Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0273209
Help
Entry
DDB_G0273209 CDS
T00245
Symbol
trappc10-1
Name
(RefSeq) trafficking protein particle complex subunit 10
KO
K20307
trafficking protein particle complex subunit 10
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
DDB_G0273209 (trappc10-1)
Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
Endosome - Golgi transport
Tethering complex
TRAPP complex II
DDB_G0273209 (trappc10-1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TRAPPC10_1st
TRAPPC10
NTS_TR130
Foie-gras_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8618876
NCBI-ProteinID:
XP_644774
dictyBase:
DDB_G0273209
UniProt:
Q556Z3
LinkDB
All DBs
Position
2:2711050..2715761
Genome browser
AA seq
1442 aa
AA seq
DB search
MSNVSPNSMNLNGSTSSTASVNDSGGGGGGGNVTSPTLSSSSASSISNSNSSSSNNLKPS
TQPLSSSSTLNTPTQFSLQHSSSSSSLNNTNIDIIEHITISYQDESSIWKYIEAELPNHL
PLKNISWKTKTGHTKVVEKMPIEILQYNDERVKAHYDNQNLYKKPYLYLYLVHCDDPDTY
KNVVRAKIKQWVTQMTERQQEWLIVYVSLGPKRFSELTSKLTRTVFDRIKNDFNVKRDRC
CQLRFLDTNNTSSGNNKDKDNDNGGGSSGTGLSTSTKQQDDLWDDFLIKMKEGIISSAEQ
YLTTYEDEIRKMDAKRTTPGWSYQNFFFIKEGLALIYERAQLYEDALMQYFELEVLFGDP
NNRSQFDQITDEVLQPNSIHCNGNILDTSFKNYRKLIYENKISLFDFKVYLFARQSKLLF
LLQKPIEAATKSISFITSMSMIIKQYPNSFAPMFKESWIFSTSMELIKACQDSFDKIVNG
AQQQQQQQQQQLQLQQQLQQQQQQQTINGSAQKVVKSISSTTPISKLFGAFGPFGSSSSN
TPSSTSATTAANGKNTPMPSNSGIASLSAGGSTIIAGLSGSQSLNNLQSAQLSGALNTQH
YIRTPSLNLTSDLSERLTEKQDRESLDFLVGDLLFSSAQRLEELAIIIGYLPVDDYNSEM
FFQNVEEVIFKSVENKKIEVDSMTAFSYQPLQVSLQSSKQFTQLYFELLGQIEKLYIQSN
RMRSISRLTFAIANLNFKLKEFQIAENLFKSISNLYSREHWSYIEYAVKTRLSYCQKQLG
HLVDYVTTCVGLLAPGLLTNRFEKDHYLSEIIQISRKPELNIVQPMIPLFKCKVTFKETV
YRYFETIKINVRIKSNLISPIRFNNGAVSFVKSGFGDKLVFQLNDFLVEPGVNNFQFTAV
GTTKATFVKDSIWLKIDNLSFGYSLRNADTAIGGGGGGTNTTTTTLPGEIKVIDSESQIT
LESFANSPLLFYSIQYVGIKLHTHSDTIEAGVLTFTSPTGATIIPTSSVIIIQSDDKTCE
TSSRTINLINDKLPLSQIGYNQTLEFYLPLMAVNTDTCTHQIRIELQHQKQTKEKFSSSL
VSSILFINPLTIDESVINVNNRLFLKTIIQCNSPNMIQFNSYSLEGCDSEYQSPEQQQLQ
QQLQQQQQLSLSSSSSSISSISSKSSQQPNLYYLVKDHNHSLAPNLNLYPGQLVSLIFEI
KKYENESLSSSTSPSSATDSSNSNGNNNNNNNNNNHSKNDLKLKIKYTSKMPQQDLDRPL
IRECKSLWRDQNEFSWPIKIELPTYLYQIDLSIQSRAYVGTIVLFEIEITNLKQQQQQQK
ESNNDNGNEKQQKQQQLQYHIVADSQIWMISGKSKHTFSFNSDTVGEKLKFSCGLIPISS
GSLPIPKVTLVGINNSNISYPKTKNEKIFVYPSPQIYSCHQLQDNNNNNNNSINSQTSTN
KT
NT seq
4329 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctaatgtatcaccaaattctatgaatttaaatggatcaacatcatcgacagcatca
gttaatgatagtggaggcggtggtggtggtggcaatgtaacatctccaacactatcatca
tcatcagcatcatcaattagtaatagtaatagtagtagtagtaataatttaaaaccatca
acacaaccattatcatcgtcatctactttaaatactccaacacaattttcacttcaacat
tcttcttcatcatcttcattaaataatacaaatattgatataattgaacatattacaatt
tcatatcaagatgaatcatcaatttggaaatatattgaagcagaattaccaaatcattta
ccgttaaagaatatatcatggaaaactaaaacaggacatacaaaagtagtggagaagatg
ccaattgaaatattacaatataatgatgaacgtgtaaaggcacattatgataatcaaaat
ctatacaagaaaccatacctctatttgtatttggtacattgtgatgatcctgatacctat
aagaatgttgtacgtgctaaaataaaacaatgggtaactcaaatgactgaacgtcaacaa
gagtggttaatagtttatgtttcattaggtccaaaaagatttagcgaattaacttcaaaa
ttaacaagaactgttttcgatagaattaaaaatgatttcaatgttaaacgagatcgttgt
tgtcaattaagatttttagatacaaataatacaagcagcggcaataataaagataaagat
aatgataatggtggtggtagtagtggaacaggtttgtcaacaagtacgaaacaacaagat
gatttatgggatgattttctaattaaaatgaaagagggtataatttcatcagcagaacaa
tatttaacaacctatgaagatgaaattagaaaaatggatgcaaagaggacaacaccaggt
tggagttatcaaaacttttttttcataaaggaaggtttagcattaatctatgaacgtgct
caattatatgaggatgcattaatgcaatattttgaattggaagtacttttcggtgatcca
