Deferribacter desulfuricans: DEFDS_1116
Help
Entry
DEFDS_1116 CDS
T01188
Name
(GenBank) conserved hypothetical protein
KO
K03592
PmbA protein
Organism
ddf
Deferribacter desulfuricans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
ddf01002
]
DEFDS_1116
Peptidases and inhibitors [BR:
ddf01002
]
Peptidases of unknown catalytic type
Family U62
DEFDS_1116
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PmbA_TldD_3rd
PmbA_TldD_2nd
PmbA_TldD_1st
DUF5048
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAI80585
UniProt:
D3PDB2
LinkDB
All DBs
Position
1109293..1110612
Genome browser
AA seq
439 aa
AA seq
DB search
MNYLDIIEYGLKLYDDITVLIIENERKKVSVKQGEIEDYNIDKSRDHFIRLLKDGKHYAF
RVSEGSFNDIKNMLNEVKDVFVYLPKDNYQLLCSDDKYENQLYLKDNSYEQFSTNLLLNT
ALEIEANALNYSDFIKKVRFTSFSANLEKRHIIFSNGEVLLEETTSFSGSTYVVAEDGND
SQSGYDFLSTVFYDDFDYNMVGQRAAREAVDLLGSKKLKSGKYYIVFKNSVMAEFLDLIA
ELVNAENILKNKSFLKNKIGENITSKIINLYDDSKMEGCVGSYYFDDEGVAGGKTEIFKD
GLLQGYLHNSYTSKKLNHKNTGNASISGSGKLGISPSNLILTGENIVSFDEIGKFDNVLF
VTEVMGMHMADPISGNFSIGINGTYYKNGEKITPFGELVLTGNLADLLYNVIAIFDDARD
FGGVITPSVMFDKFTVSGS
NT seq
1320 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattatttggatattatagagtatggtttaaaattgtatgatgatatcacagtttta
ataatagaaaatgaaaggaaaaaggtttctgtaaagcagggggagatagaggattataat
attgataaaagcagggatcattttataagattgcttaaggatggaaaacactatgctttt
agggtttctgaaggctcttttaatgatataaaaaacatgttaaatgaagtaaaggatgtt
tttgtctatcttcctaaagataattatcagttattatgtagcgatgataaatacgagaat
caactttatctaaaagataacagttatgagcaatttagtacaaatctgttattaaatact
gcattagaaattgaagctaatgcattaaattatagtgattttattaaaaaggttaggttc
acaagtttttcagcaaatcttgaaaaaaggcatataattttttctaatggagaagtttta
cttgaagaaacaacctcatttagtggttcgacatatgttgttgctgaagatgggaatgat
tcgcagagtggttatgattttttaagtacagttttctacgatgattttgattataatatg
gtaggtcaaagagctgccagagaagcagtggatttactgggtagcaaaaaactcaaaagt
ggaaaatattatatcgtttttaaaaatagtgtgatggcagaatttttagatttgatagct
gagctggtaaatgcagagaatattttgaaaaataaaagctttttaaaaaataaaattggt
gaaaatatcacctctaagattattaacctttatgatgattcgaagatggaaggatgcgtt
ggtagttattattttgatgatgaaggggtcgctggaggaaaaacagaaatatttaaagat
ggcttattacaagggtatttacacaatagttatacatcaaaaaaattaaatcataagaat
actgggaatgcttctatatctgggagtggtaaattaggtataagcccgtccaacctaatt
ttaactggagaaaatattgtatcttttgatgaaattggtaaatttgataatgttttgttt
gttaccgaggttatggggatgcatatggctgatccaattagtggtaatttctctattggt
attaatggaacttattataaaaatggagaaaaaatcactccttttggtgagttagtttta
acaggcaatttagcagatttgctatacaatgtaattgctatatttgatgacgcaagagat
tttggtggcgttataacgccttctgttatgtttgataaatttacagttagtggttcttaa
DBGET
integrated database retrieval system