Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0270040
Help
Entry
DDB_G0270040 CDS
T00245
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K20474
RAD50-interacting protein 1
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
DDB_G0270040
Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
Retrieval pathways
NRZ (DSL1) complex
DDB_G0270040
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RINT1_TIP1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8617453
NCBI-ProteinID:
XP_646491
dictyBase:
DDB_G0270040
UniProt:
Q55CJ0
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(4075572..4079519)
Genome browser
AA seq
1079 aa
AA seq
DB search
MDNGNQNESFQSKLEKLMASESHKKVTVEPINIDSFLDENFYNESFLENCNQLKQKLLNE
KSIIIKLLDELNDKSSINILFDDGKKGLDQLKEISEKRKEISLELGKQTKLTSIDNLSKY
TNLINQLTRIKKYFQLLLIIHMFYSKVKLCIDQSLLSLSLKPFINLIELQNNLNSLKVPT
GPRIIDHEERIDQIFPHLTKVVDHVVGDTCKVLETKMRQALVLSLKEINWINISNYNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNSNNNNNNNNNNNNNNNNNNDNNNNNNSKNNNNNTT
STTTSTTTSTPATTSTSTSNDNKSNNNNNSNDDNKKKNNKNKNNKNKKNNKDDNSNKDDN
NNETSNNIDNNDDEINKTNNNSEINKNKNDNKDNINNEDKQLIDKEKEEARNKINIRDRF
ISNFTNLTLLQLAVQKYQKKLNDESTIKDNQNVENYNNNNNNNNKKEQMNESNKLWSINL
ILQPLIKGFKYHFQSERVTNFIEKPEWAIHYVKKMIREYSRYLCMLQDSLEENKVYYIDL
HQWFIAGLVETVKNKFRGEIKLFLERPDHYKRYFYHTMEEIVEFQRFLLEEYQYPNPIEF
GNVKGGIEMGLIHDVGIIPVPFSIFQENSIFNRWLNLEIENCDQRFQQIYMNSNDRFQLY
YRDEFPDLDQLRPTKSAYELISVLSSLTERYQLLTDVSYQFEFFIQIQINLLLCYKNELK
SIISLLNINDDDNLHDLCFIFNSLNYCIKVLKEWDDQLIFIEIYEYMNSENVKQQDEYSL
SNSVATKGDEDYSAFSVMISDYKTLIKSLKKKIIKGLFISFATKINNYLKKGTFSINTNN
NSSNNSSGSSNSSGGGGLISSSISGITSKNIFSFSNLKQKSKQLIDSSQQQQPQPQQSQS
NQSQDKEINNEQQIKGDEQQQKQQQQQQDSENYTQYDVSNEISNGLSILRYQLGIIYRSL
TPTKLASIWKKLLLKIDKYLFNLLLNYQPKFTENDGKQFSKDIKTCLLIFNTFSNTPENY
LKRVLESTILLRMSNQDLTTFKNEFSSKLKVNLEDGLLQKYKIHNLTTDQISKIINLRI
NT seq
3240 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataatggtaatcaaaatgaaagttttcaatcaaaattagaaaaattaatggcgagt
gaaagtcataaaaaagttacagttgaaccaattaatattgattcctttttggatgaaaac
ttttacaatgaatcatttttagagaattgtaatcaattaaagcaaaaactgttaaatgaa
aaatcaattattataaaattattagatgaattaaatgataaatcatcgattaatatttta
tttgacgatggtaaaaagggattggatcaattaaaggagatatcagaaaagagaaaagag
atttcattagaacttggtaaacaaactaaacttacatcaattgacaatctttcaaaatat
acaaatttaataaatcaattaacaaggataaagaaatattttcaacttttattaattata
catatgttttattcaaaggttaaattatgtattgatcaatcattattatcattatcatta
aaaccatttataaatttaatagaattacaaaataatttaaattcattaaaagtaccaaca
ggacctagaataattgatcatgaagagagaattgatcaaatattcccacatctcactaaa
gtagtggaccatgtagtcggagatacttgtaaagtacttgaaactaaaatgagacaagct
