Desulfomarina profundi: DGMP_37700
Help
Entry
DGMP_37700 CDS
T07650
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
dbk
Desulfomarina profundi
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SdrD_B
CarboxypepD_reg
DUF11
DUF7619
CarbopepD_reg_2
GramPos_pilinBB
Ig_J
SpaA
EMC7_beta-sandw
Y_Y_Y
CARDB
DUF7507
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCL63077
UniProt:
A0A8D5G018
LinkDB
All DBs
Position
4093020..4099814
Genome browser
AA seq
2264 aa
AA seq
DB search
MNVVVDQDAVDPMIGEDFTFTVSFDNTAGEDVFGPYIDVLLDGGQDGNDAVTDDGISFQG
ATYSTATVESSVITVTQTDVGNGLIHPWAKDSNGDALVIHSVNGQSIREGDQFVSLRLPF
GSFTTDQPSIDVEITAHMGVNADVDVDLDVNVSTGALYGKDPLDNPQKPDPTLTGIETSS
LSFKPEVIQYRKDIEVTNVGADCQQAHDPDYDDTRQWADNSARLFEKNHQEIPTGPNFPA
TYVATIDVANGQTVTGLTLTEHLPDNIVYTGIASVEVGGVAAGYSTTLNGNDLIITLDND
VAGTAGTDDVVIKYNFYIPEQTTGGAAVIDPLSGDLTHITNNGAVGYNWDPAAGGQGDPN
DTAVVGGTVNPEVNAEGHFSSNPDIDDISHAQSIALQKDHSPSQADYAPGDTLDYTLDFQ
LSDYFSFGDHDPADTSYAFRIDDVVADGLAMHEDGSGNFTATIDIWENGNTYSEILTATG
SAGDKMWFTTGTTDDPSDVVIHYNLQKILAGMGLAGGILNGDLVDGVQQEATHGRISYQA
DIEQHYETEDASDTDVDQGDIIDGGATITGEVYDNANAAFTGQSEEDQSCDSLSISTGAV
SKDIYSVLHGGAYDYSPGGSTHISPGDTVTYLLRYSMPLSSIEDFELTDYLPLPIFDIDA
SGWSFNNTVYDGTNGAPGVGEWAYTDNDTFHSLTGVPDPTVAVNGAQNSISFDWTSYHNQ
SGAADNNSVIEIVFSVATSDKPFANGLSLTNQVQATEQGTPLEDHTTDAIIQVVLDEPDL
TIAKTAVPVSGVDAGDPVTFTVQVDNTGASAAFDTIIKDTLPSGFDQNTTSFTVERDGTA
LVAGTDFNWVGGGLDSDMATTADNFFADPGADGIYGTADDGSNGGIELIDVGGTGALGVG
QSLVITYTLVASDTVQPGQTMTNTATITNFAGAEGADDHTSEDLSDTAMVTTTEPLVVKA
VTGTGETSTQGNNVVIGETVEYSVTITLPEGESHDFQLEDYLDNGLALVSIDSITNPDGN
LVSSYGSWDSIRTSHASVTNSGTRFSLDFGNITNSDRDNGSNEQIVITYTAVVLNVSGNQ
QDTHLDNRARVSWDDPDNTGSTARTSWVDSPDVIVQEPDLQIVKEVWDPSSGSWVDADDV
ASSVHYDQGDSIDYRFTVEHSGSSHEDAFDAVFSDTLPADIDWSGASVTIVSDSAGLNGS
TVSLAGNTLSAAWDDILSGETTVFTVTGGLLQTASAGQVITNTGNLTWESVDSNRLPGNP
ISQYNTNSFERTGDPNDPGGSANDYSDSDAAVINVTGSIDKIDPSPSSYTIGDTVSYTIN
VTVPDGTTGDLIVKDTLPVGLSYISGSGVVVAGTFDGTLDTTPTITQSGNDLLFGFGDVN
ATDTGANDNTFTITFDALVTNIAANSSGSSLTNQVSMSFTDPANPAGSSLTIEDPTDPTV
HVTEPRITTTKQVEDVDGGAGDSQADNLQDVMRYTARFTNTGTSTAYEVSALDTLPPGLG
NLTLESAVYHNTGAGTDTDISASTSGVDNGNDTISFASTDGDSWDVAVGDYIEVKYTVEV
LGAWFVSGNHTNSIDADWSSRDGTDPAERIYDDTAARNPGLSQDGTQDTATATFTVPRGD
ANLGDRVWFDADADRSQDVGETGIGGVHVITTVDVGGTLYTATAITDVNGEYNFTHLQGA
PYTVTVDSSTLPAGMVQTFDYEWNSPVGDGLNHTAQYTLANNETFTGVDFGYTGIGSIGD
FVWYDTNQDGVQNESGMGINGASVTLRGDLDGDGIYEYSATTTTADDSSGNPGYYIFEHL
PFVNYTVTVDSMPNNLTHETYDLDGTGTLDTTVVSEAAIAAVTDVTNADFGYVGTGSIGN
RIWEDTNADGVQDGGEPGLGGVTVTLSGVDLNNDGTSDTLTTVTAADGSYSFAGLPPGDY
