Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0277663
Help
Entry
DDB_G0277663 CDS
T00245
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K20183
Vam6/Vps39-like protein vacuolar protein sorting-associated protein 39
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi04142
Lysosome biogenesis
ddi04145
Phagocytosis
ddi04148
Efferocytosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04145 Phagocytosis
DDB_G0277663
04142 Lysosome biogenesis
DDB_G0277663
04148 Efferocytosis
DDB_G0277663
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
DDB_G0277663
Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
Endosome - Lysosome transport
Tethering complex
Hops complex
DDB_G0277663
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
CNH
zf-Vps39_C
VPS3_N
Vps39_1
Clathrin
Mtp
DUF2685
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8621123
NCBI-ProteinID:
XP_642561
dictyBase:
DDB_G0277663
UniProt:
Q54ZD6
LinkDB
All DBs
Position
2
Genome browser
AA seq
1068 aa
AA seq
DB search
MLNPFELIPIIKNAPCKIESIEIWQNNIYLGTNDGQILLYIIEKVENNKKITFKSRMENS
KSLGYGKKPVDKLLLIADIGKLLTLCDGNLDVFSMYNLDGPNTQNGISTNKGVITFCSKK
KSQEFKICVVTKRKLTLYEFIGVFDMYREIALPELALTVEWCKTSLCVGSRKEYAIVDAD
SGLYKSLLELDKNVPGPRTKLILDQEKFLLTTVDLSVLVDLQGDIVQGSIIWDSNPMSMS
YLEPYLITILHNRCINIHDMKNQKLIQELNNSSHNKGASSSSSVISFQQIFEGRGNGKDF
IVLYGSSPNSVYCLHVGNIDDLVHQLINRGEHEEAIRLFEIFFKRERAELEDGYDPNREK
QIHQARLCKVYELVAMSEFYRFKFSSAFKYLQLSKLDHRAIISFFPTYMPYQTNYRSPFD
QSDIFKSIKDSAISNAPNTIELKDVDSLIDDSKSQLTLYLEHYINNINSSSNALLSGSEE
FKDLTTVLLKLYSESNKISKLISLLAKCRVNGGNSVINNQFYIQDVEEWLNNKQLYKQLG
LVYQYTEKYRKALLLWNRLSLGELSDHFNCNGIEESIQLLECKQNQDILPEPNKELVWEF
TPFLIKITQEQQQQRNNNNNNNNKDNQDDGDDDDDDSIKQLPMKIFLKKRKDQFIIDDVI
EFLTPFGDYYFQIYLEYLIYQEENRVDYLHTKLATSYIEQIFKNCPELQSSQGRTDIPIA
NSDRQKLINLLELSNCYNASTLLHRVRNSLLYEELVILYLRIGQYEKMFNIIVWKLNNFK
KAEYICESFDPNFSLSITNVVSTQTTITPTSSNTPNSSSPTIMGTSPSTTNLRNSIRLSQ
QNINNINNNIQISSSPIQGFNLINNNNNLNNNNNNNNNDSNLPKSSLYDSKRQELFLCLL
RTYLNYKEQSLKSSVKNQLTNSLIKDSNGEPIIPRYIIEFLNHYYEEMDPIKVLALLPNS
IPINLLESYLSNSFNYSISQQRESKIVKNLQKSLNLSTKSEYMMVCSASVYIGPDRRCAV
CSKPISDRVFVYFPNGTIVHPKCFQIPFICPISARNFKMNPVEFPQSI
NT seq
3207 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaatccatttgaattaataccaataataaagaatgcaccatgcaaaattgaatcg
attgaaatttggcaaaataatatatatttaggtacaaatgatggtcaaattttattatat
atcattgaaaaagtagaaaataataaaaaaattacctttaaaagtagaatggaaaatagt
aaatcattaggatatggtaaaaaacctgttgataaattattattaattgcagatattggt
aaattattaactctttgtgatggtaatttagatgtttttagtatgtataatttagatgga
ccaaatactcaaaatggtatatcaacaaataaaggtgtaataacattttgttcaaagaaa
aagagtcaagaatttaagatatgtgttgttacaaaaaggaaattaacactttatgaattt
attggtgtatttgatatgtatagggagattgcattaccagagttagcattaacggttgaa
tggtgtaaaacaagtttatgtgttggaagtagaaaagagtatgcaatcgttgatgccgat
