Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0269502
Help
Entry
DDB_G0269502 CDS
T00245
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K14303
nuclear pore complex protein Nup160
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi03013
Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
DDB_G0269502
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
ddi03019
]
DDB_G0269502
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
ddi03036
]
DDB_G0269502
Messenger RNA biogenesis [BR:
ddi03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Nuclear pore complex
DDB_G0269502
Chromosome and associated proteins [BR:
ddi03036
]
Eukaryotic type
Centrosome formation proteins
Spindle formation proteins
DDB_G0269502
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Beta-prop_Nup120_160
TPR_NUP160_120_M
HEAT_Nup120
NUP160_helical
TPR_Nup160_C
CUB_M02D8_5_4th
TPR_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8616964
NCBI-ProteinID:
XP_646016
dictyBase:
DDB_G0269502
UniProt:
Q55DW5
Structure
PDB
PDBj
LinkDB
All DBs
Position
1
Genome browser
AA seq
1791 aa
AA seq
DB search
MSDNTMNTEEIENENGFDIINDFNKVLKYNEISLKSFSDHSSNQWREFTIDSNSQGYYGY
SNNNDINFIQDKFTSTPYRSGGFNYKKSPLTDGRFIIWRLVNKSSTLELCEHYSHHSLES
NQIRIHFNNTSIIGDVFIQELNDYVIIMVTTISKTIYRFLLPHPSIIEHSDSRVGIKRKV
EVDSFGSGSGNNNKRNYKSIFSNLLNSNLDNQWSRVRGVLPDSFEPTVIRYYSATKLIIG
SSGSGSTWLELSDIKQSGDITVKKFDCKEGQGFFSSWKWGEKQEPVQDIQFLSTTTNSNN
NNNFPLALILLNNSQLKVWSANDKKFIKEITISPENWNNNNNNNNENNNNNNNNIPTSPN
INSNQQQQQQQNLSLIHKRFKIYQRSTKSFLLVVYFQFNSESQFQFFSGTNDFSNGINIK
EERFAFLKGKGLIDFNIHNGILYSIWSQIKERNYNRGRINRDQEFDEDDNKFDRNHFVDD
NNDQEEEVIFKHIYIGDLINFNHQKLSTSNGNGNGNGNNNLENEKEINMEYNQFYNGEMI
NTFDKYYETIIEHSDEDSDQPTDQTYYYNLLFNRGLFSPNSIEQALNEYKKLKDIDDHGG
DNDVEMNNGFDNDNSLESVVSNILNQEDFKFQSNEQWSIFFKLCTKFQKQTCLLGSGLFI
EPTSSIIFLIRSNQLSIMKPMKPIECLYTISNNINNSNIISDKQFYNIILNCFGSNSNVL
VNDFLYLMKCCNFIDRFIKDDYRSFEYELSRQHVNHTLLKVSEKLIANSYNNSNNNNNNN
NNSNNNNIEDNINNYSIGFIKLFKLIENPIETINLILKKFKEEFSNQNDMVIQLQQGYKN
IDKGWSGDLFADILTNCFVSTIEIKYQLLTKLSLLLGTVSNLRTHLGIDTKTLFTLEKSI
LPDSIKLLSTYYLLNWFTKQNFIKSFDNSTTSDIDKILISQNQYGDDSDNNNNINNNEYY
EDQQQQQNQQQFTISKNLNILTILINRNLNQFTSKNEFFENIEKQLSKLLCVLAPHMDLF
SMGCYLVEKNQYKQLMEFLQIIENNELIEMITPFYYLMGICYAHYSKFNEAYQYLLKATE
SIENQNQDMLKICSISKEELVCSLFVDIPIDNRMMNQTNANTTQTLISNYYLKCIKIFET
RNQPEFIIQFSLFAIDYLTLEKENFSRLDYLNKLESLYSLVFKYSLKIQEYDLAFTASTL
NPNQDVSQENKRRLILTLCENSVTTVNNNNNNNNNNNTNNNTNNNNNIGSGNSIKVLCKL
PFPQKDIEDNLLKLASAQDLNKKPDYHTILYAYYISRCNYRNASMIYYERSIRVNIEGLG
KSRGKSIFDQQQLLDTKLELLSTTINTLKLLDPSDQWIEINSSSLDIRSTNIYNNNSSLN
IANHHQHQHQQRKFNYIGNNDEFKDISVVTLKEIEKEYSYYLASKHLCSIDSQINSDFIL
SPQQLLEKLIQYSLFDVAFSLAITQEIDLGAIFESFASKCVQLQLNPQSNPFFIKNTNGY
GSGVIGNGANNNNNNYGFDCSELQHLKDKVTLTWKVLENYLQRYDSDKDFQCLSPSEINE
NSQNPNTKATIIGNQQMQLRMFGEIQQGSLVDRDCNGCSFRVSDSKGFYLDVHYSHRVPP
FFNDTQSGQQVIVIGKLQDGRFIADNVLCKQGQLRYHELVADTILYEGTLDLPTWLIQWF
