KEGG   Deferribacter desulfuricans: DEFDS_P071
Entry
DEFDS_P071        CDS       T01188                                 
Name
(GenBank) CRISPR-associated protein, Csh1 family
  KO
K19114  CRISPR-associated protein Csh1
Organism
ddf  Deferribacter desulfuricans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ddf00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:ddf02048]
    DEFDS_P071
Prokaryotic defense system [BR:ddf02048]
 CRISPR-Cas system
  Type I CRISPR-Cas system
   Subtype I-B factors
    DEFDS_P071
SSDB
Motif
Pfam: Cas_TM1802_C Cas_TM1802_M Clat_adaptor_s Cep192_D1
Other DBs
NCBI-ProteinID: BAI81695
UniProt: D3PEQ3
LinkDB
Position
pDF308:complement(82683..84569)
AA seq 628 aa
MITALKDLGELVYNDYITGLYDSKILSSKISIAELCDIKSLSDIKSLSDEKINIFTDTLT
DDLSNDSYIIREWCLEFDNNYELISPNIIEKDFQKENSYLYLYKRGSSRGTNYSPAFLDK
NANTKLNKLEQWFKNHLHINEIAQMFNEVEKHKNTILNDLIKLTQIINPKKSSREKAIFT
IKINGKYLFEIDKPNFKRILVEDYILKVTNNFQKTFSTCSICRTHKQVFSTSEIFRFYTT
DKVVYVAGGFDKDKAWKNFPICLECFIKAIIGRKTVENNFKYSFYGSNYILIPKIILNKD
NTILDEINNLLAVDKKQQNISNENRKYITNNKSEILDIISTYKDAISFYFLFLKKDNSAE
RIVLLVEDVYPSRLKTIFNAKEKIDKLFNIDYNLSYIYEFVKNDNKLFFDITNKIFKGGH
LDFNLFIRLQMDGIREKLFKDNSRNKNKLKKTILSAIMNVRFLEELEILNKEVKPMQENS
KFNEIFEKIGKKLNTPARRGIFLLGALVEKLIEIQKGKRTNSPFIKQLKGGKLTEKDIQS
LFTNTLVKYREYDAYYPFVRILAKEISNYLLKENKFHMTVDEINYYLFAGTSYYNDVIEI
AKQIAEEQKQIQNNNNENNTEENTNKNE
NT seq 1887 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgattacagctttaaaagatttaggtgaattagtctataatgattacattacaggatta
tatgattctaaaatattatctagtaaaataagtatagcagaattatgtgatataaaatca
ttatctgatataaaatcattatctgacgaaaaaataaatatatttactgatactttaaca
gatgacttgagtaatgactcttatattataagagaatggtgtttagagtttgataataat
tatgaattaatatcacctaatataattgaaaaagattttcaaaaagaaaatagttactta
tatttatataaaagaggttcttctagaggtactaactatagcccagcttttctagataaa
aatgcaaatacaaaattgaataaacttgaacagtggtttaaaaatcacttacatattaac
gaaattgctcaaatgttcaatgaagtagaaaaacataaaaacacaatattaaatgattta
attaaactaacacaaataataaacccaaaaaaatccagtcgagaaaaagctatttttact
ataaaaattaatggaaaatatttgtttgaaattgataaaccaaactttaaaagaatttta
gtagaagattatatacttaaagttacaaataattttcaaaaaacattttctacatgtagt
atatgtagaactcataaacaagtattttccacctctgaaatttttagattttatactaca
gataaagttgtttatgtcgcaggtgggtttgacaaagataaagcatggaaaaacttccct
atctgtttagaatgctttatcaaagcaattataggaagaaaaacagttgaaaataatttt
aaatatagtttttatggtagtaattatatattaatacctaaaattatactgaataaggat
aatactatattagatgaaattaataatttgttagcagtagataaaaaacaacaaaatata
tcaaacgaaaatagaaagtatataacaaataacaaaagtgaaatcttagatattataagt
acatataaagatgctattagcttttattttctctttttaaagaaagataattcagctgaa
agaattgtattattagtagaagatgtatatccatctagacttaaaactatttttaatgcc
aaagagaaaatagataaattatttaatatagattataatttgagttatatatatgaattt
gtaaaaaatgataataagttattttttgatataactaataaaatatttaaaggtggacac
cttgattttaatctatttatacgtcttcaaatggatggtattagagaaaaacttttcaaa
gataattcacgtaataaaaacaaactcaaaaaaacaatattaagtgccattatgaatgta
agatttttagaagaattagaaatattaaacaaggaggtaaaaccaatgcaagaaaattct
aaatttaatgaaatatttgaaaaaataggtaaaaaactaaacactccagcaagaagaggt
atattcttgttaggagctcttgtagaaaaattaatagaaatacaaaaaggtaaaagaact
aattctccatttataaaacaattaaaaggtggtaagctaactgaaaaagacattcaatct
ttatttacaaatacattagttaagtatagagaatacgatgcttattatccttttgtaaga
atattagcaaaagaaatttctaattatttattaaaagaaaataaattccatatgactgta
gatgaaataaattattatctttttgctggaacaagctactataatgatgtaatcgaaata
gcaaaacaaatagcagaagaacaaaaacaaattcaaaataacaataatgaaaataatact
gaagaaaatactaataaaaatgaataa

DBGET integrated database retrieval system