Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0268578
Help
Entry
DDB_G0268578 CDS
T00245
Symbol
gefV
Name
(RefSeq) RasGEF domain-containing protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RasGEF
LRR_8
LRR_4
LRR_1
RasGEF_N
Drf_GBD
FERM_f0
TFIIA
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8616407
NCBI-ProteinID:
XP_647595
dictyBase:
DDB_G0268578
UniProt:
Q55FD8
LinkDB
All DBs
Position
1:1563062..1569010
Genome browser
AA seq
1982 aa
AA seq
DB search
MGNINSICLNNNGKYRIDSISCSLEGCKLNSKELVENMVALVDKYPLTQLLIIRECKLKQ
IPVNITNLSNLSELILSDNKLSQLPWSLPPPFKPNTLLSMASITNENLVRLDLSNNRFTE
FPSSVFVLPNLKQLILCNNQLTNMNVTLCGGTSNNNGAHQPHIACQLEELKLSNNNFTIF
PSIIGDQLTTLKSLDLSGNTITSLPNSFSNLVSLTSLNLKSNKFTCFPPSLCTLDKLVHL
NLSCNQILVSPSDHTLGVSLLPSLEKLELQHNRFAHFPMDILEIVSLRVLKLQDNDIDKI
PDKIGNLLNLNELFLSENKITQLPSTIGELINLRKLYLEYNKIGSLPQEFSKLSKLNILI
LHNNDLKFVPDQLHSLSQLLRLSLDENQLSSSDQKLIKSEGSLALIKRKNKLNYGSTMNG
TGTTSSSGSASTSTHGSINKTTDILLSSVTLNNSILNQINNNNNNNNNNNNNNNNNNNSS
NNNSGTNSLSSTPNGTGKSKKKLTHLTISRSLFRGNSSNLESEKEDFINKKQQQQQQQQQ
QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQLGSTASPSTASPITSHITVNSTVLDFEDDIQKMQL
GLEALSNLETSIGSNNSGGGDSMNGSGGNINNSGGSGSGCGTISGSTTKQRRGSVFLPPT
NAFKLSPNVVSSSYNTLPASVMSGLLQQQNLENGGVGSGSGSGSPIISANSICNSNSSSS
NSLLKPPIINTTNLSTSPNLLSQSSTSFLNLPPLNQSSTNSFLPPQHQHHHHHSNLSQSL
SINNLAHRLPTSLSSSSLSSNNTYDSLQFQQQQQHHHHNHNNHQNSNQPLATIVPSFSKF
KNSFDQLLEEQDFSKKKRETLQKLSKEQKWNLLLQYRNSTLNMLNMKEHSNNSNNNQSIK
NSTIIASTTTTTTTNGESLDGSSIQQQITKNSNFQSSRFYIDNLTSKTDISLVKEVHDFL
KESGPEVSIFIGMGGIESLLGILQFNLDNAQLQFDEEKVGYCLLCLKILVECTAKSVITT
NNSLNLVTMFLTSASKYIIDIIIDIYDELLRLQVIGVSVVLDSLINFQKVKGLSSPYVPL
VALLRNPIIEMPTKTTVFKIINFLIYSFSVLEERFSVICSLLKVGILEVIGMFRALPHTS
YSLRFELDLFEEVLDSDESELVKKIGRKEVLKRMSNEDNDLSKQSSKQSMDFVRVVMVSA
GYGDLKIDLDERTSYANVIDFIQSNYQIKYSIDRYGLFVPAIGSLVLDGSILQSSGSQSR
WVDPSKSLIDNGLSNEIVEFKMKPMQIQVLQSVVVVVATNHQKEDIIKEFTIDPQLKCFE
IVQYLRTRLDSSSPAFQRKISVLTEDEDEDYESDIYGVYCFSSLESYDQGSWYPLNSRFL
DFNPTNTPTIIDVKLMERPLRVLFSGTEKLMKFNPYVPVSELIKEIKNEIHLKINIEDYG
ISYVPNVSSSNLSSLIIEETWLDPTKTLLDHNDMKCSVVQFKFKPRTVSVMVLVESGIEI
PTTDTPYQFVNTNSISEIIEKICTPHQLNPLSHSLYISDCQGQKIKLLSRQNCLRDQQVN
NGDHLIITSKQKDLPSDFNVWDEPNDSSETITYSKDRRVSSVTLNKLIEKLTSPEYTQDS
EMKTIFLSSYRSIITPSVLLSKLMERHTIPTLVDKERGKLIQRKTRLLIKSWLELETTKN
REEVITLLVQNMPAQSIEDDGLKELTELFVDLSTKSYSSILPIVIGELPKCKIPKIIDSY
VTFADMDEIEIARQLSLLTFPLYSRIETSELLNQRWSKPGGGPNIMSVVGLFNKISNWVS
FTIVNQPKLRDRAVVYGKMVKIANAFYELRNYHLLMAIISGLNASPVLRLKYTKGKLSKN
LKDNLDTLEELMSTQSSMKNYRADLAAASPPAIPFMGFHLSDLVFIDEGNQQLCDSRINF
KKLEMYKKTIATLQNFSLFPYQFTPVPIIQNYFLDYKIVADKPIYEMSLSAEPRNAERYD
IQ
NT seq
5949 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggaaatataaattcaatttgtttaaataataatggaaaatatagaattgattcaatt
tcatgttcattagaaggatgtaaattaaatagtaaagaattggttgaaaatatggtagca
ttagttgataaatatccattaacacaacttttaattataagggaatgtaaattgaaacaa
ataccagttaatataaccaatttatcaaatttaagtgaattaatattaagtgataataag
ttatcacaattaccatggtcattaccaccaccatttaaacctaatacattattatcaatg
