Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0270754
Help
Entry
DDB_G0270754 CDS
T00245
Symbol
vps16
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K20180
vacuolar protein sorting-associated protein 16
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi04148
Efferocytosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04148 Efferocytosis
DDB_G0270754 (vps16)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
DDB_G0270754 (vps16)
Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
Endosome - Lysosome transport
Tethering complex
CORVET complex
DDB_G0270754 (vps16)
Hops complex
DDB_G0270754 (vps16)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Vps16_C
Vps16_N
TPR_IF140-IFT172
MgrB
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8617595
NCBI-ProteinID:
XP_646623
dictyBase:
DDB_G0270754
UniProt:
Q55C58
LinkDB
All DBs
Position
1:4423807..4426401
Genome browser
AA seq
832 aa
AA seq
DB search
MIAAQWKIIGNSTYIKKEIYSMSWDVDLKQQVSVGSPFAGPIAVMRDSSKFVEMNSQNMK
PYLKIFTASGDLISQMIWDSSKNIVAMDWIEKERLVIVLQNATVLIFNVFCEQMTQFSLG
DIVREEEILECKIWSDGIVVLTSASQLYSVPSINDFFVESGRVIRLPPLPEEPKARPEWA
ILEPQFSLSQSIEIFMSINGTLYLIDEDKVESQLEATEPIQKMVVSPCGKKLACFDTKGT
LLILKTDGSTTNPDRMDTKATKSPVLKWCGSDGVMMYWDSIKDPILFYFSKGDSWAKFTL
DQPVSLVTEIDGLRIISDTTSEFFHKVSDVTIDIFKIGTTSPASILYDATDHFISKSPQA
DESIRSINDQLEDAVNDCILAAGFEFNGGEQSKLLKAASFGKCFLENYNPSQFVTMCRSL
RVLNAVRHHEIGIPLSIKQYYHIGIEELIDRLISRRKHLLAWRICDYLKIKSDVVLNHWA
CTKVRTDIPDQELGKIIIKKLESVPGISFANIASAAYLAGRSKLATKLLEYEPKAAEQVP
PLIKMGESGLALNKAIESGDTDLVYLVLLAMQRSLPLADFLELTFSKVVALDLLISMCKQ
KNDFPLLREIYHIKDQSKEMGNIYLQEALSSHPSQLDQRIKAYNKSIEHYHHSKDKDDQA
TSKFIDDQIKLEMLQKELETNLQDESFVGISINDTIYKLITMNQPKKAQSIRSEFKVPDK
RFWWIKIKALSIMNDWEELMKFSKEKKSPIGYEPFVEVCLDQKNQIEALKYIPKITDILP
KIQFYIQIGYFREAADIAFKEKNFDLLNLISRKCTNNEILNIIEQMKSQIRR
NT seq
2499 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatagcagcacaatggaaaattattggtaattcaacttatattaaaaaagaaatttat
agtatgagttgggatgtagatttaaaacaacaagtttcagttggttctccatttgcaggt
ccaatagctgtaatgagagattcttcaaaatttgttgaaatgaactctcaaaatatgaaa
ccatatttaaaaatttttacagcatctggtgatttaatttctcaaatgatttgggattca
tcaaaaaatatagttgcaatggattggattgaaaaagaaagattagttatagttttacaa
aatgcaacagttttaatatttaatgtattttgtgaacaaatgacacaattttcattaggt
gatatagttagagaggaggagatattggaatgtaagatatggagtgatggcatagttgta
ttgacatcagcatcacaattatattcagtaccatcgattaatgatttctttgtagagagt
ggtcgtgtaattagattaccaccattaccagaggagccaaaggctagaccggaatgggcg
atattggagccacaattctcgttatcccaatcgattgagatattcatgtcaatcaatggc
acactttatttaattgatgaagataaagttgagagtcaattagaggcgaccgagcccatt
caaaagatggtggtatcgccatgtggcaaaaagttggcatgcttcgataccaaagggaca
ttactgattttaaagaccgatgggtcgaccaccaaccccgatcgtatggacacaaaagcc
accaaatcaccagtattgaaatggtgtggtagcgacggggttatgatgtactgggactcg
attaaggacccaatcctattctacttttccaaaggtgacagttgggccaaattcacattg
gaccaaccagtttcattagtcactgaaatcgatggtcttagaatcatatccgatacgaca
tcggaattctttcataaagtatctgatgtcacaatcgatatctttaaaattggcacaacc
agtcctgcaagtatactatacgatgcaacagatcatttcatttcaaaatctccacaagcc
gatgaatcaattcgttcaattaatgatcaattggaggatgcagtaaatgattgtatttta
gcagcaggttttgaatttaatggtggtgaacaatctaaactattaaaagctgcaagcttt
ggtaaatgtttcctcgagaattacaatccttcacaattcgtcacaatgtgtagatcacta
cgtgtattgaatgcagtacgtcatcatgaaattggtataccattatcaatcaaacaatac
taccatattggtattgaagaattaatcgatcgtttaattagcagaagaaaacatctacta
gcatggcgtatttgtgattatttaaaaattaaatcagatgttgtattaaatcattgggct
tgtacaaaagttagaaccgatataccagatcaagaattgggtaaaattatcattaaaaag
ttggaatctgtacctggtatttcttttgcaaacattgcatctgcagcttatttagctggt
agaagtaaattggcaactaaattattagagtatgaaccaaaggctgcagaacaagtacca
ccattgattaaaatgggtgaaagtggtttagcattaaataaagctatagaatctggtgat
actgatttagtttatttagtattgctagcaatgcaaagatccctaccattggctgatttc
ttagaattaacattcagtaaagtggttgcattggatttactaatttcaatgtgtaaacaa
aagaatgatttcccactactaagagagatctaccatattaaagatcagtcaaaagaaatg
ggtaatatctatcttcaagaagcattatcctcccacccatctcaattggatcaaagaatt
aaagcatacaataaatccatcgagcattaccatcactcaaaggataaagacgatcaagcc
acttcaaaattcattgatgatcaaattaaattggaaatgttacaaaaggaattagaaacc
aatttacaagatgaatcattcgttggaatttcaatcaatgatacaatctataaattaatc
actatgaatcaaccaaagaaagctcaatcaattagatcagaatttaaagttcctgataaa
agattttggtggattaaaattaaagctctttcaattatgaatgattgggaagaattaatg
aaattttcaaaagaaaaaaaatctccaattggttatgaaccttttgttgaagtttgtctt
gatcaaaaaaatcaaattgaagctttaaaatatattccaaaaattactgatattttacca
aaaattcaattctatattcaaattggttactttagagaagctgctgatattgcttttaaa
gagaaaaattttgatcttttaaatcttatctctagaaaatgtacaaataatgaaatttta
aatattattgaacaaatgaaatcacaaattagaagataa
DBGET
integrated database retrieval system
