Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0277997
Help
Entry
DDB_G0277997 CDS
T00245
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K20473
neuroblastoma-amplified sequence
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
DDB_G0277997
Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
Retrieval pathways
NRZ (DSL1) complex
DDB_G0277997
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Nbas_N
TFIIA
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8621273
NCBI-ProteinID:
XP_642061
dictyBase:
DDB_G0277997
UniProt:
Q54YZ1
LinkDB
All DBs
Position
3:130346..140572
Genome browser
AA seq
3282 aa
AA seq
DB search
MEDTLNENNAILNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNSNNNNSNNNNSNN
NNNNNNNNNNNNNNENNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNESA
YDDKEIDEDTPLNKSLKQLSINSNSKQKNKKILYTLWFVDPEWIDTTQSDSQDDEERNKE
NNLSFKKFLFKRLINYSSILIKLPYSLPLTLYRNIGQTTRQSNFSPLHIHNQNQATSKLL
SSYDGSILASTQNTEITFRSSNDNFSTIQKTCNFFQNDKESQWQRLCFSPDNKLLAFSSS
GCKIYIFLIEKEQLLHMLSPGMFGLNPKDGIADLAIRHAKCNLDPDQKCYELLILGYDMI
LRRFHIPTLNNNFTIHPFISENEQLPNNYNQSNKNNNTNNHNENKGTVSNRTLKKDKNNN
IDDINSDNNDKNNNDNRKDKDDDDEEEEEEEEDDNDKSKKRFNSIGLGCSPSGLTIPNFK
SVHHSVGCMHFSPENNILAIGGNRKSSKKSSNRGPRVKAYVSFWKISDHEPYFTLLNVPT
TTTTTTTTTTSPSSSPSSGSHVLNTSSIGPGEEEIEENFENQTKAQKIWRKLKYTLFGNY
FKSVILHKVVFSIDGKQLISLDLNGTISLWKVPIEDDDDDDDDDKDKTNKKDPIILECLE
PPVTCNYKPIKIWTSKDLRSVWNNSEIPSFMQQQPYQGTSNNSNNNNNNNNSSNNNNSNR
GASSSSSNASSSTSTTTTTTTTTPASTNINQNIIENLKIVIDIAWWSDNQIIVGNKGGQF
TVFSMVDNQNCLLHDPELVSSAQPLIVTNAHNGRFFILETSYTSTDGTPIEYINGGGASG
AITNHGINGINGGISNHLHLLSYQSINELYKSKVKLPMVKTYRYLLRYFNGGDINDNDIN
DDDPFHFNIERDNNRNKRNNNNNMNNNMNNKDIILSRNKGSLKNDIHLIRRIIRFQSTTP
EQLFKTKVSQKEYGNALLIAEHYGLDKDLVHQKRWTRSMVSNESVKQYLSKVQDINWVLW
SCHIRIPLKLDSTRILLEFALDKTTQYFNNLFNCSDFNQQASSIISTNIDKLKENQNIIL
HRLILINYLNRLKTYQEIYQNDFDAFEFLRFRDCSLVSAAMEYASFEDVKAVFILLSNYS
DQILPYRLDILSMIPETAQPSSFKQLLPDELNIWNQKKQLIDQDWSQSKLIFENVLQLDW
SQRLNSTLLKKAINSLPSKEYEDIRSARDREYPYNTISIDNNNNTNNTNNNANNNSNNND
SNNDNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNYNTNNTNQNSSETNSGTSTENSGESSNNNN
NNTNNTNTGKPIIHEIDIYSIDYIEINQSNQFHFSFNHTTQQNLQQQQQQQQILGSNQNN
NLTTSTIVQEWYKKRASEIDRKSGQINNSLSLINIAIQEKHVSNLIETQRDLEELNSIVY
DESFFSGVGGGGGGGIANNNNISSSISNIVGKGIDNICEISLETYQSINPLDKIKLLLND
SNDRNIYQVIKSRCLKILKIYPYLLVDFFQNYSKENNDLSLVKSFLITYIKEKYKQYQQL
QSQSQSQSQSQSQEDINVTILDILKIGLNSIYNIQSNLNLKIINTMIDILEILPERGGWY
DSLTTNSSGGGSSSSSSSRNINSEIQILYDKKNQYNQLVSVMKILNKYQMEKPISYLVVK
KDNQDEIVSILTQIFKFAKKNNFKQSNWRLAFEDCLSIKRLLFSNTDDSQLYYLFVKNLL
SESLFFLANEYLPNCGTPDKIESLVLNAAKEFFNSSPSYGHTKNLEEARSCLELVRPPTR
KILAEINLIKAIDILYSSFNFNKLPVEVRLILENHHLKKQQQQKQQQQQQQIDQSSLKQQ
QISSKIEKGIESFNYDNYFKQGRFKLIQTVLNNCKDSYLNIETLLQISDLISDWNNIIDS
DHDNDDDDDDIIDDNEENVEEEEEEIKPNLVSDKIIVLLIVAKFSIHVKKDYKVSFKLCK
RLINEKENQQSNNNIPNSFNEIWKICSDLALCLDYSNVKAKLFLLSFSLLYCDSESVLVL
LKTFQQLQIYNNPKSIINNYDISFNNDNDQYNDQDNSYQDESEIINNLEEKRNSLKNNCE
