Crocosphaera subtropica: cce_2215
Help
Entry
cce_2215 CDS
T00686
Name
(GenBank) probable retinal pigment epithelial membrane protein
Organism
cyt
Crocosphaera subtropica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RPE65
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACB51565
CyanoBase:
cce_2215
UniProt:
B1WPJ5
LinkDB
All DBs
Position
complement(2252922..2254301)
Genome browser
AA seq
459 aa
AA seq
DB search
MTATLKINPYLSGNFAPVSREITAHNLTVTGEIPQNLRGIFLRNGPNPQFSPIGEYHWFD
GDGMVHGVHIEDGKASYRNRFIQTRGYCLEKEANKPIWTGLLEPPQMDNPYGPSKNTANT
ALVYHADRLLALWEGGEPHALTVPELDTLGPDNFEGKLMSPFTAHPKIDPMTGEMMFFGY
SMVQPPYLQYGIISPQGDLLKTVPIDLPVGVMMHDFAITENYTIFLDLPLTFRPERMQKG
ESPLQFEHDTPSRFGIVPRQGNNDDVRWFEGNSCYIFHTLNAYEEGDEIVLIACRMNGTT
VLGEVREETKESDIPRLHEWRFNLKTGEVKEQGLCDLPSEFPRINEQYTGRKSRYGYSGK
MAESSNPKFNGIIKHDFEKGGFDIHHFGSHKYGGEPIFAPNPDADKEDDGWLLTFVHDEG
SNTSELVIIDAQDFTASPVATIQIPQRVPYGFHGMWLAQ
NT seq
1380 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactgcaaccctcaaaatcaatccctatctttcaggtaattttgctcccgttagtcga
gaaattactgctcataatttaacagtgactggagaaattccccagaatttaaggggaata
ttcctcagaaatggccctaacccccaatttagccccatcggtgagtatcattggtttgat
ggggatggtatggttcacggggtacacatagaagatggcaaagcgtcttaccgtaaccgt
tttattcaaacccgtggctattgcttagaaaaagaggctaataaacctatttggacaggg
ctgctagaaccgcctcaaatggacaacccctatggtccctcgaaaaacaccgctaacact
gctctagtgtaccatgctgaccgtctcctggcactgtgggaagggggtgaaccccacgct
ttaacggttcctgaattagataccctgggccctgataattttgagggtaagttaatgtcc
ccctttacagcccatccgaaaattgatcccatgacgggggaaatgatgtttttcggctat
tcaatggttcaacctccctatttacaatacggaattatttccccacaaggagacttgtta
aaaacggttcccattgacttacccgttggggtgatgatgcacgattttgccattaccgaa
aactatactatttttcttgatcttcctttgacctttcgccctgaaagaatgcaaaaagga
gaatctcccttacaatttgaacatgataccccctctcgttttgggattgttccaagacaa
ggcaataatgacgatgtgcgctggtttgaaggtaattcttgttatattttccatacctta
aatgcttatgaagaaggcgacgaaattgttttaattgcctgtcggatgaatgggacgaca
gtattaggagaagtaagagaggaaactaaagaatccgatattccccgtcttcatgaatgg
cgttttaatctcaaaacaggtgaagttaaagaacaaggtttgtgtgatttgccttcggaa
tttcctcgtattaatgaacaatatacaggacgaaaaagccgttatggttactcagggaaa
atggcagagtcttctaaccctaaatttaacggcattattaaacatgattttgaaaaagga
ggctttgatattcatcattttggttctcataaatacggtggtgaaccgatttttgctcct
aaccccgacgcagacaaagaagacgacggatggttactaacgtttgttcatgatgaaggg
tcaaatacctcagaattagtgattattgatgctcaagattttaccgcttctcctgtggca
accatacaaattcctcaacgggttccctatggatttcatggtatgtggttagctcaataa
DBGET
integrated database retrieval system