Denitrificimonas caeni: O6P33_10950
Help
Entry
O6P33_10950 CDS
T08709
Name
(GenBank) translocation/assembly module TamB
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
dce
Denitrificimonas caeni
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dce00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
dce02000
]
O6P33_10950
Transporters [BR:
dce02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
O6P33_10950
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBE24869
UniProt:
A0AAE9VSA7
LinkDB
All DBs
Position
complement(2358179..2361859)
Genome browser
AA seq
1226 aa
AA seq
DB search
MKRISIAVVLTVLGLILLMLGASYTVLATQAGSRWMLNQVPGLMVSGWQGAVLTEWRAEE
LQWQQEGMSLHLSNAHMQIRPSCLLRSTLCLDALEVERIALVLPPTETTDEPEQALELPD
LQLPLQIEVQRLRVGEFILNGESLVTAAGLRARWLADGIHIAELGLSHQEYSVQVKGNIV
PHADWPLQLQVAAQIPIPDEPSLTVQAQLSGSLHTLTLNAQTAGYLAATLKGEAQVLDAD
LPVQLTVNVAEFLAAADLPETLTLADLVVQMQGNMQQGYQVTAEGLLAKTPEQMRLDLAA
LVNTSGAKLESLRLSASAQEFVALQGALAWQDELQADAQLQWQEFPWHSLLEQDDIPVQL
HSLTGHVSYQAGDYQGQLDGALAGPAGPFTLTTAFAGDLQQVQLSQLLLEAGQGRLQGTA
TVGFAEGVEWLADIQASQLNPAYWVAELPGELAGNIHSQGALHDGQLQVEATADIKGKLR
DSPTQLQLELHGAQQGQEVALWQLKQANIQFGDNRITATAKVDQALAANLQLELPRLVQL
WPGLAGKAEGTVSVAGTLDKPQGQALLQAGGIAYDGNKIGKLQLSSSLLASQQAQISLNA
ERVWVGDNELGTLHIDGSGTLAAHKGELSLTGPLLQAQLKLSGVLQDHDWLGQLQQLSIS
SHEQNWALEKATAISYLNTGELTIAAHCLRDKQSSLCAGKQQILPQTKIDYRLLSFPLAT
LQPWLPSDAQIKGQVNGVFKLELLEKGPIGQILLDAGQGQLRVENDEQPQVFAWQRLRLS
SELSASAIKSKFQLKGVDSGNLEVTADIDPLSAKKKLRGNFIIENVDLSALRPFIAEVET
VRGVLDGRGTLAGDLLAPYVTGFVQVRDGQLSGGELPVPFEQLQLRADIKGEQLQLKGGW
HSGDEGTGRISGSVSWAKQLLVDIDIKGQQLPLQVEPYADIEIAPDLHVSLKDQRLFISG
EVAVPKGLITIPQLPEQAVRISPDARVIGQAEPEPAMQVAMDVTVNVGAERLRFSGFGLN
ADLRGHLQVGDNMAGRGMLELLNGRYRAYGQRLELRRARLLFAGPLSQPFLDIEAVRVTG
DVTAGLRLSGPADQPRSEIFSTPAMSQEQALSWLLLGRPLQGGGEDGNVMAQAALALGLM
GTAPITSKIAEAFGVQDFSLESEGSGVTSSVVATGRISERVSLRYGVGVFEPASTLALRY
ELTKRLYLEAASGLANSLDIFYKRNF
NT seq
3681 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagcgcatcagcattgccgttgtgttaactgtgctgggtttgattttgctaatgctg
ggcgcaagctacactgtgctggccacgcaggcgggcagccgttggatgctgaatcaagtg
ccgggcttaatggtttctggttggcagggagccgtgctaactgaatggcgcgcggaagaa
ttacaatggcagcaagagggtatgtcgctgcacttaagcaacgcgcacatgcagatacgc
cccagctgcttgctgcgcagcaccttgtgtctagatgccttagaagttgagcgcattgcg
cttgtgctgccgcccacagaaaccaccgatgagccggagcaagcacttgagttgcctgac
ttacagttgcccttgcagattgaggtgcagcgcctccgtgtgggcgagtttattcttaat
ggtgaatcattagtaactgctgcaggcttgcgtgcccgctggttggctgatggcattcat
attgctgagctgggcctgagccaccaagagtacagcgtgcaagttaaaggcaatattgtt
ccgcatgccgattggccgttgcagttacaagtggctgcgcagattcccattcctgacgag
ccaagcttaaccgtgcaggctcagttgagtggcagcttgcatacactgactttaaatgcg
cagaccgcaggttatctggcggcaaccctcaagggtgaggcgcaggttttggatgcggat
ttgcctgtgcagttaactgtcaatgtggcagagtttttagctgctgcggatttgccagaa
accctgacactggccgatttggtcgtgcaaatgcagggcaatatgcagcagggctatcaa
gtgacggccgaaggcttgttggctaaaactcccgaacaaatgcgcctggatttggcggca
