCKKNFLSPLRMREWREVYFQLLNLAKTFKW
TISESESSYAQVHQALLSGLLGYIGFNYELKEYLGARGMKFYIFPGSSQFKRTPKWLCAA
EITETTKLYARMVAKIDPAWLESIAEHLTKKHYSEPHWSQKRKAVMASLRITLYGLDIVV
NRKVQYSDVDPQVSRELFIRHALVYGEFATNAEFFQKNLSLLEEVEDLEHKARKRDIAID
EETLFSYYDKLIPVDINNGVVFEKWYQSLSKLEREQLIFDKRSLMQHEAHEVTDNAYPDF
FDFGGFQLPLSYHFDPTAKDDGVTMTVPLVLLDQIDANQCDWLVPGLLEEKVIALMRALP
KNIRKACVPVPHYAQAVIEAIDIDLAANFYDILVRQLVRITGISFDSSVWQDAAIEAHLY
INYRVVDPQNKVLAEGRDLSVIRDKLRGVERPQVSAAKKNNDTLYQAWDFGEIALTRDVT
EHSIKLSVYPCVETREDGVVLTHKSTLLEAEIATRLATRKLLMLFCSHINRTLVERIAHN
KNLHLLFSLIKETKWQDELIAKAYDIAFAIEQKPVVRTRGQFNAMYDAGRGQLVSTIENL
CSDIEALMLSYQNLHKLLNRKKLPFDLLALYQEVRSIVDGLVYKGFIVKTPYHWLQRISL
YLQALSNRLDKAPRAAKQDRQYQIEQEELTHLLKQKMQQKGVINTLEIDEIHWLMYELWI
SWYSQDVKTIETVSTTRLKKRIQAL
NT seq 3858 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcagtccactaattcattgataaaagttattaacaatgtacaaacaaaagatcgtgct
cgattaatgatgcgtttcagcgagcttgccaaagcgcatcatacggataatgataaatgg
caaaaattgctcactgacgcggatcaatccaaagaaaaggtggcactgcgtcgcacgagc
atgcctaagattaattatcctgatttgccagttagtcagcgggttgatgagattaaaaaa
gctatttgtgataaccaagtggtgattatcgccggtgaaaccggttcgggtaaatcaacg
caattacccaaaatttgtcttgatttaggtttaggtgccaaaggactgattggacacacg
caaccaaggcgtctggcagcgcgctcgattgccaatcgtttaagtgaagaaaccaatatg
ccactcgggcaaggcataggttttaagattcgttttagtgatcaaaccaatgacaatacc
tttatcaaggtgatgaccgatggtattttgttagcggaaattcaaaatgataaatatctt
tcgcaatatgaagtgattattatcgatgaggcgcatgagcgtagtttaaatattgatttt
ctattagggcatatccatcagattttaaaaaaacgtcccgatttaaagcttattattact
tcagcgacgattgatcaggcgcgttttgctgagcatttcaatgcgccaattatcgaagtc
tcgggacgaacttatccagttgagattcgttatcaagatccattagactttgaggatgag
ctatcacaagcggatcaaattttgcgtgctgtgcatagtttacatcacgaaaaaccaggt
gatattttggtgtttctcgcaacggagcgtgatattcatgaaacagcagaagtattaaga
aaagcgcaattaagacacaccgaagttttgccattatttgcgcgattatctaatgctgat
caagataagatatttaatcctcgcggggttggtaggcggattattttatcaacaaacgtt
gccgagacctcattaacggtgcctggtatttgctatgtgatcgatagtggtgatgtgcgt
attagtcgctatagttatcggactaaagtgcaacacttgccgattgagccaatttcacaa
gccagtgccaatcaaagagcgggacgctgtggacgcgtggctgaaggaatttgtattcga
ctttattcagaagaagactttctatcacgtgcagcatttaccgatcctgagattttacgt
acgaacttagcgtcagttattttacaaatggaaaccttaaagcttggtaatatcgagaag
tttccctttttagaaaaaccagattcacgcatggtcaaagatggctatcgtttgctgcat
gagataggcgcgttgactgagcacagcaaaaaacatcatctgcaaattacgccaatcggg
cgacaaattgccaagtttccattagatccacgtttggcgcgaatgcttgtcagtggtgcc
aaacttggtgttttgcgtgagattctgattattgtcagctttttaagtattcaagatccg
