Desulfosporosinus acidiphilus: Desaci_4745
Help
Entry
Desaci_4745 CDS
T02148
Name
(GenBank) RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor
Organism
dai
Desulfosporosinus acidiphilus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RCC1
RCC1_2
Gly_rich_SFCGS
FAS1_thioest_ins
YajC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFM43571
UniProt:
I4DCP7
LinkDB
All DBs
Position
pDESACI.01:12213..17945
Genome browser
AA seq
1910 aa
AA seq
DB search
MLKRLSIIFSSIVILFLFACSAVYADTIFGASGDVPDVGSNYTVVPIDGLAQANQAVNQM
VTALNNGEHIIIAGGTGGSVTSSMIQSVMSQVKPNGGSITVVAGIASDQTYTMMQQYTSK
QTVSVPGNGTGNQTPNSNASTYGYASQPGGSWTGTSITAYNYGQTLLTSTAPGNTTGGLL
NYKFPTVPVYVAPPPFFPPRPSIVGSVSSHDAYPGQVLTLKATLGSATTSGRAVDNMGNT
VQITSTGNFSYTVPSNMKIGDTITFTFYASNQWIDNIMGNTDYTFVENNMTVTATANPKT
LAPTEWTSLSANTTGFSNKVTALAQPVQIDATKSTIAAGSGHTLAVRSDSTVWSAGSNTF
GQLGNNSTANSSTPVQVSGLSSIVGVSAGDSTSMALRSDGIVFVWGRGTEGQLGNGTYSN
SSTPVQVPGLSNIVSISCGGYHCMALRKDGAVFVWGYGYNGELGNNTYSCSATPLQVQNL
PKITCIGAGAYHCLAVAYDGTCWSWGYNNYGQLGDGTTTNRSIPVQVIGITNAKFVSGGM
YHSVLQSTDGSFYGWGWNAYGQLGKGDNGDSYVPAGMVGWSGQSIVACGYSTTIIGNDNT
VYSTGYGGDGQLGNGTNNTSYTFVSTGLINTLRIASGPYDCRTVLAITADYSAHVWGQNA
YGQYGDMNTVNSNTPTDYASTKNIAKALSVNQQNDQYSMLLKSDGSVWAWGNNGEYQLGI
AGSNGTDIWTPTEVTTGMVDIAMPGGGYTYNTYGVKSDGTVWAWGQCSEIYVGWGRNQTF
EGEGPPVQVTALNNIASISTGNGALYFVKKDGTVCDINGNVIPGTANIIKASTSLYGMVT
MLKSDGTVWSYGTDSSGNGGLGGASPTSNAVQIPGLSGIIDIADNSNNVLALKSDGTVYH
WGGIWDTIHGVEVYGSSTPSLVSGLSNIKYLYIGEWTLYAIDGNGNGWRWGWFTDSSGHA
SLTYPPVSTSTILPYGIYALNSSSYTTIPNNIFKLCENVNGELSFIPTNGTIASVNLFAN
NSITYSIGSTSSYTPITINFTPSDYSYPQSNSWTASLQIPINAPINSQVIVNVTSQSPWL
NTSDSKHQSVSTSIVLNIKNTIKLSNASTSATHVSPGQTITVSTASTGYALGVVAYGTNP
SNPSNPIAFNMNANTAVATIPKDNTWWVNFTIPSNAPTGAYTIWLVGYNNVFINQPNSVP
LYLNVTVGSPPLEITSVSATDPVWSHRSNLNLINATDLSTFSTWNSSDGWQSVGVQQSDG
FWQVPRVSRSGNTNSEILMSNQYSVTAGQTYTESFLYKTDGTDNSDIQIVFWTGPRWVAV
PATVTNLGNGIKQATASFTINSGETTLRALDTLPPSGNWNNISFANGQLYLSNQNIVTVY
ATTSGSTDHINISVSGQAQTNGVINPYSIALPNMLSSNKTNWYITYQVPDNVPDGSPLTF
ALTAVSPSGVSYGPVYTAVTVARHLDVFGHVSTQTASPGQVVPIDATTNGYASSVTVQDN
FSSSSVSLNPIGSITSAGNMWTGSYTIPPSARIGQSITLTYTPKDVNNGTAFTGNPDQKT
ILVVNNPQIISTTFNQTYPYAGATTGAPTGTVDAIVLTSGWINSLNVSWDTSYSIPATSY
IDIDSKGTRQWTIKGLTVPANADVSNVIPTYLNIRAQTPYIEQSTGGYQTVTGTATLPIA
NTIVTTAQQLANPVINVSAGPATVTITVKTTGYATQAWAKTISGTTIQVGSTVTGTIPYS
NTFTGTYTVPQGTPSQIFEIPVWATNTTAFVNQPQSNLDYIDLNIGGLPSIFSASLNPYT
INLPATEADRTITLYTQTTGQVSGVQVSLSVNGGPSVILPSGTMAATSGSAPGLVNWQGS
YVVDPSTPDQTQLTFTFQAKDSGGNPSGPTITPHYVTVFHAKPPIVVITH
NT seq
5733 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttaaaagattaagcattattttttcgtccattgtaattctctttctttttgcttgt
tctgcagtttatgcagatactattttcggagcaagtggggatgtccctgatgtagggagt
aactatacggtcgtaccaattgatggccttgctcaagcgaatcaggctgtcaaccagatg
gttactgccctcaacaacggtgagcatatcatcattgcgggtggtacaggtgggtcggtc
acgtcttccatgatccagagcgtgatgagccaggttaagcctaatggggggtctattacg