ctggtcaacaccagcggcgcaaagttggaatctttgcgcttaagtgccagtgcacaagag
tttgtagccttgcaaggtgcgctagcttggcaagatgagttacaagccgatgcccaattg
cagtggcaagagttcccttggcatagcctattagagcaagacgatattcccgtgcagctg
cacagcctgactgggcacgtcagttatcaggcaggtgattatcagggccaactggatggc
gctttagcgggtcccgccgggccatttactttaaccacagcgtttgcgggtgatttacag
caagtgcaattaagtcagttgctgctggaagctggccaaggacgcttacaaggcacggcc
actgttggctttgccgagggtgtggagtggttggcagatattcaagccagtcagttaaac
cctgcgtactgggtggcagaattacccggcgagctggcgggcaatattcatagtcagggt
gctctgcatgatgggcagttgcaggttgaggccacagcagacattaaaggtaaattacgc
gactcaccaacccagttgcaactggagttacacggcgcgcagcaggggcaagaggttgcc
ttgtggcagcttaaacaagccaacatccaatttggcgataaccgcatcactgcaacagca
aaagttgatcaagcgctggctgccaacctgcagttggagttgccacgactggtgcagttg
tggcccggcttagcgggtaaagccgaggggacagtgagtgtcgccggtactttagataag
ccgcaaggccaggcactattacaggccggcggtattgcgtatgacggcaataaaatcggc
aaattgcagctcagcagtagcttgctggcatcacagcaagcacaaatcagtctaaatgct
gagcgggtttgggtgggcgataacgagcttggcactctgcacattgacggctcgggaaca
ttggcagcacacaaaggcgagctgtctttaactggcccgctgctgcaagcacaactcaag
ctcagtggcgtactgcaagaccacgattggctaggtcagctgcagcaattatcgatcagc
agtcatgagcaaaactgggctttagaaaaagcgactgcgatcagctatttaaatacgggt
gagctgactattgctgcacattgcttgcgtgacaaacagtccagtttatgtgccggtaaa
cagcaaatactaccgcagaccaaaatcgattaccgcttgttgagttttccgttggcaact
ttacagccttggttgcccagtgacgcgcagattaaagggcaggtcaatggcgtctttaag
ttagagttgctggaaaaaggccctataggtcagatcttattggatgccgggcaaggccaa
ctgcgcgtggaaaatgatgagcaaccacaggtgtttgcttggcaaaggctgcgcttaagt
agcgaactcagtgccagcgccattaagtctaagtttcagttaaaaggtgtggacagcggt
aatttagaagtcacggcagatattgatccactgtcggcgaagaaaaaactgcgcggtaat
tttattattgagaacgttgatttatctgctctgcgaccatttattgcagaagtggaaaca
gtgcgtggcgtgctggatgggcgcggcactttagcgggtgatttacttgcgccttatgtc
acaggctttgtccaagtgcgtgatggtcagctcagtggcggggagttgccagtacctttt
gaacagttgcaactgcgcgccgatattaaaggtgagcaactgcagctcaagggcggttgg
cacagtggtgatgagggcacagggcgtatttcaggcagtgtcagctgggctaagcagtta
ctggtggacattgatattaaaggccaacagttaccgttgcaggttgagccttacgctgat
attgaaattgccccagacctgcacgtgagcctaaaagatcagcgcttatttattagcggt
gaagtggctgtacctaaaggcttgatcaccattccacagttgcccgagcaagcggtacgt
atttcaccggatgcgcgagtgattggccaggctgagccagagccagccatgcaagtggca
atggacgtgacagtgaatgttggtgcggagcgcttgcggttttcagggtttggcttaaat
gcggacttgcgtggtcatttgcaggtgggggacaacatggccgggcgcggcatgttagag
ctgctcaatggtcgctatcgcgcttatggacagcgcctagagttacgccgcgcgcgtttg
ctctttgctgggcctttaagccagccttttctggatattgaagcggtgcgggtcaccggc
gatgtgactgcaggtctgcgcttgagcggtccggctgatcagccgcgcagtgaaattttc
tccacgccggcgatgagtcaggagcaagctttgtcgtggttgctgcttgggcggccgctg
caaggtggtggtgaagatggcaatgttatggcacaagcggcgttggctttgggtttaatg
gggactgcgcccattaccagtaaaattgccgaagcctttggcgtgcaagactttagcctc
gaaagtgaaggcagtggcgttacctcaagcgtagtagctacagggcgcatcagtgaacgc
gtgagcctgcgctatggtgtcggtgtttttgagccggcaagtaccttggcgctgcgttat
gaattgactaaacgcttgtatttagaagcggccagtggcttggccaactccttggatata
ttttataagcgcaacttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