cgcgagcgaccgatgcaatttcaacaaaaatcagatgaaatgcacaagcaagatcaccat
caagactcagatttcttgggtgtggtgaatctatggcaacgttttaatgctgaaactaaa
agcttatctcatcgcttaacacgtgaatattgcaaaaagaatttcttatctcctttgcga
atgcgtgaatggcgtgaggtttatttccaactgctgaatctagcgaagacctttaagtgg
acaatctcagaaagtgaatcaagctatgcacaagtccatcaagcactattatcagggcta
ttaggctatattggctttaattatgagcttaaggaatacttaggcgctcgcggtatgaaa
ttttatatatttcctggctcatcgcagtttaaacgcacaccaaaatggctgtgtgctgct
gaaattactgaaacgacgaagctctatgcgcgcatggttgctaaaatcgatcctgcttgg
ttagaatctattgctgagcacttaaccaaaaagcattatagtgagccgcattggagccaa
aagcgtaaagcagtgatggcaagcttgcgtattacgttatatggcttagatattgtggtt
aatcgcaaggtgcaatatagtgatgttgatccacaagtctcacgtgagttatttattcgt
catgctttggtgtatggtgagtttgcaacaaatgctgagtttttccaaaagaacttgagt
ctattagaagaagtcgaagacttggagcataaggcgcgtaaacgcgacattgccattgat
gaggagactctatttagttattacgataaattgattccagtagatattaataatggtgtg
gtatttgaaaaatggtatcaatctttatcaaagcttgagcgtgagcagctgatctttgac
aaaagaagtctgatgcagcatgaagcgcatgaggtaactgataacgcatatcctgatttc
tttgattttggcggatttcagttaccgttgagttatcattttgatcccacagcaaaagat
gatggcgtaacgatgacggtacctttagtactcttagatcaaatcgatgccaatcaatgt
gattggcttgttcctggattattggaggaaaaagttattgctttgatgcgcgcacttcct
aagaatatccgtaaagcgtgcgtaccagtgccacattatgctcaagcggtcattgaggcg
attgatattgatttagcggctaacttctatgatattctagtgcgtcaactcgtgcgtatt
accggtatttcatttgactcaagtgtttggcaggatgcggctattgaggcgcatttatat
ataaattatcgtgtggttgatcctcaaaacaaggtgctggctgaagggcgtgatctaagc
gtgattcgtgataaattgcgtggtgttgagcgtccacaggtaagcgcggctaaaaagaac
aatgatacactttatcaagcgtgggattttggtgagattgccttaacgcgtgatgtcaca
gaacacagtattaaattgagcgtttatccatgtgttgagacacgtgaggatggtgtggta
ttgacacataaatcaaccctactggaagcggaaatcgccacaaggcttgcaacacgtaag
ctgttgatgcttttctgttcacatatcaatcgcacgttagttgaacgtatcgcgcataat
aagaacttacatttattatttagtcttatcaaagagacgaaatggcaagatgagttaatt
gccaaagcctatgatattgcctttgcgattgagcaaaagcctgtggtgcgcacgcgcggg
cagtttaatgcgatgtatgatgcaggaagaggtcagttggtatcaacgatcgaaaatcta
tgcagtgatattgaagccttgatgttaagctatcaaaacttacataaattacttaatcgc
aagaagttgccttttgatttattagcactttaccaagaagtgcgcagtatcgttgatggt
ttggtttataaaggttttattgttaaaacaccttatcattggttacagcgtatttcactc
tatctacaagcacttagtaatcgcttggataaggcgccaagggcagcaaaacaagatcgc
cagtatcaaattgaacaagaggaactcactcatttgcttaagcagaaaatgcagcaaaag
ggcgtgattaatacccttgagattgatgagattcattggcttatgtatgagctatggatc
tcatggtatagtcaggatgttaaaaccattgaaacggtgtcaacaacgcgattgaaaaag
agaattcaagcattgtaa

DBGET integrated database retrieval system