Daucus carota (carrot): 108223483
Help
Entry
108223483 CDS
T05350
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At1g06143-like isoform X1
Organism
dcr
Daucus carota (carrot)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR
PPR_2
PPR_1
PPR_3
E_motif
PPR_long
Eplus_motif
Ig_F54D1_6
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108223483
NCBI-ProteinID:
XP_017253261
UniProt:
A0A164XQM3
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(6928354..6935718)
Genome browser
AA seq
553 aa
AA seq
DB search
MYDTVMNCFKKCFNLKELECLYALMIKNNAVQDCFYMNQFITTCSTFRRTDYAVRAFIQM
KSPNAYVYNAIIKAFIHCLNPIQALHFYLSMLRAGVSPSSYTFPSVIKGCVLVSDLGFGE
SVHGQIFRFGFGSNVFVQTSLIDFYSGFGRLVGARQVFDEIPERDGFVWTTMLSGYSRGG
DMGSARRLFDEMPERNVATWNSLINGYARVRDMGSCELLFREMPEKDLISWTTMISCYSQ
NKLYSEALTVFSEMRMNGVRPDEVTMTTVISSCAHLGALDLGKDIHLYVMQNGFELDVYI
GSALIDMYAKCGSLERALVVFFKLQEKNLFCWNSIIEGLAVHGLAEEAISMFGRMEKDNI
KPNGVTFISVLSACTHAGLVEVGRRWFKKMTHELSITPQIEHYGCMVDLLCKAGLFEDAL
ELIQSMTMEPNAIIWGAVLGGSKLYKNLDIAQVAANMLMVLEPNNSGYYSLLVSMHADAN
RWNEVAKTRSAMKELGVEKSCPGSSWIEMESKIHQFAASDKCHPAASQIYSLLHELESQL
KLYGHVLEFEFFT
NT seq
1662 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtacgatactgttatgaactgtttcaaaaaatgtttcaacttaaaagaactcgaatgc
ctctatgccttgatgatcaagaacaatgctgtgcaagattgcttctacatgaaccaattt
ataacaacctgttctacatttcgtcgaacagattatgcagttcgagcatttatacagatg
aaatcccccaatgcttatgtatataatgctataatcaaagcttttattcattgtttaaac
cccatccaagctctacacttttatttaagtatgttgagagctggagttagcccaagtagc
tatacatttccttcagtgattaaagggtgtgtgttagtttctgatttagggtttggagaa
tctgttcatgggcagatttttagatttgggtttggttcaaatgtgtttgttcagacttct
ttgattgatttttactctgggtttgggagacttgtgggtgcaagacaggtgtttgatgaa
atacccgagagggatggttttgtgtggactacgatgctttcaggttattcgcgtggcggt
gatatgggttctgcgaggagattgtttgatgaaatgccggagaggaatgtggctacttgg
aattctctgattaatggttatgcgagagtgagggatatggggagttgtgagttgttgttt
agagagatgccggaaaaggatttgatttcgtggacgacgatgattagttgttattctcag
aataagttgtatagtgaagcattgacagtgtttagtgaaatgaggatgaatggagttaga
cctgacgaggttacgatgaccactgtgatttctagctgtgcacatcttggggcgcttgac
ctgggaaaggatattcatctctatgttatgcaaaatgggtttgaacttgatgtttatatt
gggtctgcgctaattgatatgtatgcaaaatgcgggagcttggaaagagctctggttgtg
tttttcaagttacaggagaagaatttattctgttggaattcgattattgaaggactggca
gtacatgggcttgctgaagaagcaatctcaatgtttggcaggatggagaaagataatata
aaacctaatggtgttacatttattagtgttctgagtgcttgcactcatgccggactagtt
gaagtgggtcgcagatggtttaagaagatgacacatgaattgtcgattacaccacaaatt
gagcactatggatgtatggttgatctgttgtgcaaggctggtcttttcgaagatgcatta
gaacttatacaaagcatgacaatggaaccaaatgctataatctggggcgcagtactagga
gggtcaaagctatacaaaaacttggatattgctcaagttgcagcgaatatgctaatggtt
ttggagccaaacaatagtggatattacagtcttttagtcagcatgcatgctgatgcaaac
cgatggaatgaagttgctaaaactaggtcagctatgaaggaacttggagtagaaaagagt
tgccctggctctagttggattgaaatggaaagcaagattcatcagtttgcagcatctgat
aaatgtcacccagccgctagccaaatttattctcttctacatgaattagaaagccagtta
aagctgtatggccatgtattggagttcgagttttttacatag
DBGET
integrated database retrieval system