gttgtcgcagggatagccagcgatcagacatatacgatgatgcagcagtacacctctaag
cagacagtgagcgttccaggtaatggcactggaaatcaaacacccaactcaaatgcctcg
acctacggatatgcttctcaacctggcggctcatggacgggtacttctatcacggcctat
aactatggccaaactcttctgacaagtacagccccaggaaacacaactggcggcctttta
aattataaatttccaacagttccggtttatgttgctccaccaccgttctttcctccgaga
ccctcaatagtcggttcagtaagcagtcacgatgcctaccctgggcaggtattgactctt
aaggctacattagggagtgcaacaacttcggggcgagcagtagataatatgggaaacaca
gttcaaataactagcacaggcaatttcagctataccgtgccatctaatatgaagatcgga
gatacaataacctttaccttctacgcttcaaaccaatggatcgataacataatgggtaat
acggattacacttttgtagaaaataacatgactgtgactgcaacggctaatccaaaaaca
ttggctccgacagaatggacttctttatcagcaaacaccactggtttttcaaataaagtt
acggctttggcgcagcctgtacaaatagacgcaactaaatcaactatagcagctggttca
ggtcatacattagcagtacgttcagattctacagtatggtcagcaggaagtaatactttc
gggcaactaggtaataattctaccgctaatagcagcaccccggtacaagtatcaggtcta
tcgagcatagtaggagtaagtgccggagattcaactagtatggcacttagatcagatggt
attgtattcgtttggggtagaggtaccgaagggcaattaggtaacggaacatattcaaat
agctcgacaccggtacaggtcccagggctatccaacatagtatcaattagctgtggtgga
taccattgtatggcacttcgaaaagatggggctgtatttgtatggggttatggatataac
ggagaacttggaaataatacttattcgtgtagtgcaacgccattacaagtacaaaactta
ccaaaaataacctgtataggtgctggtgcttatcactgtttagctgtggcatatgatgga
acctgttggtcatggggttacaacaattacggtcaattaggtgacggaacaaccacaaat
agaagtataccagtacaagttataggaatcacgaatgcaaagtttgtatctggaggtatg
tatcactcagtactacagagcactgacgggtcattttatggctggggatggaacgcatat
gggcaactgggcaaaggggataacggagattcatatgtaccagctggaatggtaggatgg
tcaggtcaatcaattgtagcctgcggttacagtactacaattataggtaacgacaatacg
gtgtactccacaggttacggcggagacggtcaattaggaaatggcacaaataacacatca
tatacatttgtgagtacaggattaataaacacattaagaattgcgtcaggaccctatgat
tgcagaacagtattagcaattacggcagattattcggcgcatgtatggggacaaaatgcc
tatggacagtatggcgatatgaatacggtcaatagtaatacgccaacagattatgcttca
acgaaaaatatagctaaggcattgtctgttaatcagcaaaatgaccagtattcgatgctg
ctaaaatctgacggatcagtatgggcatgggggaataatggagaatatcagcttggaata
gcaggtagtaacggtacagacatatggacacctacagaggtaactacaggtatggtagat
atagccatgcctggaggaggttatacctacaatacgtatggtgtaaaatctgatgggact
gtgtgggcttgggggcagtgctctgaaatttatgtagggtggggacgcaatcaaacgttt
gaaggtgaggggccaccggtacaagtaactgctctcaataatatagcgtcaatttcaacc
ggaaatggggctttgtattttgtaaaaaaagatggtactgtctgtgatatcaatggtaat
gtaatacctggtacagctaatataataaaagcttctacgtctttatacggaatggttaca
atgttaaaatctgatggaactgtgtggtcttacggcactgactcgtctggtaatggtggt
ttaggtggagcatcaccaacttcaaatgctgtgcaaataccaggactatcaggaataata
gatatagcagacaacagcaataatgtcctagctttaaaatccgatggaacggtctatcac
tggggtgggatatgggacactattcatggggtggaggtctatggttcaagtacgccttca
ttagtatctggattatctaatataaaatatttatatattggcgaatggaccctatacgct
atagatggtaacggtaatggttggcgatgggggtggtttacagactcctctggccacgca
agtttaacctatccacctgtcagcacttcaacaatattaccatatggcatatacgcttta
aacagctcctcttatactacaatcccaaataatatatttaaattgtgtgaaaatgttaat
ggcgaactctcgtttatcccaaccaatggaactatcgcatcagtaaatttatttgcaaat
