KEGG   Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0279267
Entry
DDB_G0279267      CDS       T00245                                 
Name
(RefSeq) histone deacetylase family protein
Organism
ddi  Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Motif
Pfam: Hist_deacetyl Zn_Tnp_IS1 Fer4_10
Other DBs
NCBI-GeneID: 8621960
NCBI-ProteinID: XP_641762
dictyBase: DDB_G0279267
UniProt: Q54X15
LinkDB
Position
3:complement(1861211..1865976)
AA seq 1489 aa
MSTIHQVNEMNSRVGEKPACCIGAARGHCTAHCPRIEDVLYSQRKGKTNKGAQRWRCKAC
GTKWTSKGIIIQPPVVPDTIVNSIGFGNGPEEISMEQLRANARPYKKTKTGDNILQTSPF
PSLFGNSIGMGLGGNNNNINNNNNSNGSNSSNNSHNGGSSPSGSPIPSPPSPVSFLQRNS
NVFVPILPQSNGNNINNNNNNNSNSNSNNINSNSSNSMQLQNNNNNNGQLRSSSSSLSLS
SSSSQLNSSSNGNGSSRNLLTSQKSAQSLIGNINNNNNNNNIINNNSNNNTNNNNNIMNG
TTTSTTKPVVVGGPMQILNSVVNNSPTSSKPILSSSSQNLLYNSSGSIPQPSQSPQNNNN
TTINNNNNTTNNNNNNNNSNNNNNSNNNNNNSNNNNINNVANGTPRPSLQTSRLQGKLPS
PQQYNTSPSHQQYPSPKNNNNSNNIIPIQSTYGQPTPPPTKPPVSSKAPAVYHNVRVPSP
NTTVDNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNSNNNNNSNNNNNNINNNNNNNNNSNNNN
NGNSNNNNNNNSNYQQQHQYFSPNQNYIQQQVQAVQTQQAQHILAQQQAQAQQQYIQQLQ
LQQQTLAHAQSQAAHQAQTLTHSRHNDLLSPIDSQIWAPIQYSWIQTHYNPSSSLLECLK
RLINSVVVFSNELPVDQRLKMINFLTTLSSPSSESQYNTNASKQMLNCIDNSVFNITKHY
QMLYQSISKHYSMMEDSFIPLTEVYFDENEINKFIHFSDQFKIIEEQFEFILRELSSIRD
TLIIKRENIEKNIIESSKFLNNSSNNDNGIEEIGLEQAKQDTTRLLESLAPLETTLNSME
IKFKSIQKEISMVIRVFSFFELLYNIHINCHQTIVEKHSRQLSTYMIDVIQQSLYNCDVI
SVAYNRLKTGLFNSNNNNNNNNNNNNNNNEEDDQLIDTTNPFINKLSDLLSKYENISKNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNRNRDRDREFERDNNSNNNNNNIEKERNRNNRI
RDRDNMDIDNISSFISNNQQQHIGQSQSVQQSSQLPKERKVMALYHTTCLDHLVPDDHPE
SPKRLSSVIKAINDFSRQSDRLIIKNDPEEINDKWILTVHSPEYLRLLEDLTEKLDANEI
RPLNVNNDGASTGINQFSTSTPITTTGTATVTPGSTTSSTNGEQCEDGDTFVSKLSLHAA
KRSAGATCQAIDNVMKGNVTSAFVAARPPGHHAGRDGLTSGTSSQGFCLLNHVCIGAKYA
QLKYNLDKIAIIDFDVHHGNGTEEILSNDQGFYFLSIHMFEEGFYPGSGGGVGSIGVVNL
NEFNEQNDYDDDDNNNDVNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNSNSITQQSTITNNSN
CKGNIVNIPLDPKSSASSFLKAFSIIIDKLNDYQPELILISCGFDAHMEDHLASLCLLEE
NYVEITRSLRRVADRWCKGRLVSILEGGYNINALRQCTIAHLSALSEDD
NT seq 4470 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcaacaattcatcaggttaatgaaatgaacagtagggttggagaaaaaccagcatgt
tgtattggtgctgcaagaggtcattgtacagcccattgtccaagaattgaagatgtttta
tattctcaaagaaaaggaaaaacaaataaaggtgctcaaaggtggagatgtaaagcatgt
ggtacaaaatggacttcaaaaggaattattattcaacctccagttgtaccagatacaatt
gttaatagtattggatttggaaatggaccagaagaaatttcaatggaacagttgagagcc
aacgcaagaccctataaaaaaaccaaaactggagataatatattacaaacatcccctttc
ccatctttatttggtaatagtataggtatgggtttaggaggtaataataataatattaat
aataataataatagcaatggtagtaatagtagtaataatagtcacaatggaggaagttct
ccaagtggctcaccaataccatcacctccatcacctgtttcatttctacaaagaaattca
aatgttttcgtaccaatactacctcaaagtaatggtaacaatattaataacaataataat
aataatagtaatagtaatagcaacaatatcaacagcaatagttcgaactcgatgcaatta
caaaacaataataataataatggtcaattaaggtcttcttcatcttcattatctttatca
tcttcatcatcacaattgaatagtagtagtaatggaaatggtagcagtagaaatttatta
acatcacaaaaaagtgctcaatcattaattggtaatattaataataataataataataat
aatattattaataataatagtaataacaatactaataacaataacaatattatgaatgga
accacaacttcaacaaccaaaccagttgttgttggtggtccaatgcaaattttaaatagt
gtcgtaaataattcacctacctcttcgaaaccaatactctcctcttcttctcaaaatcta
ttatataatagtagtggatcaatacctcaaccatctcaatctcctcaaaataataataat
actactataaataataacaataatactacaaataataataataataacaataatagtaat
aataataataatagtaataataataataataatagtaataataataatattaataatgtg
