Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0279099
Help
Entry
DDB_G0279099 CDS
T00245
Name
(RefSeq) DEP domain containing protein
KO
K20404
SEA/GATOR complex protein SEA1/DEPDC5
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
DDB_G0279099
Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
Autophagy
Other autophagy associated proteins
SEACIT/GATOR1 complex
DDB_G0279099
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
IML1
DEP
DEPDC5_CTD
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8621871
NCBI-ProteinID:
XP_641865
dictyBase:
DDB_G0279099
UniProt:
Q54XA2
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(1626037..1632840)
Genome browser
AA seq
2242 aa
AA seq
DB search
MNNNNKKGVYILWVHDQQFSKEELVVNPEYFPKLKIMDVLKIYSPSNPSKRLCLRVKQLS
PLKTKLQISISKYVAGVFDFALRKEVVVNIIPEKQAIIDFVELSFKDQYIGRSDMWRLKL
NLQNECVYVLKKLAFAQIRAQVEEMVSNGQKVSSGLIDDSTKFVFRSRSAKFVLFIQMSK
EMWDYSPDGELYFEKAVNGFLKNLFQRWKSLSVNHTITIILFSRTFHENDDILDEIPNIP
RNPQGKLYQDFYKVVVNEETRPDWSSIIVNLKREFNDYHTSVNWDIYGRNSALGKNSTAS
QGNFLEAINLGMSYFDKHYIDRDFTRTGQMIVVISAGTGIFEVDPDINLITKQRMIDNGI
GCDLICLNNHPLHVVPLFKFTISNQNKSQNTIQNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNSNNNKNNQNNGKAISNIGRNNNNSNSGSSGNSNNSSGGQLYNFPYWLAIS
FYDENNTTTTTTDVTTNDKRNGLFVPQFKIPEKVNSFYYEDDEKPVYDFYIPKDPRNLPA
FATPKINHKYTSNSLGVNSYEDTIFNMPNGGGILDDSNALGGNNNNNYNNNNGNGNGHNH
NNHNNNNNNNNNNDHGGHSDTEPSDFSDTEDNSSTTPNSQYSRVAIGLNDKKRATFQIGG
TRSSSSFENQRTIINSTTSNNNNNNSNNVVNKRYTSTQHQPILRNGGTINNNNNNQQNHP
ISPSNSFDQKTIPYHNQLLSTIPPQLFGKKKKEINPFTYDSTPFHLTSNRRRWSHLWFSP
NTYIFGKTNTNPNPFLPNWKSLCEPASLPITTDYFPSTKDLKAKYREYVHNLTLPDDNEY
TNSFEALLKELISQRLAQGYQLIMITNSEIDPTTTTTTGGTTTPATTTPATTTPATTATS
TTPTTIITPTTNPSTATSAIATPSMATPSSSTTTTTTTANLSTSPPNSSNTVPNSGGSGK
GTKKSYQLSLGHDFHSITYDPSNLSIQVKRYQRYNGRNSSGSKKLRYHYFLNTIHLQGFL
HNSIELQHTASSEYPWNSLDNLICGQLAMSGFGPRIKYWRVLYAIIPTVENNQHQQQLQL
EQQEKEKEKARLAALEKKKPFPREDSFSTLILPTNSSSSSSSSSSLPSTVSTTNTNTNNN
NNNNNNNNNNNINTTVPTNVPTTTTTDDSTVKNTSTTTATTATEDHGLNTAFNSSSIPIP
SKLASPLQSPNLSPKASSVSTSMAALSSSTLVSSNANTTTTNNPVLTTTTTTTTTTAVLN
SNGTPLVNSNSSSNSNFAQNSISMLNGSQQQQQLIGSQSAPTSPLTPHKNINTNNNNNNN
TTTNTTNNNNSVMNGSAGIINSSSGLNGIKSPPLPILPSSNSLLSSNVSPSNNITPLNSI
TNSSELLPSSSGASSSSSNTLSSSNSGENNALPEHTEEERLIAFNKFKEFINSQINRNQL
AANSNAQSSLLNSSTNNANSNNSSNSTNTSGTVIQQKLDIKTILFSSIETFDPSTIVSNE
KSNNNTYTNNNNNNNSINSLNYNSVPSQEQIDLFKEKLYSSNLSGIFYRLNMPYPIGIKM
TERKYGIRRTSYKKCFIGAECIDWMLQNIEITKREEALIICQKMMDQKLIKQVEKSTFVD
GQFYYRLKEDDLFISSPIIKTINNTNNNFNNNNTNSNNNQQQQQQQQSIPSVTSSAVNSP
NKDSNTPDHSPISSPKQIGNKLSSSSNNTPSTFLNSSTNNTNQSTNTTSSSSSTTNINTT
