Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0279107
Help
Entry
DDB_G0279107 CDS
T00245
Name
(RefSeq) hypothetical protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
POLQ_helical
DEAD
Helicase_C
HTH_61
HHH_5
Helicase_dom4_arc
DUF4332
DEXQc_Suv3
PAS
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8621875
NCBI-ProteinID:
XP_641869
dictyBase:
DDB_G0279107
UniProt:
Q54X98
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(1638888..1642604)
Genome browser
AA seq
1238 aa
AA seq
DB search
MSKRPLDFKPLNNNDNKNKILKTNINDNSPINKTILTSKNISQINSSKGVFQTPLVKTIT
YNDSYTSLLQPLQPQQQKQQTINQPLQRKLSPPQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQLPP
PQQTIKSIQPLQGKPYVNNKSEGLIGASSYRSVSNNSTALSSTLKKQSLSTNNKTNIPKN
NYQNDNKKIIGIINTHNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNINGINNINNNINNKNNNVNSVNNNSSNNKSNSVSGCLISFGTQEFDISTSQFDYDV
ESGSSESESSIELENFDFDLASTCSQSFIEELNHNIATNSTQQRNLAEAFNNPNYHDLLF
NNNNKKSTTTTTAITTTKTTTTTTNTSSPSKSLVINKNNQQQQQKQKEQQKIEYKIICDN
PKLISNDIEECCVKIFGLPKSVGTIYKRRGMKQLYDWQKECLSDSNLLLGENLIYSLPTS
GGKTLVAEIILFRNLLIKNKKSLFIFPFVSIVCEKTESMHEFSSALQIPVEGYHGCNGTI
PVLPGKRLLICTIEKANIIVNQLIEDGRLLDIGCVVVDEIHMIGDGERGQLLEVLISKLL
YMSKGQIQIIGMSATIPNIDNLQKWFRGGVYQGTFRPVPLTEYIKIGDKLYDKENNLVKS
LQGTEANENHTLQLCLEVVPKHSVLIFCASKLLTVSLALQLAKSFPQAILDNRRDEREIL
IQLIESSNGCKVEEDFKRMIMAGVAYHNADLTNDEREVIERGFKERSLLVLCATSTLSTG
VNLPARRVILRSPRMGRNVLDIRSYRQMVGRAGRAGIDEFGESILMCDHFAPDKAKKLLT
SPMDPLLSSINKNVESFQKIILDSICSGIASDKFSILSFFSYTFYSTHLLPPKDMTPYEY
IRKLVNDSVEALIKSGHIQISCNQPDPNDKKTIGTAKFDLDGKPTEESIRYEYTPLGYAC
FRSGLSIKNAKFLYDELRIIQNGAVVISEQLHMCYIISPVHNIPEIPDLDQYGKFLSKLK
GPKQLVAKLLEISDQYVYYKQLDEMAITFQEENRNRRFFSAMVLNDLIHEVPLSMVSTKY
NLNRGTVQSLMNGAASHAWMVSLFCKKLGWVELEALVNLYIQRLDKGVRHEIVPLVEING
VKQARARALWAAGFKTVKSIALASPEELNKAVKLGKFNSISIAATIIREAGKLLERKSEE
LRAKADELILDMSIKSTKTTTTTTNYPDDNDFESNFIE
NT seq
3717 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaaagagaccattagattttaaacctttaaataataatgacaataaaaataaaatt
ttaaaaaccaatataaatgataattcacctataaataaaacaatattaacctcaaaaaat
atatcacaaatcaatagttcaaaaggtgtatttcaaactccacttgttaaaactattacc
tacaatgatagttatacatctttacttcaaccattacaaccacaacaacaaaaacaacaa
acaataaatcaaccacttcaaagaaaattatcaccaccacaacaacaacaacaacaacaa
caacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaattaccacca
ccacaacaaacaataaaatctattcaaccactccaaggaaaaccatatgtaaataataaa
tccgaaggtttaattggagcatcatcttatagatcggtttcaaataattcaacagcatta
agctccactttaaagaaacaatccttatcaactaataataaaacaaatataccaaaaaat
aattatcaaaatgataataaaaaaattatcggtattattaatactcataataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataatataaatggtataaataatataaataataatataaacaataaaaataat
aatgtaaatagtgtaaataataattcaagtaataacaaatcaaattctgttagtgggtgt
ttaattagttttggaacacaagagtttgatatttcaacaagtcaattcgattatgatgtt
gaaagtggtagtagtgaaagcgagtcatcaattgagcttgaaaattttgattttgatttg
gcttcaacttgcagtcaatcattcatagaggagttaaatcataatatagctacgaattct