aataataggtcacaatttgatcaaatcactgatgaagttttacaaccaaatagtattcat
tgtaatggtaacattttagatacttcctttaaaaattatagaaagttaatttatgaaaat
aaaattagtttatttgattttaaagtttatttatttgcaagacaatcaaaattattattt
ttattacaaaaaccaattgaagcagcaacgaaatcaatatcatttattacatcaatgtca
atgataattaaacaatatccaaattcatttgcaccaatgtttaaagaatcatggatattc
agtacaagtatggaattgattaaagcatgtcaagattcattcgataagattgtaaatggt
gctcaacaacaacaacagcaacagcaacaacaattacaacttcaacaacaattacaacaa
caacaacagcaacaaactataaatggtagtgcacaaaaagttgtgaaatcaattagttca
actacacccatttcaaaattatttggtgcatttggaccttttggtagtagtagtagtaat
acaccatcatcgacatcagcaactacagcagcaaatggtaaaaatacaccaatgccaagt
aatagtggtatagcttcattaagtgcaggtggatcaacgattatagcaggtttatcaggt
tcacaatctttaaacaatttacaatctgcacaattatcaggtgctttaaatactcaacat
tatattcgtacaccttctttaaatttaacaagtgatctctctgaaagattaactgaaaaa
caagatagagaaagtttagattttttagttggtgatttattatttagttcagctcaaaga
ttagaagaattggcaataattattggatatttaccagttgatgattataatagtgaaatg
ttctttcaaaatgtagaagaagttatatttaagagtgtagagaataaaaagattgaagtt
gattcaatgacagcatttagttatcagccattacaagtctcacttcaatcatcgaaacaa
ttcactcaactttatttcgaattgttaggtcaaattgagaaattgtatattcaatctaat
agaatgagaagtattagtagattaacatttgcaattgcaaatttaaatttcaaattaaaa
gaatttcaaattgcagagaatcttttcaaatcaatttcaaatctttactctagagaacat
tggtcctatatagaatatgccgttaaaactagattatcctattgtcaaaagcagttgggt
catttagttgattatgtaacaacttgtgttggtttattagctcctggtttattaacaaat
agatttgaaaaagatcattatttatctgaaattattcaaatttctcgaaaacctgaatta
aatattgttcaaccaatgataccattatttaaatgtaaagttacatttaaagaaacagtt
tatagatattttgaaacaattaaaatcaatgttagaataaagagtaatttaatatcacca
attagatttaataatggtgcagttagttttgtaaagagtggtttcggtgataaattagta
tttcaattgaatgatttccttgttgaaccaggtgtaaacaatttccaattcacagcagtt
ggtacaactaaagcaacctttgttaaagattcaatttggttaaaaattgataacctttca
tttggttattcattacgtaatgctgatacagctattggtggtggtggtggtggtacaaat
acaacaacaactacattaccaggtgaaattaaagttattgatagtgaatcacaaataact
ttagaatcatttgcaaatagtccattattattttatagtattcaatatgttggaattaaa
ttacatactcattccgatacgattgaagcgggtgtattaacattcacttcaccaactggt
gcaactataataccaacttcatcagtaatcatcatacagagtgacgataaaacttgtgaa
acttcctcaagaacaataaatttaattaatgataagttaccattatctcaaattggttat
aatcaaacattggaattctatttaccattgatggctgtaaataccgatacttgcactcat
caaattagaatcgaattacaacatcaaaaacaaaccaaagaaaaattttcatcatcattg
gtctcttcaattttattcattaatccattgacaatcgatgaatctgtcattaatgtaaat
aatagattattcttaaaaactattatacaatgtaattctccaaatatgattcaatttaat
tcttattctttagaaggttgtgattcagaatatcaatcacctgaacaacaacaattacaa
caacaattacaacaacagcagcaattatcattatcatcttcaagttcatcaatctcatca
atctcttcaaaatcttcacaacaaccaaatttatattatttagtaaaagatcataatcat
tcattagcaccaaatttaaatttataccctggccaattagtttcattaatttttgaaatt
aaaaagtatgaaaatgaatctttatcatcatcaacatcaccttcatcagcaactgatagt
agtaatagtaatggaaacaataacaacaacaacaataacaacaaccatagtaaaaatgat
ttgaaattaaagataaaatatacaagtaaaatgcctcaacaagatttagatagaccatta
attagagaatgtaaatcattatggagagatcaaaacgaatttagttggccaattaaaatc
gagcttccaacttatctttatcaaatagatctatcaattcaaagtagggcttatgttggt
acaatagttctttttgaaattgaaattacaaatttaaaacaacaacaacaacaacaaaaa
gaaagtaataatgataacggtaatgaaaaacaacaaaaacaacaacaattacaatatcat
atagttgctgattcacaaatttggatgatatctggtaagagtaaacatacattttcattt
aatagtgatacagttggtgaaaagcttaaatttagttgtggtttaattccaatctcctct
ggctcattaccaattccaaaagtaactttagtcggtataaataattcaaatatttcttat
ccaaaaactaaaaatgaaaagatattcgtttatccatcaccacaaatttattcatgtcat
caattacaagataataataataataataataatagtattaatagtcaaactagtacaaac
aaaacataa
DBGET
integrated database retrieval system