agtggactctataagagtctattggagttggataagaatgtaccgggtccacgtacaaag
ttaatattggatcaagagaaattcctattgacgacagtggacctatcggtgttggtggat
ttgcaaggtgacattgtccaagggtcaatcatttgggacagcaatccaatgtcgatgtcg
tacctggagccatacctcatcaccatactccacaaccggtgcataaacatacacgatatg
aaaaaccaaaaactcattcaagagttgaataatagttcgcataataaaggcgcatcgtcg
tcatcgtcagtgatatcattccaacagattttcgaaggacgtggtaatggcaaggatttc
atagttttgtatggcagttcacccaattccgtgtactgtttgcatgttgggaatatcgat
gatttagtacaccaattgattaataggggcgagcatgaggaggccataaggttgtttgaa
atatttttcaagagggagagggccgagctcgaggatgggtacgacccaaatagggagaaa
caaattcaccaagctagactttgcaaagtttatgaattggttgcaatgtcggaattctat
agatttaaattctcttcagcattcaagtatctccaattatcaaaattggatcaccgtgct
atcatatcattctttccaacttatatgccctatcaaactaactatcgttcaccatttgat
caatctgatattttcaaatccattaaagatagtgcaatttcaaatgcaccaaatacaatt
gaattaaaagatgtagattcattaattgatgattcaaaatcgcaattaactttatattta
gaacattatataaataatattaatagtagtagtaatgcattgttaagtggtagtgaagaa
tttaaagatttaacaacagttttattaaagctatattctgaatcaaataaaatttcaaaa
ttaatatcattattagcaaaatgtagagttaatggtggtaatagtgtaattaataatcaa
ttctatattcaagatgttgaagaatggttaaataataaacaactttataaacaattagga
ttggtttatcagtatactgaaaagtatagaaaagcattattactttggaatagattatca
ttgggtgaattatcagatcatttcaattgtaatggtattgaagaatcaattcaactttta
gaatgtaaacaaaatcaagatatattaccagaaccaaataaagaattggtttgggaattt
acaccatttttaattaaaattacacaagaacaacaacaacaacgaaataataataataat
aataataataaagacaaccaagatgatggtgatgatgatgatgatgattctataaaacaa
ttaccaatgaaaatatttttaaagaaaagaaaagatcaatttataattgatgatgttatt
gaatttttaacaccatttggtgattactattttcaaatctatttagaatatttaatttat
caagaagagaatagggttgattatttacatacaaagttagcaacttcatatattgaacaa
atctttaagaattgcccagaattacaatcttctcaaggtagaaccgatataccaattgca
aattctgatagacaaaaattgattaatctattggaattatcaaattgttataatgcttca
acattgttacatcgtgttcgtaatagtttactctatgaagaattggttatactttatctt
agaatcggtcaatatgaaaagatgtttaatattatagtttggaaattaaataattttaaa
aaagctgaatatatttgtgaatcttttgatccaaattttagtttatcaattacaaatgta
gttagtactcaaactacaataacaccaacatcttcaaatacaccaaattcatcatcacca
acaatcatgggtacttcaccatcaacaacaaatttaagaaattcaattagattatcacaa
caaaatataaataatataaataataatattcaaatatcttcatcaccaatacaaggtttt
aatttaattaataataataataatttaaataataataataataataataataatgattca
aatttaccaaaatcatcattatatgattcaaaaagacaagaattatttttatgtttatta
agaacttatttaaattataaagaacaaagtttaaagagtagtgtaaagaatcaattaaca
aattcacttataaaagattcaaatggtgagccgattataccacgttatatcattgaattt
ttaaatcattattatgaagaaatggatccaataaaggttttggcactattaccaaactct
ataccaattaatttattagagagttatctttcaaatagcttcaattattcaattagtcaa
caacgtgaatctaaaatcgttaaaaatttacaaaaatctttaaatctatcaactaaatcc
gaatatatgatggtttgttctgcttcggtttatattggtcccgatagacgttgtgccgtt
tgttcaaaaccaattagtgatcgtgttttcgtttactttccaaatggtacaatagttcat
ccaaaatgtttccaaataccttttatttgtccaatttctgcaagaaactttaaaatgaat
cctgttgaatttcctcaatcaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
