Crocosphaera subtropica: cce_4585
Help
Entry
cce_4585 CDS
T00686
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K22044
moderate conductance mechanosensitive channel
Organism
cyt
Crocosphaera subtropica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cyt00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cyt02000
]
cce_4585
Transporters [BR:
cyt02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
cce_4585
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MS_channel_2nd
MS_channel_3rd
MS_channel_1st
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACB53933
UniProt:
B1WVE3
LinkDB
All DBs
Position
4732938..4735067
Genome browser
AA seq
709 aa
AA seq
DB search
MGSTLPDNKSCCYGWRIIFSYDNKNVKVIMKNLKLVKLDAQRIKKLMLSISRLIIIFIVS
LTLTLTWTTQSFGQISLFSQPSNETNSQTGPWDLNQAYTCGKFWCSDVYIHDDIRDSKNI
LLTPELTLATLKKLNQSSTEATQLLEKRAKVIEQTFNRIVNNIIITKISSKPPIIKPLKF
WKPAALPKFLHPNPIKPLHPCTPKIKIGIKNNQTVIFIDEQLDVDIASQSIITVTEIDAT
ANGKTIEDLAKTWQNTIELSFSNAFWGYEFDRQYPQARLVMSSIAMGIALLLIMFIELLR
TWLRRWDNGLRQKLKNLTESITVKPEASTPTNLKAENNNDCLTEQNSRPDKSHKKRSKLS
FWLTRILNFIKKVIKKNKWLYGRLSRSQQKIILQKQSLIKQERNFAQLLLRISFILQILS
LMSGFVVITLIFRDIRFLSVFLLRETLNIIFLWIGLTLLDKIGDFMIDYYLNRWANQAQI
FDPTSNRYTLRINTYSVVLKQATTFITIILGIYGTLWLIGLKPSVLAGAGILTVALAFLS
RNLLEDMLNGVLILSTDRYAIGDVIDVGEGMGGLVENINLFVTSLRNLDGQVIAIPNSKI
STVINNTKEWSRVNFTIKIAWNEDIKRAIDVMNQVANQMQNEPEWGSKILEPMEVLGIDE
VSHEGILIHVLIKTQPSEHWGIGREFRLRVKQAFDEMDISLGIPHRKIV
NT seq
2130 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgggttctactcttcctgataataaatcctgctgttatggctggagaatcatttttagt
tatgataataaaaatgtaaaagttattatgaaaaatttaaaattagtaaaacttgatgct
caacgaattaaaaaactaatgttatctatctctaggttaattatcatttttattgtgagt
ttaaccttaactttaacctggacaactcagagttttggacaaattagcttattttctcaa
ccctctaacgaaaccaatagtcaaaccggcccttgggatcttaaccaggcctatacctgt
ggaaaattttggtgtagtgatgtttatattcatgatgatatccgagacagtaaaaatatt
ttattaacaccagaattaaccttagctaccctcaaaaaactaaatcagtctagtacagaa
gccactcaattattagaaaaaagagctaaagtcatcgagcaaacttttaatagaattgtt
aataatattattattacgaaaattagttctaaacctcctattattaaacctttgaaattt
tggaaaccggccgcactaccaaagtttttacatcctaaccctatcaaaccccttcatcct
tgtacacccaagataaaaattggtatcaaaaataatcagactgttatttttattgatgag
caattagatgtagatattgcttcacaatcaattattactgtaaccgagatagatgccaca
gctaatggaaaaaccattgaagatttagcaaaaacttggcaaaatacgattgaactctct
tttagtaatgccttttggggatacgaatttgaccgccaatatcctcaagcaagattagta
atgtctagtattgctatgggaatagcgttactattaattatgttcattgaattgctcaga
acttggttgagaagatgggataatggacttagacaaaaactaaaaaacttaacagaatct
ataacagttaaaccagaagcatctaccccaactaatcttaaggctgagaataataatgat
tgtttaacagaacagaatagccgacctgataaatctcacaaaaagcgaagcaaattatct
ttttggttgactcgaattttaaattttatcaaaaaagtaattaagaaaaataaatggttg
tatggtcgcttatctcgttcccaacaaaagatcatattacagaaacaaagtctaataaaa
caagaaagaaattttgctcaactcttactgaggatatctttcattttgcaaatactgagc
ttaatgtctggttttgttgttattaccttaatctttcgggacattcgttttttatccgtt
tttcttctaagagaaacgcttaatataatattcttatggatagggttaacgcttctcgat
aaaataggtgattttatgattgactattatttgaatcgttgggctaatcaagctcaaatc
tttgatccaacttctaatcgttacaccctgagaattaatacttattcagtcgtgcttaaa
caagccaccacgtttatcacaattatcttaggtatttatggcactttatggctcattgga
cttaaaccttctgttttagcaggggcaggtattttaacagtagctcttgcgtttttatcc
cgtaatctattagaagatatgcttaatggtgttcttattttatctactgatcgctatgct
attggagatgtgattgatgtaggtgaaggtatgggaggtttagtggaaaatattaattta
tttgttacgtctttgcgtaatcttgatgggcaagtgatcgctattcctaatagtaagatc
agcactgtcattaataatacaaaggaatggtcaagggtaaactttaccatcaaaattgct
tggaatgaagatattaaaagagctattgatgtgatgaatcaagtagctaatcaaatgcaa
aatgaaccagaatggggcagcaaaattttagaaccaatggaagtattagggatagatgaa
gtgtctcatgaagggattttgattcatgtattaattaaaacccaacccagtgaacattgg
ggaattggtcgagaatttcgactacgagtcaaacaagcttttgacgaaatggatatttct
ttgggaattccccatcgtaaaattgtatga
DBGET
integrated database retrieval system