Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0274119
Help
Entry
DDB_G0274119 CDS
T00245
Symbol
abcA5
Name
(RefSeq) ABC transporter A family protein
KO
K05643
ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 3
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
DDB_G0274119 (abcA5)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ddi02000
]
DDB_G0274119 (abcA5)
Transporters [BR:
ddi02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCA (ABC1) subfamily
ABCA1, 2, 3, 4, 7, 12, 13 subgroups
DDB_G0274119 (abcA5)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
ABC2_membrane_3
AAA_21
R1_ABCA1
SMC_N
SRP54
AAA_29
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8619461
NCBI-ProteinID:
XP_644031
dictyBase:
DDB_G0274119
UniProt:
Q8T6J2
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(4156981..4162118)
Genome browser
AA seq
1662 aa
AA seq
DB search
MGEKSSQLKTLLKKNLLLKSKSKCGICCEIVFPIIIVLLVFAILVLVQLFKPNYDLIKTT
QFSNRINENNIIIYGGKAGSLNVEQKGVIDMMKFQLSNELNKSISEVDVYFKEINDKSEM
ENYFQINSTQVFGGIWFESNQLSSVANTTNTNTTTNSFKYSIRLDSNSVLDSNKVKDNGI
DSSDYLTKNWAYIQIAMDQAIFGYFGLDYKLVINGQRYPDPYVELWQKWINGRESVFKSA
GSVFVSAALLIFTFRLVTELVVEKETKIREGMSIMGLNQYCYFISWIITSLVTALPIDLI
IIVILKGSQVIHSTSWIIVIVTLILYLLTLQLLAFIFSMFFDKSKFAGLLTFLTILLINI
CGIFIGEYEIINIHIKLLLCCIFSPIGIACSFYIMSIRDIPDTISTINLNQVISEKQIIG
TFVFNIIFYTFLIWYLDKIVKTEYGTKEPWYFLFTKRYWTVGAGKINKKNKNKEYNYNDI
ESTIQNNNNDNIEMVPIEVRNKTTISIRNLRKEFKTGDGLRIAVNDLNLDMFDGQIHGLL
GPNGSGKSTTISMLTGLLSPTSGTAFILGNDITYQMNEIRKCTGVCLQTDIIWNQLTVLE
HLEIYASLKGITNKKQIKSESLKMANEIDLGEKLHTPAGSLSGGQKRKLCLGIAFIGRST
IIFLDEVSSGMDPSSRRKVWDFLLSHKKGKTIILTTHYLDEADYLSDRISIISHGKLITD
GSSLFLKNKYGVGYLLTCSKSLNTIDQFNVDQVTQFIRDQIPDVTVLSNAGSEISFRLPT
ASLPVFSKFFKDFDENLSNFHIDSYGISVTTLEEVFLKIGTDIDTDALSIADGNGNDDEL
KRSIGVSSTGIKSKQQLKALLIKRVKTSSKDFKAFLLSLLLPLLVIIGSIIVFKEVDNEV
IFYNNSTEPLTFSLLQQYGKNDIVPIQLAGTTSEFDFNKFLSNSPYFNQFQYLNNSINFN
QYLINNYKQSSGSINFTIPLSSSLINNTTKVISYNSLFNFNYIHSWPVHVNLINDALLRN
HNGIGIECTSLPFDHILTSFQKASQGMNIQSIVYFIVIMMAGFSLMAGSFAGSISQERTN
RIKRLLYISGCKKYIYWVSNLLWDYFFAFILLLITCIILAIVDDKFNDQFGLFFLSLVLF
SLSIIPLSYLFSFKFSSFGKSTGAITAIHFSIGVIMTIAMIILRIEVIIKNSSSLENIAD
IIDIVFNILSPLYAFSRVIFIISGFPGSLRLGALKIDDYWSLHYASTPIIILSVHVVVWT
IFILLIDYSPEFKGYLRNPKTILPPPPPIDEDSDVSAERIRLESMSPIPSTDQGSGGGGD
MLQYKGLHKLFIGKGKNPNKNAVYNSTLGIPQGQTFGLLGLNGAGKTTTVSMLAGDILPT
SGQITINGHDLVTDRAQALRGVSVCPQFDALITLLTAREQLSLYCAIKGVPDDKISLVVE
AFIKMMDLGKIANSNTGGYSGGNKRKVSLSIAMLGNPSVVLIDEASSGCDPIIRYRQCQV
ISELGKNKVIILTSHSMSEIQALCSRMTIMRDGQFKCLGSTQHIKSKFGAGYSVEVKFKK
SCLEVGIPQSLQCVLECFPNATILDQHDLMASLELPNPPENPIKVSEIFNILSTELSSIL
DDYSVSQTSLEQVFLKLTGATHEDRLNLNNQQQQQQTIPNSD
NT seq