TVTVDSTSMSSDYIQSGDPDAIKDNSSSHVLSLGENYTEMNFGYTKTGSIGDTVWFDADG
NGVQNGSEPGFSGVKVTLVGDVDLDGTPDTLTTYTDADGHYLFNTLPVGNYSITVDTATL
PGGIRQTFDNDGLATADTTSVTLGYDEDNQITDFGYTGTGSIGDQLWIDQNQNGRMDSGE
LPLAGVKICIGIDLDGDGRPDYTETTVTNGAGNYIFDNLPAGAHTICVDPSTLPAGVQQV
FDPDGRLDNGTTVNLRAGEHNRSTDFGYISSTELNNSLPGEGVISTGLLSDPLLFFQASG
GRMGKRSFPSRQSLLSGPHRFYRYLRFTADMPSPGQLCHSFYMI
NT seq
6795 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgttgtggtggatcaggatgcagtggatccgatgattggtgaggattttactttc
actgtatcatttgataacactgcaggagaagatgtttttggtccatatatcgacgtattg
cttgatggtggacaggatggaaacgatgcggtgacagacgatggcatttcttttcagggt
gccacgtactccacagcaactgttgagtcttcagttattactgtaacccagaccgatgtc
ggaaatggattaatccacccgtgggcaaaagacagtaacggtgatgcgcttgttattcat
tccgttaatggtcagtctatcagggagggggatcaatttgtcagtttgcgtttgcctttt
ggttcgtttacaaccgatcagccttctattgacgtggaaataactgctcatatgggggtg
aatgccgatgtcgatgttgatctggatgtcaatgtttctacaggagctttgtatggcaaa
gacccacttgataatccccagaaaccggatccgactctgactggtattgaaacttcttct
ctttcatttaaaccggaggttatacagtacagaaaagatattgaggtgacaaatgtcggg
gcagattgtcagcaagcacatgatcccgactatgatgataccaggcaatgggctgataat
tcagcaagactgtttgaaaaaaaccatcaggaaataccaaccggaccgaattttccagca
acatatgtggcaacaatcgatgttgctaatggtcagaccgtcaccgggctcacgctgact
gagcatcttcccgataatatagtctatacgggaattgcctctgttgaggttggaggtgtg
gccgcgggatacagtacgaccttaaacggaaatgatctgatcataaccctggacaatgac
gttgccgggacagctggaacagacgatgttgtcataaaatataatttttatataccagaa
cagaccacgggaggcgctgcggtaattgatcccttatctggggatctgactcatataaca
aataacggtgcggttggatataattgggatccagcagcagggggacagggagaccccaat
gatactgcagttgtgggtggtaccgtaaatcctgaagtgaatgcagagggacatttttcc
tccaaccctgatattgatgatatttctcatgcccagtccatagctcttcaaaaagatcac
agtccgtcgcaggcggactatgcaccaggggatacgcttgactacacgcttgatttccag
ctttccgattatttctcatttggtgaccatgatccagcagataccagttacgcctttcgt
attgatgatgtcgtggctgatggtctggccatgcatgaggatggcagtggtaattttaca
gcgaccatagatatctgggaaaacggcaacacatattctgaaattcttacggcaacaggg
agtgccggagataaaatgtggttcacaacagggacgactgatgaccccagtgatgttgtc
attcactataatctacagaaaattcttgcgggtatggggctggccggtggtattcttaac
ggagacctggttgatggagttcagcaggaagcaacccatggtcgtataagttatcaggct
gatattgagcaacattacgaaactgaagatgcgagtgatactgatgtcgatcagggggat
attattgatggcggtgccactataaccggtgaagtgtatgacaatgcgaacgctgccttt
actggccagagtgaagaagatcagtcctgtgacagcctcagcatttctaccggagcggtg
agtaaggatatttattctgttctgcacggtggcgcttatgattacagcccgggtggtagt
acccatatttctcctggtgatacggtaacctatcttcttcgttacagcatgcctctgtca
agtattgaggattttgagttgactgattacctgccacttcccatttttgatattgatgca
agcggatggagttttaacaataccgtgtacgatggtacaaacggtgctccaggtgtcggg