IKLVPPFIESKESITKLFDQDYNNNNQDDISKIESIDQTLLYYYQQKQVILNNHCGISGG
SSSSSSSGSSNNIKEKIENVLLELSNISFQNGDMKASLSYLLNLNGKDNQIIISNFFNKL
IDSTKSSDSFQTSQERCTKLACYFYSLKLLLKYQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQSQK
EQSQQEQQSQQEQQKSTTTVSPLQLFSYSIETVISKAIQISSSKTSNVENNDDKNNNNND
DDENIESSLLLKYYNLMVDSIQEKELSEIDTYVDFNRFKQDSQYKIDTINSFAKSNQIKS
LETSISMAKRYGVTIYQVLLTHIEWNLLSSSSSSSSSSSNTGGCQFILSNDNINELKSSN
HLENTIETLNQLYNQIDGTSYDKLIYYLDLKNLIDSSNDIKSKKKLLSFLLKNQHQHLDT
TDNSDVSDDDNHDQIDFKLILKPTFDPINEKTKKQINPNNISFWSKLISILQEIRHDELI
HDLSLERIYYYMIQNLIEKDFQNSYSILLKYKKDLDHQDLDNLYISLLIGNYSSKLSIDN
RIKFIIIKLKELKEFYNNNEEEEEEEENDNDNDKNEHYQNELLFYQSIEEHLISVKQLNS
IKDLIGGIGFIQHYDNDISTKLLNYYNNHHQQQQKQQQNEEGIIIEPIKLIENEKEKSVE
SIIYKLIKSEGSCLPSTIKSIYNNFYPQASLTSTTSGGSGSKKVVSISNINPVNVKLINY
YTTCIKDILENQQVDNNQKSMINQIETICKLSIKDESLDDWDSSTLRSSILNQLREYNNY
HSIDTKVLVFEKLIQLQMYDESNSKQEKQKLQDSQFIKQHKTHSIIKDIWKDTGIDQSVF
NIEITDPLSSVPLFYKLLEFTNSIQFFLQLSKLLTLWNKVGSNNNNNNNSNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNYNNNNNKEDDDNDNNEKTEEELANVSILHECWFKLFEKIIKNLSGSGKDVI
NALVSIRMDQVSNFSMKLDEEHSLMNLLKSDQSKFPITTSWKFSLFSNFNSIKQLIINDI
KFEIKKLIKSEQSSSPSPSSKSEISTIVKDQQLLHLIYSFGAINHFLSTPLYKPLFDMLL
QFNLLNRNKIDPNSIYTSLQYSAAMLTIDKKFYQASLISLFWWRIDYQPIQTLDNSLIFL
EKFLVQSISLIDQQKLTINSNDWLICKDKLQSALNILLNNIN
NT seq
9849 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaggatacattaaatgaaaataatgctattttaaataataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataatagtaataataataatagtaataataataatagtaataac
aacaacaacaacaacaataataataataataataataataatgaaaacaacaataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataatgagagtgca
tacgacgataaagaaatagatgaagatacaccgttaaataaaagtttaaaacaattatca
ataaattcaaattcaaaacaaaagaataaaaagattttatataccctttggttcgtggat
ccagagtggattgatacaacacaatctgatagtcaagatgacgaagagagaaataaagag
aataatttatcttttaaaaaatttttatttaaaagattaataaattattcaagtatttta
attaaattaccatattcattaccacttacattatatcgtaatattggacaaacaacacgt
caaagtaatttctcaccattacatattcataatcaaaatcaagctacatcaaagttatta
tcaagttatgatggttcaatattagcatcaactcaaaatactgaaatcacatttagatct
tcaaatgataatttttcaacaattcaaaaaacttgtaatttctttcaaaatgataaagaa
agtcaatggcaaagattatgttttagtccagataataaattattagcattttcatcaagt
ggttgtaaaatttatatattcttaattgaaaaggaacaattattacatatgttatcacct
ggtatgtttggtttaaatccaaaggatggtattgctgatttagcaattcgtcatgcaaag
tgtaatttagatcctgatcaaaaatgttatgaattattaattttaggatatgatatgatt
ttaagaagattccatattccaacattaaataataattttacaattcatccattcattagc
gaaaatgaacaattaccaaataattataatcaatcaaataaaaataataatacaaataat
cataatgaaaataaaggtacagttagtaatagaactttaaaaaaagataaaaataataat
attgatgatataaatagtgataataatgataaaaataacaatgataatagaaaggataag
gatgatgatgatgaagaagaagaggaagaagaagaagatgataatgataaatccaaaaag
agatttaatagtattggtttaggttgttcaccaagtggtttaacaattccaaattttaaa
tctgttcatcattcagttggttgtatgcatttctcaccagagaataatattttagctatt
ggtggtaataggaaatcatcaaagaaatcatctaatagaggtccaagagttaaagcatat