4989 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggagagaagtcatcacaattaaaaactcttttaaaaaagaatttattattaaaatca
aaatcaaaatgtggaatttgttgtgaaattgtttttccaattattattgtattacttgta
tttgcaattttagtattagtacaactttttaaaccaaattatgatttaataaaaacaact
caattttcaaatagaattaatgaaaataatataataatatatggtggaaaagcaggatca
ttaaatgttgaacaaaagggagttattgatatgatgaaatttcaattatcaaatgaatta
aataaaagtattagtgaagttgatgtatattttaaagagattaatgataaatcagaaatg
gagaattattttcaaattaactcaacacaagtatttggtggaatttggtttgaaagtaat
caattatcatcagtagctaatactaccaacaccaacaccacaacaaactcatttaaatat
agtatacgattagattcaaatagtgttttagattcaaataaagttaaagataatggtatt
gatagtagtgattatttaacaaagaattgggcatatattcaaattgcaatggatcaagca
atatttggatactttggattggattataaattggtaattaatggacaacgttatcctgac
ccgtatgtagagttatggcaaaaatggataaatgggagggaatcggtatttaagagtgca
ggatcagtgtttgtatctgctgctttattaatattcacttttagattggtgacggaatta
gtagttgagaaggaaacaaagattagggaaggtatgagtataatggggttaaaccaatat
tgttatttcatatcatggattatcacatcactagtgactgcactaccaattgatttaatt
ataattgtaattttaaaaggtagtcaggtgattcattcaacttcatggattatcgttatt
gttacattgatattatacttgttaacattgcaattgcttgcatttatattctcaatgttt
tttgataaatctaaatttgcaggattgttaacattcttaacgatattgttaattaatata
tgtggtattttcattggtgaatatgagattataaatatacatattaaattattattatgt
tgtatattctcaccgattggcatagcatgttcattctatataatgtcaattagagatata
ccagacacgatttcaacaataaatttaaatcaagtaatatcagaaaaacaaataataggt
acatttgtatttaatattatattttatacatttttaatttggtatttagataaaatcgtt
aaaactgaatatggtacaaaagaaccatggtattttttatttacaaaaaggtattggaca
gttggtgctggtaaaattaataaaaagaataaaaataaagaatacaattataatgatata
gaatcaactattcaaaataataataatgataatattgaaatggtaccaattgaagttaga
aataaaacaacaatttcaattagaaatttaagaaaagaatttaaaactggtgatggttta
agaattgcagtaaatgatttaaatttagatatgtttgatggtcaaattcatggtttatta
ggtccaaacggtagtggaaaatcaacaacaatctcaatgttaactggactattatcacca
acatccggtacagcattcatacttggtaatgatataacttatcaaatgaatgaaattaga
aaatgtacgggtgtatgtttacaaactgatatcatttggaatcagttaactgtattggaa
catttagaaatatatgcatcattaaaaggcataacaaataaaaaacaaattaaatctgag
tctttgaaaatggcaaatgagattgatttgggtgaaaaactacacacaccagctggctca
ctatcaggtggccaaaaacgtaaactttgcctaggcattgctttcattggtagatcgact
ataatattcttggatgaggtttcctcaggcatggatccaagttcgcgtagaaaagtatgg
gactttttattatctcataaaaagggtaaaactataattcttacaactcattatttagat
gaagcagattatttatctgatagaatttccattatatcacatggtaaattaattactgat
ggtagttcattatttttaaagaataaatatggtgttggttatttattaacttgtagtaaa
tctttgaataccattgatcaattcaatgttgatcaagttactcaattcataagagatcaa
atacctgatgtaactgtactttcaaatgcaggttcagaaatttcatttagattaccaact
gcttcattacctgtattttcaaaattctttaaagattttgatgagaatttatcaaatttt
catattgattcctatggtattagtgtaaccactttggaagaggttttcttgaaaatcggt
acagatatcgatactgatgcgctttcaattgcagatggtaatggcaatgatgatgaatta