gaatgggcatatactgacaacgatacctttcattcacttaccggtgtacccgatcccacc
gtggcggtcaatggagctcagaattccataagctttgactggacgtcctatcacaaccag
agtggtgctgcagacaataactccgttatagaaatagtcttttctgttgcaacctctgat
aaaccgtttgccaacgggctttccctgaccaaccaggtacaggcaactgagcagggaaca
ccccttgaagaccacacgactgacgcaataatccaggtggttcttgatgaaccggatctg
actattgctaaaactgctgtccctgtgtcaggagtcgatgccggtgatccggttaccttt
acggttcaggttgacaatacaggggcttccgctgcctttgatacaataataaaagacact
ctgccctccggttttgatcagaatacaacctcgtttaccgtggaaagggatgggacagcg
ctggtggcggggactgatttcaattgggtcgggggtggtcttgacagcgatatggcaaca
actgcagataatttctttgccgatcccggcgcggatggaatctatggtaccgcagatgat
gggagcaatggaggtatagagcttatagatgttggtggaacaggcgcacttggtgtgggg
cagtccctggtgataacctacaccctggtagcctcggatacagttcagcctggtcaaaca
atgaccaatacagcaacaatcactaattttgcaggtgccgaaggggccgatgatcatacc
agcgaggatctttcggatacggcgatggttacgacaaccgagcctttggtcgtaaaggcg
gtaaccggtaccggtgaaacgtctacacaggggaacaatgttgttatcggtgaaactgtt
gaatacagtgtcactataactctgccggaaggcgagtcacatgactttcaactggaggac
tatctggataatgggctggcccttgtttccattgattccataacgaatcctgatggtaat
cttgtcagcagttatggcagttgggattccatcagaacctctcatgccagtgtaacaaac
agtggtacacggttttccctggatttcggcaatattactaatagcgatcgtgacaatggt
tctaatgagcaaatcgttatcacctacaccgcagttgttttgaatgtatctggaaatcaa
caggatacacacctcgataacagggccagggtaagctgggatgatcctgataacaccggg
agtactgctcggacaagttgggtggattcacccgatgtaattgtgcaggagccggatctg
cagattgtaaaagaagtttgggatccatcgtcggggagttgggttgatgctgacgatgta
gccagttcagtgcattatgatcagggtgacagcattgactatcgctttactgtggagcac
agtggatcaagccatgaagatgcttttgatgcggttttttcagatactcttcctgccgat
atcgactggtctggcgcgagtgtcaccattgtttcagatagtgcaggtttaaatggcagt
actgtttccctggccggtaatactctttcggcagcctgggatgatattctctcgggggaa
acgacggttttcactgtaaccggcggtctgctgcagacagcttcagccgggcaggttatt
acaaatacaggaaacctgacctgggagagtgttgattctaatcgtctgccgggcaatcca
atttcacaatataataccaattcttttgagcggaccggagatccgaatgatcccggtggt
tctgccaatgattacagcgattcggatgctgctgtaattaatgttaccggatcgatagat
aagattgacccgtctccttcttcttatactattggcgatactgtttcctatacaattaac
gtgacagttcctgacggaacaacaggagatctcattgtcaaagatacgttgccggttggc
ctgagttacatcagtggcagcggcgtggttgttgcagggacatttgatggtactcttgat
acaacgccgacgatcacacagtcgggtaacgatcttctttttggcttcggtgatgtaaat
gcaacggataccggagccaatgacaatacttttaccatcacttttgatgcactggtgaca
aatattgcagccaacagctccggcagctcgctcactaaccaggtatccatgagttttaca
gatccggcaaatccggccgggtcttcactgaccattgaagatcctaccgatcccacagta
catgtaacggaaccccggataacaaccacaaaacaggtagaagacgtggatggtggggca
ggagatagtcaagccgataatctccaggatgtcatgcgctataccgcacgtttcaccaat
