Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0277527
Help
Entry
DDB_G0277527 CDS
T00245
Symbol
ddx20
Name
(RefSeq) DEAD/DEAH box helicase
KO
K13131
ATP-dependent RNA helicase DDX20 [EC:
5.6.2.7
]
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
ddi03041
]
DDB_G0277527 (ddx20)
Enzymes [BR:
ddi01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.7 DEAD-box RNA helicase
DDB_G0277527 (ddx20)
Spliceosome [BR:
ddi03041
]
Other splicing related proteins
Proteins involved in snRNP biogenesis
SMN complex factors
DDB_G0277527 (ddx20)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
CMS1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8621069
NCBI-ProteinID:
XP_642653
dictyBase:
DDB_G0277527
UniProt:
Q54ZI9
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(8128317..8130866)
Genome browser
AA seq
849 aa
AA seq
DB search
MKNKILFSFSNPMNSNSSNNIENNNNSNNNNNNFKNNFKNFSRKRTNDIEIEDNITFSEL
LLQKEVLKGLEDGGYQRPSPIQLKAIPLGISGVDLIAQAKSGTGKTIVFGVIALECVLRE
SKLLRQKQELNKTQLTNQTNKQLLEMDDDTYVETMVGIIRKPLVLIIAPTREIAVQIKDV
IKSISKYCKRIKCEVFIGGLNSNNNKDENNNNILNNEDVNRLNGTQIIVGTPGKIKSLIE
NLHLRTDTLKMVIMDEADKLLDASFSKTINWIYSAIGNGNSNKNNSSSGSGIQMLAFSAT
YPSYLINLLKLYMNNENLVEIRLCSDTPSLEGIKQYYQIFRNDFTENNYKTFQNKCKSLV
LVLEQVSFYQAIIFCNHKIRGEELTRQLNREGWPTAFIAGGQNQKDRLSTMSALKSFNIR
ILVSTDLISRGIDVERVNLVINLDLPKDHETYFHRIGRTGRFGTYGVSITFINMKSIQQQ
QQQQQQQQQQIENENENENNNNNEGFQEIDFINQLIQEYSVDITERVDNDIIPEELYSYQ
LSNPNDQQSLANLKLKQQQTILLNKQLEELKINENENENQYQNEDEEEEQEEDDYHYENQ
HQNEDEEEEQEEDDYHYENQHQNEEEEQEQQEEDDDNYNYENDNDSEEYEFIDDSIIEQT
EYYYLNSNNNNNNNKNKYGNTINNNHYRNSSFNGPKNSINNNKFKNKNINNNDQRNSQSN
GIKKKVNTNNNNFYPHYYNNPYPQNYYYDYQYFSDNSYYNNNYNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNYYQQHGNNPYGYNIPNSIQYSSNQFYYCTCPNC
PTMNYHQYI
NT seq
2550 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaacaaaattttattttcattttcaaatccaatgaattctaatagtagtaataat
atagagaataataataatagtaataataataataataattttaaaaataattttaaaaat
ttttcaagaaaaagaacaaatgatattgaaattgaagataatataacattttcagaatta
ttattacaaaaagaagttttaaaaggattagaagatggtggatatcaaagaccatcacca
attcaattgaaagcaataccattgggtattagtggtgttgatttaatagcacaagctaaa
tccggtactggtaaaaccatagttttcggtgtaatagcattggaatgtgttttacgtgaa
tcaaaattactcagacaaaaacaagaattaaataaaactcaattaactaatcaaaccaat
aaacaattattagagatggatgatgacacctatgttgaaactatggttggtattataaga
aaacccctagtcttaataattgctccaactagagaaatcgctgttcaaattaaagatgta
attaaatcaattagtaaatattgtaaaagaattaaatgtgaagtttttattggtggttta
aatagcaacaacaacaaagatgaaaacaataataatattttaaataatgaggatgtaaat
agattaaatggtacccaaattatagttggcacacctggtaaaattaaatctttaattgaa
aatttacatttacgtactgatactttaaaaatggttataatggatgaggctgataaatta
ttagatgcatcattttcaaaaactataaattggatttatagtgcaattggtaatggtaat
agtaataaaaataatagtagtagtggtagtggtattcaaatgttagcattttcagcgacg
tatccaagttatttaataaatttattaaaactttatatgaataatgagaatttagttgag
attaggttatgttcagatacaccatcgttggagggtataaaacagtattatcaaatcttt
agaaacgatttcacagagaataattataaaacatttcaaaataaatgcaagagtcttgta
ttggtacttgaacaagtttcattctatcaagctataatattttgtaatcataaaattaga
ggtgaagaattaacaagacaattgaatagagaaggttggccaactgctttcattgctggt
ggccaaaatcaaaaagatcgtctttcgactatgagtgctttaaaatcttttaatattaga
attttggtttcaacagatttaatttcacgtggtattgatgttgaaagagttaatttagta
attaatttagatttaccaaaagatcatgaaacttattttcatagaattggtagaactggt
agatttggtacatatggtgtttcaataacttttattaatatgaaatctattcaacaacaa
caacaacaacaacagcaacaacaacaacaaattgaaaatgaaaatgaaaatgaaaataat
aataataatgaaggatttcaagaaattgatttcattaatcaattaattcaagaatattct
gttgatattacagaaagagttgataatgatattattcctgaagaattatatagttatcaa
ctttcaaatccaaatgatcaacaatcattagcaaatttaaaattaaaacaacaacaaaca
attttattaaataaacaattagaagaattaaaaataaatgaaaatgaaaatgaaaatcaa
tatcaaaatgaagatgaagaagaagaacaagaagaggatgattaccattatgaaaatcaa
catcaaaatgaagatgaagaagaagaacaagaagaggatgattaccattatgaaaatcaa
catcaaaatgaagaagaagaacaagaacaacaagaagaggatgatgataattataattat
gaaaatgataatgatagtgaagaatatgaatttattgatgatagtataattgaacaaact
gaatattactatcttaatagtaataataataataataataataaaaataaatatggaaat
acaattaacaataaccattaccgcaatagtagttttaatggtcctaaaaatagcattaat
aataataaatttaaaaataaaaatattaataataatgatcaaagaaattcccaaagtaat
ggaataaagaaaaaagtaaatacaaataataataatttttatcctcactattacaacaat
ccctaccctcaaaactattattatgattaccaatatttctctgataatagttactataat
aataattataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataattattaccaacaacatggtaataatccttatggttacaat
ataccaaattcaattcaatattcatccaatcaattttattattgtacatgtccaaattgc
ccaactatgaattaccatcaatacatataa
DBGET
integrated database retrieval system
