Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0277019
Help
Entry
DDB_G0277019 CDS
T00245
Symbol
wdr36
Name
(RefSeq) U3 small nucleolar ribonucleoprotein
KO
K14554
U3 small nucleolar RNA-associated protein 21
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi03008
Ribosome biogenesis in eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
DDB_G0277019 (wdr36)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
ddi03009
]
DDB_G0277019 (wdr36)
Ribosome biogenesis [BR:
ddi03009
]
Eukaryotic type
90S particles
U3 small nucleolar RNA-associated proteins
DDB_G0277019 (wdr36)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Utp21
WD40_Prp19
WD40_CDC20-Fz
Beta-prop_EML_2
WD40_WDHD1_1st
WD40
Beta-prop_WDR90_POC16_2nd
WDR55
ANAPC4_WD40
Beta-prop_EML
EIF3I
WD40_MABP1-WDR62_2nd
Beta-prop_WDR19_1st
WD40_MABP1-WDR62_1st
Beta-prop_TEP1_2nd
NBCH_WD40
Beta-prop_HPS5
Beta-prop_DCAF4
Beta-prop_WDR75_1st
Beta-prop_LRRK2
Beta-prop_CAF1B_HIR1
WDR90_beta-prop_4th
Beta-prop_NUP159_NUP214
Beta-prop_IFT140_1st
Beta-prop_VPS8
Beta-prop_Nup120_160
KNTC1_N
Cytochrom_D1
Cwf_Cwc_15
Beta-prop_SCAP
Lactonase
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8620696
NCBI-ProteinID:
XP_642832
dictyBase:
DDB_G0277019
UniProt:
Q550V0
LinkDB
All DBs
Position
2:7238641..7241913
Genome browser
AA seq
1026 aa
AA seq
DB search
MESGSQIFLPYKSVGYVSSGVPFKLRAEKLHYSIMLAIGNSFQLLNSIKLFPRMVSNSQE
GKIRDMSFYKKDHFLTTCKKDIILWKGQYEEFRFRGHSSKVIKLMVFDNILFSLAKNNEL
IMWDVDSRLIFKEQLPEFNAKTHRITEIVHPLGYYNKILIGFESGEAQIWNIKTKKLIFT
FNLVKDNKNIKDKITSFQQSPVSDIIAIGFSDGNVIIHNLKLNKTVLSFQQRGSVSSISF
RSDGQKQHVATSSHSGDILIWDLEKNKPFHTLKAHDSECTKVEFLREEPIICTTGNDNSI
KMWQFNGVDGVPILLRERTGHLDPPKSSEFFGDEQENSVISISDQSIRYVSIVASTFNKE
LSKKNFKKEMTPFSGFSTNFRRNRSWETAVSIHEDSKHAFTWDCSSYSINKKLNIQEPIS
STKISTCGNFVFFGTVYGNLLKFNIQSGIKRAKILPNIQKTSITSIIVEPTNQFIITSGL
DSIINYWDFNDLKYLYSIDINNTNTNNKENQDNNNNDNKKSKIRISKMLLHSESGIFAVV
SNDDKIRLYDIDTRKLVRYFNVKGNVNSIVFSHDGRWIIASTQVDSVVRVLDIPSGKMID
WFKMPKPVTSLSFSPKGEYLVTTHSGQLPIYLWSNQSHFGSVFLKTPPQIPNTIILPSQV
IEISPIQESSNNKQKSSTKKLKEKEQHEQDEEFEIQQDLGLPEEFDEEMEDNQVDNNDND
ADDNKKSTIKQIDQLITLSSDVAKSKWQSLLNLDIIKERNRPIQQNEKPALAPFFLSTIQ
GLEPKFAKIDVVNPLTIKTAVSTGGGGSANTTGSTDDNENNGEPTEEELKGWDNWAGADD
EENDDDDDDEDNENDDQDEDSEDDEDEGDEDLEKTTETFKNEKEIYRSDKVIKTDSLQGT
RTNFNLSLENGYITQNYSESLRILKSLTPSGIDFEIRTLTTADDYADIHYMFDFIVYQLL
KNGDYDFIQSILSVTLKVHGYLLYDTTFKRDLRQLLLVFNEPWFKMQKLFHSNICMLRYF
TNTLNN
NT seq
3081 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatcaggatcacaaatctttcttccatataaatcagttggttatgtcagttcaggt
gtaccatttaaattaagagctgaaaaattgcattattcaattatgttagccattgggaat
tcttttcaattattaaattcaattaaattatttccaagaatggtatcaaatagtcaagaa
ggtaaaattagagatatgtcattttataagaaagatcattttttgacaacatgtaaaaaa
gatattatattatggaaaggtcaatatgaagaatttagatttagaggacattcatcaaag
gttattaaattgatggtatttgataatatattattttcattggcaaaaaacaatgaactg