gtttcattttggaaaatttctgatcatgaaccttatttcactttattaaatgtaccaact
acaacaacaacaacaacaactactacaacttcaccttcatcatcaccatcatcaggatca
catgtattaaatacatcatcaattggaccaggagaagaagagattgaagaaaattttgaa
aatcaaacaaaggcacaaaaaatttggagaaaattaaagtatacattatttggaaattat
tttaagtctgttatacttcataaagtggttttctcaattgatggtaaacaattgatttct
ttagatttaaatggtacaatatcattatggaaagtaccaattgaagatgatgatgatgat
gacgatgatgataaagataaaaccaataaaaaggatccaataattttagaatgtttagag
ccacctgtaacttgtaattataaaccaattaaaatttggacatcaaaagatttacgttca
gtttggaataattctgaaataccatcatttatgcaacaacaaccttatcaaggtacttca
aataacagtaataataataataataataataatagtagcaataataacaatagtaatagg
ggtgcatcatcatcatcttcaaatgcatcatcatcaacatcaacaacaacaacaacaaca
acaacaacaccagcatcaacaaatattaatcaaaatataattgaaaatttaaagattgta
attgatatagcatggtggtctgataatcaaattatagttggtaataaaggtggacaattt
acagtattttcaatggttgataatcaaaattgtttattacatgatccagagttagtatca
tcagcacaaccattaattgttacaaatgcacataatggtagattttttatattggaaact
tcttatacttcaaccgatggtactccaattgaatatattaatggtggtggtgctagtggt
gctattactaatcatggtataaatggtattaatggtggtatttctaatcatctacatcta
ctatcatatcaatcaatcaatgaattatataaaagtaaagttaaattaccaatggttaaa
acttatagatatctattacgttattttaatggtggtgatattaatgataatgatataaat
gatgatgatccatttcattttaatattgaaagagataataatagaaataaaagaaataat
aataataatatgaataataatatgaataataaagatattatattatcaagaaataaaggt
agtttaaagaatgatattcatttaatacgtagaattataagatttcaatcaacaacacca
gaacaattatttaaaactaaagtttcacaaaaagagtatggtaatgcattgttaattgca
gaacattatggattagataaagatttagtacatcaaaagagatggacaagatcaatggta
tcaaatgaatctgttaagcaatatctttcaaaggtacaagatatcaattgggtattatgg
tcatgtcatattagaataccattgaaattagattcaactagaattctattagaatttgca
ttagataaaacaactcaatattttaataatctatttaattgttcagattttaatcagcaa
gcatcatcaatcatttcaacaaatatagataaattaaaagagaatcaaaatataatttta
catagattaattttaataaattatttaaatagattgaaaacctatcaagaaatttatcaa
aatgatttcgatgcttttgaattcttaagatttagagattgttcattggtttcagcagct
atggaatatgcaagttttgaagatgtaaaagcggttttcattttattatcaaattattcc
gatcaaattttaccctatagattagatattctatcaatgatacctgaaactgctcaacca
tcatcttttaaacaattattacctgatgaattaaatatttggaatcaaaagaaacaattg
attgatcaagattggtcacaatcaaaattaatctttgaaaatgtattacaattagattgg
tcacaacgtttaaattcaactttattaaaaaaagctatcaattctttaccttcaaaagaa
tatgaagatattagatctgctagagatagagaatatccttataatactattagtattgat
aataataataatacaaataatacaaataataatgcaaataataattcaaataataatgac
agtaataatgataataacaataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataataataataattataatacaaataatacaaatcaaaatagt
agtgaaactaatagtggtacatcaactgaaaatagtggtgagagtagtaataataataat
aataacacaaataatacaaatacaggtaaaccaattatacatgaaattgatatttattca
attgattatatagaaatcaatcaatcaaatcaattccatttttcatttaatcatacaact
caacaaaatctacaacaacaacaacaacaacaacaaatacttggtagtaatcaaaataat
aatttaacaacatcaacaattgttcaagaatggtataaaaagagagcaagtgaaattgat
agaaaatcaggtcaaattaataattcattaagtttaattaatattgcaattcaagagaaa
catgtttcaaatttaattgaaactcaaagagatttagaagaattaaattcaatcgtttat