SKGRQDTLFKLYFRHSRLIDASITLRDLFKHAQFELNQINNNNNNNNTIKTSSQITSKTI
SLNIPYDLIDRFFIEAKKIKSSIIDQKEKQQLTQELTLAENEMIKYFSKVN
NT seq
5376 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgataatacaatgaatacagaagaaatcgaaaatgaaaatggatttgatattatt
aatgattttaataaagttttaaagtataatgaaatttcattaaaatcattttcagatcat
tcatcaaatcaatggagagaattcacaattgatagtaatagtcaaggttattatggttat
agtaataacaatgatatcaattttattcaagataaattcacatcaacaccatatagatct
ggtggttttaattataagaaatcaccattaactgatggtagattcataatttggagattg
gttaataaatcatcaacattggaattatgtgaacattattcacatcattcattagaaagt
aatcaaattagaattcatttcaataatacatcaatcattggtgatgttttcattcaagaa
ttaaatgattatgttatcattatggttacaactatttcaaaaacaatttatcgtttctta
ttaccacatccatcaataattgaacattctgattctagagttggtataaaaagaaaagtt
gaagttgatagttttggtagtggtagtggtaataataataaaagaaattataaatctata
ttttcaaatttattaaattcaaatttagataatcaatggtcaagagttagaggagtatta
ccagactcatttgaaccaacagttattagatattattcagctactaaattaatcattggt
tcaagtggatcaggttcaacttggttagaattgagtgatattaaacaaagtggtgatatc
actgttaagaaattcgattgcaaagaaggtcaaggtttctttagttcttggaaatggggt
gaaaaacaagaacctgttcaagatattcaatttttatcaacaacaacaaatagtaataat
aacaataatttccctttagcattaattttattaaataattcacaattaaaagtttggtct
gcaaatgataaaaagtttataaaagaaattacaatttcacctgaaaattggaataacaat
aataacaataacaatgaaaataataataataataataataatatacctacatcaccaaat
ataaattcaaatcaacaacagcaacaacaacaaaacctatcattaattcataagagattt
aagatttaccaaagatctactaaaagtttcttattggttgtatattttcaatttaattca
gaatctcaattccaatttttctcaggcacaaatgatttctcaaatggtataaacataaaa
gaagaaagatttgcatttttaaaaggaaaaggtttaattgattttaatattcataatgga
attttatattcaatttggagtcaaattaaagaaagaaattataatagaggtagaattaat
agagatcaagaatttgatgaagatgataataaatttgatagaaaccattttgttgatgat
aataatgatcaagaagaggaagttatatttaaacatatttatattggtgatttaattaat
ttcaatcatcaaaaattgtcaacatcaaatggtaatggtaatggtaatggtaataataat
ttagaaaatgaaaaagaaattaatatggaatataatcaattttataatggtgaaatgatt
aatacatttgataaatattatgaaactattattgaacattcagatgaagattctgatcaa
ccaactgatcaaacttattattataatctattatttaatcgtggtttattctcaccaaat
tcaattgaacaagcattaaatgaatataagaaattgaaagatatagatgatcatggtggt
gataatgatgttgaaatgaataatggatttgataatgacaactctttagaatctgtagtt
tcaaatatcttaaatcaagaagactttaaatttcaatcaaatgaacaatggtcaatcttt
tttaaattatgtacaaaatttcaaaaacaaacttgtttacttggttctggtttattcatt
gaaccaacttcatcaattatatttttaattagatctaatcaactatcaattatgaaacca
atgaaaccaattgaatgtttatatacaattagtaataatattaataatagtaatattatt
agtgataaacaattttataatattattttaaattgttttggatcaaattcaaatgtattg
gttaatgatttcttatatttaatgaaatgttgtaattttattgatagatttataaaggat
gattatagatcattcgaatatgaattatcacgtcaacatgttaatcatactttattaaaa
gtttctgaaaaattaattgcaaattcttataacaattcaaataataacaataataataat
aataattcaaataataataatattgaagataatattaataattattcaattggatttatt
aaattatttaaactaattgaaaatccaattgaaactattaatttaatattaaagaaattt
aaagaagaattttcaaatcaaaatgatatggtcattcaattacaacaaggttataagaat
attgataaaggttggagtggtgatttatttgcagatatcttaacaaattgtttcgtctca
acaattgaaattaaatatcaactattgacaaagttatcattattattgggtacagtttca
