KEGG   Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0278435
Entry
DDB_G0278435      CDS       T00245                                 
Name
(RefSeq) AAA ATPase domain-containing protein
  KO
K14575  AAA family ATPase
Organism
ddi  Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi03008  Ribosome biogenesis in eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ddi00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
    DDB_G0278435
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis [BR:ddi03009]
    DDB_G0278435
Ribosome biogenesis [BR:ddi03009]
 Eukaryotic type
  Pre-60S particles
   Export and cytoplasmic maturation factors
    DDB_G0278435
SSDB
Motif
Pfam: AAA AAA_lid_3 RuvB_N AAA_5 AAA_14 AAA_16 AAA_22 TIP49 RNA_helicase AAA_2 AAA_28 Mg_chelatase CDC48_N IstB_IS21 AAA_18 nSTAND3 ABC_tran AAA_7 AAA_33 AAA_24 Zot
Other DBs
NCBI-GeneID: 8621569
NCBI-ProteinID: XP_642364
dictyBase: DDB_G0278435
UniProt: Q54Y38
LinkDB
Position
3:complement(877848..880508)
AA seq 886 aa
MSLIKLLVEDQPYKQIKKTSVGYISIRCMQNNEITIGDIIYIVPVNNNNNNNNNNNNNNN
NNKENNNNNNSEIPWNYFNCNNKDINSSGSNCSIMTAWPLQKLSTQHIQLDSIQRENCNV
KIGDYVYLFKTPFQSVNTVSNNLLISNIYPKLDCRYLEIQCETISQQQYVQSLQSFGMLE
TLILSQIIGRYFIPQNSFTIHLSNNIIKFKILKLSINKIENNSSNNNSNNNDDCDINSLD
FNKLSLKEKKDNIDNEFIKSIFRICESTKIKLINSNLQSTLICESTINSNNNNNNNSNNK
IDNNKNINLNFQSIGGLDLQVKQIRELIDLSFYKLDLLKSFGVKPPKGILLYGPPGTGKT
LLARIVATQTNATLFTINGADILDKFYGMTEKTLQKIFKDAAQKSPSIIFIDELDALCPK
REDNSSEVEKRIVGSLLTLMDGVVSTSDQNDGGGGDNGNGNGNCGGDKVIVIGCTNRPDS
IDSALRRPGRFDNEIEISIPNQQGREQILNIFLSKIPNQLTSQEIAMIASKTHGFVGADI
ESLCKEASLKCFNRIKNENQKLFQSINIEKEEKGKEEKQEENLQNLLSLIKLSMNDMLLA
LNQVKPSSMREVVVEIPKVFWGDIGGQEHIKQKLKEAIEWPLKYPQSFIRMGIKPPKGIL
LYGPPGCSKTLLAKALATESGLNFIAVKGPELLSKWVGESERAVRDIFKKARQNSPSILF
FDEIDGLAISRSGEGSGAVERVVSQLLTEMDGIQPLTNVTIIGATNRPDIIDKAILRAGR
IDRILYISPPDLDARKEIFNIHLKKVPHSSDIDINQLSILTDGYSGAEVTSICREASIAA
MKEDINAKEINMSHFISAIGNVKKGITQEMLDFYKDYQENSNLQVL
NT seq 2661 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcgttaattaaactattggttgaagatcaaccgtataaacaaattaaaaaaacgtca
gttgggtatataagtattaggtgtatgcaaaataatgaaattacaataggtgatataatt
tacatagttccagtaaacaataataataataataataataataataataataataataat
aataataaagaaaacaataataataataattcagaaataccatggaattattttaattgt
aataataaagatataaatagtagtggtagtaactgttcaataatgacagcatggccatta
caaaaactatcaacacaacatattcaattagattcaattcaaagagagaattgtaatgtt
aaaattggtgactatgtttatttatttaaaacaccatttcaatctgtaaataccgtatca
aacaatcttttaatttcaaatatatatccgaaattagattgtagatatttagaaattcaa
tgtgaaacaatatcacaacaacaatatgtacaatcacttcaatcatttggtatgcttgaa
actttaattttatcacaaatcattggtagatatttcattcctcaaaattcctttacaatt
catctaagcaataatattataaaatttaaaattttaaaattatcaattaataaaattgaa
aataatagtagtaataataatagcaataataatgatgattgtgatataaatagtttagat
ttcaataaattaagtttaaaagaaaaaaaagataatattgataatgaatttattaaatca
atttttagaatttgtgaatcaacaaaaataaaattaattaattcaaatttacaatcaact
ttaatttgtgaatccacaataaatagtaataataataataataataatagtaataataaa
attgataataataaaaatataaatttaaattttcaatcaattggtggtttggatttacaa
gttaaacaaattagagaattaattgatctatcattttataaattagatttattaaaatca
tttggagttaaaccaccaaaaggtattttattatatggtccaccaggtacaggtaaaaca
ttattggcaagaattgttgcaactcaaaccaatgcaacattatttacaatcaatggtgct
gatatccttgacaaattctatggtatgactgaaaaaactttacaaaaaatatttaaagat
gctgcacaaaaatcaccttcaatcattttcattgatgaattggatgcattatgcccaaaa
cgtgaagataatagttcagaagttgaaaaacgtatagttggtagtttattaacattaatg
gatggtgttgtatcaacaagtgatcaaaatgatggtggtggtggtgataatggtaatggt
aatggtaattgtggtggtgataaagttatagtaatcggttgcactaatagacctgatagt
attgattcagcattaagaagacctggaagatttgataatgaaattgaaatatcaattcca
aatcaacaaggtagagaacaaattttaaatattttcctttcaaaaattccaaatcaatta
acatcacaagagatagcaatgattgcctcaaaaacacatggtttcgttggtgctgatatt
gaatcgctttgtaaagaagcatcattaaaatgttttaatcgtattaaaaatgaaaatcaa
aaattatttcaatcaattaatattgaaaaagaagaaaaaggaaaagaagaaaaacaagaa
gaaaatcttcaaaatttattatcattaattaaattatcaatgaatgatatgttattggca
ttgaatcaagttaaaccatcatcaatgagagaagttgtagttgaaatacctaaagtattt
tggggagatattggtggacaagagcatattaagcaaaagttaaaagaagccattgaatgg
ccattaaaatatccacaatcatttattcgtatgggtatcaaaccacccaaaggtattcta
ttatatggtccaccaggttgtagtaaaactttattagccaaagctttagcaactgaatct
ggtttaaatttcattgcagtaaaaggacctgaacttttaagtaaatgggttggtgaatct
gaaagagcagtacgtgatatcttcaaaaaagcacgccaaaactcaccatccattctattt
ttcgatgaaatcgatggcttggccatcagtagaagtggtgaaggtagtggtgccgttgaa
cgtgtggtatctcaacttttaaccgaaatggatggtatccaacctttgacaaatgtaact
atcattggtgccaccaatagacctgatatcatcgataaagctatattacgtgccggtaga
atagatagaattctctatatttcaccaccagatttagatgcaagaaaagaaatattcaat
attcatttaaaaaaggttcctcactcttcagacattgacattaatcaactttcaattcta
accgatggttacagtggtgctgaagtaacttcaatttgtcgtgaggcatcaattgctgca
atgaaagaagatattaatgcaaaagaaattaatatgtctcatttcatctctgcaattggt
aatgttaaaaaaggtatcacccaagaaatgttagatttttacaaagattatcaggaaaat
tcaaacttacaagttttgtaa

DBGET integrated database retrieval system