gcatcaattaccaatgagaatttggttagattggatttatcaaataatcgatttacagag
ttcccttcaagtgtatttgttttaccaaatttgaaacaattaatactatgtaataatcaa
ctcaccaatatgaatgtaacattatgcggaggaacatcaaataataatggagcgcatcaa
ccacatatagcatgccaattggaggagttgaaattgtcaaataacaatttcacaatattt
ccctcaatcataggtgaccaattaacaaccttgaaatcattggatctctctggaaacact
ataacctcattaccaaactcgttctcaaatttggtgtctttgacatcattgaatttaaaa
tccaataaattcacttgttttccaccaagtctttgcacattggataaattggtacattta
aatctatcatgtaatcaaatactagtcagtccatcagatcatacattgggtgtgagttta
ttaccatccttggagaaactggaattacaacataatcgtttcgctcattttccaatggac
attttagagattgtctcgttgagagtattaaaacttcaagataacgatattgataaaata
ccagataaaatcggtaaccttttaaatttgaatgaattatttttatcagagaataaaatc
actcaattaccttcaaccattggtgaactaataaatttaagaaaactttatttagaatat
aataaaatcggttcattaccacaagaattttcaaaactttcaaaattaaatattttaata
cttcataataatgatttaaaatttgtaccagatcaattacattcactatcacaattatta
agattatcattagatgagaatcaattatcttcatctgatcaaaaattaattaaatctgaa
ggttctttagcattaataaaaagaaaaaataaattaaattatggtagtacaatgaatggt
actggtacaacaagttcaagtggttctgctagtactagtactcatggttcaattaataaa
acaactgatattttattatcaagtgttactttaaataatagtatacttaatcaaataaat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataatagtagt
aacaataatagtggtacaaatagtttaagtagtacaccaaatggtacaggtaaatcaaaa
aagaaattaactcatttaacaatttcaagatcattatttcgtggtaattcatcaaattta
gagagtgaaaaagaagattttataaataaaaaacaacaacaacaacagcaacagcaacaa
caacaacaacaacagcaacagcaacaacaacaacaacaacagcaacaacaacaacaacaa
caacagcaacaacaacttggatcaacagcatcaccatcaacagcatcaccaataacaagt
catattacagtgaatagtacagttttagactttgaagatgatatacagaaaatgcaatta
ggtttagaggcattatcaaatttagagacgagtattggtagtaataatagcggtggtggt
gatagtatgaatggtagtggtggtaatattaataatagtggtggtagtggtagtggttgt
ggtactattagtggtagcactacaaaacaaagaagaggtagtgttttcttaccaccaaca
aatgcatttaaattatcaccaaatgtggttagttcaagttataatacattaccagcatct
gtaatgagtggtttattacagcaacagaatcttgagaatggtggtgttggtagtggatca
ggatcaggctcaccaataattagtgcaaatagtatatgtaatagtaatagtagtagtagt
aattcattattaaaacctccaattatcaatacaaccaatttaagtacatcaccaaattta
ttaagtcaatcttcaacaagttttttaaatttaccaccattaaatcaatcttcaacaaat
tcatttttaccaccacaacaccaacaccaccaccaccattcaaatttatcacaatcatta
tcaattaataatttagcacatcgtttaccaacttcattatcatcatcatcactatcatca
aataatacctatgatagtttacaattccaacaacaacaacaacaccatcaccacaatcat
aataatcatcaaaattcaaatcaaccattagcaacaattgtaccatcattttcaaaattt
aaaaactcatttgatcaattattagaagaacaagattttagtaaaaagaaaagagaaaca
cttcaaaaattatcaaaagaacaaaaatggaatttattacttcaatatagaaattcaact
ttaaatatgttaaatatgaaagagcattcaaataatagtaataataatcaatcaattaaa
aattcaactataatagcatcaacaacaacaacaacaacaacaaatggtgaatcattggat
ggttcatcaattcaacaacaaattacaaaaaattcaaattttcaatcatcaagattttat
attgataatttaacaagtaaaacagatatttcattagtaaaagaagttcatgacttttta
aaagaaagtggaccagaggtatcaatatttattggtatgggtggtattgaaagtttatta
ggaattttacaatttaatttagataatgcgcaattacaatttgatgaagaaaaagttggt
tattgtttattatgtttaaagatattggttgaatgtacagcgaaatcagtgattacaact
aataactcattgaatttagttaccatgtttttgacatctgcaagtaaatatatcattgat
