Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0278761
Help
Entry
DDB_G0278761 CDS
T00245
Name
(RefSeq) NF-X1-type zinc finger-containing protein
KO
K27391
NFX1-type zinc finger-containing protein 1
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_12
AAA_11
ZnF_RZ-type
AAA_19
AAA_30
SAM_1
SAM_2
DEAD
AAA_16
Spo12
New_glue
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8621679
NCBI-ProteinID:
XP_641923
dictyBase:
DDB_G0278761
UniProt:
Q54XT3
LinkDB
All DBs
Position
3:1131314..1136948
Genome browser
AA seq
1793 aa
AA seq
DB search
MDQLAHLKISSSGGGDDEINKNNNNKQKPTTTTTTTTTTTTTSSTPKTTPSRDNNRNNNR
NNRNNNNNNNNNNNNNTNNRNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNKFNNNRYNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNRFNNNNNNNRFNNNRVNIEEWKNDKVIEWLEKNEFNQYVEKFKEEQI
DGNTLIEFSSMNQSDKIFERLGFIHIGPKINFQRKLKELVLSSQPQKQQQRQSNNNQNNN
NQNNKHIVDYSDAIHHINNKQDKDNKKKSEFEPFKTAHEMENYLKKKIVQADSDEDIVEL
LNHQIINLKDIIGRDFLQFSVQDLLVRIYTHEKFQGGILEQFFNKLIFELISSKFFSSIY
NFPQYIQEIGSLPQFKASIDLMDLVSSKFNDSITILPVELFEIRFNELNADTNQSRLSNQ
TLKTVEHIKGLIKVLKQKKQLSKLNTIQQLTQPIFNIDEISYKNLPIAPTRDEIHSKVLP
KLKPLKIGTYSSSEEYIDTQFNLLREDMIHPIREALTLIQNGSSSPYYYTDVIFKGFTKT
QTSLSFLIEFKYRSKIKWEKFSKLLNGSLLVLSCDNFTNILVATVEKRPDRGEEKQISIS
FYGDNQENQMDLMYLFENSFSMIESPTYFESVKNVLSSLQRINSDDLPFQSYLLKCSGQE
IIPKYFQDHPVINLQTTFDNTERINIRTSEFPERLGTLDPSQIEAFEHCLKSELSLVQGP
PGTGKSYIGVKLFEVIHRHLKENSAKNAPILVLCYTNHALDQFLDHIITNVTKKVIRVGS
RSRDERMKDYNIRNFIRAEKRQFEYYRQRDDVVAILKEYLDTFSNELSYEDFLKFAGNDY
NKGQDDDDGDDDDDDDDDNGGDIKCSNMNFNRWGQWIKSIKKKIKEDLTLLKVPKSLKPS
INEIENEDDEDDEDLVETLLNERRFDYGNISGGSGITAHDISEYDIQSIVTMTRLEKRDY
KDIQDIFDIKENDRIYYYRYLLNKKIRHSLKTIQDYAKQYKELSDTILDYENKAYIRALS
SVNVVAATITGASRLKRVFDSINSKCVIIEEAAEVLEGHIVSVLPKTIEHLVLIGDHEQL
KPSCAVYQLAEKFQLNVSLFERIMKNGGAHRQLSIQRRMVPNISQFIHPIYPNLRNHPEV
LIRFATESTIKGIQKNIFFLEHTIPESSPTESTSKSNLFEADYVVGLADYLLKQEYKPTD
IVILTPYTGQLLKIKNQIRNRKHELLSKVQVRTVDQYQGEECNIVILSLVRSNERGDSGF
VKIKNRINVAISRARNAMYLVGNSDLLRKANPIWENMFKILSEPSVNAIGPILKLRCENH
KDQITNITSGKDFANVPQGGCLLNCSTRLECGHQCGLACHIFDQDHINIKCTKPCEHIHQ
KCGHTCKKTCSDDCGLCEVLVDRDLPCGHKKKLACNIDPLQYKCQEPCQKQRRCGHKCEL
KCSEYCEKNNCKEKVEKKLQCGHIETKECYNNSNVCNAKCKDILPCGDPCSQKCKDHKTA
QFGIRSHPPCSKKECTRELFCGHRCNSQHACSSGSCGDCKKKCLNACTHSVCNTGCSKLC
NPCREKCKRGCIHVGKCKNLCKEQCSIKNCDQRCTKKLPCKHQCIGLCGEKCVSICRICN
PDYLEPITRMKLSEFDENDCFIELHKGHVFLVDNLDTFMNIKDESGKIVHKKCPSCNMII
SAKDAPRYKDIINKTWNQIDSIKRKLMERVTKEETDMVVKAMGGAAGHWFVCENKHTYYI
GECGGAMQIGNCIECKAKVGGTNHSLLPNNKHSDIDGSNNPLYRPFIQPPEFD
NT seq
5382 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatcaattagctcacttaaaaatttcatcatctggtggtggagatgatgaaataaat
aaaaacaacaataataaacaaaaaccaaccaccaccaccaccacaactacaacaactact
accacttcatcaacaccaaaaacaacaccatccagagataataatagaaataataataga
aataatagaaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacactaataataga
aacaacaacaacaacaacaacaacaacactaataataataataataataacaataataat
aataataataaatttaataataatagatataataataataataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataacaatagatttaataataataacaat
aataatagatttaataataatagagttaatattgaagaatggaaaaatgataaagtaata
gaatggttagaaaagaatgaatttaatcaatatgttgaaaagtttaaagaagaacaaatt
gatggtaatacactaatagaatttagttcaatgaatcaaagtgataaaatatttgaaaga
cttggtttcattcatataggtccaaaaattaattttcaaagaaaattaaaagaattggtt
ttatcttcacaaccacaaaaacaacaacaacgtcaatcaaataataatcaaaataataat
aatcaaaataataaacatattgttgattatagtgatgcaattcatcatattaataataaa
caagataaagataataaaaagaaatcagaatttgaaccatttaaaactgctcatgaaatg
gagaattatttaaaaaagaaaatcgttcaagcagattctgatgaagatattgttgaatta
ttaaatcatcaaattattaatcttaaagatatcattggtagagatttcttacaattctct
gtacaagatttactggtgagaatttatacacatgaaaaatttcaaggtggaattttggaa
cagtttttcaataaattaattttcgaattaatatcatctaaattcttttcatcaatttat
aactttccacagtacattcaagagattggtagtttgccacaatttaaagcatcgattgat
ttaatggatttggtctcctctaaattcaatgatagtattacaattttaccagttgaattg
tttgaaattagattcaatgaattgaatgctgacaccaatcaaagtagactatccaatcaa
acacttaaaacagttgaacatattaaaggtttaattaaagttttaaaacaaaagaaacaa
ttatcaaaacttaatacaattcaacaattaacacaaccaattttcaatattgatgaaatt
agttataagaatttaccaatagcaccaactcgtgatgaaattcattcaaaggtattacca
aaattaaaaccacttaaaattggtacctattcatcatctgaagaatatattgatacacaa
tttaatctattaagagaagatatgattcatccgattagagaagctttaacacttattcaa
aatggttcttcatcaccttattattatactgatgtaatttttaaaggatttacaaaaact
caaacatcattaagttttttaattgaatttaaatatagaagtaaaattaaatgggagaaa
ttttcaaaattattaaatggatcattgttagtattatcatgtgataattttacaaatatt
ttagttgcaaccgttgaaaaaagaccagatagaggtgaagaaaaacaaatttcaatttca
ttttatggtgataatcaagagaatcaaatggatttaatgtatttatttgaaaattcattc
tcaatgattgaatcaccaacttatttcgaatctgtaaagaatgtattatcatcattacaa
agaattaattccgatgatttaccatttcaatcatatcttttgaaatgttcaggtcaagag
attattccaaagtatttccaagatcatccagttattaatttacaaactacatttgataat
actgaacgtatcaatattagaacatcggaatttccagagagattgggtacattggatcca
agtcaaatcgaagcatttgaacattgtttgaaatcagagttatctttagttcaaggtcca
ccaggtactggtaaatcttatattggtgtgaaattattcgaagtgattcatagacattta
aaagagaattcagcaaagaatgctccaatattggttttatgttataccaaccatgccttg
gatcaatttttggatcatatcattacaaacgttacaaagaaagtaattagagtcggttca
agatctcgtgatgaaagaatgaaagattataatattcgtaatttcattcgtgctgaaaaa
agacagtttgaatactatagacaaagagatgatgtagttgcaatacttaaagagtattta
gatactttttcaaatgaattatcatatgaagattttttaaaatttgctggaaatgattat
aataaaggtcaagatgatgatgatggcgatgatgatgatgatgatgatgatgacaatggt
ggtgatataaaatgctcaaatatgaattttaatagatggggtcaatggataaaatcaata
aagaaaaagattaaagaagatttaactttattaaaagtaccgaaatcattaaaaccttca
attaatgaaattgaaaatgaagatgacgaagatgatgaagatttagttgaaaccttatta
aatgaaagaagatttgattatggtaatatttcaggtggtagtggtattactgctcatgat
