Crocosphaera subtropica: cce_3035
Help
Entry
cce_3035 CDS
T00686
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
cyt
Crocosphaera subtropica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_9
Cadherin_4
Cadherin_5
DUF4347
HemolysinCabind
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACB52383
UniProt:
B1WW50
LinkDB
All DBs
Position
complement(3089839..3095631)
Genome browser
AA seq
1930 aa
AA seq
DB search
MLCFSMITIINRYHFYRLNKQPRSSAASRITPYFCQHRKSLMETYRNHQDHRQLFSQFVQ
DNQTSMIENTRLVIIDGNVDHPQQLQQGVAEGVTSIILDRHRDGIEQITEVLATHRNIAS
IHLVSHGWAGGIQLGNTQLSLHTFDKYLSQLKSWSGKLSGVSMLLYGCQVALGEQGRRFL
DRLHQITGANIAASSDRVGNALKGGNWDLNFKLGQITEKLAFLPQTQRAYAGVFQPRIGI
TADNLVLVEDEGTATTITFTLSEPPPPDGVIVTIANDVPWSLGDFTLFPPPPFSGGRPLG
GNSNNSAFDFQITAQTATITFPIFNDRDRVAQGNIDFPNTEFRNDDQGVEESTFRLLPRD
GYDVDPNASEITFTLADTRSQLAPPPSPPTVSLETNTDILYESDGTVLTFTFTLSEPPPP
EGVTVTVNGDVAQNLNQLDLFNVSVTGGQFPVPDFDNTGFSFTITEQTATISSPIFNDGT
PEEPSTVTYTLVPGDGYEVDSSTNEATVTFADSSNTAPVASNDSNSTSEDSSVNGNVLNN
DTDADGDALTVTEVNGESADVGTEITLASGALLTLNSDGSYSYNPNGVFDNLETGETATD
SFNYTVSDGQGGTDTATATITIDGFTPNTPPVASNDSNSTSEDSSVNGNVLNNDTDADGD
ALTVTEVNGESADVGTEITLASGALLTLNSDGSYSYDPNGVFDNLETGETATDSFNYTVS
DGQGGTDTATATITIDGFTPNTPPVASNDSNSTSEDSSVNGNVLNNDTDADGDALTVTEV
NGESADVGTEITLASGALLTLNSDGSYSYDPNGVFDNLETGETATDSFNYTVSDGQGGTD
TATATITIDGITPPPVNTPPVATDDSNSTPENASLAGNVLNNDTDADGDALTVTEVNGES
ADVGTEITLTSGALLTLNSDGSYSYDPNGVFDNLEDGETDTDSFNYTVSDGQGGTDTATA
TITIDGITPPPVNTPPVATDDSNSTPENASLAGNVLNNDTDADGDALTVTEVNGESADVG
TEITLTSGALLTLNSDGSYSYDPNGVFDNLEDGETDTDSFNYTVSDGQGGTDTATATITI
DGITPPPVNTPPVATDDSNSTPENASLAGNVLNNDTDADGDALTVTEVNGESADVGTEIT
LTSGALLTLNSDGSYSYDPNGVFDNLEDGETATDSFNYTVSDGQGGTDTATATITIDGIT
PPPVNTPPVATDDSNSTPENASLAGNVLTNDSDADGDSLSVTEVNGQASDVGSQVTLASG
ALLTLNSDGSYSYDPNGVFDNLEDGETDTDSFNYTVSDGQGGTDTATATITIDGITPPPV
NTPPVATDDSNSTPENASLAGNVLTNDSDADGDSLSVTEVNGQASDVGSQVTLASGALLT
LNSDGSYSYDPNGVFDNLEDGETDTDSFNYTVSDGQGGTDTATATITIDGITPPPVNTPP
VATDDSNSTPENASLAGNVLTNDSDADGDSLSVTEVNGQASDVGSQVTLASGALLTLNSD
GSYSYDPNGVFDNLEDGETDTDSFNYTVSDGQGGTDTATATITIDGITPPPVNTPPVATD
DSNSTPENASLAGNVLTNDSDADGDSLSVTEVNGQASDVGSQVTLASGALLTLNSDGSYS
YDPNGVFDNLEDGETDTDSFNYTVSDGQGGTDTATATITIDGITPPPVNTPPVATDDSYS
LEENAAITGNVLDNDTDADGDPLSAIVDEGPSNGTLDFNEDGSFTYTPNEGFSGTDSFTY
QANDGTDNSDTTTVTLEVTEAPVTEEILSFGTVGNDTFDAGVTPDFNGTDDIVFAGSGND
LIDTTAGTGGNRLYGGSGNDTFLLGDNNRAFGGGGDDIFYLLGDRNVITGGTGADQFWFA
LGEIPNDIDTITDFELDVDTLGIGGLGVSYEDLTLTQQGSNTLISSNGQNFGLLLDIEAT
QLDEDHFVFG
NT seq
5793 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgttatgtttttctatgatcactatcattaatagatatcatttttataggctcaacaaa
cagccaaggtcatctgctgcttcaagaatcactccctatttttgtcagcacaggaaatct
cttatggaaacctatcgtaaccatcaagatcacagacagttattttcacaatttgtacag
gacaatcagacttctatgatagaaaatacaagattagtcatcatcgacggcaacgttgat
catcctcaacagttgcaacaaggggttgccgaaggagtaaccagtattattctagatcgt
catcgagacggcattgaacaaatcaccgaagttttagccacccacaggaatattgcgagt