gcaaatggtacaccaagaccatctcttcaaactagtagacttcaaggaaaattaccatcc
ccacagcaatataatacttctccatcacatcaacaatatccaagcccaaaaaataataat
aatagtaataatattattccgatccaatcgacatatggtcaaccaacaccaccaccaacg
aaaccaccagtttcaagtaaagcaccagcagtctatcataacgttcgagtcccttcacca
aacacaactgtagataacaataacaataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataatagtaataataataataatagtaat
aataataataacaatatcaataacaataataataataacaataatagtaataacaataat
aatggtaatagtaataacaacaataataataattcaaattatcaacaacaacatcaatat
ttttcaccaaaccaaaactatattcaacaacaagttcaagcagtacaaacacaacaagca
cagcatatattagcacaacaacaagcacaagcacaacaacaatatattcaacaacttcaa
ctacaacaacaaacattagcacatgcacaatcacaagctgcacatcaagcacaaacatta
acacactctagacataatgatctattgtcacctatagattcacaaatttgggcaccaata
caatatagttggattcaaactcattataatccatcctcatcattattggaatgcttaaag
cgattaataaattcggtggttgttttttctaatgagttaccagtcgatcaaagattaaag
atgattaactttttaacgactctctcatcaccatcatcggaatcacaatataacacaaat
gcaagtaaacaaatgttgaattgtattgacaatagtgtatttaacatcaccaaacattat
caaatgctctatcaatcgatatcaaaacattactcaatgatggaagatagtttcatacca
ttaactgaagtttatttcgatgaaaatgaaattaacaaattcattcatttctctgatcaa
ttcaaaatcattgaagaacaatttgaattcattcttcgtgaattatcttcaattagagat
actcttattattaaaagggaaaatattgaaaagaatattatagaatcttcaaaattttta
aataatagtagtaataatgacaatggtatagaagaaattggattagaacaagcaaaacaa
gatactacaagattattagaatcattggcacctttggaaactacattaaattcaatggaa
attaaatttaaatcaattcaaaaagagatttcaatggtcattagagttttctctttcttt
gaattactttataatattcatatcaactgtcatcaaacaatcgttgaaaaacattcaaga
caattatcaacctatatgattgatgtaattcaacaatctttatacaattgtgatgtaatc
tctgttgcttataatagattaaaaactggtctttttaattcaaataataataacaataat
aataacaataacaataataataataatgaggaagatgatcaattaattgatacaactaat
ccattcattaataaattaagtgatttattatcaaaatatgaaaatattagtaaaaataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataacaataatagaaatagagatagagatagagaatttgaaagagat
aataatagtaataacaataataataatattgaaaaagaaagaaatagaaataatagaatt
agggatagagataatatggatattgataatatttcatcatttattagtaataatcaacaa
caacatattggtcaatcacaatcggtacaacaatcatcacaattaccaaaagaaagaaaa
gtgatggcactttatcatactacttgcttagatcatttagtacctgatgatcatcctgaa
tcaccaaaacgtttaagttcagttataaaggcaatcaatgatttctcgagacaatctgat
aggttaatcattaaaaatgatccagaggaaattaatgataaatggattttaacagttcat
tcaccagagtatcttagattgttggaggatttaaccgagaaattggatgcaaatgaaatt
cgtccattaaatgtaaataatgatggtgcaagcacaggcattaatcaattctcaacatca
actccaatcacaacaactggtactgccactgttactccaggttccacaacaagtagtaca
aatggtgagcaatgcgaagatggtgatacattcgtaagcaaactatctttacatgccgcc
aaaagatctgctggtgcaacttgtcaagccattgataacgttatgaaaggtaatgtaaca
agtgcttttgttgccgctcgcccacctggtcatcatgctggtagagatggtttaactagt
ggtactagttctcaaggattttgtctattgaatcatgtttgtattggtgctaaatacgct
caactcaagtataatttagataaaattgcaatcattgatttcgatgttcatcatggaaat
ggtaccgaagaaatattatcaaatgatcaaggtttctatttccttagtattcatatgttt
gaagaaggtttctatcctggtagtggtggtggtgttggttcaattggtgtagttaattta
aatgaatttaatgaacaaaacgattatgatgatgatgataataataatgatgtaaataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataaaaat
aataataataataatagtaattcaataacacaacaatcaacaattactaataatagcaat
tgtaaaggaaacattgtaaatattccattggacccaaagagttctgcaagttcattttta
aaagcattttcaattattattgataagttgaatgattatcaaccagaactaattttaatt
tcttgtggattcgatgcacatatggaggatcatttggcttctttatgtttattggaagaa
aactatgtcgaaattacaagatccctacgtagagttgccgatcgttggtgtaaaggtaga
ttggtttcaatattagaaggtggttataatataaatgccttaagacaatgtacaattgct
catttatctgcattaagcgaagacgattaa

DBGET integrated database retrieval system