Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0270828
Help
Entry
DDB_G0270828 CDS
T00245
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K14827
pre-rRNA-processing protein IPI1
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi03083
Polycomb repressive complex
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09126 Chromosome
03083 Polycomb repressive complex
DDB_G0270828
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
ddi03009
]
DDB_G0270828
Ribosome biogenesis [BR:
ddi03009
]
Eukaryotic type
Pre-60S particles
5-FMC complex
DDB_G0270828
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ipi1_N
HEAT_GCN1
LPMO_AA14
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8617022
NCBI-ProteinID:
XP_646072
dictyBase:
DDB_G0270828
UniProt:
Q55DQ9
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(3009708..3012882)
Genome browser
AA seq
959 aa
AA seq
DB search
MGRSAPKKTLQPSLDFKVKKKKLGKKPPPNPNITVTTFKSKALNMPGQNIVEEKDDLVNH
RNLTLKDLLTKLNHYNDQVKKDAVTGIRDLILKHPSVLFVHLGAIMNKLVEVINDLDKDV
RHCTHTLISTILPMLDEISISPFIPLFSVYINSGMTHLKTTIRLDSLRLLDIFIDHYPNL
VSRSCHQMIPNYIDLLKRVSGAATVATISTSTSSSANVPISASVPVSQQKNKSSTASSTP
KANSLHTRVMILKSLFKLIKVLLHEPDLSFSSLLNKIHKQRENTQIIDGKMAIDCSLTYQ
AYNDRKVFPDLFSKYLVKNNEQQQLNSDGTVKSLFPTILETSEEVKQFSSTLLPILIDLW
LELGPSNPGISFQVLEDLELVVSIIQLLVHCLKENFSTTDFYEQLRKDYIKFFSVHFPFY
VGSPSNPDSKEWIISCSINSLMTQTASHFLGYSPSISNVDQTINGWYQPFFEFIEDALNG
KLIDEKVEATKGQSIKTHISNLLWIVKIILPILSSTQSESILNSFISFDEKCHPHSTSKK
ACVFFIKELIDIQSNPLLSNVKSFKNIIEWGLTSLPKLLWKLGNSDNDTSLMILNILLSV
GRDKSKIKQYDSIQNALVPFFFTISKPTPQFPNGKQIYGPFSSLPLNIQFLALNTLYYFS
SLNKIMIRSLIAICRSNKSSPEIISIVLDLIHNLYLVGTLSLSHYTAFCIAITLSITSKE
IEDNTNNVIMIDEEKIQEQEKIIKKLCWNINSLRLSNSIENILEPMTEPFISELKKISTN
FQDNNNENSGDSLNYILSLILSCFTDKNDYNNEIREKEFKSLSNELIITITNSIFIYIFQ
SIKFINSTSTKIYDLNIILKIIQLDNSNQILINILNLISSKLNVGNNQVEKNNNNQYSIL
SLIELFKSKELYEIFQLSNVKSIVGSIVKKVEKSVSTQLSTEKQLLEKLLSEVKLLFNE
NT seq
2880 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtagatcagcaccaaaaaaaacattacaaccatcacttgattttaaagtgaaaaag
aagaaattgggtaagaaaccaccaccaaacccaaatattacagttacaacttttaaatct
aaagcattaaatatgccaggtcaaaatatagttgaagaaaaagatgatttagttaatcat
cgtaatttaacattaaaggatttattaacaaaattaaatcattataatgatcaagttaaa
aaggatgcagttacaggtatacgtgatttaatattaaaacatccaagtgtattattcgtt
catttaggtgcaattatgaataaattagtagaggtaatcaatgatttagataaagatgtt
agacattgtacccatactttaatatcaacaattttaccaatgcttgacgaaatatcaatt
tcaccattcataccattgttttcagtttacattaattccggtatgacacatttaaagaca
accatccgtttagattcattacgtttattggatattttcattgatcattatccaaattta
gtatcacgtagttgtcatcaaatgattccaaattatattgaccttttgaaaagagtatct
ggtgcagccaccgttgcaaccatttcaacttcaacttcatcctctgcaaatgttccaatt
tcagcatcagtaccagtatctcaacaaaagaacaaatcatcaactgcttcatcaactcca
aaagcaaattcattacatactagagttatgattttaaaaagtctttttaaattaattaaa
gttttattacatgaaccagatttatcattctcttcattattaaataaaattcataaacaa
agagaaaatactcaaattattgatggaaagatggcaattgattgtagtttaacctatcaa
gcttataatgatagaaaagtttttccagatttatttagtaaatatttagttaaaaataat
gaacaacaacaattaaatagtgatggtacagttaaatcattatttccaacaattttagag
acatcagaagaagttaaacaattttcaagtacattattaccaattttaattgatttatgg
ttagagttgggaccatcaaatccaggtatttcattccaagttttagaggatttagaattg
gtagtttcaattattcaacttttagttcactgtttaaaagaaaacttttcaaccactgat
ttctatgaacaattaagaaaggattatattaaattcttttcagttcattttccattttat
gttggttcaccaagtaatccagattcaaaagaatggattataagttgttcaatcaattca
ttgatgactcaaacagcttcacactttttaggttattcaccatcgatttcaaatgttgat
caaactattaatggttggtatcaaccattctttgaatttattgaagatgcattgaatggt
aaattaattgatgaaaaagttgaggctacaaaaggccaatctattaaaactcacatttca
aatcttttatggatagttaaaattatcttaccaattttatcatcaactcaaagtgaatcc
attttaaattctttcattagttttgatgaaaaatgtcatccacatagtacttcaaagaaa
gcttgtgttttctttattaaggaattaattgatattcaatcaaatccattattatcaaat
gttaaatcttttaaaaatataattgaatggggtttaacttctttaccaaaattattatgg
aaattgggtaattctgataatgatacatcattgatgattttaaatattttattatcagtt
ggtagagataagagtaaaattaaacaatatgattcaattcaaaatgcattagtaccattc
ttttttacaatttcaaaaccaacaccacaatttccaaatggtaaacaaatttatggtcca
ttctcaagtttaccattgaatattcaatttttagctttaaatactttatattatttctca
agtttaaacaaaattatgattagatctttaattgcaatttgtagatcaaataaatcatca
ccagaaattatttcaattgttttagatttaattcataatttatatttagttggtacatta
tcattatcacattatacagcattttgtattgcaattactttatcaattacatcaaaagaa
attgaggataatactaataatgtaataatgattgatgaagagaaaattcaagaacaagaa
aaaattataaagaaattatgttggaatataaattcattaagattatcaaattcaattgaa
aatattttagaaccaatgacagaaccatttataagtgaattaaaaaagatttcaacaaat
ttccaagataataataatgaaaattcaggtgattctttaaattatattttatctttaatt
ttatcatgttttactgataaaaatgattataataatgaaattagagaaaaagaattcaaa
tcattatcaaatgaattaataataacaattacaaatagtatttttatttatattttccaa
tcaattaaatttataaattcaacatcaacaaaaatttatgacttaaatatcattttaaaa
attattcaattggataattcaaatcaaatattaattaatattttaaatttaatttcaagt
aaattaaatgttggtaataatcaagttgaaaaaaataataataatcaatattcaatttta
tcacttatcgagttatttaaatcaaaagaattatatgaaatattccaattgtcaaatgtt
aaatcaatcgttggttcaattgtaaaaaaagttgaaaaatcagtttccactcaactttcc
actgagaaacaattacttgaaaaattattatctgaagtaaaattattatttaatgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
