Daucus carota (carrot): 108199274
Help
Entry
108199274 CDS
T05350
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
dcr
Daucus carota (carrot)
Pathway
dcr03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dcr00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
108199274
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
dcr03019
]
108199274
Messenger RNA biogenesis [BR:
dcr03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
108199274
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
RBD_DGKtheta
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108199274
NCBI-ProteinID:
XP_017222513
UniProt:
A0A175YQZ1
LinkDB
All DBs
Position
8:25626246..25629401
Genome browser
AA seq
450 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWDTTEEKLSEYFGNYGEVLLTSVMKDKLTGKPRGFGFVVFADPSVL
DAVLQEKHVIDGRLVEPKRAMSREEQQVSKAGNPSSGRSYGGGDVRTKKIFVGGLPPTLS
EEEFRQYFEAYGQVTDVVVMYDQQTNRPRGFGFISFDTEDAVDRVLHKNFHDLNGKQVEV
KRALPRDSNAGGGGRTMGGGVSRGGGGYPSYGASGGNVSSYDGRDSSRYMQSQNTGGGYP
SYGSSGYGASSNWYGPGGNGAGSGGYGSYGGANPGYGGPAGASYGNPNVPNTGYGSYGSG
PAGASRNAYGAHASSGYGNTQWGASGGSNGGPGGAPVSVPTGQSPSGAAAYGNQGYGYGG
YGGPDGSYGNPAAYGAVGGRPGGAPNSSSAGGEVQSGSGGYMGGNYGDPTGNSGYGNQGW
RSDPSQGSGSYGAPSGGQVGYGGGYGAPQQ
NT seq
1353 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcaggggaagctgtttattggtgggatatcatgggacacgactgaggag
aagctgagtgagtattttgggaattatggggaggttttgttgacatctgtcatgaaagat
aagcttacgggaaagcctagaggctttggctttgttgtctttgcagatccttctgttctt
gatgctgttcttcaggagaaacatgtcattgatggcagattggttgagcctaagagggcc
atgtctagggaagaacaacaagtgtcgaaggctgggaacccaagttctggcagaagctat
gggggtggtgatgttaggactaagaaaatttttgttgggggtttacctccaacattgagt
gaagaagaatttcgtcagtattttgaggcttatgggcaagttactgatgtggtggttatg
tatgaccagcagactaatcgtccacgtgggtttggttttatatcttttgataccgaggat
gcagttgatcgggttttgcacaaaaacttccatgatttgaacggtaagcaagtggaagtt
aaaagggctcttcccagagattccaatgctggtgggggtggtcgtactatgggtggcggt
gtaagccgtggtggtggaggttatccgagctatggcgcatctggtggcaatgtaagttca
tatgatggtcgtgattcgagcaggtacatgcagtctcagaatactggtggtggttatcca
tcatatggatcatctggatatggtgcatctagtaattggtacggtcctggtggtaatggc
gctggttctggtggctatggtagttatggtggtgccaatcctgggtatggtggtcctgct
ggggcctcatatggaaaccctaatgtcccaaatactggttatggttcttatggtagtggt
ccagcaggtgcttcaaggaatgcatatggtgcccatgcatcttctggatatggtaatact
cagtggggtgcttcgggtggctctaacggtggtcctggtggtgcacctgtttctgtgccc
acaggtcaatctcctagtggagctgctgcctatgggaaccaaggttatggctatggtgga
tatggtggaccggatgggtcatatggaaatccagctgcatatggtgctgttgggggtcgg
cctggtggtgccccaaatagttcatctgctggtggtgaagtacaatctggcagtggagga
tacatgggtggtaattatggggatccaacagggaattcaggatacggaaaccaaggatgg
agatctgacccctcgcaaggttctggtagttatggggcacctagtggcggacaagttgga
tatggcggtggttatggcgcaccacaacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