accggaacctccactgcctacgaggtttcggctctggataccctgcctccgggattgggt
aatttaacgctggaaagtgcagtgtatcataacaccggtgccggaacggacacggatata
tctgcttcgaccagtggtgtggataatggtaatgataccatcagttttgcaagtactgac
ggagattcctgggatgtggctgtcggtgattatattgaggtaaagtatacggtcgaggtg
ctgggtgcatggttcgtcagtggtaatcacaccaacagtattgatgctgactggtccagc
agggacggcaccgatcccgctgaaagaatatatgatgatacagcggctcgtaatccggga
ctgtctcaggatggtacgcaggatacggcaacggcaacgttcactgtacccagaggcgat
gccaatctgggggatcgtgtctggtttgatgccgatgcagacaggtcgcaggatgtggga
gagacaggtatcggtggggttcatgtaattactacggtggatgttggtggtacgctttac
acggctacggccataacagatgtaaacggagagtataattttactcatctacagggtgca
ccctatacggttactgtggactcttccactctcccggcaggaatggttcagacatttgat
tacgagtggaacagtccggttggagatggtctgaatcatacagcacagtatactctggcc
aataatgaaacttttaccggagttgatttcggttataccgggatcgggtccattggtgat
tttgtctggtacgataccaatcaggatggtgttcagaatgaaagcggaatggggattaac
ggtgcatctgtaacccttcgtggggatttggatggagacggcatatatgaatacagtgcc
acgacaacgacggcagacgacagttcggggaatcctggatattatatctttgaacacctg
ccgtttgtgaattacacggttacagtggacagtatgcccaataacctgacccatgaaaca
tacgatcttgatggtaccggtacactggatacaactgtcgtttcagaggcggcaattgcc
gcagtgacagatgtgaccaatgcggatttcggctatgtgggcacaggctccatcggtaac
agaatatgggaagataccaatgcggacggcgttcaggatggcggagagccaggccttggt
ggcgttacagtcaccctttcaggtgtcgatctcaacaatgatggaacctcggacaccctg
acaaccgtgacggctgcggacggaagctattcctttgccggccttccacccggagattat
acggttacggttgattcgacctccatgtcctcggactatatccagagcggggatcccgat
gcgataaaagacaacagttccagtcatgttctgtccttgggtgagaactacacggaaatg
aattttggttacacgaaaacaggatccataggtgacacagtctggtttgatgcggacgga
aacggtgttcagaatggtagcgagccgggcttttccggagtcaaagtgaccctggtgggg
gatgtagatcttgacggaactccggataccctgacaacatacacggatgcagacgggcat
tacctgtttaatacactccccgtgggtaactactcgataacggtggatacggccactctt
cctggcggcatcaggcagacttttgataatgacggtctggcgacagcagatacaacgtca
gttactcttggttatgatgaggacaatcaaataacggatttcgggtatacgggaacgggg
tcaatcggcgatcagctctggattgaccagaaccagaacggcaggatggattccggggag
ttaccacttgcaggggtgaaaatatgtatcggtattgacctggatggagatggaagaccc
gattatacggagacaaccgtcacgaacggagcaggcaactatattttcgataacctgcct
gcaggtgctcatacgatctgtgttgatccatcgacactccccgccggtgttcagcaagta
tttgatccggacggccgcctggataacggaaccaccgttaatctgagagcgggagagcat
aacagaagtactgattttgggtatatcagttcaacagagttaaataattcgcttccggga
gagggtgtaattagcacagggcttctttcggacccgcttctgttctttcaggcgtctggg
ggcagaatggggaaacgttctttcccttccagacagagcctcttgtctggcccacaccgg
ttctaccggtatctccggtttacagcggatatgccgagcccgggacaactctgtcactcg
ttttatatgatatga
DBGET
integrated database retrieval system