atttcagaatatgatattcaaagtattgttacaatgacaagattagagaaaagagattat
aaagatattcaagacattttcgatattaaagaaaatgatagaatttattattatcgttat
cttttaaataaaaagattagacattcattgaaaaccattcaagattatgcaaagcaatat
aaagagctatctgatacaatcttggattatgaaaataaagcctacattagagcattatca
tcagttaatgttgttgctgctacaattacaggtgcatctcgtttgaagagagttttcgat
tcaatcaattcaaaatgtgtaatcattgaagaggcagctgaagtattggaaggtcatata
gtttcagtattaccaaaaactattgagcatttagtattgataggtgatcatgaacaattg
aaaccatcatgtgcagtctatcaattggcagagaaattccaattgaatgtttcattattt
gaaagaatcatgaagaatggtggtgcacatagacaattatcaattcaacgtcgtatggta
ccaaatatttcacaattcattcatccaatctatccaaatcttagaaatcatccagaggtt
ttaataagattcgcaactgaatcaaccattaaaggtattcaaaagaatatctttttcttg
gaacatacaataccagaatcatcaccaactgaatcaactagtaaatcaaatcttttcgaa
gctgattatgtggttggtttagctgattatctattgaaacaagaatataaaccaactgat
attgtcatattgacaccatacactggtcaactattaaagattaaaaatcaaattagaaat
agaaaacatgaactactctcaaaagtacaagtacgtacagtggatcaatatcaaggtgaa
gaatgtaatatagtcatattaagtttagttcgttcaaatgaacgtggtgatagtggtttc
gttaaaattaagaatcgtatcaatgttgccatttctcgtgctagaaatgcaatgtatttg
gttggtaatagtgatctattgagaaaagcaaatccaatttgggaaaatatgtttaaaatt
ctatctgaaccatccgttaatgccattggtccaatcttaaagcttagatgtgaaaatcat
aaagatcaaatcacaaatatcacctctggaaaagattttgcaaatgtaccacaaggtggt
tgtcttttaaattgttcaactcgtttggaatgtggtcatcaatgtggtttagcttgtcat
atctttgatcaagatcatatcaacattaaatgtacaaaaccatgtgaacacattcatcaa
aagtgtggtcatacatgtaagaaaacctgttccgatgattgtggtctatgtgaagtattg
gttgatcgtgatctcccatgtggtcataaaaagaaattggcttgtaacattgatccactt
caatataaatgtcaagaaccatgtcaaaaacaaagaagatgtggtcataaatgtgaactc
aaatgttcagaatattgtgaaaagaataattgtaaagagaaagttgaaaaaaaacttcaa
tgtggtcatatcgaaacaaaagaatgttataacaatagtaacgtttgtaatgccaaatgc
aaagatatcttaccatgtggtgatccttgctctcaaaaatgcaaagatcataaaacagct
caatttggaattcgtagtcatccaccttgctcaaagaaagaatgtacaagagaattgttc
tgtggtcatagatgtaatagtcaacatgcatgtagttcaggttcttgtggtgattgtaaa
aagaaatgtctaaatgcttgcactcattcagtttgtaatacaggttgttcaaaactttgt
aacccatgtagagagaaatgtaaacgtggttgtattcatgttggtaaatgtaaaaacctt
tgtaaagaacaatgttccatcaagaattgtgatcaaagatgtacaaaaaaattaccatgc
aaacatcaatgtattggtttatgtggtgaaaaatgtgtttcaatttgtagaatatgtaat
ccagattatttagaaccaatcactcgtatgaagttaagtgaattcgatgaaaatgattgt
ttcattgaacttcataaaggccatgtcttcctcgttgacaacttggatacctttatgaat
attaaagatgaaagtggtaagatagttcataaaaagtgtccatcatgtaatatgatcatc
tctgctaaagatgctccaagatataaagatatcattaacaaaacttggaatcaaatagat
tcaattaaaagaaaattaatggaacgtgtaacaaaagaagaaactgatatggttgtaaaa
gcaatgggtggtgctgctggacattggttcgtttgtgaaaataaacatacatattatatt
ggtgaatgtggaggagcaatgcaaataggaaactgtattgagtgtaaagctaaagttgga
ggcaccaatcattcactattaccaaataataaacattctgacattgatggttcaaataat
cctttgtatagaccattcattcaaccaccagaatttgattag
DBGET
integrated database retrieval system