actcaacaaagaaatttagcagaggcttttaataatccaaattatcatgatttgctattt
aataataataataaaaaatcaacaacaacaacaacagcaataacaacaacaaaaacaaca
acaacaacaactaacacatcatcaccatcaaaatcattagttataaataaaaataatcaa
caacagcaacaaaaacaaaaagaacaacaaaaaattgaatataaaataatttgtgataat
ccaaaattaattagtaatgatattgaagaatgttgtgttaaaatatttggattaccaaaa
tcagttggtacaatttataagagaagaggtatgaaacaattatatgattggcaaaaggaa
tgtttaagtgatagcaatttattattgggtgagaatttaatttattcattaccaacatca
ggtggtaaaacattggttgcagaaataatattatttagaaatttattaataaaaaataag
aaatcattatttattttcccatttgtttcaattgtatgtgaaaaaacagaatctatgcat
gagttttcaagtgcattacaaattccagttgaaggttatcatggttgtaatggaactata
ccagttttaccaggaaaaagattactaatttgtaccattgaaaaagcaaatatcatagtt
aaccaattgattgaggatggtaggttattggatattggttgtgttgtcgtcgatgaaatt
catatgattggtgatggtgaacgtggccagttattagaagttttaattagtaaattgtta
tatatgtcaaagggacaaattcaaatcattggtatgtctgcaaccataccgaatattgat
aatcttcaaaaatggtttagaggtggcgtttatcaaggtacatttcgtccagttccgttg
acagagtacattaaaattggtgataaactatatgacaaagagaataacttggtcaaaagc
ctccaaggcacagaagcgaatgaaaatcatactcttcaattatgtctagaggttgtacca
aagcattcagtattgattttctgtgcatcaaagttactcactgtttcattggcacttcaa
ttggcaaagagttttcctcaggcaattctagataatagacgcgatgaaagggagatatta
atacaattgatagaatcttctaatggttgtaaagttgaagaggatttcaaacggatgatt
atggctggtgttgcttatcacaatgctgatttaacaaatgacgaaagagaagtcattgaa
agagggtttaaagaacgttccctcttggtattatgtgcaacatctacattaagtactggt
gttaatttgcctgcccgaagagtaattctaagatcaccaagaatgggtaggaatgttctt
gatattagatcctatcgtcaaatggttggtcgtgctggtcgtgctggtattgatgaattt
ggtgaatcaattttaatgtgtgatcatttcgcacccgataaagcaaagaaacttttaacc
tcaccaatggatccattgttgtcaagtattaataaaaatgttgaatcatttcaaaagata
attttggattccatttgttcaggtattgcttcagataaattttcaatactatcattcttt
tcctatacattttattcaactcatttattaccaccaaaagatatgacaccctatgaatac
attcgtaaattagttaatgactctgtggaggcattgataaaaagtggccatattcaaatt
tcatgtaatcaaccagatccaaatgataagaaaaccattggtactgcaaaatttgattta
gatggtaaaccaactgaagaatcaattagatacgagtatacaccattgggttatgcttgt
tttagatcgggtttatcaattaaaaatgcaaaattcctctatgacgagttaaggataatt
caaaatggtgcagttgttatctctgaacaacttcatatgtgttatattatatcaccagtt
cataatattccagaaatacccgatcttgatcaatatggaaagtttctaagtaaattaaaa
ggtcctaaacaattggttgctaaattattggaaattagtgatcaatatgtttattataaa
caattggatgaaatggctataacttttcaagaggagaatcggaatagacgtttcttttca
gcgatggtattaaatgatttaattcatgaagtaccactttcaatggtttcaacaaaatac
aatttaaatcgtggtacagttcaaagtttaatgaatggtgctgcatctcatgcttggatg
gtttcattattttgtaagaaattagggtgggttgaattggaagcattggtcaatttatat
attcaacggttagataaaggcgttagacatgaaatcgtacctttggtagaaataaatggt
gttaaacaagctagagctagagctttatgggctgctggttttaaaactgtaaaatctata
gcattggcatcacctgaagaattaaataaagcagttaaattgggtaaatttaattcaatt
agtatagctgcaacaataattagagaagcaggtaaattattggaaagaaaatctgaagaa
ttaagagcaaaagcagatgaattaatattagatatgtctattaaatcaacaaaaacaaca
acaacaacaacaaattatccagatgataatgactttgaatcaaattttattgaatga
DBGET
integrated database retrieval system