aatcttagaactcatttaggtattgatacaaaaacattatttacattggagaaatcaatt
ttaccagattcaattaaacttttatcaacttattatttattaaattggtttacaaaacaa
aatttcattaaatcatttgataattcaacaacaagtgatattgataaaattttaatttca
caaaatcaatatggtgatgatagtgataataataataatattaataataatgaatattat
gaagatcaacaacaacaacaaaatcaacaacaatttacaatttcaaaaaatttaaatatt
ttaacaattttaattaatagaaatttaaatcaatttacatcaaagaatgaattttttgaa
aatattgaaaaacaattatcaaaattattatgtgttttagcaccacatatggatttattt
tcaatgggttgttatttagttgaaaagaatcaatataaacaattgatggaattccttcaa
atcattgaaaataatgaattaattgaaatgattacaccattctattatttaatgggtatt
tgttatgcacattactcgaaattcaatgaagcttatcaatatttattgaaagcaacagaa
tcaattgaaaatcaaaatcaagatatgttaaagatttgttcaatctcaaaggaagaatta
gtttgtagtttattcgttgatattccaattgataatagaatgatgaatcaaaccaatgcc
aacaccactcaaactctaattagtaattattatttgaaatgtattaaaatatttgaaact
agaaatcaacctgaattcatcatacaatttagtttatttgctatcgattatttaacttta
gaaaaagagaatttctcacgtttagattatttaaataaattggaatcactttattcttta
gttttcaaatattctttaaaaattcaagaatatgatttagcattcactgcttcaactctt
aatccaaatcaagatgtttcacaagaaaataaaagaagattaattttaacattatgtgaa
aatagtgttacaactgtaaataataataataataataataataataataatacaaataat
aatacaaataataataataatattggtagtggtaatagtattaaagttttatgtaaatta
ccatttccacaaaaagatattgaagataatttattaaaattagcatctgctcaagattta
aataagaaaccagattatcatacaattctttatgcttattatataagtagatgtaattat
cgtaatgcttcaatgatttattatgaacgttcaattagagtaaatattgaaggattaggt
aaatcgcgtggtaaatcaatctttgatcaacaacaattacttgatactaaattggaatta
ttatcaacaacaattaatactttgaaattattagatccatctgatcaatggattgaaatt
aatagtagttctttagatattagatcaactaatatttataataataatagttcgttaaat
attgccaatcatcatcaacatcaacatcaacaacgtaaatttaattatattggtaataat
gatgaatttaaagatatttcagttgtaacattaaaagaaattgaaaaagagtatagttat
tatttagcatcaaaacatttatgttcaattgatagtcaaattaatagtgatttcatatta
tcaccacaacagttattagaaaagttaattcaatattcattatttgatgttgcattttca
ttggcaatcactcaagagattgatttaggtgcaatctttgaatcatttgcttcaaaatgc
gttcaacttcaattgaatccacaatcaaatccattctttataaaaaatacaaatggttat
ggtagtggtgtcataggtaatggtgccaataataataataataactatggttttgattgt
tcagaattgcaacatcttaaagataaagttacattgacttggaaagttttagaaaactat
ttacaacgttatgattcagataaggatttccaatgtttatcaccatcagagattaatgaa
aatagtcaaaatccaaatacaaaagctacaatcattggtaatcaacaaatgcaattgaga
atgtttggtgagattcaacaaggtagtttggtcgatagagattgtaatggttgttcattc
cgtgtttcagattcaaaaggtttctatttagatgttcactatagtcatcgtgtaccacca
ttctttaatgatactcaatcaggtcaacaagttattgtcattggtaaattacaagatggt
agattcatagccgataatgtactttgtaaacaaggtcaattacgttatcatgaattggta
gctgatactatcctatatgaaggtactttggatttaccaacttggttaattcaatggttc
tcaaaaggtcgtcaagatactctattcaaattatactttagacatagtcgtttaattgat
gcttcgattactttaagagatttatttaaacatgctcaatttgaattaaatcaaattaat
aataataataataataataatacaattaaaacttcatctcaaataacttctaaaacaata
tctttgaatatcccatatgatttaattgatagattctttattgaagcaaagaaaattaaa
tcatcaataatcgatcaaaaagaaaaacaacaattaactcaagaattaactttggctgaa
aatgaaatgattaaatattttagtaaagtgaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