attcacctcgtttctcatggttgggcaggaggaatacaactgggaaacacccaactgagc
cttcatactttcgataagtatcttagtcaactaaaaagttggtctggtaaactgagtgga
gtatcaatgctactctatggctgtcaggtggcattaggagaacaaggccgtcgcttctta
gaccgtttacaccagattactggggcaaatattgcagcatccagcgatcgtgtgggtaat
gccttaaaagggggaaattgggatcttaattttaaacttgggcagattacagaaaaatta
gcctttttaccccaaacacaacgagcttacgccggtgtattccagcctaggattggtatt
accgccgataacttagttttagttgaagatgaaggcactgcaaccactattaccttcacc
ctgagtgaaccaccccctccagatggggttattgttaccattgccaatgatgtaccttgg
tctttaggagactttactctttttcctcctccaccttttagcgggggacgaccccttgga
ggtaatagtaataacagtgcatttgactttcaaattactgctcaaactgccactattacc
tttcccatttttaacgatcgcgatcgtgtagcacagggtaatatcgattttcccaatact
gaattccgcaatgacgatcaaggggtggaagaatccacttttaggttgctgcctcgagat
gggtatgatgttgatcctaacgccagtgagatcacttttactctagctgatactcgttcc
caacttgcccctcctccctcgcctcccactgtttccctagaaactaacaccgatattctc
tacgagtcagacggaacggttttaacctttacctttacccttagcgaacccccaccacca
gaaggagtcacggttacggttaatggagacgtggcacaaaatttgaatcagttagacctg
tttaatgttagtgtcacagggggtcagttcccggttcccgattttgataatacgggtttt
tcctttaccattactgaacaaactgccacaattagttcccctatttttaatgatggaacc
cctgaagaaccctcaacagtaacttataccctagtccctggtgatggttacgaagttgac
tcaagtaccaatgaagctactgtaacctttgctgatagttctaatactgctcccgttgcc
agcaatgatagtaacagcacgtctgaagattcatctgttaatggcaatgttttgaataat
gacacagatgctgatggggatgctttaacggttacagaggtcaatggagaaagtgctgat
gttggtactgaaatcactttagcctctggggcattactcaccctcaacagtgatggaagt
tatagttataaccccaatggagtctttgacaacttagaaacaggagaaaccgccactgat
agctttaactacactgtcagtgatggacaaggaggaacggatacagctacagcaaccatt
actattgatggctttactcctaatacccctcccgttgccagcaatgatagtaacagcacg
tctgaagattcatctgttaatggcaatgttttgaataatgacacagatgctgatggggat
gctttaacggttacagaggtcaatggagaaagtgctgatgttggtactgaaatcacttta
gcctctggggcattactcaccctcaacagtgatggcagttatagttatgaccccaatgga
gtctttgacaacttagaaacaggagaaaccgccactgatagctttaactacactgtcagt
gatggacaaggaggaacggatacagctacagcaaccattactattgatggctttactcct
aatacccctcccgttgccagcaatgatagtaacagcacgtctgaagattcatctgttaat
ggcaatgttttgaataatgacacagatgctgatggggatgctttaacggttacagaggtc
aatggagaaagtgctgatgttggtactgaaatcactttagcctctggggcattactcacc
ctcaacagtgatggcagttatagttatgaccccaatggagtctttgacaacttagaaaca
ggagaaaccgccactgatagctttaactatactgtcagtgatggacaaggaggaacggat
acagccacagcaactattaccattgacggtattacgccacctcctgtgaatacccctcct
gtggccactgatgatagtaacagtacccctgaaaatgcttctcttgctggcaatgttttg
aataatgacacagatgctgatggggatgctttaacggttacagaggtcaatggagaaagt
gctgatgttggtactgaaatcacgttaacttcaggtgcattactcacccttaacagtgat
ggcagttatagttatgaccccaatggagtctttgacaacttagaagacggagaaaccgac
actgatagctttaactacactgtcagtgatggacaaggaggaacggatacagccacagca
actattaccattgacggtattacgccacctcctgtgaatacccctcctgtggccactgat
gatagtaacagtacccctgaaaatgcttctcttgctggcaatgttttgaataatgacaca
gatgctgatggggatgctttaacggttacagaggtcaatggagaaagtgctgatgttggt
