KEGG   Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0270906
Entry
DDB_G0270906      CDS       T00245                                 
Symbol
jcdD
Name
(RefSeq) transcription factor jumonji, jmjC domain-containing protein
  KO
K10277  [protein]-arginine 3-hydroxylase / protease [EC:1.14.11.73 3.4.-.-]
Organism
ddi  Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ddi00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis [BR:ddi03009]
    DDB_G0270906 (jcdD)
Enzymes [BR:ddi01000]
 1. Oxidoreductases
  1.14  Acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen
   1.14.11  With 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom of oxygen into each donor
    1.14.11.73  [protein]-arginine 3-hydroxylase
     DDB_G0270906 (jcdD)
Ribosome biogenesis [BR:ddi03009]
 Eukaryotic type
  Other ribosome biogenesis factors
   DDB_G0270906 (jcdD)
SSDB
Motif
Pfam: Cupin_8 JmjC_2 JmjC DUF1971
Other DBs
NCBI-GeneID: 8617129
NCBI-ProteinID: XP_646176
dictyBase: DDB_G0270906
UniProt: Q55DF5
LinkDB
Position
1:3291492..3292937
AA seq 448 aa
MDYYQSELIKLFQKSNEIYKDNNFETKLNEKNYKFLLVYLNSIHSILKIDMKLNIYQYIN
IEFKELILISKELMKIVFDIIHSGTWNNIDILFKDLFAYSSILYIYSFFLIQFKNIKVDN
NNNNNININIPNPIKKIILKKLDLALIFGDKLFNQVINQIINLISNNNNNNNNNFLNNFK
NENYNNNNENEIILNKEKLIKRISRPPSLNEFKNEYMIKGNPCVIENLMKEWPCFNERNW
SDLNYLKNVAGSRLVPIEIGPNYLHEKMKQKLINFNKFIDEYIISKNSDDDNDDIGYLAQ
TKLFEQIPQLRNDILIPEYCKIKIGCGDDDNDNNKEDNVEINAWLGPKGTVTPLHYDPKH
NFLCQIVGRKYIKLFSPKESNNLYPHLNSKLFFNTSMVDVENPDHSKFPLFKNCDYIELI
LNAGEILYIPPTYWHFVKSLSQSFSIFP
NT seq 1347 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggattattaccaaagtgaattaatcaaactatttcaaaagagtaatgaaatttataaa
gataataattttgaaactaaattaaatgaaaagaattataaatttttattagtttattta
aattcaatacattcaatattaaaaattgatatgaaattaaacatttatcaatatatcaat
atcgaatttaaagaattaattttaatatcaaaagaattaatgaaaattgtatttgatata
attcattctggaacatggaataatattgatattctatttaaagatttatttgcatattct
tcaattctatatatttactccttttttttaattcaatttaaaaatataaaagttgataat
aataataataataatattaatattaatatcccaaaccctataaagaaaataattttaaaa
aaattagatttagcattaatatttggtgataaattatttaatcaagttataaatcaaatt
attaatttaatatcaaataataataataataataataataattttttaaataattttaaa
aatgaaaattataataataataatgaaaatgaaataatattaaataaagaaaaactaatt
aaaaggattagtagaccaccaagtttaaatgaatttaaaaatgaatatatgataaaagga
aatccatgtgttattgaaaatttaatgaaagaatggccatgttttaatgaaagaaattgg
agtgatttaaattatttaaaaaatgttgctggatcaagactggttccaattgaaattggt
ccaaattatttacatgaaaaaatgaaacaaaaattaataaatttcaataaatttattgat
gaatatataatttcgaaaaatagtgatgatgataatgatgatattggttatttagctcaa
acaaaactatttgaacaaattcctcaattaagaaatgatattttaataccagaatattgt
aaaattaaaattggatgtggtgatgatgataatgataataataaagaagataatgttgaa
attaatgcttggttaggtccaaaaggaacagtgactccacttcattatgatccaaaacat
aattttctttgtcaaattgttggtaggaaatatattaaactattctcaccaaaggaatca
aataatttatatcctcatttaaactcaaaattattttttaatactagtatggttgatgtt
gaaaatccagatcattcaaaatttccattatttaaaaattgtgattatattgaattaatt
ttaaatgctggtgaaattctttatattccacccacatattggcattttgttaaatcttta
agccaaagtttttcaatattcccctaa

DBGET integrated database retrieval system