LNTNNTLSSSTPPITSIQSSMSNSTKSVVPISSLSSLINNPSLRQSNTDYLTNKEKDKEK
EIDEANGDNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNSSNNGENDSSSNSGQGSLNSTLSSI
PPATTPNTNPLHFSGGISYGSSVQNSNQHQQQQPQQPQQQQQQQQQQQQQPNNLIDYYEN
PNKISEAKIEMDLSKTDRFEWILMKYDKTFCPTRYFHVEFNWIVSTGCVVDDFINSCVRK
AKQFGLTLIQIPMEKNYSPFSLPTHVHLDQQLMSPQVLKHIFTKFGLIPDTIRKRASSLV
TRQDLYIFNDSDVQYSEYVHRTGLLFVRVVEDGFLCYINNAPSNRPFLPAATMCLESFQN
LCNQLNNSLSFIGNGSLNSNNNYNNNNNNNNNNNGGGNGNPNLLKPIDRQEANFLSLLAL
GYKQNSDTEEKNNESDSDNNHNQDTCDNSDNDTDHLSESHEGSHKNESDKEGRDKNEMWE
SQSEVVYYSVMSRSPLLGSFNE
NT seq
6729 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataataataataaaaaaggtgtttatatattatgggtacatgatcaacaatttagt
aaagaagaattagtagtaaatccagaatattttcctaaattaaagattatggatgtatta
aagatatattcaccgagtaatccaagtaagagattatgtttaagggtgaaacaattatca
ccactaaaaactaaattacagatatcgatatcaaaatatgtagcgggtgtatttgatttt
gcattaagaaaagaggtggtagttaatataatacccgagaaacaagcgattatagatttc
gtagagttgtcattcaaggatcaatatattggtagatcagatatgtggagattaaaactc
aaccttcaaaacgaatgtgtgtacgtattgaagaaattggcattcgcacaaattagagca
caagttgaagagatggtttcgaatggtcaaaaggttagcagtgggttaatagatgattca
acgaaatttgtatttcgttcaagatcagctaaatttgtattattcattcagatgagtaaa
gaaatgtgggactatagtccagatggtgaattgtactttgaaaaggctgtaaacggcttt
ctaaagaatctatttcaacgttggaaatctttatcagtgaatcatacaattaccatcatt
ctattctctagaacttttcacgaaaacgatgatatcctggatgaaattccaaacatacct
cgaaatccgcaaggtaaactatatcaagatttctataaagtcgttgtcaatgaagaaaca
cgtcctgattggagttcaattattgtaaatttaaaacgtgaattcaatgactatcatacc
tctgtcaattgggatatctatggtagaaatagtgctttaggtaaaaattcaactgcttct
caaggtaatttcttggaagcaataaatttaggaatgtcatattttgataagcattatatt
gatagagattttacacgtacaggtcaaatgattgtagttatttcagcaggtacaggtata
tttgaagttgatccagatattaatttaattacaaaacaaagaatgattgataatggtatt
ggttgtgatttaatttgtttaaataaccatccattacatgttgtaccattatttaaattt
acaataagtaatcaaaataaatctcaaaatactattcaaaataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataataacaacaacagtaataataataaaaataatcaaaataat
ggtaaagccattagcaatataggtagaaataataataacagtaatagtggtagtagtggt
aatagtaataatagtagtggtggtcaattatataatttcccatattggttagcaataagt
ttttatgatgaaaataatacaacaacaacaacaactgatgtaacaacaaatgataaaaga
aatggtttattcgtaccacaatttaaaatacctgaaaaagtgaattcattctattatgaa
gatgatgaaaaaccagtttatgatttttatatcccaaaagatccaagaaatttacctgca
tttgcaacgccaaaaattaatcataaatatacttcaaattctttaggtgtaaattcttat
gaggatactatttttaatatgccaaatggtggtggaattttagatgatagtaatgctctt
ggtggaaataataataataattataataacaataatggtaatggtaatggtcataatcat
aataatcataataataataataataataataataataatgaccatggtggacattctgat
