Desulfofarcimen acetoxidans: Dtox_0616
Help
Entry
Dtox_0616 CDS
T00986
Name
(GenBank) PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase
Organism
dae
Desulfofarcimen acetoxidans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
Response_reg
HisKA
PAS
PAS_9
PAS_8
PAS_4
Hpt
PDE8A_N
SseB_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACV61536
UniProt:
C8W0W7
LinkDB
All DBs
Position
644408..646708
Genome browser
AA seq
766 aa
AA seq
DB search
MWDNRDLTIKGNDTVMECRRLSNILECIGDGLITAATDGKVQFMNKVAEKFLCWDLAEAK
GKNIDEVFRMINLETNEILYTHYDQIIATQSPRGLRKDTVLLSRDGMLRYVSASISPVKD
MNNFVEAIVIVFRDITRRRSIEDAINSKQAKLKAVFDAAPVGIMIVNSCHIIIELNDALG
KILGRRPDQILLKKVGEGLGCKHRLENKKSCENGEIKCPLRYTIQKVIEEQTECKGIEIL
FEMKKGDNIRKVWFKLNAVPIEIEKEKHVLMVIDDINEHKRLIKELKKAKEAAEAASRAK
SEFLANMSHEIRTPLNGLIGMLDLTLLSDLTVDQKENLSIARTCVDSLMNVLNDILDFSK
IEAGKLLIENVGFNLPELVEKTVKSYSAKASEKDIGIKYSVCSDVPETLSGDPNRLRQVL
NNLLGNAIKFTQIGSVGIEVELLEKTREYVTLKFIVTDTGIGISASDREKLFQGFSQVDG
SYTRKYGGTGLGLAISKQLIEKMDGQIWVESNNHGGSKFIFTTRLKTGAFSPEKKSNTCV
YVASRELDILLAEDDKVSQMVIFRMLEEFGHSITIVNNGKEALEILAKHDYDLILMDIQM
PVMDGLATTSIIRQNECVKGKRTPIIALTAYAVKGDKEKFLSHDMDDYVSKPVTMVDLFN
TIERLNKKITINRPGCSGSYVNKVNDRFFKDIAVKTANIRKAVAESNDLLAEKMAHLIKN
DSEILQADFLKSLAFKIELAVRKGKIEQASDLCSKIEMELDRLKLL
NT seq
2301 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtgggataaccgtgacttaactattaaaggcaacgatacagtaatggagtgtaggcgt
ctttctaatattttggagtgtattggagacggtttgattacagcggctacagacggcaaa
gtccagtttatgaacaaggttgcggagaaatttttatgctgggatctggcagaggcaaaa
gggaaaaacatagatgaagtatttagaatgattaatctggaaactaacgagatattgtat
acgcattatgaccaaattattgcaacacaatcaccaagaggcttgaggaaggatacggta
ctgctttccagggatggtatgctcaggtacgtatcagccagtatatctcccgtgaaagat
atgaataattttgtggaagctattgtcattgtattcagggatattaccaggcgaaggagt
atagaagacgcgattaatagtaagcaagcaaaattgaaggcagtttttgatgcggcaccg
gtaggcataatgatagtaaactcttgtcacatcataattgagcttaatgatgcgcttggt
aaaatactgggaagacgtcctgatcaaatcttgctcaaaaaagttggtgaggggttaggg
tgtaaacacagactggaaaataaaaaaagttgtgaaaacggagaaataaagtgtcctttg
agatacacaatacagaaggtaattgaagaacagacagaatgcaagggcatcgagatttta
tttgaaatgaaaaaaggagataatatccggaaggtatggttcaaactgaatgccgtacct
atagagatagaaaaagaaaaacatgttttgatggtaattgatgatattaatgaacacaag
cgactgattaaagaactaaaaaaagcaaaagaggctgcggaagcagctagcagggctaaa
agtgagtttttggccaatatgagccatgaaataagaactcctcttaacggtttaatcggc
atgttggatctaacattattatctgatttaacagttgatcaaaaggaaaacctcagtatt
gccaggacatgtgttgattcgctaatgaatgtattaaatgatatacttgatttttcaaaa
atagaagcaggaaagctgctaattgaaaacgtggggtttaatttgccggaactggttgag
aagacagtgaaatcttattccgctaaagcaagtgaaaaggatatcgggataaaatacagt
gtgtgcagtgatgtgccggaaactcttagtggtgatccaaacaggctaaggcaggtatta
aataatctactgggtaatgcgatcaagtttacacagattggatctgttggtattgaggta
gaactattagagaagaccagggagtatgtaacgctcaaatttatagtcactgatactggc
ataggaatatctgcaagtgatagagaaaagctttttcagggctttagtcaggtagacggt
tcctacaccaggaaatacggtggtacaggactgggactggctatatccaagcagcttatt
gaaaaaatggacggacaaatatgggttgaaagtaataatcatgggggaagtaaatttatt
tttacgacaagactaaaaaccggcgcgttttctcccgaaaagaaaagtaatacatgcgta
tatgtggcttcaagagagttggatattttactggctgaagatgataaggtaagtcagatg
gttatctttaggatgctggaagagtttggtcactcaataactattgttaataacggtaaa
gaagctctggaaatactggctaagcatgattatgatttaattctaatggatattcaaatg
cctgtaatggatggattggcaacaactagtattattaggcagaatgaatgtgttaaagga
aaacgaacaccaataattgctttaactgcttatgccgtcaagggcgataaggaaaagttc
ttatcccatgacatggatgattatgtgtcaaaaccggtaaccatggtagacttatttaac
accatagagcgactgaacaaaaagataacgataaacaggcctggatgttccggcagttat
gttaataaagtcaatgaccgatttttcaaagacatagctgttaagacagctaatattaga
aaggctgttgctgagagtaatgatcttcttgcagaaaaaatggcacatttaataaaaaac
gattcggaaatattgcaggcagattttctgaaaagtctggcatttaaaattgagcttgcg
gtacgcaagggaaaaattgagcaggccagtgatctgtgcagtaaaattgaaatggaatta
gacagacttaagctattgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