gatgaatcattcttttcaggtgttggtggtggtggtggtggtggtattgctaataataat
aatatttcaagtagtattagtaatatcgttggtaaaggtattgataacatttgtgaaata
tcattggaaacttatcaatcaataaatccattagataaaattaaattattattaaatgat
tcaaatgatagaaatatttatcaagtaattaaatcaagatgtttaaaaattttaaaaatt
tatccatacttattagttgatttctttcaaaattattcaaaagaaaataatgatttatca
ttagttaaatcatttttaattacttatataaaagagaaatataaacaatatcaacaatta
caatcacaatcacaatcacaatcacaatcacaatcacaagaagatattaatgttacaatt
ttagatatattaaaaattggattaaatagtatttataatattcaatcaaatttaaattta
aaaattataaatacaatgattgatattttagagatattaccagaaagaggtggttggtat
gattctttaactactaatagtagtggtggtggtagtagtagtagtagtagtagtagaaat
attaatagtgaaattcaaattttatatgataaaaagaatcaatataatcaattagtatca
gttatgaaaattttaaataaatatcaaatggagaaaccaatctcttatttagttgttaaa
aaggataatcaagatgaaatagtttcaattttaacacaaatatttaaatttgcaaaaaag
aataatttcaaacaatcaaattggagattagcatttgaagattgtctttcaataaagaga
ttactattttcaaatactgatgattcccaactttattaccttttcgtaaagaatctttta
tcggaatcattattctttttagcaaatgaatatttaccaaattgtggtacacctgataaa
attgaatcattggttttgaatgctgcaaaagagtttttcaattcatctccttcctatggt
catactaaaaatttagaagaagctagaagttgtttagaattagttagaccaccaactaga
aaaatcttagctgaaattaatttaattaaagcaatcgatattttatattcatcttttaat
tttaataaattacctgttgaagttagattaattttagaaaatcatcatttaaagaaacaa
caacaacaaaaacaacaacaacaacaacaacaaattgatcaatcatctttaaaacaacaa
caaatttcgtctaaaatagaaaaaggaattgaatcatttaattatgataattattttaaa
caaggtagatttaaattaattcaaacagttttaaataattgtaaagatagttatttaaat
attgaaacattattacaaatatcagatttaatatcagattggaataatataatcgatagt
gatcatgataatgatgatgatgatgatgatattattgatgataatgaagagaatgtagaa
gaagaagaagaagaaattaaaccaaatttagtatcagataaaatcattgtattattaatt
gttgcgaaattttcaattcatgttaaaaaggattataaagtttcatttaaattatgtaaa
agattaattaatgaaaaagagaatcaacaatcaaacaataatataccaaattcattcaat
gaaatttggaagatttgttctgatcttgcactatgtttggactattcaaatgttaaagct
aaattattcttattatctttctctttactttattgtgattctgaaagtgttttagtatta
ttaaaaacttttcaacaattacaaatttataataatccaaaatcaatcattaataattat
gatattagttttaataatgataatgatcaatacaatgatcaagacaatagttatcaagat
gaatctgaaatcattaataatttagaagaaaagagaaattctttaaaaaataattgtgaa
attaaattagttccaccatttattgaatcaaaagaatcaattacaaaattatttgatcaa
gattataataataataatcaagatgacattagtaaaattgaatcaattgatcaaacttta
ttatattattatcaacaaaaacaagtaattttaaataatcattgtggtattagtggtggt
agtagtagtagtagtagcagtggtagtagtaataacatcaaagaaaagattgaaaatgtt
ttattagaattatcaaatatttcattccaaaatggtgatatgaaagcaagtttatcatat
ttattaaatttaaatggtaaagataatcaaattattatttcaaactttttcaataaatta
attgattcaactaaatcaagtgattctttccaaacaagtcaagaaagatgtacaaaatta
gcttgttatttctattctttgaaattattattaaaatatcaacaacaacaacaacaacaa
caacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaatcacaaaaa
gaacaatctcaacaagaacaacaatctcaacaagaacaacaaaaatctacaacaacagtc
tcaccacttcaattattttcatattcaattgaaactgtaatttcaaaagctattcaaatt
tcatcatcaaaaacatcaaatgttgaaaataatgatgataaaaataataataataatgat
gatgatgaaaatattgaatcatcattattattaaaatattataatttaatggttgattca
attcaagagaaagaattatcagagattgatacctatgttgatttcaatagatttaaacaa
