Deferribacter desulfuricans: DEFDS_1846
Help
Entry
DEFDS_1846 CDS
T01188
Name
(GenBank) TRAP-type transport system, permease component
Organism
ddf
Deferribacter desulfuricans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DctM
DUF3394
MtrH
DUF3487
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAI81301
UniProt:
D3P9B1
LinkDB
All DBs
Position
complement(1860318..1862345)
Genome browser
AA seq
675 aa
AA seq
DB search
MNSENIKKAEEILKEETGELREFRPHERLIFDTIAVGWAFFQLALASFLILNSTYVRAIH
LAFAMALVFLSIPFFKKPKRVLRFLSVTDKIPLIDYIFAILGVVSALYIVIDYNGIAMRA
GSPLPRDVIFGLLLIVVLLEATRRSIGPALSFIAIVFSLYAFFGPYMPDVLAYKGVTLTK
YVNQLSLSTEGIYGIPLGVSASIVYLFVLLGSMLDRAGAGKFFIDLAVSLLGKYKGGPAK
AAIVSSALTGLVSGSSIANIVTTGTFTIPLMKSVGYPAKKAAATEVAASTDGQLMPPIMG
AAAFIIAEYVNVPYIEVVKAAAIPAFVSYFALFFVTHLEASKLGLKGLPKEQLPDFKKTL
RNGLHYLIPIGMLVYELVVLRHSPELAAFRAIIVLAVIIFIQEFVKFKRGENDHWLKSAI
SIIKSGFVGGSRNMISVALATASAGIIVGLVNTGIGSMITEIVENLAQGNIFLLLVITAI
ASLLLGMGLPTTATYIVMASLTAPIIVEVGASYGFFVPLMAAHLFCFYFGILADDTPPVG
LASYAAAALADSEPIPTGLQGFLYDMRTAIIPFMFVFNPDLILHQVYSWPLGILIFVMAV
FAAFAFTSVIQGWLITKNKWFEIPFLLVAALILFNPEILLHYLPLGPEYKYYMYIPGLAL
FFLVLIEQKLREKLV
NT seq
2028 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaactcagaaaatataaaaaaagcagaagagatactcaaagaggaaacaggggaatta
agagagtttaggcctcatgaaagattaatctttgatacaattgcagttggttgggcattc
ttccagttggcattagcgagtttcctaattttaaacagtacatatgtgagagctattcat
cttgcttttgctatggccttagtatttttatcaatccctttctttaaaaaaccaaagcgc
gttttacgctttttgagtgtaacagataaaatacctttgatagactatatctttgcaatc
ttaggagttgtttcagctttatatattgtgatcgattacaacggtattgcaatgcgagca
ggtagtcctttacctagagatgttatttttggtttgttattaattgtggttttacttgag
gctacaaggagatccattggtcctgctttgtcattcattgccatagtcttttcactttat
gcatttttcggcccatatatgcctgatgttttggcctataaaggtgttactttaaccaaa
tatgttaatcagctttcgctatctactgaagggatatatggtatacctttaggtgtttca
gcttcaatagtgtatctttttgtactcttaggatcgatgctcgatagagctggtgcaggt
aaatttttcattgatttagctgtatcattacttggtaaatataaaggtggacccgctaaa
gctgccattgtttcaagtgctttaacaggacttgtatcaggctcaagtattgcaaatatt
gtgactactggtacgtttactattcctcttatgaaaagtgttggttatccagctaagaaa
gcggcagctactgaggtagcagcaagtactgatgggcagctcatgccaccgattatgggt
gcagctgcatttattattgcagagtatgtgaatgtaccttatatcgaggtagttaaggct
gctgcaattcctgcatttgtttcttattttgcccttttttttgttacccatcttgaagca
agtaagttagggctaaaaggtttgccaaaagagcagcttccagattttaagaaaacactt
agaaatggtttacactatcttattcctattggtatgttggtttatgagcttgttgttttg
agacattcaccagaacttgctgcatttagagcaattattgtattagctgtcattatcttt
attcaagagtttgtaaaatttaaaagaggagaaaatgaccattggttgaaaagtgcaata
tcaattattaaatcaggttttgttggtggctcaagaaatatgatatctgttgcacttgcg
actgcttcagcaggaataattgttgggcttgtaaatacaggaatcggtagtatgattact
gagatagttgagaatcttgctcagggtaatatattcttgttacttgttattacagctatt
gcaagtttgcttcttggtatggggcttcctactactgctacatatattgttatggcgtca
ttgacagcaccaattattgttgaggttggggcaagttatgggttctttgtccctcttatg
gcagctcacttattctgcttctattttggtatattggctgatgataccccgcctgtggga
ctcgcatcatatgctgcggctgctctggctgactcagagccgattccaacaggtttgcag
ggtttcttatacgatatgagaacagcgattataccatttatgtttgtatttaatcctgat
ttaatacttcatcaggtgtatagctggccgttgggaattttgatatttgttatggctgtt
tttgcagcattcgcttttacaagtgtgattcaaggatggctcattacaaaaaataaatgg
tttgaaattccatttttgttagtagcagcgctcatactatttaatcctgaaatattattg
cattacttaccacttggtccagaatataaatattatatgtatatacccggtttagctctt
ttctttttagtattgatagagcaaaagttaagagaaaaactcgtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