acagaaccttcagattttagtgatacagaggataattcttcaactactccaaatagtcaa
tattcaagagttgctattggtttaaatgataaaaagagagcaacttttcaaattggtggt
acaagatcttcttcatcatttgagaatcaaagaactataattaattctacaacttcaaat
aataataataataatagcaataatgtagttaataaaagatatacatcaactcaacatcaa
ccaattttacgtaatggtggtactattaataataataataataatcaacaaaatcatcca
atttcaccatcaaattcatttgatcaaaaaacaataccatatcataatcaattattatca
acgataccaccacaattatttggtaaaaagaagaaagagattaatccattcacttatgat
tctacaccattccatttaactagtaatagaagaagatggtcacatttatggttttcacca
aatacttatatctttggtaaaaccaatacaaacccgaatccattcttaccaaattggaaa
tcactttgtgaacctgcatcattaccaattacaactgattacttcccttcaactaaagat
ttaaaagcaaaatacagagaatacgttcataatttaacattacctgatgataatgaatat
acaaatagttttgaagcattattaaaagaattaatctctcaaagattagctcaaggttat
caattaattatgattacaaattctgaaattgatccaactacaactacaactacaggtgga
acaacaactcctgcaacaacaactcctgcaacaacaactcctgcaacaactgcaacatca
acaactcctacaacaataataactccaacaacaaatccatcaactgcaacatcagcaata
gcaacaccatcaatggcaacaccatcatcatctacaacaacaacaacaacaacagcaaat
ttatctacatcaccaccaaattctagtaatacagtgccaaatagtggtggtagcggtaaa
ggaacaaagaaatcatatcaacttagtttaggtcacgattttcattcaattacctatgat
ccaagtaatcttagtattcaggttaaacgttatcaaagatataatggtagaaatagtagt
ggttcaaagaaattaagatatcattactttttaaatacaattcatttacaaggtttccta
cataattcaattgaacttcaacatactgcatcaagtgaatatccatggaattcattggat
aatcttatctgtggtcaattggcaatgtcaggatttggtccaagaataaagtattggaga
gttttatatgctatcattccaaccgttgaaaataatcaacatcaacaacaactacaactt
gaacaacaagagaaagaaaaagaaaaagcaagattggctgctttagaaaaaaagaaacct
ttcccaagagaagattcattttcaactttaattttaccaactaattcttcttcctcttcc
tcttcttcttcatctttaccttcaactgtatcaaccactaatacaaatactaataataat
aataataataataataataataataataataatataaatacaactgtaccaacaaatgta
ccaacgacaacaacaacagatgattctactgttaaaaatacttctacaacaacagcaact
actgcaacagaagaccatggattaaatactgcatttaattcttcaagtattccaatccct
tcaaaattggcatcaccccttcaatcaccaaatctttcaccaaaagcatcttccgtttca
acttcaatggctgcattatcctcatcaactttagtatcaagtaatgctaatactacaacc
accaataatcctgttttaacaactaccacaacaacaacaacaacaacagccgtattaaac
tcaaatggaactccacttgtaaatagtaatagtagtagcaatagtaattttgctcaaaac
tcaatatcaatgttaaatggtagccaacagcaacaacaattaattggtagtcaatctgca
ccaacatccccattaacacctcataaaaatattaataccaataacaacaacaacaacaac
accaccactaacaccactaataataacaatagtgtaatgaatggtagtgcaggaataatc
aattcaagtagcggtttaaatggtataaaatcaccaccattaccaattttaccttcatcc
aactcattactttcatcaaatgtttcaccatctaacaatataacacctttaaatagtata
acaaattcatcagaattattaccatcttccagtggcgctagtagtagtagtagtaacaca
ttaagttcttcaaactctggtgaaaataatgcgttaccagaacatacagaagaggaaaga
ttaatagcatttaataagtttaaagaatttattaattctcaaataaatagaaatcaactt
