Dolichospermum compactum: NIES806_24580
Help
Entry
NIES806_24580 CDS
T10125
Name
(GenBank) glycosyl transferase family protein
KO
K20534
polyisoprenyl-phosphate glycosyltransferase [EC:2.4.-.-]
Organism
dcm Dolichospermum compactum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dcm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01005 Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
dcm01005
]
NIES806_24580
Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
dcm01005
]
O-antigen repeat unit
NIES806_24580
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Epimerase
GDP_Man_Dehyd
Glycos_transf_2
3Beta_HSD
RmlD_sub_bind
Glyco_tranf_2_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAZ86247
UniProt:
A0A1Z4V446
LinkDB
All DBs
Position
2563604..2565565
Genome browser
AA seq
653 aa
AA seq
DB search
MTLEQKIRRLQGPILVLGASGFVGANLLRQLLNYRDDVFGTTSRFPAWRLEGLNDENIFA
VDLLVDSNIDFLLEKTQPKTIFNCVAFGAYSFEKDSQLIYQTNLNLTAKLLERIATCQIS
CYVHAGSSSEYGDNCSGPHETELPAPNSDYAVSKIACANLLYFYGKKKQLPCANLRLYSV
YGPLEDSSRLIPNLIRHGVEEKYPNFVSPDISRDFVYVDDVSEAFIDTALNLKEEDYGES
FNIGSGQKTTIGDVAKVASEIFNINTEPVYNSMENRHWDISDWYANATKAQEKLQWKAKT
NFREGLIKTTAWYRELEDKERYHQSSKKFGLDTKYSVTAIIACYKDNQAIPIMYKRLRET
FLRLNIEYEIIFVNDCSPDNSEQVIQEISRTDKRVIGISHARNFGSQSAFKSGMEIATKN
ACVLLDGDLQDPPELIETFVEKWREGYDVVYGRRKKRQAPLFMQIAYKAFYRIFDHFSYL
SIPHDAGDFSLMDKKVVQAILQFPERDLFLRGVRAFVGFKQIGINYVRPERMFGVTTNNL
AKNIGWAKKGILSFSYTPLTMISFMGTVLLLLTLLLATVQIIIRILVPDSVPEGVTTVLL
TILFFGSLNLFSISIVAEYIAKIFEEVKQRPHFIRRTITKNGEIRDAYNVVKN
NT seq
1962 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactttagaacaaaaaatcagacgactacagggaccaattttagttttgggcgctagt
ggctttgtgggtgctaatttacttaggcaattactcaattatcgggatgatgtttttggc
acgacatcccggtttcctgcttggcgattagaaggattaaatgacgagaatatctttgct
gttgatttgctggttgattccaacatagattttttactggaaaaaacccagccgaaaaca
atatttaattgcgtggcttttggtgcttattcttttgaaaaagatagtcaacttatctat
caaactaatttgaatttaacagccaaacttctagaaagaattgctacctgccaaatttct
tgttatgttcatgctggcagttcttcagaatatggagataattgttcaggccctcatgaa
actgagctacctgctcctaatagtgattatgctgtttctaaaattgcctgtgctaatctc
ctctacttctatggcaaaaaaaagcaactgccttgcgctaatttaagattgtattctgtt
tatggtcctttagaagattcttcccgcctcattcccaatctaattcgccacggagttgag
gaaaaatatcccaattttgtcagtcctgatatttctagggattttgtttatgttgatgat
gttagtgaggcttttattgatacagcattaaatctcaaagaagaagattatggcgaatca
tttaatattggtagtggacaaaaaactacaattggtgatgtagccaaggttgctagtgaa
atatttaatatcaacactgaacctgtctataattccatggaaaatcgccattgggatatt
agcgactggtatgcaaatgcaacaaaggctcaagaaaagttacaatggaaagccaagaca
aattttcgagaagggttaataaaaacaaccgcatggtatcgagaactagaggataaagaa
agatatcatcagagttctaaaaagtttggtttagataccaagtacagcgtaacagcaatt
attgcttgttacaaagataatcaagcaattcctattatgtacaaacgtcttcgggagacc
tttctcagactaaatattgagtatgaaattatctttgttaatgattgtagtcccgataat
agtgaacaagtaattcaagaaatttcacgaactgataaacgggtgattggtatttctcat
gcgcgaaacttcggttctcaatctgctttcaaaagtggcatggaaatagcgactaaaaat
gcctgtgttttacttgatggggatctacaagatccaccggaattaattgaaacatttgtc
gaaaagtggcgagaaggatatgacgtagtttatggtcgtcgcaaaaaacgccaagctccc
ttgtttatgcagattgcctataaggctttttatcgtatttttgatcatttttcctatctc
tccattccccatgatgcgggagacttttctttaatggataagaaggttgtccaagcgatt
ttacagtttcctgaacgagacttatttctccggggagttagagcatttgtgggctttaaa
cagattggtataaactatgttagaccagaacgaatgtttggcgtaacaactaacaattta
gctaagaatatcggctgggctaaaaaagggattttatcttttagttacactcctttaact
atgatcagttttatgggtacagtattactgttattgaccctgttattagcaaccgtacaa
attattatccgaattcttgttccagattcagtgccagaaggggtaactacagtattactt
actattttattttttggttcactgaatttatttagcatcagtattgtcgctgaatatatt
gccaaaatatttgaagaggttaaacagagaccacattttattcgtcggacaattactaag
aatggagaaattagagatgcttacaatgtcgttaaaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system