actgaaatcacgttaacttcaggtgcattactcacccttaacagtgatggcagttatagt
tatgaccccaatggagtctttgacaacttagaagacggagaaaccgacactgatagcttt
aactacactgtcagtgatggacaaggaggaacggatacagccacagcaactattaccatt
gacggtattacgccacctcctgtgaatacccctcctgtggccactgatgatagtaacagt
acccctgaaaatgcttctcttgctggcaatgttttgaataatgacacagatgctgatggg
gatgctttaacggttacagaggtcaatggagaaagtgctgatgttggtactgaaatcacg
ttaacttcaggtgcattactcacccttaacagtgatggcagttatagttatgaccccaat
ggagtctttgacaacttagaagacggagaaaccgccactgatagctttaactatactgtc
agtgatggacaaggaggaacggatacagccacagcaactattaccattgacggtattacg
ccacctcctgtgaatacccctcctgtggccactgatgatagtaacagtacccctgaaaat
gcttctcttgctggtaatgttttaaccaacgatagtgatgcggatggagacagtctcagt
gttactgaagttaatggacaagcttctgatgttggtagtcaagttaccttagcttcaggt
gcattattaaccctcaacagtgatggcagttatagttatgaccccaatggagtctttgac
aacttagaagacggagaaaccgacactgatagctttaactacactgtcagtgatggacaa
ggaggaacggatacagccacagcaactattaccattgacggtattacgccacctcctgtg
aatacccctcctgtggccactgatgatagcaacagtacccctgaaaatgcttctcttgct
ggtaatgttttaaccaacgatagtgatgcggatggagacagtctcagtgttactgaagtt
aatggacaagcttctgatgttggtagtcaagttaccttagcttcaggtgcattattaacc
ctcaacagtgatggcagttatagttatgaccccaatggagtctttgacaacttagaagac
ggagaaaccgacactgatagctttaactacactgtcagtgatggacaaggaggaacggat
acagccacagcaactattaccattgacggtattacgccacctcctgtgaatacccctcct
gtggccactgatgatagcaacagtacccctgaaaatgcttctcttgctggtaatgtttta
accaacgatagtgatgcggatggagacagtctcagtgttactgaagttaatggacaagct
tctgatgttggtagtcaagttaccttagcttcaggtgcattattaaccctcaacagtgat
ggcagttatagttatgaccccaatggagtctttgacaacttagaagacggagaaaccgac
actgatagctttaactacactgtcagtgatggacaaggaggaacggatacagccacagca
actattaccattgacggtattacgccacctcctgtgaatacccctcctgtggccactgat
gatagcaacagtacccctgaaaatgcttctcttgctggtaatgttttaaccaacgatagt
gatgcggatggagacagtctcagtgttactgaagttaatggacaagcttctgatgttggt
agtcaagttaccttagcttcaggtgcattattaaccctcaacagtgatggcagttatagt
tatgaccccaatggagtctttgacaacttagaagacggagaaaccgacactgatagcttt
aactacactgtcagtgatggacaaggaggaacggatacagccacagcaactattaccatt
gacggtattacgccacctcctgtgaatacccctcctgtggccactgatgatagctatagc
ctggaagaaaatgctgctattaccggtaatgtgttagataatgatacagatgctgatggt
gatcctttaagtgctattgtggacgaagggccaagtaatggaacccttgatttcaatgaa
gatggttcctttacctatacccccaatgaaggattttcagggacagatagctttacctat
caagcaaatgacggaactgataattctgacacgacaactgttaccctcgaagtgactgaa
gcacctgttaccgaagaaatcttgtcctttgggactgttgggaatgatacctttgacgct
ggcgttactcccgactttaatgggactgatgatatcgttttcgcaggctcaggaaatgat
ctcattgacacaacagcaggaactggtggtaaccgtttatatggtggatctggtaatgat
actttcctcttgggtgacaacaaccgagcttttggaggtggcggagatgatattttttat
cttcttggcgatcgcaatgttattacagggggaacaggagccgatcagttttggtttgct
ttaggtgaaatacctaatgatattgataccatcaccgattttgaacttgatgttgataca
ttaggaattggtggtttaggtgtgagttacgaggatttaacgttgactcaacaaggcagt
aataccctaatctctagcaacggacaaaatttcggtcttttattagacattgaggcgact
caactggatgaagatcattttgtctttggttaa
DBGET
integrated database retrieval system