aaaagatcaattggagtttcatcaactggtataaaatcaaagcaacaattaaaagcatta
ttaattaaacgtgttaaaacatcttcaaaagattttaaagcatttttattatcattacta
ttaccattactagttataattggatcaattatagttttcaaagaagttgataatgaggtt
atattttataataattcaacagaacctttaacattttcattacttcaacagtatggtaaa
aatgatatcgtaccaattcaattggctggcacaacttcagaatttgatttcaataaattc
ttatcaaattcaccatactttaatcaatttcagtatttaaataactcaattaactttaat
caatatttaattaataattataaacaatcatcaggttcaattaatttcacaataccatta
tcatcatcattaattaataatacaactaaagtaatatcatataattcattatttaatttt
aattatattcattcttggccagttcatgtaaatttaataaatgatgctctattaagaaat
cataatggtataggtatagaatgtacttctttaccatttgatcatatattaacaagtttt
caaaaggcaagtcaaggtatgaatattcaatcaattgtttatttcattgtaattatgatg
gctggattttcattgatggcaggttcttttgctggtagtatctctcaagagcgtacaaat
agaattaaaaggttattatatatatcaggttgtaaaaagtatatttattgggtatcaaat
ttattatgggattatttctttgcatttattttattattaatcacttgtattatattagca
attgttgatgataaatttaatgatcaatttgggttattctttttatcattagttttattc
tcattatcaatcataccattatcttatttattctcattcaaattttcatcatttggtaaa
tcaactggtgcaatcactgcaattcatttttcaattggtgtaattatgacaattgcaatg
ataattttaagaattgaagtaattattaaaaattcatcatcactagagaatattgcagat
atcattgatatagtattcaatattttatcaccattatatgcattttcaagagtgattttc
ataatttcaggtttcccaggttctctaagattaggtgcattaaaaatcgatgattattgg
tcactacattatgcctcaaccccaataataattttatcagtacatgttgtagtttggact
atattcatattattaatagattattcaccagagtttaaaggttatttaagaaatccaaaa
accattctaccacctccacctcctatcgatgaagattctgatgtctctgctgaaagaatt
aggttggaatcaatgtcaccaataccatccacagaccaaggtagtggtggtggtggtgat
atgttacaatataaaggtttacataaattattcattggtaagggtaaaaatccaaataaa
aatgcagtatataattcaacattgggtataccacaaggtcaaacatttggtttacttggt
ttaaatggtgctggtaaaactacaaccgttagtatgctagctggtgatattctaccaaca
agtggtcaaataactatcaatggtcatgatttagtaaccgatagagctcaagctttacgt
ggtgtttctgtatgtccacaatttgatgcattaataacattattaactgctcgtgaacag
ttatctctatattgtgcaatcaaaggtgtaccagatgataaaatatcactagtagttgaa
gcattcattaaaatgatggatcttggtaaaattgcaaattcaaatactggtggttattca
ggtggtaataaaagaaaagtttcattatcaattgcaatgcttggtaatccatcagtagtt
ttaatcgatgaagcatcatcaggttgtgatccaatcattagataccgtcaatgtcaagta
attagtgaattgggtaaaaataaagtcatcattttaacttctcattcaatgtctgaaatt
caagcattatgttcaagaatgacaattatgagagatggtcaattcaaatgtttaggatca
actcaacatattaaatctaaatttggagcagggtattcagttgaagttaaatttaaaaag
agttgtttagaagttggtattccacaaagtcttcaatgtgttttagaatgtttcccaaat
gcaactattttagatcaacatgatttaatggcaagtttagaattaccaaatccacctgaa
aatccaattaaagtttcagagattttcaatatactttcaacagaattatcttcaatttta
gatgattattcagttagtcaaacttcattagaacaagtatttttaaaattaactggtgca
actcatgaagatcgtttaaatttaaataaccaacaacaacaacaacaaacaattccaaat
tccgattaa
DBGET
integrated database retrieval system