aattctataacatactcaataggttcaacatcatcatacacgccaataacaataaacttt
actcctagtgattactcctatcctcaatcaaattcctggacagcgagtttacaaataccc
atcaatgcaccaattaattcacaggtaattgttaatgtgacctcgcagtcaccttggctt
aatactagtgactctaaacaccaatcagtatctacttcaattgtgttaaatatcaaaaat
acaataaagttatcgaatgcaagtacttcggcaactcatgtatctcctggacaaacaatt
acagtatccacggcatctacaggttatgcgttaggtgttgttgcttacgggacaaatcca
tctaatccgagtaatccaatagctttcaatatgaatgctaatacggcggtcgcgacgatc
cccaaggataatacgtggtgggttaatttcaccattccttcaaatgcaccaacgggagcc
tatactatttggttagtaggatacaacaatgtatttattaatcagcctaatagtgtacca
ctctacttaaatgttacagtaggttctccaccattagaaataacaagtgtaagcgcgact
gatccagtttggtcgcatcgatcaaatctcaatttgattaatgctactgatctaagtacc
ttctctacatggaattcttcagatggttggcaatcagtaggtgttcaacaatcggatgga
ttttggcaagtgccaagagtaagtagatcaggtaacacaaattctgagattttaatgtct
aatcagtattcggttacagctggacaaacatacactgaatcgtttttgtataaaacagat
ggtaccgataattcggatatacaaatcgtattttggaccggtcctcgatgggtagctgtc
ccggcaacggttactaatctagggaacggtataaaacaggccacagcatcatttacaata
aactcaggtgagacaacgctaagggctttagacacgctgccgccttcgggaaattggaat
aacatttcatttgccaatggacagttatacctttccaaccaaaatattgttactgtttac
gcaacgacatccggttcaactgatcatattaatatttcggtatccggacaagcacaaaca
aacggtgtaatcaatccctattctattgcacttccgaatatgctcagtagtaataaaacc
aattggtatatcacctatcaggtaccagataatgtaccagacggaagccctctcacattt
gctttaacagcggtttccccctctggcgtatcttacgggccagtttatacggctgttacc
gtagctcgtcatttagacgtatttggacatgtcagtacacaaactgcatccccaggtcaa
gtagttcctatagatgcgacaaccaatggttatgcaagctctgttacagttcaggataat
ttctcaagttcgagtgtttcccttaatcctattggctcaattacgtctgctggaaacatg
tggacaggcagctatactatcccgccaagtgcaaggatcggacagtcaattaccttaaca
tataccccaaaagacgttaataatggaactgcgtttacagggaatccggatcaaaaaaca
attctagttgtaaataaccctcaaattatttcgacaacatttaaccaaacctatccctat
gctggagctactacaggggcaccaacagggaccgtggatgcaattgtactcacttcagga
tggatcaattccctcaatgtgagttgggacacatcctattctattccagcgacaagttac
attgatattgatagtaaaggaacgagacagtggacgattaaggggcttacagtaccggca
aatgcggatgtgagcaatgtgattcctacgtatctgaatataagagctcaaacgccttat
attgaacagtcaacagggggctatcagacggtaacaggtacagcaacgcttccgattgcc
aatacgattgtcactacggctcaacagttagctaatcctgtgatcaatgtctcagcaggt
ccagcgacggttacaatcactgttaaaacaactggctacgcaactcaggcttgggccaag
acaatctcaggaactacaattcaggttggttcaaccgtcactgggacaattccttactca
aatacctttaccggcacctatacggtacctcaaggcacgccaagtcagatatttgagatc
ccagtatgggccacaaacacaactgcctttgtgaaccaacctcaatcaaatctagattat
attgatttgaatatcggtgggttgccatctatcttttcagcgagtttgaacccatatact
attaatctaccggctactgaagcagatcgaacaataacactctatacacagacgacaggt
caggtatccggtgttcaagtgagcttgtctgtaaacggcggtccgtccgtgatcctgcct
tcagggaccatggcggctacatcaggatcggcaccagggttagtaaattggcagggctca
tacgttgtcgatccaagtacaccggatcaaacgcagcttacctttacgtttcaggctaaa
gattctggagggaatcctagcggtccgacaattacccctcattatgtaacggtctttcat
gccaaaccaccaatagtagttatcacacactga
DBGET
integrated database retrieval system