Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0271856
Help
Entry
DDB_G0271856 CDS
T00245
Symbol
vps52C
Name
(RefSeq) Vps52 / Sac2 family protein
KO
K20298
vacuolar protein sorting-associated protein 52
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
DDB_G0271856 (vps52C)
Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
Protein recycling
Others
EARP complex
DDB_G0271856 (vps52C)
Endosome - Golgi transport
Tethering complex
GARP complex
DDB_G0271856 (vps52C)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Vps52_C
Vps52_CC
Sec3_CC
CAP_N
DUF641
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8618183
NCBI-ProteinID:
XP_645443
dictyBase:
DDB_G0271856
UniProt:
Q86HF6
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(970613..973266)
Genome browser
AA seq
798 aa
AA seq
DB search
MSSTPSKHFMKQSSKLLLEDLRKEREELEDLGELDITTILGSDFDDDSISAADQELIKEA
LIKGYDLRQYSKDVENNLNQMDKMTINDYFQERDNFLTLYTQIQVVDGVLETLETMLNNY
YNDLKSIGSEMNSLQERSMSMNHKLNNRKLFDEKLSKFLDAVIIDPEFYSDLTNSKNGID
DYYISNLTKLDTKITLFDDYKKISPTICAMNEPQLSKLTVASIQKIQKYLATTLNSNFKK
LAEKKQKQKQLANMGYLFQFLFKYSQYIASEVILSYVENNEKYFTSFYKAYVSALLKLLE
DGAPGKNDFINIGTGKIKSLFNSTPSKNSNNNNNGQQQQQQQQQQLHTTFSMGNRCELLV
KEVLELPPIEPPQSSSSIPFLEAALEFIPIVNTNNNNSNSNSNNNSKESGKELPSVKYSF
DQLFRSMIYFLMDILGSETLFVKDFFLGGEDIILSIFTRSINHLVEVTENYLANSYDVVG
LVLMISMLYRYRSMMNERGVNALDKPFDRLIAMISNRFVKLFSLYLDHIKNTSIKDLKAG
ISCNSPHYVIRKYADFITTIQAVSANIPTQCECQNILCKAVAELKDSCNGLINRLVQEIE
SKDDQIIFLANNYAIVVQSIQEYVVSSNGTGGTATNGDIIPPDQDITIKPFYKSFQSVAK
KYVDTQIANLKYLSHFISFSWEWGPLVESNVKIDLKENPSFNTSNVTKILHAFEQNWRSA
IAAIRNNSINHFSQCQYAQTQIFNLVITEIYTCYRMLAIIIDKYFDSLKSDPNFKSDKII
DEMKEMNPSLNLKYIYQE
NT seq
2397 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagttcaacaccaagtaaacattttatgaaacaatcatctaaattattattagaagat
ttaagaaaggaaagagaagaacttgaagatttaggtgaattagatattacaactatttta
ggttctgattttgatgatgattcaatatctgcagctgatcaagaattaattaaagaagca
ttaataaaaggatatgatcttagacaatattcaaaagatgttgaaaataatttaaatcaa
atggataaaatgacaattaatgattattttcaagaaagagataattttttaacattatat
acacaaattcaagttgttgatggagtattagaaacattagaaacaatgttaaataattat
tataatgatttaaaaagtattggttcagaaatgaattcacttcaagaaagatcaatgtca
atgaatcataaattaaataatagaaaattatttgatgaaaaattatcaaaatttttagat
gctgtaattattgatcctgaattttatagtgatttaacaaattcaaaaaatggtattgat
gattattatatttcaaatttaacaaaattagatacaaagataacattatttgatgattat
aaaaagatatcaccaacaatttgtgcaatgaatgaaccacaattaagtaaattaacagtg
gcatcaattcaaaagattcaaaaatatttagcaacaactttaaattcaaattttaagaaa
ttagcagaaaagaaacaaaaacaaaaacaattggcaaatatgggttacctatttcaattc
ttatttaaatattcacaatatattgcaagtgaagtaattttatcatatgttgaaaataat
gaaaagtatttcacatcattctataaagcatatgttagtgcgttattaaaattattagaa
gatggtgcacctggtaaaaatgatttcattaatattggtactggtaaaattaaaagttta
tttaattcaacaccaagtaaaaatagtaataataataataatggacaacagcaacaacag
caacaacaacaacaattacatacaacattttcaatgggtaatagatgcgaattattagtt
aaagaagttttagaattaccaccaattgaaccaccacaatcatcaagttcaataccattt
ttagaagcagctttagaatttataccgattgtaaatactaataataataatagcaatagt
aatagtaataataattcaaaagaatcaggtaaagaattaccatcagtaaaatattcattt
gatcaattatttagatcaatgatttattttttaatggatattttaggttcagaaacatta
tttgtaaaggatttctttttaggtggtgaggatattattttatcaatatttacacgttca
attaatcatttggttgaagttacagagaattatcttgctaatagttatgatgtggttgga
ttggtattgatgatatcaatgttgtatcgttatagatcaatgatgaatgaacgtggtgta
aatgcattggataaaccattcgatagattgattgcaatgatttccaatagatttgtaaaa
ttattctcattgtatttggatcatattaaaaatacatcgattaaagatttaaaagctggt
atctcttgtaattcaccacattatgtaattagaaagtatgcagatttcataacaacaatt
caagcggtttctgcaaacattccaacacaatgtgagtgtcaaaatattctatgtaaagca
gttgcagagttgaaggatagttgtaatgggttaatcaatagattggtacaagaaatcgaa
tcaaaagatgatcaaatcatattcttggctaataactatgccattgtggttcaatcgatc
caagaatacgtcgttagtagtaatggcactggtggtaccgctaccaatggtgacattata
ccacctgatcaagatataaccattaaaccattctataaaagttttcaatcagttgcaaag
aaatatgttgatactcaaatcgcaaatctaaaatatttatcacatttcatctctttctct
tgggaatggggtccattggttgaatcaaatgttaaaatcgatctcaaagagaatccttct
ttcaacacttcaaatgttacaaagattcttcatgctttcgaacaaaattggagatctgct
atagctgcaattcgtaacaactctatcaatcatttctctcaatgtcaatatgctcaaact
caaatctttaatttagtaatcactgaaatttacacttgctatcgtatgttggcaattatc
attgataaatatttcgattctttaaaatctgatccaaattttaaatctgataaaatcatt
gatgaaatgaaagaaatgaatccaagtttaaatttaaaatatatttatcaagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