atcatcattgatatctatgatgaactgctaagattacaagttattggtgttagtgttgta
ttggattcattaattaattttcaaaaagtgaaaggattgagttcaccttacgtaccattg
gttgcattactaagaaatccaatcattgaaatgccaactaaaacaacggttttcaaaatt
atcaactttttaatctactcatttagtgtgcttgaagagagattctctgtaatttgctca
ctattaaaagttggtattttagaagtgattggtatgtttagagcactacctcatacatca
tatagtttaagatttgaattggatctattcgaagaggtattggatagtgatgagagtgaa
ttggtaaagaaaatcggtagaaaagaggtgttaaagagaatgagtaatgaagataatgat
ctctctaaacaatcatcaaaacaatcaatggatttcgttagggttgtaatggtttctgcg
ggttatggtgatttaaagattgatttagatgagagaacttcctatgccaatgttatagat
ttcattcaatcaaattatcaaatcaagtatagcattgatagatatggtttattcgtacct
gcaattgggtcattggtattggatggttcaattttacaatcatcaggctcacaatcacgt
tgggttgatccaagtaaatcattgattgacaatggactaagcaatgaaatcgttgaattc
aaaatgaaaccaatgcaaattcaagtacttcaatcagtggtggtggtggtggctaccaat
catcaaaaggaagatattattaaagagtttacaattgatccacaattgaaatgttttgaa
atcgttcaatatcttcgtacaagattagatagttcttcaccagcttttcaaagaaagatt
tcagttctaacagaggatgaagatgaagattatgaatcagacatctatggcgtctattgt
tttagtagtttagaaagttatgatcaaggtagttggtatccattgaattccagattcttg
gatttcaatccaaccaatactccaaccattattgatgttaaacttatggaaagaccccta
cgtgtactatttagtggtactgaaaagctaatgaaattcaatccatacgtaccggtttca
gagttaatcaaagagataaagaatgaaattcatttgaaaattaatatcgaagattatggt
atctcttatgtaccaaatgtttcaagttcaaatctatcatcattaatcatagaggagaca
tggttagatccaaccaaaacactattggatcataatgatatgaaatgttcagttgtacaa
tttaaatttaaaccacgtactgtatcagttatggtattggttgaaagtggtattgaaata
ccaaccactgacactccttatcaatttgtaaatactaattcaatctctgaaatcattgaa
aagatttgtacaccacatcaattgaatcctctatcacattcactctatatttccgattgt
caaggtcagaaaattaaactattatcacgtcaaaattgtttacgtgatcaacaagttaac
aatggtgatcatttaataataacttcaaaacaaaaggatcttccatcagatttcaatgtt
tgggatgaaccaaacgattcaagtgaaaccattacctattcaaaggatcgtagagtttct
tctgtaaccttaaataaattaattgaaaagttaacatcaccagagtatactcaagatagt
gaaatgaaaactatattcctaagttcctatcgttcaattataacaccatcggtgctatta
agtaaacttatggaaagacatacaataccaacattggtcgataaagaaaggggtaaatta
attcaaagaaaaactagactcttaattaaatcttggttagaattggaaactacaaaaaat
cgtgaagaagttataactttattagttcaaaatatgcctgctcaatcgattgaagatgat
ggtttaaaagagttgaccgaactatttgtagatttatcaacaaaatcttactcttcaata
cttccaattgtaattggtgaattaccaaaatgtaaaatcccaaaaatcattgactcctat
gtaacatttgccgatatggatgagattgaaatagcaagacaattatcactcctcacattc
cctttatattctagaattgaaacttcggaacttttaaatcaacgttggtcaaaaccaggt
ggtggtccaaatattatgtctgtcgttggtttatttaataaaatttcaaattgggtttca
tttacaattgttaatcaaccaaaacttagagatagagccgttgtctatggtaaaatggtt
aaaattgccaatgctttctatgaacttcgtaattatcatctcttaatggcaattatttcc
ggtttaaatgcttctcctgtacttagattaaaatataccaaaggtaaactttcaaaaaat
cttaaagataatcttgataccttggaagagttaatgtcaactcaatcctcaatgaaaaat
tatagagcagatttagctgctgctagtcctccagcaattccatttatgggctttcattta
tctgatctagttttcatcgatgaaggtaatcaacaattatgtgactctagaattaatttc
aaaaaattggaaatgtataaaaaaacaattgcaacacttcaaaatttctcacttttccct
tatcaattcactcctgttccaatcattcaaaattactttttagattataaaattgttgct
gataaaccgatttatgaaatgagtttatctgctgaaccaagaaatgctgaaagatatgat
attcaataa
DBGET
integrated database retrieval system