attatgtgggatgttgattcacgtttaatttttaaagaacaattaccagaatttaatgca
aaaactcatcgtataacagagattgtccatccacttggatattataataaaattttaatt
ggatttgaaagtggtgaagcacaaatttggaatattaaaacaaagaaattaatatttaca
ttcaatttagtaaaggataataaaaacattaaagataaaatcacctcatttcaacagtca
ccagtttcagatataattgcaattggtttttcagatggtaatgttatcattcacaatttg
aaattgaataaaacagtattaagttttcaacaaagaggttcagtttcatcgatttccttt
agaagtgacggtcaaaagcaacatgttgccacaagtagccatagtggtgatatattaatt
tgggatcttgaaaagaataaacctttccatacattgaaagcacatgatagtgaatgtaca
aaagttgaattcctaagggaagaaccaatcatttgcaccaccggtaacgataattcaata
aagatgtggcaattcaacggtgtagatggtgtaccaattctcttaagagaacgtaccggt
catttagatccaccaaaatcaagcgaattctttggcgatgaacaagagaactcagtgatt
tcaatctctgatcaatcaattcgttacgtttcaattgttgcctccacttttaataaagaa
ttatcaaaaaagaatttcaaaaaagaaatgactccatttagtggtttctctacaaacttt
cgtagaaatcgtagttgggaaactgcagtttcaattcatgaagattcaaaacatgctttc
acttgggattgttcaagttattccataaataagaaattaaatattcaagaaccaattagt
tcaactaaaatttcaacttgtggtaattttgttttctttggtactgtttatggtaatcta
ttgaaattcaatattcaatctggtattaaacgtgctaaaattttaccaaatattcaaaaa
acttcaataacaagtataatagttgaaccaactaatcaatttataattacaagtggttta
gattcaattataaattattgggattttaatgatttaaaatatttatattcaattgatatt
aataataccaatacaaataataaggaaaatcaagataacaataacaatgacaataaaaaa
agtaaaattagaatttcaaaaatgttattacatagtgaatctggtatatttgcagtggtt
tcaaatgatgataaaattagattatatgatattgatacacgtaaattagttagatatttc
aatgttaaaggtaatgttaatagtattgtttttagtcatgatggtcgttggattattgca
agtactcaagttgattcggtcgttcgtgtacttgatattccatctggtaaaatgattgat
tggttcaaaatgccaaaaccagtaacaagtttatcattctctccaaaaggtgaatattta
gttacaactcattccggacaattaccaatttatctttggagtaatcaatctcatttcggt
tcagttttccttaaaactccacctcaaattccaaatacaatcattttaccttcacaagtt
attgaaatttcaccaattcaagaatcatctaataataaacaaaaaagttcaactaaaaaa
ttaaaagaaaaagaacaacatgaacaagatgaagaatttgaaattcaacaagatttaggt
ttacctgaagaatttgatgaagaaatggaagataatcaagttgataataatgataatgat
gctgatgataataaaaaatcaactattaaacaaattgatcaattaattacattatcaagt
gatgttgcaaaaagcaaatggcaatcactcttaaatttagatatcattaaagaaaggaat
agaccaattcaacaaaatgaaaaaccagctttagcacctttctttttatcaactattcaa
ggtttagaaccaaaattcgctaaaattgatgttgttaatcctttaactattaaaactgct
gtctcaactggtggtggtggtagtgcaaatacaactggttcaactgatgataatgaaaat
aatggtgaaccaactgaagaagaattaaaaggttgggataattgggctggtgctgatgat
gaagaaaatgatgatgacgatgatgatgaagacaacgaaaatgatgatcaagatgaagat
agtgaagatgatgaagatgaaggtgatgaagaccttgaaaaaactactgaaactttcaaa
aatgagaaagaaatttatagatcagacaaagttattaaaactgattcacttcaaggtaca
agaactaattttaatttatcattagaaaatggttatataactcaaaattattcagaaagt
ttaagaatattaaaatcattaaccccatctggtattgattttgaaattagaacattaaca
acagctgatgattatgctgatattcattatatgtttgatttcattgtttatcaattattg
aaaaatggtgattatgatttcattcaatcaatactcagtgtcactttaaaggtacatggt
tatttattatatgataccactttcaaaagagatctcagacaattattattagtatttaat
gaaccttggtttaaaatgcaaaaacttttccattcaaatatttgcatgcttagatatttc
acaaatactttaaataattaa
DBGET
integrated database retrieval system