gctgcaaattcaaatgcacaatcttctttattaaatagctcaactaataatgccaactca
aacaatagtagtaattctacaaataccagtggtacagttattcaacaaaaattagatatt
aaaacgattttattctcatcgattgaaacttttgatccatcaacaatagtttcaaatgaa
aagagtaataacaatacttatactaataataataataataacaatagtattaatagttta
aattataatagtgtaccaagtcaagaacaaattgatttatttaaagagaaattatattca
tccaatttatcaggtattttctataggttaaatatgccatacccaattggcattaaaatg
actgaaagaaaatatggtattagaagaacttcctataagaaatgttttattggtgctgaa
tgtatagattggatgttacaaaatattgaaatcactaaaagagaagaagctttaatcatt
tgtcaaaaaatgatggatcaaaaattaattaaacaagttgaaaaatcaacttttgtagat
ggtcaattttattatcgtctaaaagaagatgatttattcattagttcaccaataattaaa
acaattaataatactaataataattttaataataacaatacaaatagtaataataatcaa
caacaacaacaacaacaacaatcaattccatcagtaacatcctcagctgtaaactcacca
aataaagatagtaatacacctgatcattcaccaattagttctccaaaacaaattggaaat
aaactttcatcaagcagtaataatactccatctacctttttaaatagtagcacaaacaat
acaaatcaaagtacaaatacaacatcttcttcatcctcaacaacaaatataaatacaact
ttaaatacaaataatactttatcttcctcaacaccaccaataacttctattcaatcctca
atgtcaaattcaactaaatctgtagtaccaatttcttcattatcttctttaattaataat
ccatcattaagacaatcaaatactgactatttaactaataaagaaaaagataaagaaaaa
gaaattgatgaagccaatggtgataataataataataataataataataataataataat
aataataataataacaataataataataataacaataataataatagtagcaataatggt
gaaaatgattcatcatcaaattctggacaaggtagtttaaactcaaccttatcatctata
ccaccagcaacaacgccaaatacaaatccattacattttagtggtggtatatcatatgga
agtagtgttcaaaatagtaatcaacatcaacaacaacagccacaacagccacaacaacaa
caacaacaacaacaacaacaacaacaacaaccaaataatttaatagattattatgaaaat
ccaaataaaattagtgaagcaaaaattgaaatggatttatcaaaaacagatcgttttgaa
tggatattaatgaaatatgataaaacattttgtccaacaagatatttccatgttgaattt
aattggatagttagtacaggttgtgtagttgatgatttcattaatagttgtgttagaaaa
gcaaaacaatttggattgacactcattcaaattccgatggaaaagaattatagtccattc
tcattaccaactcatgttcatttggatcaacaattaatgtcaccacaagtattgaaacat
attttcacaaagtttggtttaatacctgatacaattagaaagagagcttcctcattagtt
accagacaagatctttacatctttaatgattccgatgttcaatattcagaatatgttcat
agaactggtcttttattcgtaagagtggtcgaagatggtttcctttgttatattaacaat
gctccttcaaatagaccatttttacctgcagctactatgtgcttagaatctttccaaaat
ttatgtaatcaattaaataattctctatcttttattggtaatggtagtttaaatagtaat
aataattataataataataataacaataataataataataatggaggtggtaatggtaat
ccaaaccttttaaaaccaatcgatcgtcaagaagcaaatttcctatctttattggcatta
ggttataaacaaaatagtgacactgaagaaaagaataatgaaagtgatagcgataacaat
cacaatcaagacacatgcgataatagtgataatgataccgatcaccttagtgaaagtcat
gagggtagtcataaaaatgaaagtgataaggaaggcagagataaaaatgaaatgtgggaa
tcacaaagtgaagtagtttattatagtgttatgtctcgtagtccattattaggttcattt
aatgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