ttggttttatctttaaaagaaattaattggattaatatttcaaactataataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataattctaataataataataataataataataataataataataataat
aataataataatgataataataataataataatagcaaaaataataataataatactact
tctaccactacttccaccactacttccactcccgctactacttccacttccacttctaat
gataataaatctaacaataataacaatagtaatgatgataataaaaaaaagaataataaa
aataagaacaataaaaataaaaaaaataataaagacgataatagcaataaagatgataat
aataatgaaactagtaataatattgacaataatgatgatgaaattaataaaaccaacaat
aatagtgaaattaataaaaataaaaatgataacaaagataatattaataatgaagataaa
caattaattgataaagaaaaagaagaagctagaaataaaattaatattagagatagattc
attagtaatttcacaaatttaacattattacaacttgctgtacaaaaatatcaaaagaaa
ttaaatgatgaatcgaccattaaagataatcaaaatgttgaaaattataataataataat
aataataataataaaaaagaacaaatgaatgaaagtaataaattatggtcaattaattta
atattacaaccattgattaaaggttttaaatatcatttccaaagtgaaagagttacaaat
ttcatagagaaaccagaatgggcaattcattatgttaaaaagatgattagagaatatagt
agatatttatgtatgttacaagattcattggaagagaataaagtttactatatcgattta
catcaatggtttattgcaggtttggttgaaactgttaaaaacaaattccgtggtgaaatt
aaattattcctcgagagacctgatcattataaacgttatttttatcatacgatggaggag
attgttgaattccaaagattcctacttgaagaatatcaatatccaaatccaattgaattt
ggtaatgtcaagggtggcattgaaatggggctaatccatgatgttggcatcattcctgta
cctttctcaatctttcaagagaattccattttcaatcgttggttaaacttggagattgaa
aattgtgatcaacgattccaacaaatctatatgaactcaaatgaccgtttccaattatac
tatcgtgatgaattccctgacttggatcaattacgtcctaccaagtctgcttatgaattg
attagtgttttatcgtcactaactgaacgttatcaacttttaaccgatgtttcctatcaa
ttcgaattctttattcaaattcaaatcaatctattactttgttataaaaatgaattaaaa
tcaatcatctctttattaaacattaatgatgatgataatcttcatgatttatgttttatt
ttcaatagtttaaactattgtattaaagttttaaaagaatgggatgatcaattaattttc
attgaaatctatgaatatatgaatagtgaaaatgttaaacaacaagatgaatattcactt
tcaaatagtgttgcaacaaaaggtgatgaagattattctgctttctctgtaatgatttca
gattataaaactttaattaaatctttaaaaaagaaaattattaaaggtttattcataagt
tttgcaactaaaattaataattatttgaaaaaaggaacattctcaataaatactaataat
aatagtagtaataatagtagtggtagtagtaatagtagtggtggtggtggtttaattagt
agcagtattagtggtattacctcaaagaatatatttagctttagtaatttaaaacaaaaa
tcaaaacaattaattgattcatctcaacaacaacaaccacaacctcaacaatctcaatct
aaccaatcccaagataaagaaattaacaatgaacaacaaataaaaggagatgaacaacaa
caaaaacaacaacaacaacaacaagatagtgaaaattatactcaatatgatgtttcaaat
gaaatttctaatggactttcaatattaagatatcaacttggtataatttatagatcatta
acaccaactaagctagcatctatttggaaaaaattattattgaaaattgataaatatcta
ttcaaccttttattaaactatcaaccaaaattcactgaaaatgatggtaaacaattctct
aaagatattaaaacttgtttgttaatattcaatactttttcgaatactcctgaaaattat
ttaaaaagagttttggaatcaacaattttattaagaatgagtaatcaagatttaacaact
tttaaaaatgaattttcaagtaaattaaaagttaatttagaggatggacttttacaaaaa
tataaaattcataatttaactactgatcaaatctctaaaataataaatcttagaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