gattctcaatataaaattgatacaattaatagttttgcaaaatcaaatcaaattaaatca
ttggaaacctcaatttcaatggcaaaaagatatggtgtcacaatttatcaagtattatta
actcatattgaatggaatcttttatcatcatcgtcatcatcatcatcatcatcttctaac
actggtggttgtcaatttatactatcaaatgataatatcaatgaattgaaatcatctaat
catttagagaatacaattgaaactttaaatcaattatataatcaaatcgatggtacaagt
tatgataaattaatttattatttagatttaaagaatttaattgattcaagtaatgatatt
aaaagtaaaaagaaattattatcattcctattaaagaatcaacatcaacatctagatact
actgataatagtgatgttagtgatgatgacaatcatgatcaaattgattttaaattaata
ttaaaaccaacttttgacccaatcaatgaaaaaactaaaaaacaaattaatccaaataat
atctcattttggtcaaaattaattagtattcttcaagagattagacatgatgaattaatt
catgatttatcattagaaagaatttattattatatgattcagaatttaattgaaaaagat
tttcaaaattcttattcaatattattaaagtataaaaaggatttagatcatcaagattta
gataatttatatatctctttattaattggtaattattcttcaaaattatcaatcgataat
agaattaaatttataattattaaattaaaagagttaaaagaattttataataataatgaa
gaagaagaagaagaagaagaaaatgataatgataatgataaaaatgaacattatcaaaat
gaattattattttatcaatcaattgaagaacatttaattagtgtaaaacaattaaattct
ataaaagatttaattggtggtattggtttcattcaacattatgataatgatatatcaaca
aaattattaaattattataataatcatcatcaacaacaacaaaaacaacaacaaaatgaa
gaaggtattattattgaaccaattaaattaattgaaaatgaaaaagaaaagagtgtagaa
tcaataatttataaattaattaaatctgaaggtagttgtttaccatcaacaattaaatca
atttataataatttctatccacaagcctctttaacttctactactagtggtggtagtggt
agtaaaaaagttgtttcaatttcaaatattaatcctgtaaatgttaaattaattaattat
tatacaacttgtataaaagatattttagaaaatcaacaagttgataataatcaaaagtca
atgattaatcaaattgaaaccatttgtaaactatcaattaaagatgaatcattagatgat
tgggatagtagtacattaagatcttcaattttaaatcaacttagagaatataataattat
cactcaattgataccaaagttttagtatttgaaaaactaattcaattacaaatgtatgat
gaatcgaattcaaaacaagagaaacaaaaattacaagattctcaatttattaaacaacat
aaaactcattcaatcattaaagatatttggaaagataccggtattgatcaatccgtattt
aacattgaaatcactgatccattatcaagtgtacctttattctacaaacttttagaattt
actaattcaatacaattctttttacaattatcaaaattattaactttatggaataaagtt
ggtagtaataataataataataataatagtaataataataataataataataataataat
aataataataataataataataataattataataataataataataaagaagatgatgat
aatgataataatgaaaaaactgaagaagaattagcaaatgtatcaattttacatgaatgt
tggtttaaattatttgaaaagataataaagaatctctctggatctggaaaagatgtaatt
aatgctttagtttcaattcgtatggatcaagtttcaaacttttcaatgaaattagatgaa
gaacattctttaatgaatttattgaaatctgatcaatctaaattcccaattacaacgagt
tggaaattttcattattttcaaattttaactctattaaacaattgataattaatgatatt
aaatttgaaattaagaaattgataaaatctgaacaatcatcatcgccatcgccatcatcc
aaatcagaaatctcaacaatagtaaaagatcaacaattattacatttaatttattcattt
ggtgcaattaatcatttcttatcaactccactttataaacctttgtttgatatgttatta
caattcaatttacttaatagaaataagattgatccaaactcaatctatactagtcttcaa
tattctgctgcaatgttaacaattgataaaaagttttatcaagcatctctaattagttta
ttctggtggagaattgattaccaaccaattcaaaccttggataattctttaatcttttta
gaaaaatttttagttcaatcaatttctctaattgatcaacaaaaactaacaatcaattct
aatgattggttaatttgtaaagataaacttcaatcagctttaaatattcttttaaataat
attaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
