Dendrobium catenatum: 110098289
Help
Entry
110098289 CDS
T05027
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At3g13880
Organism
dct
Dendrobium catenatum
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR
PPR_1
DYW_deaminase
PPR_3
E_motif
PPR_long
Eplus_motif
DUF4476
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110098289
NCBI-ProteinID:
XP_020680723
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
815 aa
AA seq
DB search
MQCSQKYLIGYLECTSFKLCKGFSTLLQSMDSLAYSDILQSSTDTHSLPLGKSVHAHMIR
NHFKQNLFLQNNLLNLYCKCGDMNHAHKLFDVIPNKDIVSWNVLVSGYFQSGFSDEAIRV
FKVARNAQIKLDRFAYAGAVSICSRTGNLSFGKAVHGLIVVSGFTKHAFLTNSLLDMYSK
CGRIDEVRRVFDNSDHLDDVSWNSLVSAHVRIGLVFETLRIFAQMHLLGCKINCFSVGSV
LKCCSYSAELLQFGRMVHSSVIKVGLDYDVFVGSSMIDMYSKNGILEEAINVFKGMADPN
VVVFNAMISGFCQLKMESHNELAGESFTLYSEMRRKGMMPSKFTFSSVLRACNLTDSFEL
GKQIHAQVYKCKLQFDEFIGSALIDLYSKSSSIEDGLSCFHSIPKQDIVTWTSMISGYVQ
NEHFERALSLFDDLLTIGRKPDEFTLSSVMSACANLAISKSGEQIQNYVTKTGFDRYIIC
GNAQIFMYARSGDTEAASQTFYEMVNHDVVSWSAMISSHALYGCAKDALALFGDMKCCGV
APNHITFLGVLTACSHGGLVDEGFRYFESMKRDYGMVPNMKHCACIVDLFGRSGRLDKAE
KFIMDSGFQDDPIVWRSLLSSCRIHHDIERGRQVAERLMQLDPNASATYVILYNMYLDSG
RRSMALRTRELMKERGVKKEPGLSWIEMGGSIHSFVAGDKIHPRRQEIYAWLEEMISRIE
RLGYVRNATSESDDLGLEKKVNLLNCHSEKLAVTLGILSLPKAAPIRVMKNLRVCVDCHT
TMKLFSAVEGREIVLRDPIRFHRFRDGSCSCGDYW
NT seq
2448 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaatgctctcagaagtacttgattggctatttagaatgcacatctttcaaactatgt
aagggcttttccaccttactccaatctatggactctttagcttactctgatattctgcaa
tcttccactgatactcattctctccctcttgggaaatccgttcatgcccatatgatacga
aatcatttcaagcaaaatctttttctccaaaacaatcttcttaacttgtactgcaagtgt
ggggacatgaaccatgcccataagctatttgatgtaattcccaacaaagatattgtgtca
tggaatgtgcttgtatctggatatttccaatcaggttttagtgatgaagccatacgtgtg
ttcaaagttgctagaaacgcacaaatcaagctagaccgcttcgcttatgcaggtgcagta
agcatctgttctcgcactgggaacttgagttttgggaaggcggtgcatggccttattgtt
gttagtgggttcacaaagcatgcttttcttacaaattcacttttggacatgtactcaaag
tgtggtcggattgatgaagtgaggcgtgtctttgataattcagatcatttagatgatgtg
tcatggaattcattggtttcggcacatgttagaattggtttggtctttgaaactctaagg
atttttgctcaaatgcatttgttggggtgcaaaatcaattgtttttcagttggaagcgtt
ctcaagtgctgctcatactcagctgagttgctgcagtttggtagaatggtgcatagctct
gttattaaggttggattggattatgatgtttttgtgggaagttctatgattgacatgtat
tctaagaatggtatcttggaggaagcaatcaatgtctttaagggaatggctgatcctaat
gttgttgtattcaatgccatgatatctggattttgtcagttgaagatggaatcacataat
gagcttgcaggtgaatcttttaccttatactctgagatgcgaaggaaaggaatgatgcca
tccaagtttactttctccagcgtgttgagagcttgtaacttaactgattcctttgagctt
gggaagcaaatccatgctcaagtttataaatgcaaactccaatttgatgaattcatagga
agtgcactgatagacttgtattctaagtcaagctctattgaagatggacttagttgcttc
cattctatacctaaacaagatattgttacttggacatcaatgatttcaggttatgttcag
aatgagcactttgaaagggcactcagcttgtttgatgatctattgacaattggaagaaag
ccagatgagttcactctatcaagtgttatgagtgcttgtgcaaacttggctatatcaaag
tcaggtgaacagattcaaaattatgtgaccaaaactggatttgaccgatatatcatttgt
ggcaatgcacaaatcttcatgtatgcaagatctggtgatactgaagctgccagtcaaact
ttttacgagatggttaatcatgatgtggtgtcatggtctgcaatgatctccagccatgca
ctgtatggttgtgctaaagatgctcttgccctttttggcgatatgaaatgctgtggagtt
gcccctaatcacatcacttttcttggtgttcttactgcctgcagccatggaggcttagtg
gatgaaggatttaggtactttgaaagcatgaagagggactatggaatggtacctaatatg
aagcattgtgcttgcattgttgatctctttggtcgatctgggaggcttgataaggctgag
aaattcataatggattctggctttcaagatgatcccattgtgtggcgatcattgttgagc
tcctgtcgaattcatcatgacattgaaagaggcagacaagtggcagagaggttaatgcag
cttgatcccaatgcttctgctacctatgtcattctctacaatatgtacttggattctggt
agacgatctatggctttaagaacaagagagctaatgaaagaaagaggggtgaaaaaggaa
cctggacttagttggattgagatgggaggatcaattcattcttttgtagcaggtgacaag
atccatccccgaagacaggaaatatatgcatggctggaggagatgatttcaaggatagag
aggctgggttatgtcagaaatgcaacttcagagtcagatgatttaggcttagagaagaag
gtgaatttgttaaactgtcatagtgagaagttggcagtgacacttggaatattatcattg
ccaaaagcagctcccatcagggtgatgaaaaacttgagggtgtgtgtggattgccacaca
acaatgaagttattctcggcagttgaaggaagagagattgtgttaagggacccaattcga
tttcatcggtttagagatggttcatgctcttgtggtgactattggtag
DBGET
integrated database retrieval system
