Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0269966
Help
Entry
DDB_G0269966 CDS
T00245
Symbol
ddx1
Name
(RefSeq) DEAD/DEAH box helicase
KO
K13177
ATP-dependent RNA helicase DDX1 [EC:
5.6.2.7
]
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
ddi03041
]
DDB_G0269966 (ddx1)
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
ddi03016
]
DDB_G0269966 (ddx1)
Enzymes [BR:
ddi01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.7 DEAD-box RNA helicase
DDB_G0269966 (ddx1)
Spliceosome [BR:
ddi03041
]
Other splicing related proteins
Spliceosome associated proteins (SAPs)
RNA helicase-like proteins
DDB_G0269966 (ddx1)
Transfer RNA biogenesis [BR:
ddi03016
]
Eukaryotic type
tRNA spricing factors
tRNA splicing ligase complex
DDB_G0269966 (ddx1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
SPRY
Helicase_C
ResIII
CMS1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8617394
NCBI-ProteinID:
XP_646435
dictyBase:
DDB_G0269966
UniProt:
Q55CP6
LinkDB
All DBs
Position
1:3941617..3944019
Genome browser
AA seq
765 aa
AA seq
DB search
MSAFEDLGVLPEIIKAIEELDWLLPTPIQTEAIPLILGGGDVLAAAETGSGKTGAFALPI
LQITYETLNKKAEIPIIAPTNTSGEDGTSGGGGGGGGGDTIELDQIDRDKNMAVDGLICQ
SRSSDWCGIKATKGISSGKFYYESIVRDEGLCRIGFALKKSSRNIGTDKFSWGYGGTGKK
SHESKFIDYGKPFGNNDVIGCYINFDEEIIGFTKNGQDFGEAFTFNSKAGIFYPALVLKN
AEMEFNFGSKPMKHDLKGYKPINQAELLIDQQTSTQIDNSKNNNNNNNKKGSGNNKKNKG
KDDDKMNDEDNNNKQPRKTLSLIIEPTRELADQAYSAILNFSKYLDSPKIQVSLCIGGEK
SNGGRNKIEGDIIIGTPGRLESLVKEGSIDLSSIKFFVLDEADQLIDDNLAIVNFIYNKL
PIGQNLQVLFFSATLHSTKVIKFCEQITKNPTWVDLKGRDFIPDLITHAYVKADPIKFES
LWRNSENPLRIRTDGVHASDVQQFGKLKEPEQKSEAIKLLKAQLLLKCIQSFKMDQAIIF
ARTRLDCDHIHQFLKDAGGGNTSGLEGEFSSTVLHGGDNISRARKDNLEKFRNGDVRFLI
CTDVAARGIDIRGLPYMINYTLPESFEDYIHRVGRVGRSDRIGLAISLVAYEQEKVWYHT
CRDKGKGCHNTKLTENGGCCIWYDEPQLFTAIQENIGPIELDSDFQLPKDMKQLNFGGST
KLTGASADYKPHTEELRSRVLQLSQLEETIQIDYLTLPKRIIKLK
NT seq
2298 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcagcatttgaagatttaggtgttttaccagaaataattaaagcaattgaagaatta
gattggttattaccaacaccaattcaaacagaagcaataccattaattttaggtggtggt
gatgtattagcagcagcagagacaggatcaggtaaaactggtgcatttgcattaccaatt
ttacaaattacatatgaaactttaaataaaaaagcagagattccaataattgcaccaacc
aatacatcaggagaagatggcactagtggtggtggtggtggtggtggtggtggagataca
attgaattggatcaaattgatagagataagaatatggcagttgacggattaatttgtcaa
tctcgttcatcggattggtgtggtattaaagcaactaaaggtataagcagtggtaaattt
tattatgaatccattgttagagatgaaggattatgtagaattggattcgctttaaaaaaa
tcatcaagaaatattggtactgataaattcagttggggatatggtggtactggtaagaaa
tcacatgaatctaaatttatagattatggtaaaccttttggaaataatgatgtaatcggt
tgttatattaattttgatgaagaaataattggtttcacaaagaatggtcaagattttggt
gaagctttcactttcaactctaaagctggtatattctatcctgctttagttttaaaaaat
gctgaaatggaatttaattttggttcaaaaccaatgaaacatgatttaaaaggttataaa
ccaattaatcaagctgaattattaattgatcaacagactagtactcaaatagataattca
aagaataataataataataataataaaaaaggtagtggaaataataaaaaaaataaagga
aaagatgatgataaaatgaatgatgaagataataataataaacaaccacgtaaaacatta
tcattaattattgaaccaactagagaattagcagatcaagcttatagtgcaattttaaat
ttttcaaaatatttagattcaccaaagattcaagtttcattatgtattggtggtgagaaa
tcaaatggtggtagaaataagattgaaggtgatattataattggtacaccaggtagattg
gaatcattggttaaagaaggttcaattgatttatcatctattaaattctttgttttggat
gaagccgatcaattgattgatgataatttagcaattgtaaatttcatttataataaatta
ccaattggtcaaaatttacaagtactcttttttagtgcaaccttacattcaacaaaggtt
attaaattttgtgaacaaattacaaagaatccaacatgggtagatttaaaaggtagagat
ttcataccagatcttatcactcatgcctatgtaaaagctgatccaatcaaatttgaatca
ctttggagaaatagtgaaaatcctttacgtattcgtactgatggtgttcatgcttcagat
gttcaacaatttggaaagttaaaagaaccagaacaaaaatcagaggctattaaattatta
aaagctcaattactcttaaaatgtattcaatcatttaaaatggatcaagctatcattttt
gcacgtacacgtttagattgtgatcatattcatcagtttttgaaagacgctggcggtggc
aatacctctggattggagggtgaattctcttcgaccgttttacatggtggtgataatatt
tcacgtgctagaaaagataatttagagaaatttagaaatggtgatgttcgtttcttaatt
tgtacagatgttgccgctaggggtattgatattagaggtttaccatatatgatcaattat
acattaccagaatcattcgaagattatattcatagagttggtcgtgttggtagatccgat
agaattggtttggcaatttctttagtggcttatgaacaagagaaagtttggtatcatact
tgtcgtgataagggtaaaggttgtcataatacaaaattaacagagaatggtggttgttgt
atttggtatgatgaacctcaacttttcactgctattcaagaaaatattggtccaattgaa
ttagattcagattttcaattaccaaaagatatgaaacaattaaatttcggtggttcaact
aaattaactggtgcttctgctgattataaacctcatactgaggaattacgttcaagagtt
ttacaattatctcaattagaagaaactattcaaattgattatttaactttaccaaaaaga
ataataaaattaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
